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大肠埃希菌CRISPRs间隔序列的来源研究
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作者 梁文娟 崔聪聪 +5 位作者 段广才 刘慧莹 徐亚珂 郗园林 杨海燕 陈帅印 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第2期137-140,共4页
目的研究大肠埃希菌全基因组中规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)的间隔序列分布及来源规律。方法通过BLAST、CRISPRs finder、ClustalX和CRISPRTarget分析CRISPR/Cas、间隔序列及其来源。结果 203株大肠埃希菌中74.4%含有I-E CRIS... 目的研究大肠埃希菌全基因组中规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)的间隔序列分布及来源规律。方法通过BLAST、CRISPRs finder、ClustalX和CRISPRTarget分析CRISPR/Cas、间隔序列及其来源。结果 203株大肠埃希菌中74.4%含有I-E CRISPR/Cas,9.4%含有I-F CRISPR/Cas,17.2%存在CRISPR3-4;CRISPR1,CRISPR2,CRISPR3和CRISPR4的间隔序列数目范围分别为1-25、1-27、4-7和2-22;其独特间隔序列数目分别为339、346、57和66。CRISPRTarget分析I-E和I-F CRISPR/Cas的间隔序列分别匹配816条质粒和293条噬菌体,2 428条质粒和139条噬菌体,差异有统计学意义(χ~2=319.30,P<0.01)。结论大肠埃希菌中CRISPR/Cas分布广泛,I-E和I-F CRISPR/Cas可能发挥不同的免疫功能。 展开更多
关键词 规律成簇的间隔短回文重复序列 间隔序列 噬菌体 质粒 大肠埃希菌
CRISPR1上游侧翼序列用于大肠埃希菌和志贺菌鉴定的效果评价
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作者 梁文娟 崔聪聪 +5 位作者 段广才 刘慧莹 徐亚珂 郗园林 杨海燕 陈帅印 《中华流行病学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第12期1607-1610,共4页
目的探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列(CRJSPR)1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas),并分析其种... 目的探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列(CRJSPR)1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas),并分析其种系;选取CRISPRs上、下游各500bp侧翼序列,使用ClustalX进行序列比对;采用PCR方法扩增CRISPR1上游侧翼序列,以确定其对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。结果73.4%(149/203)的大肠埃希菌存在I-E型CRISPR/Cas系统,包含了A、B1、D种系;8.4%(17/203)的大肠埃希菌存在I-F型CRISPR/Cas、17.2%(35/203)的大肠埃希菌不存在CRISPR/Cas,这2种大肠埃希菌均属于B2种系;9株志贺菌均存在I-E型CRISPR/Cas。在大肠埃希菌(B2种系外)、志贺菌CRISPR1上游和大肠埃希菌(B2种系)各存在61bp侧翼序列,序列一致性为99%,且有种属特异性,PCR扩增此区域鉴定大肠埃希菌和志贺菌的灵敏度和特异度均>91%。结论基于CRISPR1上游序列可用来鉴定大肠埃希菌和志贺菌,且具有良好的效果。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 志贺菌 成簇规律间隔的短回文重复序列 侧翼序列 鉴定
成纤维细胞生长因子5基因rs16998073位点多态性与河南农村汉族人群高血压易感性的关联
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作者 张霞 屠润琪 +5 位作者 千新玲 田忠艳 张海庆 霍文倩 张功员 王重建 《中华高血压杂志》 CSCD 北大核心 2018年第10期978-981,共4页
