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基于改进Mask RCNN和SVR的无接触梭子蟹体质量预测研究 认领
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作者 唐潮 胡海刚 +1 位作者 史策 钱云霞 《宁波大学学报:理工版》 CAS 2021年第2期31-41,共11页
提出了一个改进Mask RCNN目标检测算法用以对养殖梭子蟹进行视觉特征测量.通过在养殖区域采集梭子蟹图像,用上位机识别梭子蟹旋转角度以及甲长和甲宽方向,对输出的Mask进行模板修补,提高模板内区域的置信度.通过图像-实景对应关系换算... 提出了一个改进Mask RCNN目标检测算法用以对养殖梭子蟹进行视觉特征测量.通过在养殖区域采集梭子蟹图像,用上位机识别梭子蟹旋转角度以及甲长和甲宽方向,对输出的Mask进行模板修补,提高模板内区域的置信度.通过图像-实景对应关系换算梭子蟹的真实尺寸,并估算其投影面积、甲宽与甲长,结果准确率高于85%.同时,对视觉算法得到的梭子蟹尺寸特征与其体质量进行拟合,引入k-means聚类,实现双模型支持向量回归机(SVR)预测结构.通过差分进化算法对SVR适应度函数进行寻优,设计了随迭代次数、寻优效果同步变化的缩放因子,以及适者更易生存策略的交叉概率因子,以验证改进算法的寻优能力.测试时,对新传入的数据首先进行归一化处理,然后判断所归属的聚类中心,再传至相应的SVR模型进行预测.测试结果相对误差小于18%. 展开更多
关键词 梭子蟹 视觉特征 体质量 Mask RCNN 无接触测量
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基于高通量测序技术对浙江传统发酵蔬菜微生物多样性的解析 认领
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作者 鲍伟 韩姣姣 +5 位作者 张旨轩 芦晨阳 周君 明庭红 李晔 苏秀榕 《食品科学》 EI CAS 北大核心 2021年第6期178-185,共8页
以浙江地区传统发酵蔬菜臭冬瓜、臭苋菜梗、酸笋和酸茭白为研究对象,采用Illunina MiSeq高通量测序技术,分别分析浙江传统发酵蔬菜的汁液、固形物和培养物中细菌和真菌微生物群落组成和多样性,探讨“臭”和“酸”类发酵食品的微生物群... 以浙江地区传统发酵蔬菜臭冬瓜、臭苋菜梗、酸笋和酸茭白为研究对象,采用Illunina MiSeq高通量测序技术,分别分析浙江传统发酵蔬菜的汁液、固形物和培养物中细菌和真菌微生物群落组成和多样性,探讨“臭”和“酸”类发酵食品的微生物群落组成差异。结果表明:14个样品中细菌和真菌的测序覆盖率分别为0.97和0.99。分析细菌,臭苋菜梗固形物的可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)最多、Shannon指数最高;而酸笋固形物中的OTU最少,酸笋汁的Shannon指数最低;且臭苋菜梗汁、固形物和培养物以及酸笋固形物和培养物的菌群结构更为接近。分析真菌,臭冬瓜培养物和酸茭白固形物中的真菌OTU最多,臭苋菜梗培养物中的OTU最少,而酸茭白汁中没有检测出真菌;酸笋汁的Shannon指数最高,臭苋菜梗培养物的Shannon指数最低;除卤水、臭苋菜梗汁和酸笋样品外其余样品的真菌群落组成更为接近。在属水平,臭冬瓜培养物、酸笋汁、酸笋固形物和酸茭白汁的优势细菌属分别为脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、埃希菌属(Escherichia)和Caproiciproducens,卤水培养物、酸茭白固形物和培养物的优势细菌属为梭菌属(Clostridium),臭苋菜梗汁、固形物和培养物的优势细菌属为拟杆菌属(Bacteroides),卤水、臭冬瓜汁和固形物的优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus);卤水的优势真菌属为柯达酵母属(Kodamaea),臭苋菜梗汁、固形物和培养物的优势真菌属为假丝酵母属(Candida),而其他样品的优势真菌属为Leptospora。 展开更多
关键词 传统发酵蔬菜 酸笋和酸茭白 16S rDNA高通量测序 微生物多样性
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基于数据挖掘的股外侧肌基因表达谱的增龄性变化研究 认领
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作者 杨若愚 李晓凡 +2 位作者 李馨逸 朱利扬 王碧云 《体育科研》 2021年第2期78-84,共7页
