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CRISPR/Cas系统在植物抗病毒中的应用 预览
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作者 闫洪波 高艳丽 +2 位作者 孙世卫 窦炎丹 吴志明 《草业科学》 CAS CSCD 2019年第5期1405-1414,共10页
近年来,CRISPR/Cas系统因其简易性和有效性不仅在植物基因组编辑中得到广泛应用,而且开始应用于植物抗病毒研究。本文介绍了CRISPR/Cas系统的研究进展,详述了CRISPR/Cas9和CRISPR/Cas13a在抗植物病毒中的应用,以及靶向病毒基因组和靶向... 近年来,CRISPR/Cas系统因其简易性和有效性不仅在植物基因组编辑中得到广泛应用,而且开始应用于植物抗病毒研究。本文介绍了CRISPR/Cas系统的研究进展,详述了CRISPR/Cas9和CRISPR/Cas13a在抗植物病毒中的应用,以及靶向病毒基因组和靶向宿主植物基因组两种抗病毒基本策略;同时讨论了CRISPR/Cas12a和相关原核Ago系统在抗植物病毒上的潜在应用前景,并指出CRISPR/Cas在应用中存在的挑战。由于CRISPR/Cas系统在抗植物病毒研究中的优势,可能给植物抗病毒育种带来革命性变化。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 CRISPR/Cas13a 植物病毒 病毒基因组 宿主植物基因组 抗病毒策略 Ago系统
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甲型流感病毒基因组的进化与变异 被引量:1
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作者 陈闻天 黄鹤 +1 位作者 于汉杰 李铮 《中国病毒病杂志》 CAS 2018年第5期411-420,共10页
甲型流感病毒对人类社会造成严重危害,而快速变异的特点使得预防控制工作极为复杂。目前的研究大多聚焦于部分亚型的进化及突变,缺少能系统反映甲型流感病毒基因组的整体研究工作。本文结合生物信息学与病毒学研究最新成果,针对甲型流... 甲型流感病毒对人类社会造成严重危害,而快速变异的特点使得预防控制工作极为复杂。目前的研究大多聚焦于部分亚型的进化及突变,缺少能系统反映甲型流感病毒基因组的整体研究工作。本文结合生物信息学与病毒学研究最新成果,针对甲型流感病毒全基因组8条片段的进化特点及突变对功能的影响进行全面综述,从而揭示近年来对人类社会中造成严重影响的H1N1、H3N2、H5N1与H7N9等亚型流感病毒的起源与进化,有助于进一步提高对甲型流感病毒的认识和抵御潜在流感大流行的能力。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 病毒基因组 H1N1 H5N1 H7N9
植物呼肠孤病毒研究的最新进展 预览 被引量:3
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作者 龚祖埙 彭海 《中国病毒学》 CSCD 1993年第2期 125-131,共7页
<正> 植物呼肠孤病毒是一类形态复杂、具有多种病毒结构蛋白及片段化双链RNA基因组的病毒,一直受到病毒学家的注意。植物呼肠孤病毒对媒介昆虫的侵染不表现细胞病理
关键词 植物病毒 呼肠孤病毒
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CRISPR/Cas系统在抗病毒研究中的应用
4
作者 于楠楠 闫洪波 张香美 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期393-398,共6页
近年来,CRISPR/Cas系统因其效率高、靶向性强、易操作等优势,已被广泛应用于多种病毒研究中。本文首先简单介绍了CRISPR/Cas系统的分类,并比较了Cas9和Cas12a与Cas13a的特点;其次重点介绍了CRISPR/Cas9通过靶向破坏病毒基因组,或编辑宿... 近年来,CRISPR/Cas系统因其效率高、靶向性强、易操作等优势,已被广泛应用于多种病毒研究中。本文首先简单介绍了CRISPR/Cas系统的分类,并比较了Cas9和Cas12a与Cas13a的特点;其次重点介绍了CRISPR/Cas9通过靶向破坏病毒基因组,或编辑宿主关于病毒生命周期的关键因子的策略在抗病毒方面的各种应用,CRISPR/Cas13a采用靶向破坏病毒基因组方法在抗病毒中的应用,以及CRISPR/Cas12a和CRISPR/Cas13a在病毒基因检测中的应用。最后讨论了CRISPR/Cas在病毒研究中面临的挑战,并讨论了CRISPR/Cas12a作为抗病毒工具的潜在应用前景。由于CRISPR/Cas系统自身的优势,预计该系统将会给病毒相关的疾病诊断和控制带来革命性的变化。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 病毒 病毒基因组 宿主因子 基因检测
