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Mindray BC6900网织红细胞参数参考区间的建立及与手工法检测的比较 预览
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作者 周露露 陈燕 徐卫益 《实验与检验医学》 CAS 2019年第4期635-637,共3页
目的 Mindray BC6900(仪器法)检测外周血网织红细胞(reticulocyte,RET)参数的参考区间建立及探讨仪器法与手工显微镜镜检法(手工法)检测网织红细胞结果的相关性。方法留取来我院体检的390例健康受试者外周抗凝血,用Mindray BC6900全自... 目的 Mindray BC6900(仪器法)检测外周血网织红细胞(reticulocyte,RET)参数的参考区间建立及探讨仪器法与手工显微镜镜检法(手工法)检测网织红细胞结果的相关性。方法留取来我院体检的390例健康受试者外周抗凝血,用Mindray BC6900全自动血液分析仪检测网织红细胞及其它相关参数,并参照美国临床和实验室标准化协会(CLSI)C28-A3文件推荐方法建立参考区间。采用仪器法与手工法检测73例临床患者的网织红细胞。数据采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 RET%的参考区间:男性(0.60~1.82)%,女性(0.60~1.77)%;RET#的参考区间:男性(0.024~0.082)×1012/L,女(0.029~0.092)×1012/L;未成熟网织红细胞比率(immature reticulocyte fraction,IRF)、低荧光网织红细胞比率(low fluorescence ratio,LFR)、中荧光网织红细胞比率(middle fluorescence ratio,MFR)、高荧光网织红细胞比率(high fluorescence ratio,HFR)的参考区间男性分别为2.4~14.5%、83.3~97.5%、2.4~13.9%、0~1.3%;女性分别为2.9~13.3%、86.7~97.2%、2.9~12.2%、0~1.0%。仪器法与手工法检测RET%的相关系数为0.965,相关性良好。结论建立Mindray BC6900全自动血液分析仪成人网织红细胞相关参数的参考区间,为临床疾病的诊断、鉴别诊断、预后及疗效观察提供辅助诊断依据;仪器法与手工法检测RET%具有良好的相关性,仪器法效率高、准确度高,可以广泛运用于临床实验室检测。 展开更多
关键词 MindrayBC6900 网织红细胞 参考区间 相关性
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经肠道播散诱导内源性感染小鼠模型的建立及评价 预览
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作者 叶先飞 陈丽 +2 位作者 王若南 葛超荣 陈瑜 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期291-297,共7页
目的建立经肠道播散诱导发生内源性感染的小鼠模型,为研究肠道微生态与内源性感染的相关机制提供可靠的实验模型。方法24只ICR雌性小鼠随机分为模型组A、模型组B和对照组C。模型组A给予广谱抗生素溶液口服破坏肠道正常菌群后尾静脉注射5... 目的建立经肠道播散诱导发生内源性感染的小鼠模型,为研究肠道微生态与内源性感染的相关机制提供可靠的实验模型。方法24只ICR雌性小鼠随机分为模型组A、模型组B和对照组C。模型组A给予广谱抗生素溶液口服破坏肠道正常菌群后尾静脉注射5-氟尿嘧啶(5-FU)进行免疫抑制。在模型组A的基础上给予白假丝酵母菌灌胃引入机会性致病菌即为模型组B。对照组C同等方法给予生理盐水处理。实验过程中持续观察小鼠粪便菌群变化,平板计数法检测小鼠组织载菌量,HE染色观察小鼠肺、肝、盲肠和大肠组织病理变化,荧光定量PCR法观察小鼠肠道主要菌群定量变化。结果实验终点时模型组A小鼠组织器官均出现细菌感染,模型组B小鼠表现为细菌和真菌混合感染。两模型组小鼠肺和肝脏组织器官均表现为典型的炎症表现,而盲肠和大肠表现为黏膜炎症和屏障完整性被破坏。肠道菌群定量结果显示两模型组肠道主要菌群结构发生紊乱,肠道定植抗力下降,B/E值<1。结论在小鼠肠道菌群紊乱和免疫抑制的条件下,肠道致病菌或机会致病菌突破肠道黏膜屏障引起组织器官感染,该模型能够为从肠道微生态方面预防及控制内源性感染的研究提供可靠的模型基础。 展开更多
关键词 内源性感染 动物模型 抗生素 肠道菌群
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人血浆百草枯高效液相色谱-串联质谱法的建立与评价 预览
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作者 王佳嫄 郑书发 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS 2019年第3期177-182,共6页