目的探讨成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因rs16998073位点多态性与河南农村汉族人群高血压易感性的关联。方法从“河南农村队列”研究中抽取1096例高血压患者(高血压组),以及根据性别(同性别)、年龄(±3岁)进行1:1匹配的109... 目的探讨成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因rs16998073位点多态性与河南农村汉族人群高血压易感性的关联。方法从“河南农村队列”研究中抽取1096例高血压患者(高血压组),以及根据性别(同性别)、年龄(±3岁)进行1:1匹配的1096名非高血压患者(对照组)作为研究对象。采用磁珠法抽提全血基因组DNA,采用SNPscan^TM高通量单核苷酸多态性(SNP)分型技术对FGF5基因上选取的rs16998073位点进行基因分型,采用条件Logistic回归分析FGF5基因多态性与高血压易感性的关联。应用多因素降维法探讨FGF5基因一环境危险因素的交互作用。结果高血压组和对照组位点rs16998073基因型分布频率差异具有统计学意义(x^2=6.400,P=0.041)。调整可能的混杂因素后,FGF5基因rs16998073位点突变基因型AT+TT与高血压易感性存在统计学关联(OR=1.34,95%CI1.10~1.62)。进一步分析显示,FGF5基因rs16998073位点与体质量指数(BMI)对高血压易感性的影响存在相乘交互作用(调整OR=1.41,95%CI1.30~1.53)。结论FGF5基因rs16998073位点多态性与高血压易感性存在关联,且该位点基因多态性和BMI对高血压的发生具有交互作用。 展开更多
关键词 成纤维细胞生长因子5基因多态性 高血压 环境危险因素 交互作用
高血压人群中体质指数与全死因死亡风险的队列研究
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作者 刘雪娇 王炳源 +14 位作者 任永成 赵阳 刘德臣 张冬冬 陈序 刘磊磊 程诚 刘飞燕 周琼桂 陈国桢 洪士皓 刘丹 胡思琦 张明 胡东生 《中华流行病学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第7期914-919,共6页
目的探讨高血压队列人群中BMI和全死因死亡风险的关系。方法研究对象为河南省某农村地区高血压队列人群,应用Cox风险比例回归模型计算基线时不同BMI水平人群随访期间的全死因死亡比例HR值及其95%CI,并采用限制性立方样条模型拟合BMI... 目的探讨高血压队列人群中BMI和全死因死亡风险的关系。方法研究对象为河南省某农村地区高血压队列人群,应用Cox风险比例回归模型计算基线时不同BMI水平人群随访期间的全死因死亡比例HR值及其95%CI,并采用限制性立方样条模型拟合BMI与全死因死亡风险的剂量一反应关系。结果5461名高血压队列人群累积随访31048.38人年,平均随访6年,随访期间死亡589人。控制潜在的混杂因素后,以基线正常体重组(18.5kg/m2〈BMI〈24.0kg/m^2)为参照,低体重组(BMI〈18.5kg/m2)、超重组(24.0kg/m2〈BMI〈28.0kg/m2)和肥胖组(BMI≥28kg/m^2)人群发生死亡的HR值(95%C/)分别为0.83(0.37~1.87)、0.81(O.67~0.97)和0.72(0.56-0.91)。限制性立方样条模型分析结果显示,在高血压队列人群中,基线BMI和全死因死亡风险关联强度呈现倒“S”形非线性剂量反应关系(非线性检验P〈0.001)。结论超重和肥胖可能是高血压人群死亡风险的保护因素,与“肥胖悖论”一致。 展开更多
关键词 体质指数 死亡 高血压 肥胖悖论
我国成年人群年龄对体质指数与高血压发病风险的修饰效应
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作者 张冬冬 刘雪娇 +14 位作者 王炳源 任永成 赵阳 刘飞燕 刘德臣 程诚 陈序 刘磊磊 周琼桂 徐琦焕 熊一涵 刘佳立 游子扬 张明 胡东生 《中华流行病学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第6期765-769,共5页
目的探讨中国成年人群年龄对BMI与高血压发病风险的影响。方法采用整群随机抽样方法,选择河南省新安县≥18岁20194名农村常住居民为研究对象,于2007-2008年开展基线调查,2013-2014年随访。采用logistic回归模型分析基线BMI、年龄别BM... 目的探讨中国成年人群年龄对BMI与高血压发病风险的影响。方法采用整群随机抽样方法,选择河南省新安县≥18岁20194名农村常住居民为研究对象,于2007-2008年开展基线调查,2013-2014年随访。采用logistic回归模型分析基线BMI、年龄别BMI与高血压发病风险的关系。结果共纳入9768名研究对象,在6年随访期内,发生高血压1950例,其中男性784例,女性1166例,相应的累积发病率分别为19.96%、20.51%和19.61%。以BMI〈22kg/m。组为参照,基线BMI为22-、24-、26-、≥28kg/m。的研究对象发生高血压的RR值(95%CI)分别为1.09(O.93-1.27)、1.17(1.01-1.37)、1.34(1.14-1.58)和1-31(1.09-1.56)。青中年人群随着BMI的升高,高血压发病风险呈逐渐上升趋势(P〈0.05);老年人群随着BMI的增加,高血压发病风险则无显著变化趋势(P〉0.05)。结论BMI与高血压发病风险的关联受到年龄因素修饰的影响,在青中年人群中干预BMI可更有效降低高血压发病风险。 展开更多
关键词 体质指数 高血压 年龄 修饰效应 队列研究
脂肪干细胞对糖尿病大鼠勃起功能障碍的影响 预览
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作者 王文华 葛永超 +10 位作者 侯全亮 张程达 葛梦颍 田惠子 任炳楠 岳利敏 杜冰会 李丹康 赵青林 OPOLOT Godfrey 张卫东 《郑州大学学报:医学版》 北大核心 2018年第5期675-678,共4页