Multiplex qPCR for serodetection and serotyping of hepatitis viruses: A brief review 预览
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作者 Mohammad Irshad Priyanka Gupta +1 位作者 Dhananjay Singh Mankotia Mohammad Ahmad Ansari 《世界胃肠病学杂志:英文版》 SCIE CAS 2016年第20期4824-4834,共11页
The present review describes the current status of multiplex quantitative real time polymerase chain reaction(q PCR) assays developed and used globally for detection and subtyping of hepatitis viruses in body fluids. ... The present review describes the current status of multiplex quantitative real time polymerase chain reaction(q PCR) assays developed and used globally for detection and subtyping of hepatitis viruses in body fluids. Several studies have reported the use of multiplex q PCR for the detection of hepatitis viruses, including hepatitis A virus(HAV), hepatitis B virus(HBV), hepatitis C virus(HCV), hepatitis D virus(HDV), and hepatitis E virus(HEV). In addition, multiplex q PCR has also been developed for genotyping HBV, HCV, and HEV subtypes. Although a single step multiplex q PCR assay for all six hepatitis viruses, i.e., A to G viruses, is not yet reported, it may be available in the near future as the technologies continue to advance. All studies use a conserved region of the viral genome as the basis of amplification and hydrolysis probes as the preferred chemistries for improved detection. Based on a standard plot prepared using varying concentrations of template and the observed threshold cycle value, it is possible to determine the linear dynamic range and to calculate an exact copy number of virus in the specimen. Advantages of multiplex q PCR assay over singleplex or other molecular techniques in samples from patients with co-infection include fast results, low cost, and a single step investigation process. 展开更多
关键词 CO-INFECTION VIRAL genome Quantitative real-time POLYMERASE chain reaction GENOTYPING techniques SER
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寨卡病毒基因序列分析及核酸检测方法 被引量:3
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作者 狄弘玮 彭浩然 +4 位作者 朱善邦 朱诗应 戚中田 唐海琳 赵平 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期661-667,共7页