目的 建立测定人血浆百草枯浓度的高效液相色谱-串联质谱法并评价。方法 用甲醇蛋白质沉淀法对血浆样品预处理后,以乙腈-水(含200mmol/L甲酸铵和0.1%甲酸)为流动相梯度进样,流速为0.4mL/min。通过色谱柱(WatersXBridgeBEHHILIC,2.5μm,2... 目的 建立测定人血浆百草枯浓度的高效液相色谱-串联质谱法并评价。方法 用甲醇蛋白质沉淀法对血浆样品预处理后,以乙腈-水(含200mmol/L甲酸铵和0.1%甲酸)为流动相梯度进样,流速为0.4mL/min。通过色谱柱(WatersXBridgeBEHHILIC,2.5μm,2.1mm×100mm)分离样品。以ESI正离子模式、多反应离子监测(MRM)模式监测百草枯(m/z186.1→171.1作为定量离子对)。用该方法检测临床患者血浆百草枯浓度,用ROC曲线评价血浆百草枯浓度和百草枯中毒严重指数(SIPP)对临床结局的判断价值。结果 血浆百草枯浓度在50~10000ng/mL时,线性关系良好(R^2=0.997),最低定量下限为50ng/mL。低(100ng/mL)、中(2000ng/mL)、高(8000ng/mL)3个浓度水平质控品的不精密度均符合要求,且无基质效应。处理后样品室温放置6h内稳定,样本反复冻融3次对结果无影响。31例中毒患者SIPP为17.76(0.30~90.91)h·mg/L,死亡组SIPP高于存活组(P<0.05)。SIPP的ROC曲线下面积为0.889,最佳临床临界值为11.679h·mg/L。结论 本法灵敏、准确、快速、特异性好,适用于临床检测百草枯中毒患者。 展开更多
关键词 百草枯 高效液相色谱三重四级杆串联质谱 百草枯中毒严重指数
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苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者病毒检测及临床特征分析
4
作者 何佳慧 崔大伟 +5 位作者 杨先知 谢国良 郑书发 余斐 董月皎 陈瑜 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2019年第3期315-319,共5页
目的分析苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者常见病毒及患儿临床特征,为婴幼儿急性腹泻的流行病学研究和临床治疗提供参考。方法选取2010至2014年苏浙闽地区多家医院门诊就诊的急性腹泻患儿1 452例,采用ELISA法检测A组轮状病毒(HRV),多重PCR... 目的分析苏浙闽地区婴幼儿急性腹泻患者常见病毒及患儿临床特征,为婴幼儿急性腹泻的流行病学研究和临床治疗提供参考。方法选取2010至2014年苏浙闽地区多家医院门诊就诊的急性腹泻患儿1 452例,采用ELISA法检测A组轮状病毒(HRV),多重PCR法检测诺如病毒(NoV)、肠道腺病毒(EAdV)和星状病毒(HAstV),并用RT-PCR法对A组轮状病毒阳性的样本进行G和P分型。结果 1 452例患儿中由常见病毒引起的急性腹泻患儿有707例,占总调查患者的48.69%。急性腹泻患儿常见病毒感染中单一病毒感染占90.10%(637/707),其感染病毒的构成以轮状病毒最多(47.52%,336/707),其次为诺如病毒(36.07%,255/707)以及星状病毒(2.40%,17/707)和肠道腺病毒(4.10%,29/707)。病毒感染腹泻患儿中多重感染者共70例,占9.90%(70/707),以A组轮状病毒合并诺如病毒感染最为常见,占多重感染者的68.57%(48/70)。226份A组轮状病毒阳性标本中,G分型以G1为优势分型,占33.19%;P分型中则以P [11]比例最高,占38.50%;G、P型组合以P [11]G11为主(38.50%)。结论 A组轮状病毒是引发婴幼儿急性腹泻的主要病毒,诺如病毒次之,且婴幼儿病毒性腹泻患者可合并多种病毒感染。不同地区腹泻患儿病毒感染阳性率有差异,轮状病毒基因型表现则具有多样性。 展开更多
关键词 婴幼儿 急性腹泻 临床特征
流感病毒对神经氨酸酶抑制剂耐药性的研究进展 被引量:1
5
作者 包佳琪 王晓晨 +2 位作者 邹迁达 郑书发 陈瑜 《中华临床感染病杂志》 2018年第6期473-480,共8页
流感病毒是流行性感冒的病原体,该类病毒传播速度快、感染性强,对公共卫生造成重大威胁。目前,一线抗流感病毒药物神经氨酸酶抑制剂已在临床上广泛使用,相应的耐药株逐渐出现,为流感的防治带来困难。本文对流感病毒结构特点、耐药分子... 流感病毒是流行性感冒的病原体,该类病毒传播速度快、感染性强,对公共卫生造成重大威胁。目前,一线抗流感病毒药物神经氨酸酶抑制剂已在临床上广泛使用,相应的耐药株逐渐出现,为流感的防治带来困难。本文对流感病毒结构特点、耐药分子机制、耐药株流行现状和耐药性检测方法作了综述,旨在为今后的流感病毒耐药性研究和临床用药提供参考。 展开更多
关键词 流感病毒A型 流感病毒B型 流感病毒C型 神经氨酸酶抑制剂 耐药 突变
2016年浙江省急性胃肠炎患者诺如病毒的分子流行病学特征分析 预览 被引量:3
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作者 陈伟萍 崔大伟 +3 位作者 杨先知 郑书发 谢国良 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第4期304-308,共5页