目的:评价脂肪干细胞(ADSCs)对糖尿病型大鼠勃起功能障碍(ED)的治疗效果,探讨ADSCs治疗ED的机制。方法:108只雄性SD大鼠,其中20只为正常对照,余88只大鼠通过腹腔注射STZ建立糖尿病模型。糖尿病大鼠行阿扑吗啡实验,将实验阴性者分... 目的:评价脂肪干细胞(ADSCs)对糖尿病型大鼠勃起功能障碍(ED)的治疗效果,探讨ADSCs治疗ED的机制。方法:108只雄性SD大鼠,其中20只为正常对照,余88只大鼠通过腹腔注射STZ建立糖尿病模型。糖尿病大鼠行阿扑吗啡实验,将实验阴性者分为ED模型组(19只大鼠)和ADSCs治疗组(20只大鼠),前者海绵体移植PBS缓冲液,后者海绵体移植ADSCs悬液。4周后,在10 V刺激下测定海绵体内压(ICP)和平均动脉压(MAP),计算ICP/MAP。采用免疫荧光染色方法检测大鼠阴茎海绵体中v WF、α-SMA、n NOS蛋白的表达。结果:(1)ADSCs增殖能力较强且可被诱导分化为脂肪细胞和成骨细胞。(2)正常组、ED模型组和ADSCs组的ICP/MAP值分别为(0.690±0.096)、(0.250±0.096)和(0.440±0.130),差异有统计学意义(P〈0.05),ADSCs组明显高于ED模型组。(3)ADSCs治疗组大鼠阴茎海绵体v WF、α-SMA和n NOS蛋白的表达均高于ED模型组(P〈0.05)。结论:ADSCs疗法能够提高大鼠的勃起功能,增加大鼠阴茎海绵体v WF、α-SMA和n NOS蛋白的表达。 展开更多
关键词 脂肪干细胞 糖尿病 勃起功能障碍 大鼠
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基于倾向得分匹配法的父亲相关因素与儿童急性白血病的关联
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作者 高盼 梁歌 +1 位作者 王一然 卢洁 《中华疾病控制杂志》 CSCD 北大核心 2018年第7期726-730,共5页
目的研究父亲相关因素与儿童急性白血病(acuteleukemia,AL)易感性的关联。方法基于成组病例一对照研究,于2014—2016年在河南省4家医院募集AL患儿及对照。用倾向得分匹配法(propensity scorematc.hing,PSM)均衡组间协变量,标... 目的研究父亲相关因素与儿童急性白血病(acuteleukemia,AL)易感性的关联。方法基于成组病例一对照研究,于2014—2016年在河南省4家医院募集AL患儿及对照。用倾向得分匹配法(propensity scorematc.hing,PSM)均衡组间协变量,标准化差异法验证匹配效果。匹配后数据用条件Logistic回归模型作关联分析,计算调整人群归因危险度百分比(popuMion attributable risk percent,PARP),并作亚组分析。结果共纳入病例、对照各407例。经PSM共匹配出270对病例及对照,匹配后16个协变量的标准化差异值均小于0.1。条件Logistic回归分析显示:父亲孕前6个月农药暴露(OR调整=1.93,95%CI:1.23~3.05)、染发(OR调整=2.31,95%CI:1.04-5.12)与儿童AL相关联,其调整PARP分别为11.42%、4.62%。其中前一个关联在男性、确诊年龄〈5岁、居住地农村、有父亲孕前烟草暴露史的儿童亚人群中有统计学意义(均有P〈0.05)。结论父亲孕前6个月暴露于农药、染发能增加儿童AL的易感性,应在孕前保健中予以控制。 展开更多
关键词 白血病 父亲 危险因素 倾向得分匹配 条件LOGISTIC回归
脑卒中三级网络筛查及对早期干预方案的卫生经济学分析 预览 被引量:1
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作者 时松和 李桑桑 +3 位作者 刘德臣 许予明 李玉生 宋波 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2017年第3期459-461,464共4页
目的 在脑卒中防治三级网络筛查模式的基础上探讨早期干预方案的成本效用情况。方法 2012年和2013年选择郑州大学第一附属医院的筛查点人群作为干预组,选取河南省其他四个基地医院的筛查点人群作为对照组,2013年的干预组采取国家卫计委... 目的 在脑卒中防治三级网络筛查模式的基础上探讨早期干预方案的成本效用情况。方法 2012年和2013年选择郑州大学第一附属医院的筛查点人群作为干预组,选取河南省其他四个基地医院的筛查点人群作为对照组,2013年的干预组采取国家卫计委规定的常规筛查模式基础上的三级网络筛查模式,其余均采取常规筛查模式。通过使用脑卒中高危人群筛查和干预项目风险评估表搜集相关信息,计算出双侧颈动脉内膜增厚的检出率。利用Markov模型在双侧颈动脉内膜增厚早期药物干预基础上,对适应人群所行的颈动脉内膜剥脱术进行成本效用分析。结果 三级网络筛查模式双侧颈动脉内膜增厚的检出率高于常规筛查模式(χ^2=66.406,P〈0.001);实行早期干预方案可使30年间每10万人中减少1689例脑卒中的发病,每减少1例脑卒中发病需费用50050元,每增加一个质量调整寿命年需投入6049元。结论在三级网络筛查模式的基础上采取颈动脉内膜剥脱术在成本效用分析上具有积极的意义。 展开更多