目的分析寨卡病毒基因组序列特征,建立寨卡病毒的核酸检测方法。方法构建81种虫媒传播黄病毒和寨卡病毒的系统进化树,比较寨卡病毒与登革病毒4型、日本脑炎病毒的核酸和氨基酸序列差异,分析亚洲型和非洲型寨卡病毒基因变异位点,尤其是... 目的分析寨卡病毒基因组序列特征,建立寨卡病毒的核酸检测方法。方法构建81种虫媒传播黄病毒和寨卡病毒的系统进化树,比较寨卡病毒与登革病毒4型、日本脑炎病毒的核酸和氨基酸序列差异,分析亚洲型和非洲型寨卡病毒基因变异位点,尤其是中国的4株输入性寨卡病毒基因序列。通过比较亚洲型和非洲型寨卡病毒全基因组核酸序列,设计一组寨卡病毒实时荧光定量PCR检测的引物和探针,并检测其敏感性与特异性。结果 81种虫媒传播黄病毒中,寨卡病毒与Spondweni、Kedougou病毒同源性最近。全基因组核酸序列比较结果显示寨卡病毒与登革病毒4型的同源性比日本脑炎病毒更近,而氨基酸序列比较结果显示寨卡病毒与日本脑炎病毒的同源性更近。与传统亚洲型寨卡病毒比较,广东GD01株有5个氨基酸突变位点,广东GDZ16001株有3个,浙江ZJ03株有6个,赣县VE Ganxian株有33个。所设计的PCR引物和探针对质粒标准品检测呈阳性,检测下限为100拷贝/mL,对细胞培养的寨卡病毒RNA检测呈阳性,而对登革病毒1~4型和日本脑炎病毒检测呈阴性。结论寨卡病毒与Spondweni病毒同源性最近,赣县VE Ganxian株的高变异显示寨卡病毒正在快速变异。本研究设计的PCR引物和探针可用于亚洲型和非洲型寨卡病毒株检测,具有较高的敏感性和特异性。 展开更多
关键词 寨卡病毒 病毒基因组 RNA序列分析 核酸检测 亚洲
基于核酸杂交的病毒基因组特异性纯化富集方法的初步研究 被引量:1
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作者 王利静 刘林 +4 位作者 李建东 李伟红 张硕 梁米芳 李德新 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2016年第2期212-215,共4页
目的 探索实验室高通量检测前临床样本中病毒核酸特异性纯化富集的方法.方法 以负链RNA病毒发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)为模拟样本,针对病毒基因组S、M和L三个片段设计杂交探针,并进行5'端生物素修饰,与链霉亲和素修饰磁珠共... 目的 探索实验室高通量检测前临床样本中病毒核酸特异性纯化富集的方法.方法 以负链RNA病毒发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)为模拟样本,针对病毒基因组S、M和L三个片段设计杂交探针,并进行5'端生物素修饰,与链霉亲和素修饰磁珠共价结合,纯化样本中SFTSV核酸,比较研究特异性纯化富集对样本二代测序效果的影响.结果 cDNA文库制备时全转录组扩增前或后进行特异性富集纯化均较不开展富集纯化有显著改善,有效数据比例分别为5.57%、6.39%、2.71%,差别具有显著性(x2=9 799.8,P<0.001).对全转录组扩增前或后进行特异性富集纯化对测序结果进行比较分析时发现,扩增后进行纯化优于扩增前(P<0.001).结论 基于核酸杂交的病毒基因组特异性富集纯化方法可有效降低二代测序中背景值,提高测序效率,具有高通量检测前特异性纯化富集样本的作用. 展开更多
关键词 病毒基因组 纯化 富集 二代测序
埃博拉病毒2014年毒株的基因组变异特征分析 被引量:2
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作者 朱永强 戚中田 +1 位作者 王升跃 董辉 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期612-618,共7页
目的通过对埃博拉病毒2014年毒株基因组共102株序列的分析,研究其变异特征,探讨病毒基因组变异与其流行病学特征改变之间的关系。方法选取NCBI公共数据库中埃博拉病毒全基因组序列,应用Mummer3.0软件分析病毒基因组变异特征;使用MEGA5... 目的通过对埃博拉病毒2014年毒株基因组共102株序列的分析,研究其变异特征,探讨病毒基因组变异与其流行病学特征改变之间的关系。方法选取NCBI公共数据库中埃博拉病毒全基因组序列,应用Mummer3.0软件分析病毒基因组变异特征;使用MEGA5软件进行蛋白进化分析;应用CPHmodels和PyMOL软件,根据蛋白同源性模拟蛋白的三维构型。结果埃博拉病毒2014年毒株(扎伊尔型)基因组中,共有606个位点发生变异,其中有49个变异位点是2014年毒株特有的、并导致所编码的氨基酸发生非同义突变。特别是NP蛋白第128位、GP蛋白第82位和L蛋白第1 951位氨基酸,不仅在2014年之前所有的扎伊尔型毒株中是保守不变的,而且在其余埃博拉病毒亚型之间也是高度保守的,但在2014年毒株中却发生了特异性的变异。结论埃博拉病毒2014年毒株基因组具有独特的变异特征,使得NP、GP和L蛋白发生变异,特别是GP蛋白第82位氨基酸由丙氨酸突变为缬氨酸,将影响其所在的α螺旋的稳定性,这可能是2014年毒株致死能力减弱和传播能力增强的原因之一。基因组变异是否直接导致此次疫情中病毒流行病学特征改变,还需要进一步的实验研究证实。 展开更多