目的探讨2016年浙江省急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学和基因特征。方法收集2016年1月至12月共1 308份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便标本,用一步法双重荧光RT-PCR技术检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型,用分层抽样抽取阳性标本核酸... 目的探讨2016年浙江省急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学和基因特征。方法收集2016年1月至12月共1 308份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便标本,用一步法双重荧光RT-PCR技术检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型,用分层抽样抽取阳性标本核酸进行普通RT-PCR扩增,并对扩增产物进行测序分析。结果诺如病毒阳性率为10.55%(138/1 308),其中GⅠ型12例,GⅡ型118例,GⅠ/GⅡ型混合感染8例。诺如病毒在不同年龄组的阳性率随患者年龄上升而下降,以≥60岁组最低;不同性别组间的阳性率差异无统计学意义;诺如病毒感染全年分布,其中12月阳性率达到顶峰,为37.50%。测序结果显示GⅠ的基因亚型主要是GⅠ.6;GⅡ的基因亚型以GⅡ.4与GⅡ.17为主,分别占40.91%(18/44)和34.09%(15/44)。结论诺如病毒是引起2016年浙江省急性胃肠炎的重要病原体,且GⅡ.4和GⅡ.17是主要的基因亚型。 展开更多
关键词 诺如病毒 急性胃肠炎 基因型
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2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型HA和NA基因的分子特征分析 预览 被引量:3
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作者 鄢翠林 崔大伟 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第1期66-69,共4页
目的探讨2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的分子特征,为甲型流感病毒H3N2亚型的防控提供科学依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)中获得我国2016~2017年... 目的探讨2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的分子特征,为甲型流感病毒H3N2亚型的防控提供科学依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)中获得我国2016~2017年分离的525株甲型流感病毒H3N2亚型病毒和13株H3N2亚型参考株的HA和NA基因序列。应用MEGA 6.0软件分析HA和NA的分子进化特征、氨基酸位点和耐药位点的变异情况。结果进化树分析显示13株参考株之间HA和NA氨基酸的同源性均为96.9%~99.1%。2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型的病毒株HA和NA氨基酸序列之间同源性均为96.3%~100%,HA和NA的优势亚分支均为3C.2a.1,相当一部分毒株分型不够明确。HA氨基酸变异分析显示9株发生N121E突变,103株发生N121K的突变且主要来源于2017年的香港毒株;182株发生G/R142K突变;A/Hong_Kong/3079/2017-HA和A/Guangdong-Chengguan/1383/2017-HA均发生A128I突变;NA蛋白仅3株(A/Hunan-Suxian/1980/2016-NA、A/Hunan-Yuhua/11799/2016-NA和A/Ningxia-Yuanzhou/1657/2016-NA)发现H275Y耐药位点突变。结论 2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型的HA和NA蛋白与参考株间存在一定的差异,优势亚型均为3C.2a.1;与病毒的毒力及药物相关的部分关键氨基酸位点发生变异。应密切关注H3N2病毒的分子特征,为其防控提供参考。 展开更多
关键词 甲型流感病毒H3N2亚型 血凝素 神经氨酸酶 分子特征
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手足口病患儿细胞因子水平及免疫球蛋白的变化及其临床意义 被引量:4
8
作者 毛其芬 崔大伟 +5 位作者 杨先知 谢国良 王伟 吴亦栋 郭希超 陈瑜 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第3期305-308,312共5页