关键词 脑卒中三级网络筛查模式 颈动脉内膜剥脱术 Markov模型 成本效用分析
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CTX-M-15型大肠埃希菌的分子分布特征及质粒传播规律研究 被引量:2
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作者 徐亚珂 龙金照 +4 位作者 段广才 梁文娟 刘慧莹 陈帅印 郗园林 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第11期1048-1051,1057共5页
目的探讨CTX-M-15型大肠埃希菌的分子分布特征及质粒传播规律。方法 232株CTX-M-15型大肠埃希菌鸟枪法测序序列从GenBank数据库获取,利用CGE在线工具获得菌株的MLST分型、耐药基因及质粒类型信息,应用eBURST软件绘制MLST分型结果聚类图... 目的探讨CTX-M-15型大肠埃希菌的分子分布特征及质粒传播规律。方法 232株CTX-M-15型大肠埃希菌鸟枪法测序序列从GenBank数据库获取,利用CGE在线工具获得菌株的MLST分型、耐药基因及质粒类型信息,应用eBURST软件绘制MLST分型结果聚类图。结果 232株CTX-M-15型大肠埃希菌共检测出37个MLST型别,其中以ST131菌株检出率较高,为35.34%(82/232)。菌株中耐药基因数目为1~22个不等,出现耐药基因数目较多菌株的ST型别为ST131和ST617,其中blaOXA-1、aac(6')Ib-cr、aac(3)-II、aadA、mph(A)等7种耐药基因在ST131菌株和非ST131菌株中的分布差异有统计学意义(P〈0.05或P〈0.01),且ST131菌株检出率高于非ST131菌株(P〈0.05或P〈0.01)。菌株中检测到blaOXA-48、blaKPC-2、blaNDM-1、blaCMY、blaVIM等其他类型的β-内酰胺类耐药基因,主要的β-内酰胺基因组合形式是blaTEM-1+blaCTX-M-15,而在ST131中主要的组合形式是blaOXA-1+blaCTX-M-15(32/82)。检测到的不相容性质粒的类型有9种,其中IncF型质粒的检出率较高,为95.26%(221/232),该质粒在ST131菌株中的检出率为98.78%(81/82)。菌株中IncF型复制子类型出现频率较高的是IncFIA+IncFIB+IncFII(83/232),在ST131菌株中上述复制子中检出率较高的是IncFIA+IncFII,为51.22%(42/82)。IncF型质粒经pMLST分型可获得59种型别,F36:A4:B1、F31:A4:B1、F48:A1:B49型质粒主要存在于ST131菌株和CC10克隆复合体中,而ST131菌株中主要的质粒类型是F2:A1:B-(38/82)。结论 CTX-M-15型耐药基因主要存在于ST131型别的大肠埃希菌株中,ST131菌株比其他菌株具有更强的适应能力,同种型别的质粒可以在亲缘关系相近的菌株之间传播。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 CTX-M-15 MLST 质粒分型
中国高校控烟建设项目管理者吸烟现况调查
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作者 冯丽云 黄婷 +1 位作者 吴晓跃 乔岩 《中国公共卫生》 CSCD 北大核心 2017年第5期718-720,共3页
目的 调查“中国高校控烟倡导能力建设项目”的91所院校的管理者吸烟现况,对高校培养学生控烟能力的影响因素进行分析。方法 于2015年3—4月,采用电话随访,对象包括院长、科研副院长和办公室主任,主要内容是否吸烟。吸烟率比较采用χ2... 目的 调查“中国高校控烟倡导能力建设项目”的91所院校的管理者吸烟现况,对高校培养学生控烟能力的影响因素进行分析。方法 于2015年3—4月,采用电话随访,对象包括院长、科研副院长和办公室主任,主要内容是否吸烟。吸烟率比较采用χ2检验。结果 失访2所,共89所院校,应答率为97.8%;被调查对象共计267人,不同时间进入项目的管理者平均吸烟率无差异(χ2=3.644,P=0.162),3个职位之间的吸烟率无差异(χ2=2.925,P=0.232),总吸烟率为24.5%;院长占总吸烟人数的44.07%。结论 高校管理者是吸烟的高危人群,院长吸烟率较高,高于一般人群吸烟率21.3%,影响高校无烟校园创建和学生控烟倡导能力建设的推进。 展开更多
关键词 电话随访 高校管理者 吸烟率 控烟倡导
深圳市2011-2014年孕妇乙型肝炎病毒感染状况分析 被引量:7
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作者 鲍雪琴 单芙香 +6 位作者 路滟 吕秋莹 符霞 王兴鲍 洪烈城 魏雅臻 程锦泉 《中华疾病控制杂志》 CSCD 北大核心 2017年第4期336-339,共4页