关键词 埃博拉病毒 病毒基因组 变异(遗传学) 计算生物学
Advances of Studies on the Viral Proteins of PRRSV 预览
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作者 Cao Zongxi Shi Zhihai +2 位作者 Lin Zhemin Jiao Peirong Zhang Guihong 《动物与饲料科学:英文版》 CAS 2014年第2期80-82,90共4页
Porcine reproductive and respiratory syndrome( PRRS) is one of viral diseases with severe reproductive obstacle of pregnant sows and respiratory tract symptoms and higher mortality of piglets as characteristics,which ... Porcine reproductive and respiratory syndrome( PRRS) is one of viral diseases with severe reproductive obstacle of pregnant sows and respiratory tract symptoms and higher mortality of piglets as characteristics,which is caused by porcine reproductive and respiratory syndrome virus( PRRSV). PRRS has brought great threats to swine industry in the world. The advances of studies on the viral proteins of PRRSV were reviewed from the genome,non-structural proteins and structural proteins of PRRSV. 展开更多
关键词 PRRSV VIRAL GENOME NON-STRUCTURAL PROTEINS Structu
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鱼类神经坏死病毒研究进展与发展趋势 预览 被引量:3
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作者 陈文捷 刘晓丹 +6 位作者 胡先勤 王文文 秦真东 王瑶 周洋 刘小玲 林蠡 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1666-1672,共7页
神经坏死病毒(nervous necrosis virus,NNV)是一种世界范围内流行、严重危害多种海水和淡水鱼类的传染性病原。NNV为单一正链、2节段RNA病毒,基因组由RNA1(3.1 kb)和RNA2(1.4 kb)组成。在病毒复制过程中,会合成亚基因组RNA3。RNA... 神经坏死病毒(nervous necrosis virus,NNV)是一种世界范围内流行、严重危害多种海水和淡水鱼类的传染性病原。NNV为单一正链、2节段RNA病毒,基因组由RNA1(3.1 kb)和RNA2(1.4 kb)组成。在病毒复制过程中,会合成亚基因组RNA3。RNA1编码RNA聚合酶。RNA2编码衣壳蛋白,为病毒的唯一结构蛋白。RNA3编码B1和B2两种非结构蛋白。根据病毒衣壳蛋白的基因序列,神经坏死病毒可以分成4种基因型,分别为拟鲹、红鳍东方鲀、条斑星鲽和赤点石斑神经坏死病毒基因型。但是,目前只发现A、B、C三种病毒血清型,A对应拟鲹神经坏死病毒基因型,B对应红鳍东方鲀神经坏死病毒基因型、C对应条斑星鲽神经坏死病毒和赤点石斑神经坏死病毒基因型。病毒存在垂直和水平两种传播途径,而且广泛分布于养殖和野生鱼类中。阻断病毒在野生与养殖鱼类之间的传播和开展新型鱼类疫苗研发是将来研究趋势。 展开更多
关键词 神经坏死病毒 病毒基因组 病毒蛋白 基因型 血清型 疾病防控
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绵羊肺腺瘤病毒内蒙古分离株前病毒全基因组克隆及序列分析 被引量:3
11