目的探讨不同病情的手足口病患儿(HFMD)主要细胞因子及免疫球蛋白IgM、IgG、IgA的表达水平及其变化的临床意义。方法收集HFMD患儿50例,根据病情分为重症组12例,轻症组38例,另外选取同龄健康者15例为对照组。应用液相芯片分析平台检测I... 目的探讨不同病情的手足口病患儿(HFMD)主要细胞因子及免疫球蛋白IgM、IgG、IgA的表达水平及其变化的临床意义。方法收集HFMD患儿50例,根据病情分为重症组12例,轻症组38例,另外选取同龄健康者15例为对照组。应用液相芯片分析平台检测IL-4、IL-6、IL-10、IL-17A、TNF-α、IGF-β水平;实时荧光定量PCR检测上述细胞因子mRNA表达水平;免疫比浊法检测免疫球蛋白IgM、IgG、IgA的水平。结果重症组患儿血清各细胞因子水平显著高于轻症组及对照组(P〈0.05);重症组患儿外周血单个核细胞表达的各细胞因子mRNA水平显著高于轻症组(P〈0.05);重症组及轻症组血清免疫球蛋白IgM、IgG、IgA的水平较对照组明显下降(P〈0.05);重症组与轻症组间免疫球蛋白水平无明显差异(P〉0.05)。结论HFMD患儿存在细胞因子水平的改变,体液免疫功能低下,这些变化可能参与HFMD病情的发展。 展开更多
关键词 手足口病 细胞因子 免疫球蛋白
双重荧光定量PCR检测志贺毒素stx1和stx2基因
9
作者 陆芸 王若南 +3 位作者 谢国良 余斐 郑书发 陈晓 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第5期591-593,597共4页
目的建立一种双重荧光定量PCR检测志贺毒素stx1和stx2基因的方法。方法根据不同细菌来源的stx1和stx2序列,设计PCR引物和TaqMan探针,建立双重实时荧光定量PCR检测体系,进行灵敏度、特异性和重复性评价,并对腹泻患者粪便样本进行检测分... 目的建立一种双重荧光定量PCR检测志贺毒素stx1和stx2基因的方法。方法根据不同细菌来源的stx1和stx2序列,设计PCR引物和TaqMan探针,建立双重实时荧光定量PCR检测体系,进行灵敏度、特异性和重复性评价,并对腹泻患者粪便样本进行检测分析。结果双重实时荧光定量PCR检测含志贺毒素基因重组质粒的最低检测下限为102 copies/mL;该法对12种常见肠道病原菌均无特异性扩增,对不同浓度的标准质粒检测重复性高,Ct值变异系数均小于10%;对急性腹泻粪便标本的检测阳性率高于细菌分离培养。结论建立的双重实时荧光定量PCR可作为不同细菌来源的志贺毒素基因的快速鉴定方法,亦可用于人感染性腹泻标本的快速筛查。 展开更多
关键词 志贺毒素 stx1 stx2 实时荧光定量PCR
标本类型和储存条件对促肾上腺皮质激素检测结果稳定性的影响 预览
10
作者 董敏雅 杨东蕾 姚一帆 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第21期2982-2983,2987共3页
目的探讨标本类型和储存条件对促肾上腺皮质激素(ACTH)检测结果稳定性的影响。方法将标本分成血浆组和血清组,每组各57例,并在抽血后1h内检测ACTH浓度。在血浆组中选取30例血浆量充足的标本分成室温组、冷藏组和冷冻组,每组各30例,其... 目的探讨标本类型和储存条件对促肾上腺皮质激素(ACTH)检测结果稳定性的影响。方法将标本分成血浆组和血清组,每组各57例,并在抽血后1h内检测ACTH浓度。在血浆组中选取30例血浆量充足的标本分成室温组、冷藏组和冷冻组,每组各30例,其中室温组和冷藏组在2、24、121h时检测ACTH浓度,冷冻组在24、121h时检测ACTH浓度。检测结果与设定的标准值进行比较分析。结果血清组ACTH水平明显低于血浆组,差异有统计学意义(P〈0.05)。室温组在2、24、121h时的检测结果与标准值比较差异有统计学意义(P〈0.05);冷藏组在2、24h时的检测结果与标准值比较差异无统计学意义(P〉0.05),而在121h时的检测结果与标准值比较差异有统计学意义(P〈0.05);冷冻组在24、121h时的检测结果与标准值比较差异无统计学意义(P〉0.05)。结论采用乙二胺四乙酸二钾抗凝标本检测ACTH时,在低温下应于1h内完成检测;若24h内不能完成检测时,应将分离的血浆冷冻储存于-20℃,其在121h内检测结果变化相对稳定。 展开更多
关键词 促肾上腺皮质激素 稳定性 冷藏 冷冻
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江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析
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作者 陈海江 崔大伟 +1 位作者 余景璐 陈瑜 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第7期771-775,781共6页