目的了解2011-2014年深圳市孕妇乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染状况,为预防和控制乙型肝炎(简称乙肝)母婴传播提供科学依据。方法对到助产机构初次进行产前检查的孕妇免费检测乙肝两对半,并由助产机构责任医生将孕妇的基... 目的了解2011-2014年深圳市孕妇乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染状况,为预防和控制乙型肝炎(简称乙肝)母婴传播提供科学依据。方法对到助产机构初次进行产前检查的孕妇免费检测乙肝两对半,并由助产机构责任医生将孕妇的基本信息及检测结果录入自主研发的信息管理系统,通过SPSS 19.0进行统计分析。结果深圳市孕妇乙肝表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)阳性率、乙肝表面抗体(antibody to hepatitis B surface antigen,抗-HBs)阳性率、乙肝病毒e抗原(hepatitis B e antigen,HBeAg)阳性率、乙肝病毒e抗体(antibody to hepatitis B e antigen,抗-HBe)阳性率及乙肝病毒c抗体(antibody to hepatitis B core antigen,抗-HBc)阳性率分别为8.40%、47.84%、3.11%、12.28%、21.24%。不同年份、户籍类型、年龄、文化程度和职业的孕妇HBsAg、抗-HBs、HBeAg、抗-HBe和抗-HBc这五项指标阳性率之间的差异均有统计学意义(均有P〈0.001)。结论深圳市孕妇HBsAg阳性率仍高于全国水平,半数以上孕妇没有检测到抗-HBs,流动人口孕妇HBV感染状况较常住人口严重。加强深圳市孕妇的免疫接种和查漏补种,有助于控制乙肝母婴传播。 展开更多
关键词 孕妇 肝炎 乙型 慢性 感染
“四全照顾”在恶液质治疗中的作用 预览 被引量:1
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作者 彭瑞 郭巧云 宋春花 《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2017年第3期253-257,共5页
恶液质是一种以浪费型代谢为主的状态,多发生于肿瘤及其他重大慢性病,严重降低患者的生存率和生存质量。虽然恶液质的研究一直在进展,但是到目前为止,其机制尚未阐明,尚且没有有效的手段可以彻底治愈恶液质。"四全照顾"不仅是对患者... 恶液质是一种以浪费型代谢为主的状态,多发生于肿瘤及其他重大慢性病,严重降低患者的生存率和生存质量。虽然恶液质的研究一直在进展,但是到目前为止,其机制尚未阐明,尚且没有有效的手段可以彻底治愈恶液质。"四全照顾"不仅是对患者身、心、灵的照顾,也是对患者从发病到去世的全程照顾;不仅包括对患者的照顾,还包括对其家属的关怀;不仅由医生、护士进行疗护,心理师、营养师等人员也参与组成专业的照顾团队。恶液质具有不可逆的终末性质,为了提高恶液质患者的生存质量,"四全照顾"需要被运用到恶液质的治疗中。"四全照顾"不仅能有效舒缓患者和家属的身心痛苦和精神压力,而且具有深远的社会意义,有利于社会和谐、稳定。但是与此同时,"四全照顾"在我国的发展程度有限,发展水平在世界上处于落后地位,一些现实问题如生命自主权的选择、有限的社会认可和政策支持,需要我们积极地去面对和解决。本文就"四全照顾"在恶液质治疗中的作用做一综述,为"四全照顾"运用于恶液质治疗在我国的发展和推广提供理论依据。 展开更多
关键词 四全照顾 恶液质 肿瘤
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医学硕士科学与专业学位研究生培养现状调查与分析 预览 被引量:5
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作者 王重建 李玉倩 +5 位作者 周浩 王旗 李琳琳 崔玲玲 贾正国 孙长青 《河南医学研究》 CAS 2016年第8期1350-1353,共4页
目的了解医学硕士科学与专业学位研究生的培养现状,为医学硕士研究生培养质量评价提供参考依据。方法以河南某大学医学院2015届即将毕业的396名医学硕士研究生为研究对象,通过问卷对医学硕士科学与专业学位研究的培养质量进行调查。... 目的了解医学硕士科学与专业学位研究生的培养现状,为医学硕士研究生培养质量评价提供参考依据。方法以河南某大学医学院2015届即将毕业的396名医学硕士研究生为研究对象,通过问卷对医学硕士科学与专业学位研究的培养质量进行调查。结果除社会实践参加情况和导师培养计划未见统计学差异外(P〉0.05),医学硕士科学学位研究生在课程设置、教学规章制度建设与执行、教学质量、教学质量监控、学位论文选题等级、学位毕业论文完成质量及第一作者发表中文核心/SCI文章等方面均优于专业学位研究生(P〈0.05),但在毕业后出国留学/攻读博士意愿方面,专业学位研究生高于科学学位研究生(P〈0.05);自主选择学位类型与所在学位类型一致性方面,医学硕士研究生的总一致率为72.0%,但临床医学专业一致性仅为69.9%,较其他医学专业低,且倾向于选择专业学位。结论医学科学学位硕士研究生培养质量优于专业学位研究生,临床医学硕士研究生倾向于选择专业学位类型。 展开更多
关键词 医学硕士 研究生 科学学位 专业学位 培养现状
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基于CRISPR/Cas的大肠埃希菌分子标志物的监测研究 被引量:5