作者 刘畅 李磊 +3 位作者 于立新 么宏强 周建华 马学恩 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期508-513,共6页
为了探究绵羊肺腺瘤病毒(Jaagsiekte sheep retrovirus,JSRV)内蒙古流行株与国际各代表株间的亲缘关系,本研究以内蒙古地区绵羊肺腺瘤病自然病例的肺组织总DNA为模板,克隆gag、pro与pol基因,并应用双酶切的方法将其与本实验室先期制... 为了探究绵羊肺腺瘤病毒(Jaagsiekte sheep retrovirus,JSRV)内蒙古流行株与国际各代表株间的亲缘关系,本研究以内蒙古地区绵羊肺腺瘤病自然病例的肺组织总DNA为模板,克隆gag、pro与pol基因,并应用双酶切的方法将其与本实验室先期制备并保存的LTR、env基因连接起来,得到了含有JSRV内蒙古分离株前病毒全基因组重组质粒pMD-JSRV。序列分析结果表明,JSRV内蒙古分离株前病毒全基因组全长7 690bp,具外源性JSRV典型的分子特征:1在gag基因中含Sca I酶切位点;2核衣壳蛋白区有2个保守的可形成锌指结构的"CCHC"基序;3env基因编码的TM区胞浆尾部包含保守的特异性"YXXM"基序。将其进行同源性分析,结果表明该株病毒属JSRV-II型,与分离自美国的代表株AF105220间亲缘关系较近,同源性达95%。本研究为进一步探讨JSRV内蒙古分离株基因组结构特点与其致病机制间的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 绵羊肺腺瘤病毒 病毒全基因组 克隆 序列分析
2009年新型甲型H1N1流感病毒全基因组序列重组分析 被引量:18
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作者 殷建华 谢佳新 +4 位作者 韩磊 鹿文英 韩一芳 张宏伟 曹广文 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期637-640,共4页
目的:分析2009年流行的新型甲型流感病毒(A/H1N1)全序列的基因重组现象。方法:从NCBI基因数据库下载2009年新型甲型流感病毒(A/H1N1)全基因组序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA4.0)软件对8... 目的:分析2009年流行的新型甲型流感病毒(A/H1N1)全序列的基因重组现象。方法:从NCBI基因数据库下载2009年新型甲型流感病毒(A/H1N1)全基因组序列,采用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 4.0(MEGA4.0)软件对8条基因序列进行拼接和比对,分析2009年爆发株与历史流行株序列间的同源性;同时采用Simplot3.5.1软件分析新型流感病毒A/H1N1基因重组现象。结果:2009年3月以来爆发的新型A/H1N1病毒株聚合酶B1(polymerase B1,PB1)基因来自于人H3N2,其同源性为93.7%;聚合酶B2(polymerase B2,PB2)和聚合酶A(polymerase A,PA)与禽H5N1同源性较高,同源性分别为89.0%、89.9%;血凝素(hemagglutinin,HA)、核蛋白(nucleoprotein,NP)和非结构蛋白(non-structural protein,NS)与北美地区猪H1N1同源性较高,同源性分别为91.7%、93.1%和93.1%;神经氨酸酶(neuraminidase,NA)和基质蛋白(matrixprotein,MP)与欧洲地区猪H1N1同源性较高,同源性分别为90.5%、95.5%。全基因序列同源性分析发现2009年新型A/H1N1病毒与北美地区猪H1N1病毒同源性最高,为83.9%。结论:2009年新型甲型H1N1流感病毒可能是人H3N2、北美地区猪H1N1、欧洲地区猪H1N1、禽H5N1的基因重排病毒。 展开更多
关键词 H1N1甲型流感病毒 病毒基因组 遗传重排 进化
对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(福建株)基因组的克隆 预览 被引量:4
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作者 吴昊 徐丽美 杨丰 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期 147-151,共5页
对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHN... 对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHNV,但未见其基因组序列报道.本文首先利用DNA末端加尾和嵌套PCR克隆了IHHNV基因组两末端序列,并根据测定的末端序列设计引物,PCR扩增出中国福建株IHHNV基因组序列. 展开更多