目的:基于数据挖掘的分析方法,研究骨骼肌增龄性的基因表达差异,探讨与老年人肌肉衰减综合症相关的差异基因,分析差异基因富集的重要分子通路,寻找相关分子标记,为后续工作提供可能的研究线索和思路。方法:利用基于高通量平台检测的老... 目的:基于数据挖掘的分析方法,研究骨骼肌增龄性的基因表达差异,探讨与老年人肌肉衰减综合症相关的差异基因,分析差异基因富集的重要分子通路,寻找相关分子标记,为后续工作提供可能的研究线索和思路。方法:利用基于高通量平台检测的老年人和年轻人的股外侧肌的基因表达数据,进行差异基因筛选,并利用相关在线数据库和分析工具进行GO和KEGG富集分析,使用STRING在线工具和Cytoscape软件分析和制作差异基因的蛋白互作网络,寻找相关分子标记。结果:筛选出2028个股外侧肌的增龄性差异表达基因,其中2020个为表达下调基因、8个为表达上调基因。通过基因富集分析,在维生素消化吸收、T细胞受体信号通路、神经营养蛋白信号通路、神经活性配体-受体相互作用、Jak-STAT信号通路、胰岛素抵抗等重要通路均有较多的差异基因的富集。利用蛋白互作网络分析和相关算法得到CXCR5、ADCY8、NPY等核心基因。结论:骨骼肌增龄性变化存在大量的基因表达变化,其中绝大多数为基因表达的下调;差异基因可能通过多条重要的分子通路影响老年人群骨骼肌功能的下降和衰退,调控肌肉衰减综合症的发生与发展;筛选出的核心基因可为后续深入研究肌肉衰减综合症的分子标记物提供线索。 展开更多
关键词 基因表达 富集分析 蛋白互作网络 肌肉衰减综合症
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氨氮胁迫下饥饿与复投喂对黄颡鱼肝脏中脂质代谢相关酶活性及相关基因表达的影响 认领
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作者 刘嘉欣 张木子 +3 位作者 黎明 谢雨欣 钱云霞 王日昕 《动物营养学报》 CAS 北大核心 2021年第1期436-447,共12页
为了研究氨氮胁迫下饥饿与复投喂对黄颡鱼脂质代谢的影响,将360尾黄颡鱼幼鱼[初始体重为(14.95±0.03)g]随机分配到12个养殖桶中,每桶30尾。对照组人工饱食投喂42 d,试验组饥饿14 d后恢复投喂28 d。对照组和试验组分别被暴露到总氨... 为了研究氨氮胁迫下饥饿与复投喂对黄颡鱼脂质代谢的影响,将360尾黄颡鱼幼鱼[初始体重为(14.95±0.03)g]随机分配到12个养殖桶中,每桶30尾。对照组人工饱食投喂42 d,试验组饥饿14 d后恢复投喂28 d。对照组和试验组分别被暴露到总氨氮浓度为0(低氨氮处理,正常养殖环境)和5.70 mg/L(高氨氮处理,氨氮胁迫)的水体中,每组分配3桶试验鱼。结果显示:饥饿14 d后,高氨氮处理黄颡鱼肝脏中6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGD)、脂肪酸合酶(FAS)活性以及6PGD、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)、FAS、胆固醇调节元件结合蛋白-1(SREBP-1)、过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)和过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)基因的mRNA相对表达量显著低于低氨氮处理(P<0.05),而肝脏中肉碱棕榈酰转移酶(CPT)、脂蛋白脂酶(LPL)活性以及肉碱棕榈酰转移酶1(CPT1)和LPL基因的mRNA相对表达量则显著高于低氨氮处理(P<0.05);在氨氮胁迫或正常养殖环境下,饥饿14 d后,试验组黄颡鱼肝脏中6PGD、FAS活性以及6PGD、G6PD、FAS、SREBP-1和PPARγ基因的mRNA相对表达量显著低于对照组(P<0.05),而CPT、LPL活性以及PPARα、CPT1和LPL基因的mRNA相对表达量显著高于对照组(P<0.05);恢复投喂28 d后,高氨氮处理黄颡鱼肝脏中6PGD、FAS活性以及6PGD、G6PD、FAS和PPARα基因的mRNA相对表达量显著低于低氨氮处理(P<0.05),而肝脏中CPT、LPL活性以及CPT1和LPL基因的mRNA相对表达量则显著高于低氨氮组(P<0.05);在氨氮胁迫或正常养殖环境下,恢复投喂28 d后,试验组黄颡鱼肝脏中6PGD活性以及6PGD和G6PD基因的mRNA相对表达量显著高于对照组(P<0.05),而肝脏中LPL活性显著低于对照组(P<0.05);此外,在氨氮胁迫下,试验组黄颡鱼肝脏中FAS、SREBP-1和PPARγ基因的mRNA相对表达量显著高于对照组(P<0.05),而LPL基因的mRNA相对表达量则显著低于对照组(P<0.05)。综上可知,氨氮胁迫和饥饿胁迫均会促� 展开更多
关键词 黄颡鱼 氨氮胁迫 饥饿胁迫 复投喂 脂质代谢 酶活性 基因表达
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海链藻定向培养对凡纳滨对虾生长、存活及养殖水质的影响 认领
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作者 曾国权 黄晨 +3 位作者 蒋霞敏 张朋龙 彭瑞冰 陈琛 《宁波大学学报:理工版》 CAS 2021年第1期1-7,共7页
旨在探究定向培藻在凡纳滨对虾养殖中应用效果.选取体长0.545 cm的凡纳滨对虾84万尾,随机分为2组(每组3个重复,每个室内水泥池(30 m^2)14万尾),对照组水体不添加藻,试验组水体中添加海链藻(藻浓度维持2×10^4~5×10^4 cell·... 旨在探究定向培藻在凡纳滨对虾养殖中应用效果.选取体长0.545 cm的凡纳滨对虾84万尾,随机分为2组(每组3个重复,每个室内水泥池(30 m^2)14万尾),对照组水体不添加藻,试验组水体中添加海链藻(藻浓度维持2×10^4~5×10^4 cell·mL^-1),试验周期25 d.结果表明:定向培藻对凡纳滨对虾生长、存活及养殖水质影响显著(P<0.05),其中,对虾体长、体质量成活率和饵料系数均为海链藻组显著大于对照组(P<0.05);养殖水体的p H日差值和、NO3--N、NH4+-N、PO43--P和养殖水体中弧菌数量均为海链藻组显著小于对照组(P<0.05).由此可见,在凡纳滨对虾养殖过程中,养殖池中添加定向培海链藻有利于维持养殖池水体的水质稳定,减少水体的氮磷含量和抑制弧菌的生长,同时也有利于凡纳滨对虾的健康生长. 展开更多
