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应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构 预览
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作者 吴欢欢 王伟继 +2 位作者 吕丁 胡玉龙 孔杰 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第4期84-94,共11页
采用基于Illumina测序平台的高通量测序技术,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼鱼肠道及其养殖水体、生物饵料中细菌种类及丰度进行研究。测序结果显示,养殖水体、生物饵料和大菱鲆幼鱼肠道等19个样品共获得有效序列547621条,可聚类于3... 采用基于Illumina测序平台的高通量测序技术,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼鱼肠道及其养殖水体、生物饵料中细菌种类及丰度进行研究。测序结果显示,养殖水体、生物饵料和大菱鲆幼鱼肠道等19个样品共获得有效序列547621条,可聚类于3771个可分类操作单元(OTUs),归属于养殖水体、生物饵料、健康幼鱼和发病幼鱼的操作分类单元(OTU)个数分别为3038、1090、87和777,其中,健康幼鱼与生物饵料、健康幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为57和0,发病幼鱼与生物饵料、发病幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为481和31。表明幼鱼肠道微生物多样性与生物饵料密切相关。根据细菌注释结果,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)在大菱鲆幼鱼肠道中占优势地位,其中,健康幼鱼肠道微生物共聚类为8个门,发病幼鱼的肠道微生物可聚类为19个门。与健康幼鱼相比,发病幼鱼肠道门水平上的3种主要优势菌群落结构出现失衡。此外,对各样品中丰度最高的100位OTU分析显示,幼鱼肠道优势菌种类与生物饵料中的优势菌种类密切相关,而每个发病幼鱼肠道优势菌种类具有一定的独立性。本研究旨在为大菱鲆健康养殖和微生态调控提供实验依据。 展开更多
关键词 生物多样性 高通量测序 大菱鲆
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基于线粒体DNA控制区序列的6个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖群体的遗传多样性分析 预览 被引量:1
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作者 刘红 张海强 +1 位作者 蔡生力 戴习林 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第1期63-73,共11页
运用线粒体DNA(mtDNA)控制区部分基因序列测序技术对6个凡纳滨对虾养殖群体(S1、S2、G1、G2、K1和Sg)的遗传多样性和系统进化关系进行了分析。结果显示,在检测到的146个单倍型中,144个为单群体特有,其余两个为群体S1和S2共享。6... 运用线粒体DNA(mtDNA)控制区部分基因序列测序技术对6个凡纳滨对虾养殖群体(S1、S2、G1、G2、K1和Sg)的遗传多样性和系统进化关系进行了分析。结果显示,在检测到的146个单倍型中,144个为单群体特有,其余两个为群体S1和S2共享。6个群体的单倍型多样性(Hd)为0.42–0.99,核苷酸多样性(π)为0.00–0.08,其中,单倍型多样性最高的是群体K1 (Hd=0.99±0.01),核苷酸多样性最高的是群体S2 (π=0.08±0.04)。综合考虑,遗传多样性最低的为群体S1 (Hd=0.42±0.08, π=0.00),遗传多样性最高的是群体S2 (Hd=0.88±0.02, π=0.08±0.04)。AMOVA分析结果显示,来自群体间的遗传差异(46.98%)略低于来自群体内的遗传差异(53.02%)。各群体间的遗传分化Fst值均为正值(0.173–0.974),表明6个群体间存在较大程度的遗传分化差异。基于遗传距离的构建的UPGMA系统进化树和基于单倍型结果构建的NJ聚类图显示,系统进化树主要分为两支:S1和S2群体聚在一起成为一支;G1和G2群体首先聚在一起,再与Sg群体聚在一起,随后与K1群体聚成另一支,6个群体单倍型的聚类关系与遗传距离的进化关系类似。进一步对群体内雌雄群体间遗传差异进行分析发现,同一群体的雌雄群体间遗传多样性水平相近,雌雄群体间基本出现轻微到明显的遗传分化;比较相同群体不同生长速率的个体的遗传参数发现,生长较快群体与生长较慢群体间可能出现一定程度的遗传分化差异;对同一公司不同时间购买的群体分析发现,购买间隔较长(7–9个月)的群体之间的遗传分化值可能会大于不同种虾公司间群体的遗传分化值。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 mtDNA控制区序列 遗传多样性 遗传分化 雌雄群体差异 生长差异