关键词 传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV) 嵌套PCR 病毒基因组 5’和3’末端序列
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水稻条纹病毒分子生物学研究进展 预览 被引量:7
14
作者 张恒木 孙焕然 +1 位作者 王华弟 陈剑平 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期 436-440,共5页
水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)是最重要的水稻病毒之一,给水稻生产造成了严重损失。它隶属于纤细病毒属,是该属的典型成员。其基因组由4条单链负义RNA基因组片段组成,根据序列分析和试验证据推测共可编码7个病毒蛋白。围... 水稻条纹病毒(Rice stripe virus,RSV)是最重要的水稻病毒之一,给水稻生产造成了严重损失。它隶属于纤细病毒属,是该属的典型成员。其基因组由4条单链负义RNA基因组片段组成,根据序列分析和试验证据推测共可编码7个病毒蛋白。围绕近年来国内外有关RSV粒子特点、基因组和病毒蛋白的研究进展作一简要综述,并提出了RSV研究过程中涉及到的一些问题。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 病毒基因组 病毒蛋白
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纳米孔测序技术在病毒基因组研究中的应用
15
作者 王佶 马学军 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第2期214-219,共6页
Oxford Nanopore Technologies (ONT)公司开发出了商业化的纳米孔测序仪-MinION。相对于二代测序技术平台,MinION的主要特点是读长长、简单快速、便携性高且可以实时分析测序数据。各国的研究人员也已经逐步将MinION应用于病毒检测... Oxford Nanopore Technologies (ONT)公司开发出了商业化的纳米孔测序仪-MinION。相对于二代测序技术平台,MinION的主要特点是读长长、简单快速、便携性高且可以实时分析测序数据。各国的研究人员也已经逐步将MinION应用于病毒检测、病毒全基因组测序、新病毒的发现、病毒准种与进化研究等领域。本文回顾了近几年纳米孔测序技术在病毒基因组研究中的应用,讨论了病毒基因组测序目前存在的问题,并展望了纳米孔测序技术未来的发展前景。 展开更多
关键词 纳米孔测序 MinION 病毒基因组测序 病毒检测
慢性乙型肝炎患者病毒基因组与乙型肝炎病毒e抗原、肝功能关系分析 预览 被引量:4
16
作者 刘振杰 曹永坚 +1 位作者 岑子华 徐宁 《国际检验医学杂志》 CAS 2016年第13期1784-1786,共3页
目的探讨乙型肝炎病毒基因组(HBV-DNA)、乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)、肝功能的相关关系,为临床治疗提供参考。方法回顾分析401例患者的HBV-DNA、HBeAg、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)水平,对HBVDNA与HBeAg进... 目的探讨乙型肝炎病毒基因组(HBV-DNA)、乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)、肝功能的相关关系,为临床治疗提供参考。方法回顾分析401例患者的HBV-DNA、HBeAg、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)水平,对HBVDNA与HBeAg进行相关性分析。根据患者的HBV-DNA、HBeAg水平进行分组,比较各组的ALT、AST水平差异。结果 (1)HBV-DNA与HBeAg的阳性率存在相关性,相关系数r=0.671(P〈0.01);(2)HBV-DNA载量达105 copies/mL时,血清ALT、AST较HBV-DNA阴性组及低载量组显著升高,差异有统计学意义(P〈0.05);(3)在HBV-DNA载量相当时,HBeAg阳性组与阴性组ALT、AST活性差异无统计学意义(P〉0.05)。结论 (1)HBeAg与HBV-DNA具有相关性;(2)HBV-DNA载量较高的患者容易出现肝功能异常;(3)HBeAg的存在情况与肝功能无显著相关性。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒基因组 乙型肝炎病毒E抗原 丙氨酸氨基转移酶 天冬氨酸氨基转移酶
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家蚕二分浓核病毒在家蚕细胞中的体外拯救 被引量:1