目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行... 目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行氨基酸置换熵值分析。结果S基因226个氨基酸位点突变分析中,产生突变有位点122个,位点突变率C基因型(45.58%)高于B基因型(30.09%)(χ^2=11.523,P=0.001);总突变率C基因型(1.36%)高于B基因型(0.80%)(χ^2=46.642,P=0.000);α决定簇突变率C基因型(2.40%)高于B基因型(0.96%)(χ^2=20.524,P=0.000)。B基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ^2=0.735,P=0.391);C基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ^2=44.467,P=0.000)。B基因型氨基酸突变最多的位点为200、213、161和21位点,C基因型氨基酸突变最多的位点为126、68、3、53和194位点。两个基因型dN/dS均值均小于1。B基因型没有发现正向选择位点,发现8个负向选择位点。C基因型发现7个正向选择位点,17个负向选择位点。B基因型仅发现一个易突变位点(200位),C基因型也仅发现一个易突变位点(126位),大多数氨基酸位点熵值〈0.4。结论江浙沪地区S基因突变率水平较低,其中C基因型位点突变率、α决定簇突变率和总突变率高于B基因型,α决定簇突变率高于总突变率。C基因型经历外界环境免疫选择压力和自身进化压力双重影响,自身进化压力强于外界环境免疫选择压力;而B基因型主要遭受自身进化压力。尤其要格外关注C基因型的进化进程。 展开更多
关键词 乙肝病毒 S基因 α决定簇突 选择压力 氨基酸置换熵值
2013-2015年杭州地区急性腹泻患者来源副溶血弧菌毒力基因及耐药性调查 被引量:6
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作者 谭焕腾 陈晓 +3 位作者 蒋俊丽 王若南 孙长贵 陈瑜 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第2期151-154,158共5页
目的对2013-2015年杭州地区腹泻患者副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)毒力基因的携带和耐药进行调查研究。方法可疑菌株用全自动细菌鉴定仪(VITEK2Compact,生物梅里埃,法国)进行鉴定,用PCR方法检测其8种毒力基因,用纸片扩散法检... 目的对2013-2015年杭州地区腹泻患者副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)毒力基因的携带和耐药进行调查研究。方法可疑菌株用全自动细菌鉴定仪(VITEK2Compact,生物梅里埃,法国)进行鉴定,用PCR方法检测其8种毒力基因,用纸片扩散法检测13种抗生素的敏感性。结果 120株副溶血弧菌中,tdh+或trh+的致病菌株占95.0%(114株),tdh-且trh-的非致病株占5.0%(6株)。所有120株副溶血弧菌均含有T3SS1基因,T3SS2α基因主要存在于tdh+/trh-的菌株中,T3SS2β存在于trh+的菌株中,2株tdh-的菌株首次检出T3SS2α基因。本研究中大流行菌株占64.2%(77株),非大流行菌株占35.8%(43株)。多达65.8%的副溶血弧菌对氨苄西林耐药,而90.0%以上的副溶血弧菌对其他抗生素包括喹诺酮类、第三代头孢菌素类、氨基糖苷类、四环素类和磺胺类抗菌药物较敏感。结论杭州地区腹泻来源的副溶血弧菌多为大流行菌株,对常见抗菌药物敏感性高,但耐药率有所上升,要加强监测并引起临床重视。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 TDH TRH T3SS 耐药性
血清曲霉菌特异性IgE检测在变态反应性支气管肺曲霉病诊断中的应用 预览 被引量:1
13
作者 楼滨 徐珍 范剑 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第19期2733-2735,共3页
变态反应性支气管肺曲霉病(ABPA)是由寄生于支气管内的曲霉菌抗原引起的过敏性反应,常合并于哮喘和囊性纤维化的患者,临床及影像学表现多样化,临床表现为难以控制的哮喘、反复发生的肺部浸润和支气管扩张,其病原菌包括烟曲霉菌、
关键词 变态反应性支气管肺曲霉病 曲霉菌 特异性IGE
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浙江省柯萨奇病毒A16 VP1基因特征分析及B细胞抗原表位预测 预览 被引量:2
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作者 徐莉 崔大伟 +7 位作者 戴玉柱 王磊 杨先知 谢国良 郑书发 孙长贵 成军 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2017年第1期65-71,共7页