关键词 定向培藻 海链藻 凡纳滨对虾 生长率 弧菌
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暂存和运输方式对野生三疣梭子蟹暂养的影响 认领
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作者 韩胜明 任志明 +3 位作者 邱雪妮 杨华 母昌考 王春琳 《宁波大学学报:理工版》 CAS 2021年第1期8-14,共7页
三疣梭子蟹是我国重要的海产经济蟹类,野生梭子蟹的暂养是一种高效利用梭子蟹自然资源的经济手段.为探究适合野生三疣梭子蟹暂养的方法,研究了野生三疣梭子蟹捕捞后不绑螯堆积式暂存(M1)、绑螯单个体式暂存(M2)两种暂存方式以及橡皮筋... 三疣梭子蟹是我国重要的海产经济蟹类,野生梭子蟹的暂养是一种高效利用梭子蟹自然资源的经济手段.为探究适合野生三疣梭子蟹暂养的方法,研究了野生三疣梭子蟹捕捞后不绑螯堆积式暂存(M1)、绑螯单个体式暂存(M2)两种暂存方式以及橡皮筋绑螯堆叠盛放于塑料筐中运输(T1)、不绑螯单个盛放于单体盒中运输(T2)两种运输方式分别对其暂养存活的影响,并以超氧化物歧化酶(SOD)、总抗氧化能力(T-AOC)、丙二醛(MDA)、血糖、皮质醇、热休克蛋白(HSP70)几种生理指标了解其生理响应特征.结果显示:(1)不同暂存方式对野生三疣梭子蟹暂养的影响中,M2方式暂存的蟹暂养累积存活率为91.4%,显著高于M1(P<0.05),M1组蟹累积存活率为70.0%;根据对M1、M2组蟹血淋巴中几种生理指标的检测,引起两组蟹存活率差异的原因可能是M1暂存方式对蟹造成不可逆的损伤胁迫,抗氧化及应激能力显著降低,生理机能和免疫防御能力受损.(2)不同运输方式对野生三疣梭子蟹暂养的影响中,T2方式运输的蟹暂养累积存活率为41.5%,略高于T1(P>0.05),T1组蟹累积存活率为30.8%;根据对T1、T2组的蟹血淋巴中几种生理指标的检测,引起两组蟹存活率差异的原因可能是以T1方式运输的蟹受到挤压胁迫,抗氧化及应激能力略低于T2.综上分析,以绑螯单个体式的暂存方式和不绑螯单个盛放于单体盒中的运输方式获取的野生三疣梭子蟹更适合暂养. 展开更多
关键词 野生三疣梭子蟹 暂存方式 运输方式 暂养 存活
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‘凤丹’和紫斑牡丹6个产地种子脂肪酸组分的比较 认领
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作者 张姗姗 赵凡 +2 位作者 魏小豹 张秀新 曾秀丽 《中国粮油学报》 CAS 北大核心 2021年第3期84-90,共7页
对6个不同产地的‘凤丹’和紫斑牡丹种子百粒质量进行测定,利用气质联用色谱法(GC-MS)对其种仁油脂成分及含量进行测定,并探讨了脂肪酸组分与环境因子的相关性。结果表明:不同产地‘凤丹’百粒质量变化较大,平均在19.56~32.69 g之间,紫... 对6个不同产地的‘凤丹’和紫斑牡丹种子百粒质量进行测定,利用气质联用色谱法(GC-MS)对其种仁油脂成分及含量进行测定,并探讨了脂肪酸组分与环境因子的相关性。结果表明:不同产地‘凤丹’百粒质量变化较大,平均在19.56~32.69 g之间,紫斑牡丹百粒质量较为一致,平均24.32~25.39 g。不同产地两类油用牡丹籽油脂肪酸成分一致,不饱和脂肪酸均占总脂肪酸的85%以上,所有油脂成分中α-亚麻酸含量最多,平均为(57.25±8.11)mg/g;不同产地及类型油用牡丹脂肪酸含量存在差异,其中保康产紫斑牡丹籽油的总脂肪酸含量、不饱和脂肪酸含量及α-亚麻酸含量均最高,除保康外,其他产地牡丹籽油的饱和脂肪酸及不饱和脂肪酸含量均是‘凤丹’高于紫斑牡丹。牡丹籽油脂肪酸各组分与环境因子中的纬度、年降雨量和年平均气温呈现显著正相关(P<0.05),与海拔呈显著负相关(P<0.05)。综合分析认为保康紫斑牡丹是发展油用牡丹的一个潜在优良种质资源,两个主流油用牡丹类型在高海拔地区的种子质量、脂肪酸含量均低于低海拔地区,在高海拔地区大规模发展现有油用牡丹需慎重考虑。 展开更多
关键词 牡丹籽油 不饱和脂肪酸 环境因子 品种选育
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QuEChERS结合超高效液相色谱-串联质谱法测定牛奶中莫昔克丁残留 认领
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作者 徐峰 于佳勇 吴银良 《食品安全质量检测学报》 CAS 2021年第2期673-678,共6页