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水产饲料中外源性氨基酸的应用 预览
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作者 宋宏斌 冷向军 +2 位作者 周玉岩 张宇喆 戈蕾 《饲料工业》 北大核心 2010年第A01期 119-121,共3页
近年来,饲料工业,特别是水产饲料工业的迅速发展,导致对鱼粉的需求量不断增加,而全球鱼粉资源是有限的,特别是受今年智利地震的影响,更导致鱼粉价格一路攀升,达到历史新高。多年前就已经提出的如何减少和替代鱼粉在水产饲料中的... 近年来,饲料工业,特别是水产饲料工业的迅速发展,导致对鱼粉的需求量不断增加,而全球鱼粉资源是有限的,特别是受今年智利地震的影响,更导致鱼粉价格一路攀升,达到历史新高。多年前就已经提出的如何减少和替代鱼粉在水产饲料中的用量,再次成为行业关注的热点。以其他动植物蛋白源替代鱼粉后,在不同程度上均面临着某种或某几种必需氨基酸的缺乏问题,特别是杂粕类,如菜粕、棉粕等的大量应用, 展开更多
关键词 必需氨基酸 水产饲料 应用 外源性 替代鱼粉 饲料工业 植物蛋白源 需求量
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吡啶羧酸铬对草鱼生长和糖耐量的影响 预览 被引量:13
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作者 刘太亮 蒋明 +4 位作者 文华 袁丹宁 吴凡 刘伟 冷向军 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期 198-201,共4页
用分别添加0.0(CK)、0.2、0.4、0.8、1.6和3.2mg/kg毗啶羧酸铬的饲料投喂初始体质量为(12.78±1.16)g的草鱼10周,研究吡啶羧酸铬对草鱼生长和糖耐量的影响。结果表明,饲料中添加吡啶羧酸铬0.8mg/kg能显著提高草鱼... 用分别添加0.0(CK)、0.2、0.4、0.8、1.6和3.2mg/kg毗啶羧酸铬的饲料投喂初始体质量为(12.78±1.16)g的草鱼10周,研究吡啶羧酸铬对草鱼生长和糖耐量的影响。结果表明,饲料中添加吡啶羧酸铬0.8mg/kg能显著提高草鱼的特定生长率、蛋白质效率和蛋白质沉积率,0.8mg/kg组的饲料系数显著低于不添加铬的对照组。对照组及添加吡啶羧酸铬0.2~3.2mg/kg组血糖的最高值分别出现在灌服葡萄糖后2h、3h、3h、4h、3h和3h。灌服葡萄糖后9h时各组的血糖水平均降至比空腹时略高但无显著差异的水平。灌服葡萄糖后各组血糖高峰值以未添加铬的对照组最大,0.2~0.4mg/kg和1.6~3.2mg/kg组次之,0.8mg/kg组最小。本试验结果显示,饲料中添加吡啶羧酸铬0.8mg/kg能促进草鱼的生长,提高草鱼对葡萄糖的耐受量。 展开更多
关键词 吡啶羧酸铬 草鱼 生长 糖耐量
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草鱼幼鱼对饲料中钴的需要量 预览 被引量:4
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作者 袁丹宁 文华 +4 位作者 蒋明 吴凡 刘太亮 丁俊仁 冷向军 《西北农林科技大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2009年第5期74-80,88共8页
【目的】研究不同水平钴对草鱼幼鱼生长性能、机体营养成分、组织钴含量和血液指标的影响,以确定草鱼幼鱼对饲料中钴的适宜需要量。【方法】选取初始体质量为(3.21±0.35)g的草鱼(Ctenopharyngodon idella)幼鱼,随机分成6组,其... 【目的】研究不同水平钴对草鱼幼鱼生长性能、机体营养成分、组织钴含量和血液指标的影响,以确定草鱼幼鱼对饲料中钴的适宜需要量。【方法】选取初始体质量为(3.21±0.35)g的草鱼(Ctenopharyngodon idella)幼鱼,随机分成6组,其饲料中钴含量分别为0.05(对照组),0.13,0.22,0.44,0.95和1.63mg/kg,每组设置3个重复,每重复60尾,饲养试验周期为70d。【结果】饲料中添加钴显著提高了草鱼幼鱼的特定生长率、增重率和蛋白质效率(P〈0.05),但对存活率无显著影响(P〉0.05),当饲料中钴含量为0.22mg/kg时,草鱼的特定生长率、蛋白质效率和增重率最大,饲料系数最低,并与其他各试验组差异显著;饲料添加钴对草鱼全鱼水分、粗脂肪、粗蛋白和灰分含量无显著影响(P〉0.05);当饲料中钴含量为0.22mg/kg时,草鱼幼鱼肝脏、肾脏和肌肉中钴含量最大,且显著高于钴含量为0.05,0.13和1.63mg/kg试验组(P〈0.05),而当饲料中钴含量在0.22~0.95mg/kg时,各试验组之间草鱼幼鱼肝脏、肾脏和肌肉中钴含量无显著差异(P〉0.05);饲料添加钴可以增加草鱼幼鱼血红蛋白含量(HGB)、血小板计数(PLT)、红细胞压积(HCT)和红细胞计数(RBC),当饲料中钴含量为0.22mg/kg时,血液中血红蛋白质量浓度、血小板计数、红细胞压积和红细胞计数均达到最大值,与钴含量为0.05mg/kg试验组差异显著(P〈0.05)。【结论】基于特定生长率和肾脏钴含量折线法分析,草鱼幼鱼获得最佳生长和组织钴累积水平时,对饲料中钴的需求量约为0.20mg/kg。 展开更多