目的了解浙江省柯萨奇病毒A16(CA16)VP1基因特征及其变迁规律并预测VP1蛋白上B细胞抗原表位。方法在Gen Bank检索并下载35个浙江省CA16流行株及69个已知基因型CA16参考株的VP1基因序列,使用MEGA 6.0软件进行比对分析和构建种系进化树... 目的了解浙江省柯萨奇病毒A16(CA16)VP1基因特征及其变迁规律并预测VP1蛋白上B细胞抗原表位。方法在Gen Bank检索并下载35个浙江省CA16流行株及69个已知基因型CA16参考株的VP1基因序列,使用MEGA 6.0软件进行比对分析和构建种系进化树,确定浙江省CA16流行株的基因型,并分析VP1核苷酸和氨基酸同源性及氨基酸变异;运用DNA Star中的Protean模块预测VP1上可能的线性B淋巴细胞抗原表位。结果浙江省CA16病毒基因型为B1基因型(34株)和A基因型(1株)。B1型中以B1b亚型(24株)占绝对优势,其次为B1a亚型(10株)。浙江省CA16流行株VP1核苷酸和氨基酸同源性分别为75.5%-100%和89.5%-100%;VP1区氨基酸序列高度保守,但也存在部分变异。VP1中可能的B细胞抗原表位(氨基酸肽段)有13个,分别为10-20、30-38、57-62、73-79、98-106、118-123、159-168、173-177、184-189、240-246、265-273、274-284和289-295。结论浙江省CA16流行株存在A、B1 2个基因型,B1b和B1a为主要基因型,其VP1区氨基酸变异程度较低,VP1中13个预测的B细胞抗原表位可为CA16疫苗的研制提供科学依据。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A16 VP1 基因特征 氨基酸变异 B细胞抗原表位
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急性腹泻患者致泻性大肠埃希菌流行情况及耐药性分析 被引量:3
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作者 蒋俊丽 陈晓 +2 位作者 叶先飞 王若南 陈瑜 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第6期689-693,共5页
目的了解致泻性大肠埃希菌(DEC)在急性腹泻患者中的分布及对常用抗菌药物的敏感性,为疾病的防控和治疗提供依据。方法收集2014年1月至2015年12月期间就诊于浙江大学医学院附属第一医院急性腹泻患者粪便标本,采用常规病原菌检验流程对... 目的了解致泻性大肠埃希菌(DEC)在急性腹泻患者中的分布及对常用抗菌药物的敏感性,为疾病的防控和治疗提供依据。方法收集2014年1月至2015年12月期间就诊于浙江大学医学院附属第一医院急性腹泻患者粪便标本,采用常规病原菌检验流程对常见肠道致病菌进行分离培养鉴定,分离到的疑似大肠埃希菌采用多重PCR和单重PCR进行鉴定、分型,采用纸片扩散法(K-B法)对各型DEC进行18种常用药物敏感试验。结果从1 019例急性腹泻患者标本中分离到396株病原菌,其中DEC230株,分离率为22.6%,占所有分离菌株的58.1%,居病原菌首位。230株DEC中,ETEC占56.5%,EAEC占30.4%,EPEC占8.7%,STEC占0.4%,混合型DEC占0.9%,未发现EIEC。各型DEC全年均有检出,其中夏季(6~8月)分离率最高,达24.0%,患者主要分布在19~45岁,男女检出率分别为21.8%和23.2%,差异无统计学意义。DEC对氨苄西林的耐药率最高,达49.3%,对头孢唑林、复方新诺明、氨苄西林/舒巴坦的耐药率分别为46.4%、35.7%、30.9%,其余抗菌药物耐药率均低于15.0%,未出现亚胺培南耐药株。207株DEC中,产ESBLs菌株占41.1%,多重耐药菌株占44.9%。结论 DEC是本地区急性腹泻最常见的细菌性病原,是临床肠道感染中不可忽视的病原之一,尤其是同时携带多型别毒力基因菌株及产ESBLs菌株和多重耐药菌。长期持续监测其分布及耐药趋势,对疾病的预防、治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 急性腹泻 致泻性大肠埃希菌 毒力基因 抗菌药物敏感性
浙江省麻疹病毒的基因特征分析 被引量:1
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作者 孙海燕 崔大伟 童海江 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期30-36,共7页
目的分析浙江省流行的麻疹病毒(MV)的基因特征,为更好地防控麻疹提供科学参考。方法从GenBank检索并下载浙江省所有麻疹病毒株、中国麻疹疫苗株和WHO推荐参考株的血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)的基因组序列,利用MEGA 6.0软件进行比对... 目的分析浙江省流行的麻疹病毒(MV)的基因特征,为更好地防控麻疹提供科学参考。方法从GenBank检索并下载浙江省所有麻疹病毒株、中国麻疹疫苗株和WHO推荐参考株的血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)的基因组序列,利用MEGA 6.0软件进行比对分析,构建种系进化树,确定浙江省麻疹病毒流行的基因型别,并进行同源性和基因变异分析。结果浙江省麻疹病毒以H1基因型为主(27株),其他基因型为辅(2株B3型)。