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作者 梁文娟 张荣光 +7 位作者 段广才 洪丽娟 张冰 郗园林 杨海燕 陈帅印 娄婷叶 赵永新 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1080-1086,共7页
目的 探讨基于CRISPR/Cas的大肠埃希菌分子标志物的监测研究。方法 通过BLAST收集GenBank数据库中135株全基因组测序大肠埃希菌、203株鸟枪法测序大肠埃希菌的CRISPR/Cas和PCR扩增、测序获得本实验室保存361株大肠埃希菌(包括38株大肠... 目的 探讨基于CRISPR/Cas的大肠埃希菌分子标志物的监测研究。方法 通过BLAST收集GenBank数据库中135株全基因组测序大肠埃希菌、203株鸟枪法测序大肠埃希菌的CRISPR/Cas和PCR扩增、测序获得本实验室保存361株大肠埃希菌(包括38株大肠埃希菌O157:H7)的CRISPR序列,应用CRISPR Finder在线软件分析CRISPR特征、DNAMAN软件进行间隔序列的比对,使用Clustal Ⅹ进行cas多序列比对和Mega 5.1软件构建系统进化树。结果 本研究以全新的视角对大肠埃希菌的CRISPR/Cas位置进行描述;结果显示,135株全基因组测序、203株鸟枪法测序和361株本实验室测序的大肠埃希菌中分别有77.04%、100.00%和75.62%的大肠埃希菌具有CRISPR1,分别有74.81%、100.00%和92.24%的大肠埃希菌具有CRISPR2,分别有11.85%、0和1.39%的大肠埃希菌具有CRISPR3和CRISPR4;GenBank数据库下载的全基因组测序的1株和本实验室测序的2株大肠埃希菌存在4个CRISPR位点;缺少cas的CRISPR1下游有插入序列存在。在699株大肠埃希菌中,8株O55:H7、180株O157:H7、8株O157:HNM、40株O104:H4、4株O145:H28有独特的CRISPR;间隔序列的缺失可发生在CRISPR中间;依据I-E和I-F的cas构建系统发育树,均可分为两类。结论 大肠埃希菌的CRISPR/Cas可能作为鉴定强毒株大肠埃希菌或者新型菌株的分子标志物。间隔序列的缺失或获得可能与噬菌体有关。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 分子标志物
静息心率与代谢综合征关系的队列研究 被引量:2
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作者 韩成义 罗新萍 +16 位作者 张明 张璐 任永成 王炳源 张红艳 杨香玉 周俊梅 赵阳 刘雪娇 张冬冬 李琳琳 王重建 尹磊 庞超 冯天平 赵景志 胡东生 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1653-1657,共5页
目的 探讨静息心率(RHR)与MS发病的关系。方法 采用整群抽样方法,选择河南省某农村地区≥18岁常住居民为研究对象。2007年7-8月和2008年7-8月进行问卷调查、体格检查、血糖及脂质谱检测。2013年7-8月和2014年7-10月进行与基线相同内... 目的 探讨静息心率(RHR)与MS发病的关系。方法 采用整群抽样方法,选择河南省某农村地区≥18岁常住居民为研究对象。2007年7-8月和2008年7-8月进行问卷调查、体格检查、血糖及脂质谱检测。2013年7-8月和2014年7-10月进行与基线相同内容的随访。结果 在平均6年的随访期间,MS累积患病率为21.89%(1 933/8 829),其中男性为16.78%(664/3 957),女性为26.05%(1 269/4 872);控制潜在的混杂因素后,以基线RHR〈60次/min组为参照,RHR 60~69、70~79、80~89和≥90次/min组发生MS的OR值(95%CI)分别为1.24(0.95~1.60)、1.42(1.10~1.84)、1.63(1.24~2.15)和1.62(1.16~2.27),其中男性分别为1.12(0.81~1.55)、1.23(0.88~1.71)、1.42(0.97~2.07)和1.84(1.09~3.11),女性分别为1.46(0.93~2.29)、1.70(1.09~2.65)、1.99(1.25~3.16)和1.78(1.06~2.98)。结论 女性MS发病风险高于男性且升高的RHR增加MS发病风险。应制定针对RHR升高的成年人群尤其是女性的MS综合干预策略和措施。 展开更多
关键词 静息心率 代谢综合征 队列研究
2型糖尿病风险评估模型的研究进展 被引量:3
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作者 张红艳 张明 +1 位作者 石文惠 胡东生 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期836-840,共5页
2型糖尿病风险评估模型可以确定预测因素,为疾病预防提供依据。建立风险评估模型需要确定预测变量,并根据合适的方法赋值或计算未来一定时间内的发病概率。多个国家和地区建立了不同人群的2型糖尿病风险评估模型,根据引入的危险因素... 2型糖尿病风险评估模型可以确定预测因素,为疾病预防提供依据。建立风险评估模型需要确定预测变量,并根据合适的方法赋值或计算未来一定时间内的发病概率。多个国家和地区建立了不同人群的2型糖尿病风险评估模型,根据引入的危险因素的异同分为非侵袭性模型和侵袭性模型。本文结合国内外评估模型的最新进展,对两类模型的应用进行探讨和总结。国外以芬兰FINDRISC非侵袭性模型和美国Framingham侵袭性模型应用最为广泛;而中国对2型糖尿病风险评估模型的研究起步较晚,侵袭性模型应用较多。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 危险因素 侵袭性模型