关键词 草鱼 饲料试验 生长性能 机体营养成分 血液指标
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安徽南漪湖大型底栖动物群落结构 预览 被引量:14
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作者 陈立婧 彭自然 +3 位作者 孙家平 王武 杨义辉 陈华 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期 63-68,共6页
2002年7月至2004年7月,对安徽南漪湖12个采样点的大型底栖动物群落结构进行了调查研究,共获得大型底栖动物39种,隶属于3门28属。大型底栖动物的现存量在2003年冬季出现最高值,密度最低值出现在2004年夏季。软体动物的现存量占绝对优势,... 2002年7月至2004年7月,对安徽南漪湖12个采样点的大型底栖动物群落结构进行了调查研究,共获得大型底栖动物39种,隶属于3门28属。大型底栖动物的现存量在2003年冬季出现最高值,密度最低值出现在2004年夏季。软体动物的现存量占绝对优势,其优势种为河蚬(Corbicula fluminea)、梨形环棱螺(Bellamya purificata)、铜锈环棱螺(B.aeruginosa)和长角涵螺(Alocinma longicornis)。Shannon-Wiener多样性指数、Margalef多样性指数和Pielou指数的年均值分别为0.83、0.51和0.77。南漪湖西部物种数、物种多样性、现存量均较东部高。建闸蓄水后,南漪湖的环境发生了很大的改变,随水深增加,大型底栖动物的现存量呈明显下降的趋势。 展开更多
关键词 南漪湖 大型底栖动物 群落结构 多样性
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滆湖轮虫群落结构与水质生态学评价 预览 被引量:25
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作者 陈立婧 顾静 +3 位作者 彭自然 孔优佳 花少鹏 王武 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 7-16,共10页
研究了浅水湖泊——滆湖的轮虫群落结构,并用轮虫污染指示种类、E/O值、QB/T值和生物多样性指数评价滆湖的水质和营养状况。在两周年的研究中,共发现轮虫69种,污染指示轮虫39种。优势种为萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)... 研究了浅水湖泊——滆湖的轮虫群落结构,并用轮虫污染指示种类、E/O值、QB/T值和生物多样性指数评价滆湖的水质和营养状况。在两周年的研究中,共发现轮虫69种,污染指示轮虫39种。优势种为萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)、前节晶囊轮虫(Asplanchna priodonta)、针簇多肢轮虫(Polyarthra trigla)、长三肢轮虫(Filinia longiseta)和裂足臂尾轮虫(B.diversicornis)。轮虫密度年平均值为1584ind./L,生物量年平均值为5.9821mg/L。密度秋季最高,生物量夏季较高。轮虫物种多样性较低,多样性指数与其密度及生物量正相关。滆湖三个生态功能区轮虫的种类相似;湖区北部与中部的轮虫现存量差异不显著,与南部的差异显著,中部与南部间差异极显著。根据指示生物法、生物指数法和多样性指数法评价滆湖水质及营养类型,滆湖为富营养型。 展开更多
关键词 滆湖 轮虫 群落结构 生态学评价
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上海世博园白莲泾浮游藻类群落结构和物种多样性的研究 预览 被引量:5
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作者 陈立婧 顾静 +2 位作者 张饮江 彭自然 何培民 《上海水产大学学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期 333-338,共6页
上海白莲泾生态环境是中国2010年上海世界博览会规划区的重点建设项目。2006年3月至9月对白莲泾的浮游藻类进行了调查,分析了浮游藻类的群落结构、物种多样性以及浮游藻类与水质理化参数的关系。共检出浮游藻类181种,隶属于7门82属,... 上海白莲泾生态环境是中国2010年上海世界博览会规划区的重点建设项目。2006年3月至9月对白莲泾的浮游藻类进行了调查,分析了浮游藻类的群落结构、物种多样性以及浮游藻类与水质理化参数的关系。共检出浮游藻类181种,隶属于7门82属,主要优势种为水华微囊藻、铜绿微囊藻、不定微囊藻、湖泊鞘丝藻、巨颤藻、小席藻和扭曲小环藻;浮游藻类密度年平均值为21.03×10^4 ind./L,生物量年平均值为4.027 mg/L;浮游藻类的香农威尔多样性指数为0.94~2.47,丰富度指数为0.58~2.75,均匀度指数为0.39~0.78;涨潮时生物密度均值为17.60×10^4 ind./L,生物量均值为0.775 mg/L;落潮时生物密度均值为24.78×10^4 ind./L,生物量均值为1.569 mg/L。 展开更多