17
作者 张苗苗 马瑛 +6 位作者 潘晓利 胡朝阳 李国辉 司亚运 邢亚丽 陈克平 姚勤 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期86-95,共10页
家蚕二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)是特异性感染家蚕中肠引起慢性浓核病症的致病原,基因组含有2套单链DNA分子(VD1和VD2),复制机制尚不清楚.为了能够在体外拯救出有感染性的病毒粒子,构建了BmBDV的基因组全长的克... 家蚕二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus,BmBDV)是特异性感染家蚕中肠引起慢性浓核病症的致病原,基因组含有2套单链DNA分子(VD1和VD2),复制机制尚不清楚.为了能够在体外拯救出有感染性的病毒粒子,构建了BmBDV的基因组全长的克隆质粒pMD 18T-VD1和pUC-VD2,并通过酶切构建的克隆质粒来获得双链的基因组片段VD1和VD2,利用脂质体包埋的方法,线性化共转染BmN细胞.提取转染后的BmN细胞总DNA,经去甲基化处理后,通过PCR检测到病毒基因的复制;提取转染后的BmN细胞和添食回感的家蚕中肠的总蛋白,分别进行蛋白质印记杂交检测,检测到病毒基因的表达.由此首次表明,该病毒线性化的基因组片段通过共转染BmN细胞的方法,可以在体外条件下拯救出具有感染性的病毒粒子. 展开更多
关键词 病毒基因组片段 线性化共转染 BmN细胞 病毒拯救
用SARS冠状病毒全基因组芯片杂交方法分析SARS-CoV 预览 被引量:5
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作者 吴小兵 任鲁风 +8 位作者 马鑫 何新洲 袁振华 刘凤杰 赵革新 杨宇 张猛 董小岩 侯云德 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 2003年第7期 89-93,97,共6页
为从临床样品中检测和分析SARS-CoV病毒打基础,并为分析SARS-CoV病毒的复制和转录等机理提供一种有效方法.以SARS冠状病毒 TOR2株序列作为标准设计和制备一种覆盖SARS冠状病毒全基因组的寡聚核苷酸芯片,探针长度为70nt,每相邻的探针序... 为从临床样品中检测和分析SARS-CoV病毒打基础,并为分析SARS-CoV病毒的复制和转录等机理提供一种有效方法.以SARS冠状病毒 TOR2株序列作为标准设计和制备一种覆盖SARS冠状病毒全基因组的寡聚核苷酸芯片,探针长度为70nt,每相邻的探针序列重复25nt,共660条.用该芯片分析了细胞培养的SARS-CoV病毒总RNA、7个SARS-CoV病毒的基因克隆片段.对RNA样品用随机引物进行反转录PCR获得cDNA.对DNA用随机引物扩增和dUTP-cy3标记.结果用这种芯片杂交检测SARS-CoV病毒RNA可见阳性信号呈全基因组分布,并且有多处连续的阳性信号点;用正常人的白细胞RNA为对照,杂交未出现明显阳性信号.检测7个SARS-CoV病毒基因克隆片段,在该片段相应的探针区段出现连续阳性信号点.这种方法可有效地检测和分析样品中SARS冠状病毒全基因组的信息. 展开更多
关键词 SARS冠状病毒 全基因组 杂交方 SARS-COV 基因芯片
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弹状病毒研究的新进展:I.病毒的基因结构 预览 被引量:5
19
作者 沈加丽 龚祖埙 《中国病毒学》 CSCD 1997年第2期 103-111,共9页
关键词 弹状病毒 病毒 基因组结构
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病毒与人类基因组同源性实探 预览
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作者 常雅萍 马晶 《白求恩医科大学学报》 CSCD 1997年第3期 242-243,共2页
探讨病毒与人类基因组同源性问题。选用EB病毒(EBV),肠道病毒(EVs)、单纯疱疹病毒-1型(HSV-1),丙型肝炎病毒(HCV)特异性引的,以6份健康成人外周血DNA为模板,分别进行酶链式反应(PCR)。初步结果... 探讨病毒与人类基因组同源性问题。选用EB病毒(EBV),肠道病毒(EVs)、单纯疱疹病毒-1型(HSV-1),丙型肝炎病毒(HCV)特异性引的,以6份健康成人外周血DNA为模板,分别进行酶链式反应(PCR)。初步结果表明,有5份DNA样品可通过EBV、HCV特异性引物扩增,EBV引物扩增后的片段大小在154-234bp之间;HCV引物扩增的片段大小约200bp和120bp。提示病毒某些基因可能存在 展开更多
关键词 病毒基因 人类基因组 同源性
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