基于CRISPR对大肠埃希菌O157∶H7的检测 预览 被引量:3
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作者 梁文娟 张荣光 +6 位作者 段广才 王颖芳 洪丽娟 张冰 王鹏飞 郗园林 杨海燕 《西安交通大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期748-753,共6页
目的基于成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),建立对大肠埃希菌O157∶H7的新型检测方法。方法应用PCR扩增实验室保存的443株肠道细菌(310株非O157∶H7大肠埃希菌、35株大肠埃希菌O157∶H7、89株志贺菌和9株沙门菌)的CRISPR1和CRI... 目的基于成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),建立对大肠埃希菌O157∶H7的新型检测方法。方法应用PCR扩增实验室保存的443株肠道细菌(310株非O157∶H7大肠埃希菌、35株大肠埃希菌O157∶H7、89株志贺菌和9株沙门菌)的CRISPR1和CRISPR2,并将PCR产物测序;提取CRISPR database数据库中(标准法)100株肠道细菌(47株非O157∶H7大肠埃希菌、5株大肠埃希菌O157∶H7、9株志贺菌和39株沙门菌)的CRISPR1和CRISPR2序列。使用CRISPR Finder在线软件分析PCR产物测序序列和CRISPR database数据库的CRISPR序列。Clustal X软件进行间隔序列比对。比较标准法和PCR扩增CRISPR两种方法检测大肠埃希菌O157∶H7的一致性。结果共分析543株肠道细菌,其中75.6%的非O157∶H7大肠埃希菌、75.5%志贺菌、91.7%沙门菌和95%O157∶H7大肠埃希菌含有CRISPR1,其间隔序列数目为3~26、2~9、2~32、3。57.1%的非O157∶H7大肠埃希菌、77.6%志贺菌、85.4%沙门菌和100%O157∶H7大肠埃希菌含有CRISPR2,其间隔序列数目为1~20、1~6、2~27、1或4个。95%的O157∶H7大肠埃希菌的CRISPR1和90%CRISPR2分别含有3条独特间隔序列(S1-1,S1-2,S1-3)和1条独特间隔序列(S2-1)。间隔序列比对结果显示,S1-1+S1-2+S1-3和S2-1检测O157∶H7大肠埃希菌的特异性分别是100%和99.6%。标准法检测和PCR扩增CRISPR1和CRISPR2检测大肠埃希菌O157∶H7的一致性分别达99.6%和99.3%。基于CRISPR检测大肠埃希菌O157∶H7在模拟样品中的应用,结果显示在原样品大肠埃希菌O157∶H7浓度约2.3CFU/mL时,经12h增菌后即能检测出来。大肠埃希菌O157∶H7聚类分析显示,40株O157∶H7大肠埃希菌可分为3类。结论基于CRISPR的大肠埃希菌O157∶H7的检测方法,可以作为监测大肠埃希菌O157∶H7感染和高毒株大肠埃希菌O157∶H7有价值的流行病学工具。 展开更多
关键词 大肠埃希菌O157∶H7 成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR) 聚合酶链反应 检测
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CRISPR/Cas系统间隔序列同源质粒耐药信息与志贺菌耐药的关系 被引量:7
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作者 张冰 王鹏飞 +6 位作者 段广才 梁文娟 洪丽娟 王琳琳 郭向娇 杨海燕 郗园林 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第10期881-887,共7页
目的比较志贺菌耐药信息与其spacer同源质粒或噬菌体耐药信息的关系。方法应用CRISPR Target和BLAST寻找spacer同源质粒和噬菌体,根据登记号在NCBI或GenBank中寻找目标质粒或噬菌体上的耐药信息;应用Bioedit软件寻找GenBank中志贺菌的... 目的比较志贺菌耐药信息与其spacer同源质粒或噬菌体耐药信息的关系。方法应用CRISPR Target和BLAST寻找spacer同源质粒和噬菌体,根据登记号在NCBI或GenBank中寻找目标质粒或噬菌体上的耐药信息;应用Bioedit软件寻找GenBank中志贺菌的的耐药信息。