关键词 白莲泾 浮游藻类 群落结构 物种多样性 上海世博园
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凡纳滨对虾Toll样受体基因cDNA片段的克隆及序列分析 预览 被引量:9
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作者 叶旻玉 刘利平 +2 位作者 戴习林 沈默忱 徐灿 《上海水产大学学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期 263-267,共5页
对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Toll样受体基因的cDNA片段进行了克隆。从凡纳滨对虾提取肌肉、鳃和肝胰腺中的总RNA,根据黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Toll样受体的TIR区设计引物,从鳃中逆转录扩增得到cDNA序列,进行... 对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)Toll样受体基因的cDNA片段进行了克隆。从凡纳滨对虾提取肌肉、鳃和肝胰腺中的总RNA,根据黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)Toll样受体的TIR区设计引物,从鳃中逆转录扩增得到cDNA序列,进行测序。所得序列结果与其他物种的已知TIR及TLR氨基酸序列进行聚类分析建立系统进化树,并进行氨基酸序列同源性比较。结果表明所得序列与斑节对虾(Penaeus monodon)、赤拟谷盗(Tribolium castaneum)、果蝇(Drosophila melanogaster)、意大利蜜蜂(Apis mellifera)、线虫(Caenorhabditis elegans)、紫海胆(Strongylocentrotus purpuratus)的Toll样基因TIR区域的氨基酸序列有较高的相似性。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 TOLL样受体 基因克隆
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成体瘤背石磺脂类和脂肪酸组成 预览 被引量:7
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作者 吴旭干 滕炜鸣 +4 位作者 唐伯平 成永旭 于智勇 周波 杨筱珍 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 431-438,共8页
测定和比较了成体瘤背石磺的肌肉、肝胰腺、两性腺和卵黄腺指数、水分含量、总脂(TL)含量、脂类和脂肪酸组成。结果表明:(1)瘤背石磺的肌肉指数为57131%,显著高于其他3种组织(P〈0.05);肌肉和两性腺中的水分含量为80%左右... 测定和比较了成体瘤背石磺的肌肉、肝胰腺、两性腺和卵黄腺指数、水分含量、总脂(TL)含量、脂类和脂肪酸组成。结果表明:(1)瘤背石磺的肌肉指数为57131%,显著高于其他3种组织(P〈0.05);肌肉和两性腺中的水分含量为80%左右,肝胰腺中的总脂/湿质量含量为8.23%,显著于其他3种组织(P〈0.05)。(2)成体瘤背石磺各种组织总脂主要由磷脂(PL)、胆固醇(Cho)、游离脂肪酸(FFA)、甘油三酰(TG)和甘油-酰(MG)组成;肌肉中的PL/TL高达85.24%,显著高于其他3种组织(P〈0.05);肝胰腺中PL/TL含量仅为41.77%,显著低于其他组织(P〈0.05);肝胰腺中的FFA/TL达44.99%,显著高于其他组织。(3)成体瘤背石磺肝胰腺中的总饱和脂肪酸(∑SFA)含量达34.93%,显著高于其他3种组织(P〈0.05);两性腺中总单不饱和脂肪酸(∑MUFA)含量仅为18.96%,显著低于其他3种组织,总多不饱和脂肪酸(EPUFA)含量从大到小顺序依次为:两性腺(40.60%)、卵黄腺(33.21%)、肌肉(30.85%)、肝胰腺(21.00%)。肌肉中C20:4n6(AA)含量显著高于其他组织,两性腺中的C22:5n3(DPA)含量高达10.34%,4种组织中的C20:5n3(EPA)含量均显著大于C22:6n3(DHA)含量。由此可见,PL和PUFA对于瘤背石磺的两性腺发育具有十分重要作用,肝胰腺中高含量的FFA可能与其旺盛的脂类代谢有关,肌肉、卵黄腺和两性腺具有较高的脂类营养价值。[中国水产科学,2008,15(3):431-438] 展开更多
关键词 瘤背石磺 成体 脂类 脂肪酸