目的建立超高效液相色谱-串联质谱法(ultra performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测莫昔克丁在牛奶中残留的分析方法。方法采用1%乙酸乙腈振荡提取,离心后取上清液加乙二胺-N-丙基硅烷吸附剂[N-(n... 目的建立超高效液相色谱-串联质谱法(ultra performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测莫昔克丁在牛奶中残留的分析方法。方法采用1%乙酸乙腈振荡提取,离心后取上清液加乙二胺-N-丙基硅烷吸附剂[N-(n-Propyl)ethylenediamine,PSA]和十八烷基键合硅胶(C18)混合净化,上清液氮气吹干后用50%乙腈水溶液定容后供LC-MS/MS测定。结果在0.0005~0.20 mg/L浓度范围内线性良好,相关系数为0.9993。莫昔克丁在牛奶中的添加水平为0.002~0.20mg/kg,平均回收率为75.0%~82.6%,相对标准偏差为3.6%~4.8%。结论本方法快速、灵敏度高,适用于牛奶中莫昔克丁的检测。 展开更多
关键词 莫昔克丁 牛奶 超高效液相色谱-串联质谱法 QUECHERS
盐度胁迫对缢蛏血液离子浓度及碳酸酐酶基因表达的影响 认领
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作者 陈铭 林志华 +1 位作者 徐娴 何琳 《生物学杂志》 CAS 北大核心 2021年第1期83-87,共5页
比较缢蛏在5种盐度(盐度5、15、20、25和35)的水体中胁迫不同时间(4、8、12、24、48、72和96 h)后,血液中Na^+、K^+和Cl^-浓度变化以及碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)基因mRNA表达变化。结果显示:随盐度升高,Na^+、K^+和Cl^-浓度呈上... 比较缢蛏在5种盐度(盐度5、15、20、25和35)的水体中胁迫不同时间(4、8、12、24、48、72和96 h)后,血液中Na^+、K^+和Cl^-浓度变化以及碳酸酐酶(carbonic anhydrase,CA)基因mRNA表达变化。结果显示:随盐度升高,Na^+、K^+和Cl^-浓度呈上升趋势。随时间推移,低盐组Na^+、K^+和Cl^-浓度呈先下降、后稳定的变化趋势;高盐组Na^+、K^+和Cl^-浓度呈先上升、后稳定的变化趋势。qPCR结果显示,CA基因在各个组织中均有表达,鳃中表达量最高。盐度胁迫后各个实验组的CA基因mRNA表达水平随着时间的推移均呈先上升后下降,最后趋于平稳的状态,并在24 h达到峰值。盐度5与盐度35实验组的CA mRNA表达水平比盐度15与盐度25实验组的变化趋势更为明显。实验结果表明缢蛏在盐度胁迫下血液Na^+、K^+和Cl^-浓度及CA基因mRNA表达量均发生变化,迅速调节体内外离子浓度来维持渗透压的平衡。实验研究了离子浓度以及CA基因在缢蛏急性盐度胁迫过程中的作用,为缢蛏在适应盐度环境变化的分子生理机制提供基础资料。 展开更多
关键词 盐度 离子浓度 碳酸酐酶 缢蛏
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海水净化过程中球等鞭金藻对硬壳蛤风味品质的影响 认领
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作者 张思嘉 陈蓉 +1 位作者 孔周雁 徐继林 《核农学报》 CAS 北大核心 2021年第1期147-158,共12页
为了探究微藻在贝类净化中的作用,以及净化处理对贝类风味成分的影响,本研究以球等鞭金藻作为净化贝类的食物来源,通过多元统计及判别分析,对比添加球等鞭金藻净化前后贝肉挥发性成分的变化。结果表明,净化后贝类中绝大多数特征性风味... 为了探究微藻在贝类净化中的作用,以及净化处理对贝类风味成分的影响,本研究以球等鞭金藻作为净化贝类的食物来源,通过多元统计及判别分析,对比添加球等鞭金藻净化前后贝肉挥发性成分的变化。结果表明,净化后贝类中绝大多数特征性风味成分含量增加,如醛、醇、酯、酮类化合物;其中含量增加最明显的风味成分是具有黄油、肉香的酮类;而部分具有刺激性气味的苯的同系物含量显著下降(P<0.05),如1,2,4-三甲基苯等。判别分析结果表明,与传统海水净化相比,球等鞭金藻净化对贝类风味的改善效果更明显。本研究结果为微藻在贝类净化产业中的应用提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 贝类净化 挥发性成分 球等鞭金藻 硬壳蛤
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关于提升高校网课教学效率的探讨 认领
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作者 马荣荣 兰兆辉 +3 位作者 钱冬 金珊 解家松 周素明 《科教文汇》 2021年第1期65-66,共2页
网课是借助大型网络交流平台、利用新型即时网络交流工具进行的一种新兴教育模式。网课的“新”带来了前所未有的便利、生机和思考,同时它的“不成熟性”也给传统的授课教师以及教育系统带来一些挑战。该文对网课的“利”“弊”以及如... 网课是借助大型网络交流平台、利用新型即时网络交流工具进行的一种新兴教育模式。网课的“新”带来了前所未有的便利、生机和思考,同时它的“不成熟性”也给传统的授课教师以及教育系统带来一些挑战。该文对网课的“利”“弊”以及如何最大限度地提高网课教学质量进行了探讨。 展开更多
关键词 网课 利弊 教学质量 探讨
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CO2和乙酸钠对雨生红球藻生长及其虾青素积累的影响 认领