结果数据库及临床分离株志贺菌共52条spacer中有7个spacer与4个携带耐药基因的质粒同源;间隔序列CRISPR2-mel-3同源质粒pUMNF18_IncFV及携带该间隔序列的志贺菌mel-ss1998011/zz、mel-ss1998024/zz、mel-sf2005082/sx、mel-sf2013004/bj均含有相同耐药基因blaTEM、aadA2和dfrA12,间隔序列CRISPR-Q1-S1、CRISPR-Q4-S1同源的质粒pM5A24P及该间隔序列所在志贺菌sd1012均携带耐药基因ampC和tetB;间隔序列CRISPR3-mel-33同源质粒plasmid:5与该间隔序列所在志贺菌mel-sf2000102/zz均携带相同耐药基因ampH、mrdA,且二者均携带毒力相关基因yafO、yafN、virK、ldrB、ychO。该质粒上还存在I-F型CRISPR/Cas系统。结论志贺菌spacer同源质粒与该菌耐药信息分布存在相似性;CRISPR可能对志贺菌的耐药和毒力实现共调控。因此推测在最初前间隔序列整合到CRISPR基因座形成一个新的间隔序列的过程中,志贺菌可能将携带前间隔序列外源遗传物质的其他基因片段如耐药基因和毒力基因也整合到志贺菌基因组中,影响其生存及性状。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇规律间隔短回文重复序列 间隔序列 耐药
临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系 被引量:6
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作者 郭向娇 王颖芳 +4 位作者 段广才 王琳琳 王鹏飞 杨海燕 郗园林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期543-549,共7页
【目的】了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系。【方法】以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基... 【目的】了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系。【方法】以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测。对CRISPR1的PCR结果进行测序,并用CRISPRfinder在线软件对CRISPR1基因座进行分析。通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系。【结果】测序结果显示,CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高;57株志贺菌中,84.2%(48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统,其中68.8%(33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和)cse2基因中发现插入序列;毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100%、100%、98.2%和87.7%;毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P〉0.05)。【结论】CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中;部分cas基因中有插入序列;并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关。 展开更多
关键词 志贺菌 CRISPR/Cas系统 聚合酶链式反应 插入序列 毒力基因
两类医疗机构医务人员结核病职业防护现况对比研究
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作者 卢洁 王一然 +5 位作者 赵鲜丽 郝义彬 王晓楠 刘建民 王屹 周枫 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1174-1176,共3页
目的对比分析综合性医院、传染病防治医院的医务人员对结核病知识的知晓水平、职业防治行为,探讨两类医疗机构结核职业防护的管理策略。方法用横断面研究的方法,对河南某市一综合性医院和一传染病医院医务人员作结核医院管理现状的问... 目的对比分析综合性医院、传染病防治医院的医务人员对结核病知识的知晓水平、职业防治行为,探讨两类医疗机构结核职业防护的管理策略。方法用横断面研究的方法,对河南某市一综合性医院和一传染病医院医务人员作结核医院管理现状的问卷调查,内容包括结核知识知晓、职业防护行为等,对纳入对象作结核菌素皮肤(tuberculin skin test,TST)试验或收集既往TST检测结果。结果综合性医院、传染病医院完成问卷调查的对象分别是333人、398人,有TsT检测结果的分别是325人、312人;综合性医院人员TST阳性率(34.2%)低于传染病医院(48.7%)(x^2=13.93,P〈0.001)。综合性医院人员对9个结核知识单项的正答率除一项外均低于传染病医院(均有P〈0.05);对职业防护各项措施的使用率低于传染病医院(P〈0.001);两医院对医院防护口罩的使用率均极低。结论两类医疗机构,尤其是综合性医院应重视医务人员结核杆菌感染的医院管理,以降低其医务人员结核感染的职业风险。 展开更多
关键词 广泛耐药结核 医务人员 职业卫生
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