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我国沿海三疣梭子蟹9个野生群体线粒体CR和COⅠ片段比较分析 预览 被引量:14
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作者 冯冰冰 李家乐 +3 位作者 牛东红 陈琳 郑岳夫 郑凯宏 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期 28-36,共9页
通过对我国沿海三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)9个野生群体线粒体DNA控制区(putative control region,CR)基因片段和细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行扩增和测序,分别得到长度为530bp和584bp的片段。分析结果表明:... 通过对我国沿海三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)9个野生群体线粒体DNA控制区(putative control region,CR)基因片段和细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段进行扩增和测序,分别得到长度为530bp和584bp的片段。分析结果表明:CR83条序列A+T平均含量为73.2%,共检测到91个变异位点,83个个体具有66种单倍型(haplotype) COⅠ94条序列A+T平均含量为62.2%,共检测到34个变异位点,94个个体具有34种单倍型(haplotype)。用MEGA3.1软件构建9个群体NJ分子树,聚类结果显示,黄海、东海、渤海6个群体之间的相对遗传距离比较近,聚为一大支,南海3个群体相对遗传距离比较近,聚为一大支。AMOVA分析表明,群体间的遗传分化指数(Fst)为-0.07454-0.27087,其中部分群体间达到显著差异(P〈0.05)与极显著差异(P〈0.01),说明我国三疣梭子蟹不同野生群体间存在一定遗传分化。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 线粒体DNA 控制区 COⅠ 遗传多样性 遗传分化
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不同脂类营养对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)幼蟹生长、成活、肝胰腺指数和生化成分的影响 预览 被引量:19
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作者 常国亮 吴旭干 +4 位作者 成永旭 王宗凯 刘强 杨筱珍 陆剑锋 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 276-283,共8页
采用生长评价、生化分析等方法,比较了饲料中不同脂类营养对中华绒螯蟹幼蟹(2.4g左右)生长、成活和生化成分含量的影响,实验分为A组饲料雌体(AF组)、A组饲料雄体(AM组)、B组饲料雌体(BF组)和B组饲料雄体(BM组)。结果表明... 采用生长评价、生化分析等方法,比较了饲料中不同脂类营养对中华绒螯蟹幼蟹(2.4g左右)生长、成活和生化成分含量的影响,实验分为A组饲料雌体(AF组)、A组饲料雄体(AM组)、B组饲料雌体(BF组)和B组饲料雄体(BM组)。结果表明,饲料中缺乏PL和HUFA对幼蟹60天内的生长和成活并没有显著影响,但是其肝胰腺指数、肝胰腺和肌肉中的总脂及18:2n-6含量呈上升趋势,而其肝胰腺和肌肉的胆固醇、PL和HUFA含量均呈下降趋势(BF和BM组),这可能会进一步影响到幼蟹的内分泌调控和生殖蜕壳。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 磷脂 高度不饱和脂肪酸 成活率 增重率 肝胰腺指数 脂肪酸
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微小色球藻的培养及其营养组成分析 预览 被引量:5
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作者 黄旭雄 胡盼 +1 位作者 庄林川 倪良平 《上海水产大学学报》 CSCD 北大核心 2008年第1期 77-81,共5页
在实验室条件下,以Zarrouk培养液培养微小色球藻(Chroococcus minutus),探讨温度对微小色球藻生长的影响,并对微小色球藻的营养组成进行了分析。结果表明:在30μE/M^2·S~45μE/M^2·S光照强度范围内,微小色球藻的最... 在实验室条件下,以Zarrouk培养液培养微小色球藻(Chroococcus minutus),探讨温度对微小色球藻生长的影响,并对微小色球藻的营养组成进行了分析。结果表明:在30μE/M^2·S~45μE/M^2·S光照强度范围内,微小色球藻的最适生长温度范围为30℃~38℃。对微小色球藻的营养组成分析表明,该藻具有高蛋白,低脂肪,脂肪酸组成简单的特点。其粗蛋白含量为61.82%,粗脂含量仅为0.99%,饱和脂肪酸主要为C16:0和C20:0分别占44.88%和11.47%,不饱和脂肪酸主要为18:2n6(占16.01%)。干物质中总氨基酸含量为564.09mg/g,其中7种必需氨基酸占总量的37.65%,其营养组成与螺旋藻相似。 展开更多