12
作者 叶鑫 虞新磊 +2 位作者 胡朝阳 徐年军 孙雪 《核农学报》 CAS 北大核心 2021年第3期613-622,共10页
雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)是强抗氧化剂虾青素的天然优质来源,碳源是影响雨生红球藻虾青素产量的重要因素之一。为探究CO_(2)和乙酸钠在雨生红球藻生长和虾青素积累中的作用,本研究通过测定生化指标和荧光定量PCR的方法,比... 雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)是强抗氧化剂虾青素的天然优质来源,碳源是影响雨生红球藻虾青素产量的重要因素之一。为探究CO_(2)和乙酸钠在雨生红球藻生长和虾青素积累中的作用,本研究通过测定生化指标和荧光定量PCR的方法,比较了这2种碳源对雨生红球藻干重、虾青素含量、生长相关酶及基因转录水平等的影响。结果表明,在绿色营养阶段,高CO_(2)组培养雨生红球藻干重为对照组的1.81倍(第8天),可溶性蛋白含量和核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)活力升高,磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)和苹果酸脱氢酶(MDH)活力及其编码基因转录表达上调;乙酸钠组雨生红球藻干重为对照组的1.56倍(第8天),Rubisco活力及其大亚基转录表达受抑制,PEPC和MDH活力及其转录水平升高。在厚壁孢子阶段,高CO_(2)组雨生红球藻细胞状态良好,其干重和虾青素产量分别为对照组的1.96和2.40倍(第8天),3个虾青素合成相关酶编码基因的转录水平在第3天高于对照组,Rubisco、PEPC、MDH活力较高;乙酸钠组雨生红球藻干重和虾青素产量分别为对照组的1.54和1.85倍(第8天),高光胁迫1 d后藻细胞部分变红,同时3个虾青素合成相关酶的基因表达量快速升高、Rubisco活力降低,而PEPC和MDH活力升高。综上,补充CO_(2)或乙酸钠均可显著促进雨生红球藻生长和虾青素积累,而高CO_(2)浓度培养藻的状态较好,乙酸钠则可促进虾青素的快速积累。本研究结果为今后利用雨生红球藻高效生产虾青素提供了理论参考。 展开更多
关键词 雨生红球藻 CO2 乙酸钠 生物量 虾青素
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蔗糖输入对凡纳滨对虾养殖系统真核微生物群落的影响 认领
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作者 鲍方剑 黄雷 +5 位作者 陈伟 王思鹏 陈琛 黄晓林 张德民 张化俊 《水生生物学报》 CAS 北大核心 2021年第1期172-181,共10页
利用18S rRNA基因高通量测序,研究蔗糖输入条件下凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖系统中水体与絮团的真核微生物群落组成及其相互作用关系。结果表明,输入蔗糖能显著改变对虾养殖系统中真核微生物群落组成,促进水体中纤毛虫和轮... 利用18S rRNA基因高通量测序,研究蔗糖输入条件下凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖系统中水体与絮团的真核微生物群落组成及其相互作用关系。结果表明,输入蔗糖能显著改变对虾养殖系统中真核微生物群落组成,促进水体中纤毛虫和轮虫的生长,对水体绿藻的过度生长有一定抑制作用。Mantel分析发现,在第28天时,蔗糖添加以及系统中的溶解氧、亚硝酸盐和磷酸盐对真核微生物群落结构变异有显著影响。利用共线性网络分析表明碳氮比的增加可以增强水体和絮团中不等鞭毛类、纤毛虫和轮虫的相互作用,对养殖体系中藻类的过度繁殖具有一定的抑制作用。研究揭示了在蔗糖输入条件下凡纳滨对虾养殖系统中真核微生物群落的演替规律及絮团和水体微生物相互作用特征,为生物絮团技术持续稳定的应用于对虾养殖系统提供理论支持。 展开更多
关键词 生物絮团 真核微生物群落 互作网络 对虾养殖 凡纳滨对虾
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香鱼(Plecoglossus altivelis)脾脏酪氨酸激酶SYK的鉴定及其介导的MAPK信号通路研究 认领
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作者 孙娇 聂力 +1 位作者 苗亮 陈炯 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1182-1193,共12页