H1a亚型(21/27)占绝对优势,其次为H1b亚型(6/27)。浙江省所有毒株间H蛋白的氨基酸同源性为96.9%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191和Changchun-47的同源性均为95.0%~96.0%。浙江省所有毒株间N蛋白羧基末端的氨基酸同源性为82.7%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191的同源性为85.8%~89.5%,与疫苗株Changchun-47的同源性为87.3%~91.0%。结论麻疹病毒H1基因型为浙江省麻疹流行的优势株,与现行参考疫苗株(A基因型)差异较大,因此针对麻疹病毒H1基因型疫苗的研制是今后浙江省麻疹病毒防控的关键。 展开更多
关键词 麻疹病毒 基因特征 进化树 变异
江浙沪地区EV71的分子流行病学特征
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作者 王磊 崔大伟 +5 位作者 戴玉柱 徐莉 杨先知 谢国良 郑书发 陈瑜 《中华医院感染学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第19期4321-4324,共4页
目的研究江浙沪地区EV71-VP1遗传变异特征,了解江浙沪地区EV71病毒基因突变及抗原变异规律,为EV71的预防、治疗提供帮助。方法从GenBank上下载了江浙沪地区2009-2014年共79株EV71的VP1区段序列与各亚型参考株序列,用MEGA7.0软件构建进化... 目的研究江浙沪地区EV71-VP1遗传变异特征,了解江浙沪地区EV71病毒基因突变及抗原变异规律,为EV71的预防、治疗提供帮助。方法从GenBank上下载了江浙沪地区2009-2014年共79株EV71的VP1区段序列与各亚型参考株序列,用MEGA7.0软件构建进化树,分析江浙沪地区EV71-VP1分子流行病学特征;用疫苗株FY23株做为参考株比较江浙沪地区EV71毒株的氨基酸变异情况。结果通过进化树与序列同源分析,发现79株毒株均为C4a亚型,江浙沪地区EV71毒株可分为两个大簇与数个小簇,两个大簇间没有发现明显的序列差异,江浙沪三个地区的毒株在进化树上的分布不存在明显的差异。79株毒株共存在34个氨基酸位点突变,其中与病毒致病及疫苗接种效果相关的98、145、289位点发生多株突变,7株发生了病毒与受体结合相关的E145G/Q突变,7株发生了位于病毒表面BC环内的E98K突变,5株发生了与临床症状表现相关的A289T/V突变,未发现2009-2014年有明显的EV71毒株氨基酸变异差异。结论虽然2009-2014年江浙沪地区的EV71毒株流行亚型没有改变,也不存在明显地区间的流行差异,但是病毒的基因及氨基酸突变较为多见,仍应关注该地区的病毒基因及抗原变异,以便更好的预防EV71疫情。 展开更多
关键词 EV71 C4亚型 VP1基因 进化树 突变
自身免疫性胰腺炎患者血清IgG4水平的变化及临床意义 预览 被引量:2
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作者 沈舒施 李国立 +1 位作者 陈惠 张杰 《实验与检验医学》 CAS 2017年第1期32-35,共4页
目的探讨自身免疫性胰腺炎(AIP)患者血清免疫球蛋白G亚型4(IgG4)水平的变化及临床意义。方法纳入2012年10月至2016年2月在浙江大学医学院附属第一医院就诊并进行血清IgG4检查的胰腺疾病患者232例,依据其最终临床诊断分为AIP组(45... 目的探讨自身免疫性胰腺炎(AIP)患者血清免疫球蛋白G亚型4(IgG4)水平的变化及临床意义。方法纳入2012年10月至2016年2月在浙江大学医学院附属第一医院就诊并进行血清IgG4检查的胰腺疾病患者232例,依据其最终临床诊断分为AIP组(45例)、慢性胰腺炎组(除外自身免疫性胰腺炎,54例)、急性胰腺炎组(77例)和胰腺癌组(56例),同时选择73例健康体检者作为对照组,比较各组人群血清IgG4水平之间的差异;以AIP作为疾病组绘制ROC曲线,计算IgG4用于AIP临床辅助诊断的最佳界值;同时对73例健康体检者IgG4水平进行分析,建立适合本实验室的血清IgG4参考范围。结果⑴AIP组IgG4水平(5.980±4.929g/L)明显高于慢性胰腺炎组(0.651±0.546g/L)、急性胰腺炎组(0.661±0.456g/L)、胰腺癌组(0.775±0.687g/L)和对照组(0.532±0.370g/L),差异有统计学意义(P均〈0.001);慢性胰腺炎组、急性胰腺炎组、胰腺癌组和对照组IgG4水平之间均无明显差异(P均〉0.05);⑵血清IgG4为1.535g/L时,IgG4用于AIP临床辅助诊断的曲线下面积最大,面积为0.936,此时的灵敏度为85.6%,特异性为94.2%;⑶针对73例健康体检者IgG4水平所建立的95%可信区间的上限为1.27g/L,99%可信区间的上限为1.64g/L。结论 AIP患者血清IgG4水平明显高于其他胰腺疾病患者和健康体检者,血清IgG4用于AIP的临床辅助诊断具有较高的灵敏度和特异性,基于本研究所纳入的健康体检者建立的参考区间与试剂说明书之间存在一定的差异,每个实验室应建立适合于本实验室的参考范围。 展开更多