关键词 微小色球藻 温度 粗蛋白 总脂肪 氨基酸 脂肪酸
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异育银鲫c型溶菌酶全长cDNA序列的生物信息学分析及其组织表达分析 预览 被引量:16
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作者 钱曦 华雪铭 +2 位作者 黄旭雄 冷向军 周洪琪 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期 337-347,共11页
利用RACE及克隆等方法获得了异育银鲫(Carassius auratus gibelio)c型溶菌酶基因全长cDNA序列.序列分析表明,所克隆的异育银鲫溶菌酶的cDNA全长751bp,包括溶菌酶基因开放阅读框(ORF)438bp,5’非编码区(UTR)为109bp和3’UTR为2... 利用RACE及克隆等方法获得了异育银鲫(Carassius auratus gibelio)c型溶菌酶基因全长cDNA序列.序列分析表明,所克隆的异育银鲫溶菌酶的cDNA全长751bp,包括溶菌酶基因开放阅读框(ORF)438bp,5’非编码区(UTR)为109bp和3’UTR为204bp、438bp ORF共编码146个氨基酸,其成熟肽的分子量预测值为14543.6,理论等电点为8.86、通过ClustalW软件,将异育银鲫和其它多个物种e型溶菌酶的氨基酸序列进行多序列比对发现,所克隆的异育银鲫溶菌酶编码的氨基酸序列中存在c型溶菌酶的活性中心(Glu53和Asp69),且与活性位点相邻的氨基酸序列高度保守.同时,8个保守的半胱氨酸残基也与其它物种的c型溶菌酶相一致.结合BLASTN分析的结果,可以确认所获得的异育银鲫溶菌酶cDNA序列属于c型溶菌酶.异育银鲫c型溶菌酶和人c型溶菌酶(pdb 1 at6-)在蛋白质序列上有50%相似性,其三维(3-D)结构非常类似.通过氨基酸空间位置比较发现,两者具有类似的酶活中心,异育银鲫c型溶菌酶只能形成3个二硫键,比人少1个.荧光定量RT-PCR检测和溶菌酶活性测定显示,异育银鲫头肾和脾脏c型溶菌酶mRNA的表达量约为肝胰脏的2.9倍和1.7倍,异育银鲫头肾和脾脏的溶菌酶活性约为肝胰脏的6.2倍和4倍. 展开更多
关键词 异育银鲫 c型溶菌酶 序列分析 蛋白结构预测 mRNA表达 溶菌酶活性
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异育银鲫Toll样受体3的cDNA序列分析与蛋白质高级结构预测 预览 被引量:3
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作者 钱曦 黄旭雄 +2 位作者 华雪铭 冷向军 周洪琪 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期 190-199,共10页
利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列。该cDNA全长3170bp,5’端非编码区181bp;3’端非编码区283bp;开放阅读框(ORF)2706bp,编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示,其编码的氨基... 利用RT-PCR、RACE及克隆等方法获得了异育银鲫Toll样受体3(cagTLR3)基因全长cDNA序列。该cDNA全长3170bp,5’端非编码区181bp;3’端非编码区283bp;开放阅读框(ORF)2706bp,编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示,其编码的氨基酸序列与金鱼、斑马鱼、斑点叉尾鲴、虹鳟和红鳍东方纯有较高的相似性,其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%,说明TLR3在长期的进化中具有较高保守性。TLR3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽;50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列(LRR);704至726个氨基酸残基为跨膜区(TM);754至897个氨基酸残基为与白介素-1受体高度同源的区域(TIR)。将异育银鲫TLR3与入和斑马鱼胞内TIR结构的氨基酸比对后发现,Phe728、Leu738、Tyr756与Arg736在TLR3的信号转导及胞内定位过程中起到关键作用。异育银鲫TLR3胞外配体结合域的三维结构呈U型,与人TLR3的相应结构十分相似,在N端具有1个二硫键,C端有2个。因LRRs上的插入序列和14个糖基化位点,异育银鲫TLR3胞外配体结合域内表面的大量β-折叠结构呈平坦的平面。 展开更多