脾脏酪氨酸激酶(SYK)是一种非受体型酪氨酸激酶(non-receptor tyrosine kinase,NRTK)。在哺乳动物中,SYK是重要的细胞信号通路接头分子,其在免疫细胞活化,胞外刺激的信号转导和病原体识别等多种生命过程中扮演重要角色,然而在鱼类中却... 脾脏酪氨酸激酶(SYK)是一种非受体型酪氨酸激酶(non-receptor tyrosine kinase,NRTK)。在哺乳动物中,SYK是重要的细胞信号通路接头分子,其在免疫细胞活化,胞外刺激的信号转导和病原体识别等多种生命过程中扮演重要角色,然而在鱼类中却鲜有报道。本研究以香鱼(Plecoglossus altivelis)为研究对象,探讨了其SYK(PaSYK)在应对病原微生物感染及在活化免疫信号通路中的作用。我们克隆获得了香鱼SYK的cDNA序列,并利用多重序列比对、构建进化树等生物信息学方法分析PaSYK的进化地位;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法分析PaSYK在健康组织及鳗弧菌(Vibrio anguillarum)感染后的表达变化;亚细胞定位检测PaSYK在HEK293T细胞的分布情况;在香鱼头肾单核/巨噬细胞(Monocyte/macrophage,MO/MΦ)中过表达PaSYK,研究其对炎症细胞因子表达的调控作用并在HEK293T细胞及香鱼头肾MO/MΦ中研究PaSYK对MAPK信号通路的活化作用。多重序列比对结果显示,SYK的蛋白质序列和结构域在进化过程中是高度保守的。系统进化树结果表明,PaSYK与河鳟的亲缘关系密切。RT-qPCR结果表明,SYK基因mRNA在检测的所有组织中均有表达,鳗弧菌感染后免疫相关组织中PaSYK表达量均上调。此外,PaSYK能显著诱导香鱼头肾MO/MΦ中促炎因子TNF-α和IL-1β的表达,但对抑炎因子TGF-β和IL-10的表达起到略微的抑制作用。Western blot结果证明PaSYK可以激活MAPK信号通路。综上所述,SYK分子在进化上高度保守,香鱼SYK与其哺乳动物中的同源物具有保守的功能,均能活化MAPK信号通路并在炎症反应中发挥作用。 展开更多
关键词 脾脏酪氨酸激酶(SYK) 香鱼 鳗弧菌感染 炎症细胞因子 MAPK信号通路
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一株大口黑鲈(Micropterus salmoides)虹彩病毒(Iridoviridae)的分离及鉴定 认领
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作者 许峰 鲁建飞 +2 位作者 魏永伟 苗亮 陈炯 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期156-162,共7页
2018年7月,浙江省某大口黑鲈(Micropterus salmoides)养殖场暴发疑似病毒引起的疾病。现场采样发现,病鱼体长约15-20cm,鱼体于水面下暗游,反应迟钝,体表有出血点或溃疡症状。本研究通过采用鲤鱼上皮瘤细胞(epithelioma papulosum cyprin... 2018年7月,浙江省某大口黑鲈(Micropterus salmoides)养殖场暴发疑似病毒引起的疾病。现场采样发现,病鱼体长约15-20cm,鱼体于水面下暗游,反应迟钝,体表有出血点或溃疡症状。本研究通过采用鲤鱼上皮瘤细胞(epithelioma papulosum cyprinid,EPC)培养、超薄切片透射电镜观察、病毒主要衣壳蛋白(major capsid protein,MCP)克隆与测序分析等方法,从患病大口黑鲈中分离得到一株病毒,鉴定其属于虹彩病毒科蛙病毒属,命名为大口黑鲈虹彩病毒宁波分离株(LMBIV-NB001)。EPC经患病鱼组织匀浆液接种后出现细胞圆缩、死亡、脱落等典型的细胞病变症状。将感染后的EPC细胞制作超薄切片,通过电镜观察发现,EPC细胞质中存在大量直径约120nm具囊膜的正六边形成熟病毒粒子,形态与虹彩病毒相似。根据虹彩病毒MCP基因保守区域序列设计特异性引物对病鱼组织样本进行PCR扩增,获得了1029bp的目的基因片段。将该扩增片段连入pMD19-T simple质粒后测序,经BLAST比对分析显示,其与GenBank中已报道的鳜鱼蛙病毒NH-1609、大口黑鲈溃疡综合征病毒BG/TH/CU3、EPC060608-08的MCP基因同源性最高,相似度均达到99.13%。构建系统进化树分析表明,本研究分离的LMBIV-NB001株与NC_038508、GU256635、MG941005等虹彩病毒科蛙病毒属毒株聚成一簇。本论文研究结果为不同地区蛙病毒属成员的起源和分化等相关研究等提供了基础材料。 展开更多
关键词 大口黑鲈 虹彩病毒科 MCP基因 鲤鱼上皮瘤细胞(EPC) 分离鉴定
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缢蛏养殖池塘氨氧化微生物的季节变化特征 认领
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作者 王鑫毅 赵婧 +3 位作者 金珊 赵青松 周素明 竺俊全 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期862-868,共7页