关键词 免疫球蛋白G亚型4 自身免疫性胰腺炎 胰腺炎 胰腺癌
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杭州地区2009-2014年非结核分枝杆菌流行状况分析 被引量:12
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作者 余斐 陈晓 +1 位作者 嵇仲康 徐凯进 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2016年第7期808-810,815共4页
目的研究近6年杭州市非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)的流行状况。方法采用基因芯片和16SrRNA测序法鉴定2009年1月至2014年12月本院微生物实验室结核菌培养阳性的分离,并对相关资料进行总结分析。结果 6年间,从789... 目的研究近6年杭州市非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)的流行状况。方法采用基因芯片和16SrRNA测序法鉴定2009年1月至2014年12月本院微生物实验室结核菌培养阳性的分离,并对相关资料进行总结分析。结果 6年间,从789例患者标本中分离798株分枝杆菌(剔除重复菌株),NTM分离株171株,占21.4%,从2009年的11.9%上升到2014年的25.8%,MTB的构成比例降低和NTM比例升高的趋势有统计学意义(P=0.014)。NTM种群分布达18种,最常见的是胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌,分别占30.4%、26.3%和20.5%。NTM阳性患者中,男性占66.3%,女性占33.7%,45-74岁年龄段合计占65.5%。抗酸杆菌涂片检查阳性的病例中NTM检出率由2009年的8.0%上升到2014年的22.0%,趋势分析P=0.014。结论杭州地区分枝杆菌中NTM构成比例持续升高,2014年已达25.8%,以胞内分支杆菌、鸟分支杆菌和脓肿分支杆菌为主。开展NTM菌种鉴定,对鉴别诊断和有效治疗有重要意义。 展开更多
关键词 分枝杆菌 非结核分枝杆菌 菌种鉴定 基因芯片 16S RRNA
2009-2014年浙江省哨点医院急性腹泻患者病原监测研究 被引量:16
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作者 郑书发 余斐 +7 位作者 陈晓 崔大伟 杨先知 谢国良 王忆吟 余建兴 李中杰 陈瑜 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1084-1090,共7页
目的:分析浙江省门急诊急性腹泻患者的病原构成特征。方法2009年1月至2014年12月,选择杭州、湖州、宁波、衢州以及绍兴市的7家医院作为监测哨点,以其中的内科、儿科和感染科肠道门诊以及急诊的急性腹泻患者为研究对象,调查并记录患... 目的:分析浙江省门急诊急性腹泻患者的病原构成特征。方法2009年1月至2014年12月,选择杭州、湖州、宁波、衢州以及绍兴市的7家医院作为监测哨点,以其中的内科、儿科和感染科肠道门诊以及急诊的急性腹泻患者为研究对象,调查并记录患者个人基本信息、主要症状与体征等资料,采集患者的粪便样本(5g)进行8种细菌检测(包括霍乱弧菌、志贺菌、非伤寒沙门菌、致泻性大肠埃希菌、副溶血弧菌、气单胞菌、小肠结肠炎耶尔森菌、类志贺邻单胞菌)和5种病毒(包括轮状病毒、诺如病毒、扎如病毒、星状病毒和肠道腺病毒)检测。结果2009—2014年,共采集并检测9364例急性腹泻患者的粪便标本,腹泻病原阳性率为37.38%(3500例);单一细菌、单一病毒和多重感染总阳性率分别为13.14%(1230例)、20.75%(1943例)和3.49%(327例)。单一细菌感染者中,副溶血弧菌阳性率较高,为5.96%(558例),其次为致泻性大肠埃希菌,为3.86%(361例);单一病毒感染者中,诺如病毒和轮状病毒阳性率均较高,分别为10.73%(1005例)和8.35%(782例)。〈15岁患者以单一病毒感染者为主,阳性率为32.69%(1014例),≥15岁患者以单一细菌感染者为主,阳性率为16.86%(1056例)。单一细菌感染者中以25~34岁者为主,阳性率为18.62%(302例);单一病毒感染者中以1~4岁者为主,阳性率为41.12%(435例);多重感染者中以1~4岁者为主,阳性率为7.37%(78例)。7—9月感染单一细菌者比例较高,12月至次年3月感染单一病毒者比例较高。2009—2014年,门急诊急性腹泻患者病原谱变化较小,均以轮状病毒[22.34%(782/3500)]、诺如病毒[28.71%(1005/3500)]、副溶血弧菌[15.92%(558/3500)]、致泻大肠埃希菌[10.31%(361/3500)]为主。结论浙江省2009—2014年门急诊急性腹泻患者常见病原均有� 展开更多
关键词 腹泻 病原 监测 流行规律
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