关键词 异育银鲫 TOLL样受体3 CDNA末端快速扩增 序列分析 蛋白结构预测 生物信息学
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木薯粉对罗非鱼生长、饲料利用和鱼体营养成分的影响 预览 被引量:10
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作者 田雪 华雪铭 +2 位作者 周洪琪 韩斌 李维娇 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期 71-76,共6页
选择健康的吉富罗非鱼(体重1.29±0.25g)为实验鱼,配制五种木薯粉含量分别为0%、10%、20%、30%和40%的等氮(粗蛋白为32%)、等能(总能为16kJ·g^-1)实验饲料,饲喂罗非鱼56d,每饲料组设三个重复,研究不同含量... 选择健康的吉富罗非鱼(体重1.29±0.25g)为实验鱼,配制五种木薯粉含量分别为0%、10%、20%、30%和40%的等氮(粗蛋白为32%)、等能(总能为16kJ·g^-1)实验饲料,饲喂罗非鱼56d,每饲料组设三个重复,研究不同含量木薯粉对吉富罗非鱼生长、饲料利用及全鱼营养成分的影响。结果表明:(1)木薯粉能提高罗非鱼的增重和蛋白质效率,其中以40%木薯粉组的效果最佳,其增重率、蛋白质效率和饲料系数分别为1470.99%(P〈0.05)、2.36(P〈0.05)和1.27(P〈0.05)。(2)40%木薯粉组的干物质和蛋白质的表观消化率分别较对照组提高13.87%(P〈0.05)和7.93%(P〈0.05)。(3)40%木薯粉组的全鱼粗蛋白、粗灰分分别较对照组显著提高7.07%(P〈0.05)和8.78%(P〈0.05),粗脂肪降低了13.00%(P〈0.05)。 展开更多
关键词 吉富罗非鱼 木薯粉 增重率 表观消化率 饲料系数
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水体中组织胺对黑褐新糠虾生长与发育的影响 预览 被引量:9
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作者 王金锋 杨筱珍 +3 位作者 吴旭干 赵柳兰 王小艳 成永旭 《海洋渔业》 CSCD 2008年第2期 157-162,共6页
研究了不同浓度组织胺(1mg/L、3mg/L和5mg/L)养殖水体对黑褐新糠虾生长与发育的影响,其中0mg/L为对照组。结果表明:水体组织胺对黑褐新糠虾生长和存活有显著影响。其中高浓度组(5mg/L)黑褐新糠虾存活率仅为(83±12.47... 研究了不同浓度组织胺(1mg/L、3mg/L和5mg/L)养殖水体对黑褐新糠虾生长与发育的影响,其中0mg/L为对照组。结果表明:水体组织胺对黑褐新糠虾生长和存活有显著影响。其中高浓度组(5mg/L)黑褐新糠虾存活率仅为(83±12.47)%,而对照组为(97±4.71)%,两者存在显著差异(P〈0.05)。组织胺对黑褐新糠虾的生长有显著抑制作用,用药17d后,对照组体长为6.18±0.30mm,而最高组织胺浓度组(5mg/L)的体长仅约为对照组的87%,即5.35±0.26mm,两组间有显著性差异(P〈0.05);抱卵雌虾的体长各组基本一致,均约为7.58±0.24mm;组织胺能抑制黑褐新糠虾蜕壳,表现为同一时期内蜕壳比例较低;组织胺能延迟雄性黑褐新糠虾第二性征出现和雌性黑褐新糠虾抱卵的时间,分别延迟约1d和3d。 展开更多
关键词 黑褐新糠虾 组织胺 生长 发育
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缢蛏六群体线粒体DNA-COI基因序列变异及群体遗传结构分析 预览 被引量:18
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作者 牛东红 李家乐 +1 位作者 沈和定 姜志勇 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 109-116,共8页
利用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基(COI)基因序列片段对江浙闵沿海地区缢蛏三个野生群体(江苏射阳-WS、浙江象山-WX,福建霞浦-WP)和三个养殖群体(江苏射阳—CS、浙江象山-CX、福建焦城-CJ)的遗传结构进行初步分析。以特异引物进行... 利用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基(COI)基因序列片段对江浙闵沿海地区缢蛏三个野生群体(江苏射阳-WS、浙江象山-WX,福建霞浦-WP)和三个养殖群体(江苏射阳—CS、浙江象山-CX、福建焦城-CJ)的遗传结构进行初步分析。以特异引物进行PCR扩增,经纯化、测序、同源序列比对获得长度为556 bp的核苷酸序列,其中A+T含量为66.2%,显著高于G+C含量。在缢蛏六群体98个个体中共检测到了56个单倍型和66个核苷酸多态位点,多态位点比例为11.7%。野生群体的平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数略高于养殖群体,但是野生群体和养殖群体的单倍型多态性指数均大于0.9,其单倍型较为丰富。此外,六群体均有各自特有的单倍型,但只有射阳野生群体与其他群体无共享单倍型,具有鉴定该群体的特异碱基序列。遗传距离和聚类结果显示,养殖群体与象山野生群体和霞浦野生群体间亲缘关系较近。 展开更多