为探究缢蛏(Sinonovacula constricta)养殖池塘中氨氧化细菌(AOB)和氨氧化古菌(AOA)的季节变化及其环境因子相关性,试验以amoA基因为分子标记,利用荧光定量PCR技术对养殖池塘水体及沉积物中的AOA和AOB进行了研究。结果显示,季节变化对... 为探究缢蛏(Sinonovacula constricta)养殖池塘中氨氧化细菌(AOB)和氨氧化古菌(AOA)的季节变化及其环境因子相关性,试验以amoA基因为分子标记,利用荧光定量PCR技术对养殖池塘水体及沉积物中的AOA和AOB进行了研究。结果显示,季节变化对于水体及沉积物中的AOA和AOB的amoA基因丰度有一定的影响,不同季节的水体及沉积物中AOA含量均比AOB含量高一个数量级。其中水体中AOB在秋季显著高于其余三季(P<0.05);AOA在冬季最低,且显著低于春秋两季(P<0.05)。沉积物中AOB和AOA均在冬季显著高于其余三季(P<0.05)。环境因子相关性分析结果表明:水体中AOB丰度与氨氮成显著正相关(P<0.05),与亚硝氮成显著负相关(P<0.05);AOA丰度与水温成正显著相关(P<0.05),与硝氮成负显著相关(P<0.05)。沉积物中AOB丰度与溶解氧、硝氮、总氮及亚硝氮成显著正相关(P<0.05),与水温成显著负相关(P<0.05);AOA丰度与溶解氧、总氮、硝氮成显著性正相关(P<0.05),与水温成负显著相关(P<0.05)。多元线性回归方程结果显示,缢蛏养殖池塘的AOA及AOB丰度与硝氮密切相关。研究表明,AOA在缢蛏养殖池塘氨氧化进程中占据主导地位,AOA和AOB丰度受盐度、温度、氮素浓度及溶解氧等环境因子的共同影响。 展开更多
关键词 缢蛏 氨氧化细菌 氨氧化古菌 荧光定量 环境因子
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循环水养殖黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)水体中循环率对水质因子和细菌群落多样性的影响 认领
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作者 李卢国 骆云慧 徐善良 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期318-327,共10页
为探讨循环水养殖系统中循环率对水质因子和细菌群落多样性的影响,以黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)为研究对象,研究了4次/天(低循环率)、8次/天(中循环率)、12次/天(高循环率)三个流量下,养殖桶和生物过滤桶两部分细菌群落结构、多样... 为探讨循环水养殖系统中循环率对水质因子和细菌群落多样性的影响,以黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)为研究对象,研究了4次/天(低循环率)、8次/天(中循环率)、12次/天(高循环率)三个流量下,养殖桶和生物过滤桶两部分细菌群落结构、多样性以及细菌群落与环境因子的相关性。高通量测序结果表明:黑鲷循环水养殖中优势细菌类群为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)。流量的升高可增加系统的细菌多样性,且高循环率过滤桶中具有净化水质降低营养盐功能的有益菌属更为多样化及丰度更高,同时,其系统去氨氮和总氮效果更好,去除率分别是49.5%和22.3%,氨氮去除率是低循环率组的2.9倍和中循环率的3.6倍,总氮去除率是低循环率组的8.2倍和中循环率组的20.5倍。PCoA分析和聚类分析结果表明,各实验组养殖桶与生物过滤桶中细菌群落组成有着明显的差异,中、高循环率组过滤桶菌落结构与低循环率的有明显的差异。环境因子与细菌群落结构相关性分析结果表明,总磷、活性磷酸盐、亚硝酸盐和总氮等指标对细菌群落结构影响相对较大,但未发现两者间有很显著的相关性。 展开更多
关键词 黑鲷(Acanthopagrus schlegelii) 循环水养殖 细菌群落 高通量测序 循环率
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大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)单核巨噬细胞低氧胁迫比较转录组学分析 认领
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作者 朱婷芳 管峰 +2 位作者 苗亮 史雨红 陈炯 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期335-344,共10页
低氧是鱼类在水生环境中的关键压力之一。而大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,mudskipper)可能是少数能在低氧中自然呼吸的脊椎动物。本研究中,我们分析了低氧胁迫8h后大弹涂鱼头肾源单核巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ... 低氧是鱼类在水生环境中的关键压力之一。而大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,mudskipper)可能是少数能在低氧中自然呼吸的脊椎动物。本研究中,我们分析了低氧胁迫8h后大弹涂鱼头肾源单核巨噬细胞(monocytes/macrophages,MO/MΦ)转录组变化。采用Illumina Hiseq 4000平台进行高通量测序,获得了大弹涂鱼MO/MΦ短时低氧胁迫相关的转录组数据,并将获得的原始数据上传至NCBI获得ID号:SRR9771486-SRR9771491(Bioproject PRJNA543702)。分析结果显示,P<0.05和|log2(fold change)|≥1条件下进行差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)筛选,低氧处理组中共获得4487个DEGs,包括2507个上调DEGs,1980个下调DEGs。