关键词 缢蛏 线粒体DNA COI 遗传多样性
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饲料中添加蛋白酶AG对鲤鱼鱼种生长和蛋白质消化酶活性的影响 预览 被引量:16
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作者 冷向军 刘鼎云 +1 位作者 李小勤 卢永红 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 268-274,共7页
通过2个试验研究了饲料中添加蛋白酶AG对鲤鱼生长和前肠蛋白质消化酶活性的影响。试验Ⅰ选用540尾均重11.7g的鲤鱼,随机均分为6组,随机选取3组分别饲喂鱼粉含量为10%、15%、20%的3种等蛋白基础饲料,另外3组分别饲喂添加有175mg... 通过2个试验研究了饲料中添加蛋白酶AG对鲤鱼生长和前肠蛋白质消化酶活性的影响。试验Ⅰ选用540尾均重11.7g的鲤鱼,随机均分为6组,随机选取3组分别饲喂鱼粉含量为10%、15%、20%的3种等蛋白基础饲料,另外3组分别饲喂添加有175mg/kg蛋白酶AG的以上3种饲料,试验期60d。试验Ⅱ选取120尾均重48.7g的鲤鱼,随机分为2组,一组饲喂鱼粉含量6%的基础饲料为对照组,另外一组饲喂添加175mg/kg蛋白酶AG的基础饲料为试验组,试验期为30d。试验Ⅰ结果表明:摄食10%鱼粉饲料和20%鱼粉+175mg/kg蛋白酶AG饲料的鲤鱼分别具有最低和最高的增重率;在10%鱼粉饲料中添加蛋白酶AG显著提高了鱼体增重率(P〈0.05),但在15%、20%鱼粉饲料中添加蛋白酶AG,对鱼体增重率没有显著影响。试验Ⅱ结果表明:相比于对照组,试验组鲤鱼增重率提高了6.4%(P〈0.05),饲料系数降低了5.4%(P〈0.05)。试验Ⅰ和试验Ⅱ中,添加蛋白酶AG对鱼体肌肉水分、粗脂肪、粗蛋白质含量均无显著影响(P〉0.05);对消化酶活性的测定表明,在鱼粉含量为10%、6%的基础饲料中添加蛋白酶AG,可显著提高前肠组织蛋白酶活性和食糜蛋白酶活性(P〈O.05),但在鱼粉含量为15%、20%的基础饲料中添加蛋白酶AG,对前肠组织蛋白酶活性和食糜蛋白酶活性没有影响。综上所述,在鱼粉含量较低的饲料中添加蛋白酶AG,可提高鲤鱼消化道蛋白酶活性,改善生长性能。 展开更多
关键词 鲤鱼 蛋白酶AG 生长 蛋白酶活性
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杜仲叶对草鱼生长、血清非特异性免疫指标和肉质影响的初步研究 预览 被引量:44
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作者 冷向军 孟晓林 +2 位作者 李家乐 李小勤 华雪铭 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期 434-440,共7页
为考察杜仲叶对草鱼生长、血清非特异性免疫指标和肌肉品质的影响,在基础饲料(对照组)中分别添加2%、4%杜仲叶粉或0.1%、0.15%杜仲叶提取物,饲养平均体重(425.8±37.6)2的草鱼。经60d饲养,各组草鱼增重率分别为84.... 为考察杜仲叶对草鱼生长、血清非特异性免疫指标和肌肉品质的影响,在基础饲料(对照组)中分别添加2%、4%杜仲叶粉或0.1%、0.15%杜仲叶提取物,饲养平均体重(425.8±37.6)2的草鱼。经60d饲养,各组草鱼增重率分别为84.3%、92.2%、96.7%、88.2%、91.7%,饲料系数分别为2.01、1.87、1.82、2.03、1.91;与对照组相比,添加4%杜仲叶粉显著提高了草鱼增重率,降低了饲料系数(P〈0.05),添加2%杜仲叶粉、0.15%杜仲叶提取物有提高草鱼增重率趋势(P〈0.10)。对血清非特异性免疫指标的测定表明,饲料中添加4%杜仲叶粉,0.1%、0.15%杜仲叶提取物,均可极显著提高SOD活性(P〈0.01),各组溶菌酶和碱性磷酸酶活性无显著差异(P〉0.05)。对肌肉成分的分析表明,各组间肌肉水分、灰分含量无显著差异(P〉0.05),但添加0.15%杜仲叶提取物,可显著提高肌肉蛋白、谷氨酸、丝氨酸、丙氨酸、苯丙氨酸、组氨酸、脯氨酸、呈味氨基酸及总氨基酸含量(P〈0.05);添加4%杜仲叶粉、0.1%、0.15%杜仲叶提取物均可提高肌肉羟脯氨酸、胶原蛋白含量。对肌肉物理性能指标的分析表明,添加杜仲叶粉或叶提取物均可降低肌纤维直径(P〈0.05),其中,添加4%杜仲叶粉、0.1%、0.15%杜仲叶提取物还提高了肌原纤维耐折力(P〈0.05),添加2%、4%杜仲叶粉,0.15%杜仲叶提取物降低了肌肉失水率(P〈0.05)。上述研究表明,饲料中添加杜仲叶(叶粉或叶提取物)可改善养殖草鱼生长性能、血清非特异性免疫功能和肌肉品质。 展开更多
关键词 杜仲叶 草鱼 生长 非特异性免疫 肉质
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