其中低氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIF)转录本的表达无显著变化,而血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor-A.VEGF-A)和3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因转录本表达上调。基因本体(Gene Ontology,GO)注释以及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析揭示了糖酵解/糖异生和氧化磷酸化可能在MO/MΦ应对短时低氧胁迫中具有重要作用。随机选择10个DEGs进行实时荧光定量PCR验证,上述基因表达变化趋势与转录组数据一致。本研究揭示了在短时低氧胁迫下大弹涂鱼MO/MΦ基因表达及信号通路调控机制。 展开更多
关键词 低氧胁迫 基因表达 信号通路 比较转录组学分析 大弹涂鱼
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凡纳滨对虾-缢蛏生态循环养殖池塘中浮游植物群落结构与水质因子相关性研究 认领 被引量:1
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作者 骆云慧 李来国 +3 位作者 赵淳朴 王丹丽 徐善良 徐继林 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期378-387,共10页
为研究凡纳滨对虾(Litoperaaeus vannamei)与缢蛏(Siaoraovacula constricta)生态循环养殖过程中浮游植物群落结构及其与水质因子变化特征之间的相关性,本实验于2018年6月至11月在宁波市鄞州区椿霖养殖场对虾蛏循环养殖池塘中水质及浮... 为研究凡纳滨对虾(Litoperaaeus vannamei)与缢蛏(Siaoraovacula constricta)生态循环养殖过程中浮游植物群落结构及其与水质因子变化特征之间的相关性,本实验于2018年6月至11月在宁波市鄞州区椿霖养殖场对虾蛏循环养殖池塘中水质及浮游植物的动态开展了逐月采样监测,分析了养虾塘与养蛏塘中的浮游植物群落结构变化及水质因子变动。结果显示:(1)对虾养殖期间共鉴定出6个门101种浮游植物(包含9个未定种),从种的数量上来看,硅藻门>甲藻门>绿藻门>蓝藻门>裸藻门>隐藻门,其中包含优势种14种,养殖初期优势种为硅藻门的新月菱形藻(Nitzschia closteriu)、牟氏角毛藻(Chaetoceros muelleri)等,随后甲藻门的海洋原甲藻(Prorocentrum micans)和绿藻门的小球藻(Chlorella vulgaris)等逐渐占据优势,后期仍以硅藻门为主要优势种。(2)浮游植物的丰度介于6.8×10~5-2.5×10~8cell/L,生物量为2.04-65.72mg/L,Shannon-Wiener多样性指数范围为1.34-2.56,均匀度指数范围为0.43-0.72,多样性水平较高,物种分布的均匀度较好。(3)对浮游植物群落结构与水质因子进行CCA分析后得到硅藻门种群变化主要与温度、盐度、pH密切相关(P<0.05);绿藻门种群优势受氮含量(总氮、亚硝酸盐氮、氨氮)的影响较大;而甲藻门、蓝藻门种类则与磷含量(总磷、活性磷)与温度相关。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei) 缢蛏(Sinonovacula constricta) 浮游植物 水质因子 循环养殖
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以培养创新型人才为导向的动物学课程改革与实践 认领 被引量:2
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作者 王丹丽 赵淳朴 +2 位作者 李格 王亚军 徐善良 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期124-126,共3页
大学的动物学课程是生物学科基础教育平台的必修课程,对后续专业学习十分重要。以培养水产养殖学专业本科生创新型人才为背景,从"95后"和"00后"学生的个性和学习特点出发,分析了传统动物学课堂教学中存在的主要问题... 大学的动物学课程是生物学科基础教育平台的必修课程,对后续专业学习十分重要。以培养水产养殖学专业本科生创新型人才为背景,从"95后"和"00后"学生的个性和学习特点出发,分析了传统动物学课堂教学中存在的主要问题,针对性地开展了动物学课程的课堂教学改革与实践。从"问题引领"为导向的课前、课中、课后的拓展思维训练;"多维互动"为核心的"实物标本-数码模型-二维信息"一体的全息体验;"自主参与"为目标的学生科研实践和教学软件开发;"科学评价"为结果的学生自评体系创新4个方面,总结了近年来在动物学课堂教学的改革与实践经验,旨在进一步改进和提高动物学课堂教学的效果,提高学生拓展性思维及创新动手能力,为培养海洋科学的创新型人才和卓越人才打下坚实的基础。 展开更多
关键词 动物学 教学模式 改革与创新
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