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5种条件下桉树焦枯病菌MAPK基因的表达 预览
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作者 杨泽慧 陆芝 +3 位作者 李丽红 江仲鹏 冯锦秀 冯丽贞 《福建农林大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第3期337-343,共7页
采用qPCR检测Calonectria pseudoreteaudii YA51的MAPK基因在盐胁迫、氧胁迫、细胞壁干扰物质胁迫、桉树组织诱导以及不同发育时期5种条件下的表达情况.结果表明CpKss1参与致病过程,CpKss1、CpSlt2和CpIme2与菌丝生长发育有关,CpKss1、C... 采用qPCR检测Calonectria pseudoreteaudii YA51的MAPK基因在盐胁迫、氧胁迫、细胞壁干扰物质胁迫、桉树组织诱导以及不同发育时期5种条件下的表达情况.结果表明CpKss1参与致病过程,CpKss1、CpSlt2和CpIme2与菌丝生长发育有关,CpKss1、CpHog1和CpIme2参与病菌高渗胁迫反应,CpSlt2参与调控氧胁迫反应和细胞壁完整性,且4个MAPK基因所介导的级联通路间可能存在既相互独立又相互协作的关系. 展开更多
关键词 桉树焦枯病菌 MAPK qPCR
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饲料脂肪水平对大口黑鲈CPT1表达的影响 预览
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作者 宋铭琪 钟云飞 +3 位作者 郭佳玲 陈拥军 罗莉 林仕梅 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2166-2174,共9页
为研究脂肪水平对大口黑鲈鱼体组织中肉碱棕榈酰转移酶I (CPT1)基因表达的影响及不同生长阶段的表达规律。实验设计6%(低脂)、12%(中脂)和18%(高脂)3种脂肪水平的等氮不等脂饲料,饲养初始体质量为(23.60±1.26)g的大口黑鲈,分别在... 为研究脂肪水平对大口黑鲈鱼体组织中肉碱棕榈酰转移酶I (CPT1)基因表达的影响及不同生长阶段的表达规律。实验设计6%(低脂)、12%(中脂)和18%(高脂)3种脂肪水平的等氮不等脂饲料,饲养初始体质量为(23.60±1.26)g的大口黑鲈,分别在饲养第30、60和90天取肝脏、肠道、肾脏和肌肉等组织样品,以18S为内参基因,用CPT1特异性引物进行实时荧光定量实验,使用2^-△△CT法得到CPT1基因的相对表达数据。结果显示,CPT1基因在肝脏中表达量最高,在肠道和肾脏中次之,在鳃丝、心脏、肌肉、胃、脑以及脾脏中表达量较低;在不同脂肪水平处理下,CPT1表达量随脂肪水平的增加而增加;在不同生长阶段中,CPT1表达量随饲养时间的延长而增加。研究表明,饲料脂肪水平及饲养时间会诱导大口黑鲈组织CPT1基因的表达,表明CPT1可能参与机体脂肪的分解代谢。 展开更多
关键词 大口黑鲈 脂肪水平 CPT1 基因表达 qPCR
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60Co-γ和EMS诱变“天隆一号”突变体库变异特征的初步分析
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作者 张鑫 苏彤 +5 位作者 顾玉阳 张艺 姚陆铭 王彪 朱骏 顾大国 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期517-524,共8页
为培育新的适应长江流域气候类型的大豆品种,利用60Co-γ射线和EMS分别对大豆天隆一号的种子进行诱变处理,构建大豆突变体库。对350份有表型变异的株系进行连续两年田间鉴定,运用60对SSR标记进行分子检测,并对籽粒表型变化明显的突变株... 为培育新的适应长江流域气候类型的大豆品种,利用60Co-γ射线和EMS分别对大豆天隆一号的种子进行诱变处理,构建大豆突变体库。对350份有表型变异的株系进行连续两年田间鉴定,运用60对SSR标记进行分子检测,并对籽粒表型变化明显的突变株进行苯基丙酸类代谢主要酶qPCR分析。结果表明:350份材料中有145份在株高、叶形、花色、种皮色、结荚习性等方面有稳定可见的表型变异,101份材料中检测到与野生型天隆一号存在至少1个SSR位点差异,其中M3-SD-1与M3-SD-2有超过10个标记的差异。SSR分析表明,表型发生变异的突变体主要是由DNA变化引起的,且突变体发生了多位点变异,突变位点也彼此不同。qPCR检测结果显示,种皮色、脐色等发生突变的3个材料苯基丙酸类代谢途径中关键基因的表达量发生显著变化。研究结果既可以为大豆品种改良提供新的种质资源,也有助于大豆功能基因组的研究。 展开更多
关键词 60Co-γ EMS 大豆 突变体库 SSR标记 qPCR
太湖悬浮颗粒物细菌碱性磷酸酶编码基因的分布特征 预览
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作者 章婷曦 卢小然 +3 位作者 魏超 李德芳 秦梦瑶 张利民 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1368-1378,共11页
颗粒态有机磷的碱性磷酸酶矿化是水生态系统磷循环的重要环节,对细菌碱性磷酸酶编码基因的解析有利于揭示浅水富营养化湖泊有机磷矿化的微生物驱动机制.本文以太湖不同生态类型湖区悬浮颗粒物为研究对象,运用荧光定量PCR技术,探究太湖... 颗粒态有机磷的碱性磷酸酶矿化是水生态系统磷循环的重要环节,对细菌碱性磷酸酶编码基因的解析有利于揭示浅水富营养化湖泊有机磷矿化的微生物驱动机制.本文以太湖不同生态类型湖区悬浮颗粒物为研究对象,运用荧光定量PCR技术,探究太湖水体中悬浮颗粒物细菌碱性磷酸酶phoX和phoD基因的时空分布特征,以及影响两类基因丰度的主要环境因子.结果表明:太湖不同生态类型湖区中phoD基因丰度是phoX基因的6~42倍,且二者均存在显著的时空分布差异.6月,河口区phoX(9.18×10^4copies/L)和phoD(1.88×10^6copies/L)基因丰度均最高,其次分别为草型区、湖心区和藻型区.与6月相比,9月各湖区phoD基因丰度显著降低,而phoX基因丰度在藻型区和草型区则有所升高.9月,草型区phoX基因丰度最高(5.70×10^4copies/L),河口区最低(1.49×10^4copies/L).水生植物对phoX和phoD基因丰度具有重要贡献.悬浮颗粒物细菌phoX基因丰度可能被低估.溶解氧、总氮和总磷是影响太湖phoX和phoD基因丰度的主要环境因子. 展开更多
关键词 碱性磷酸酶 编码基因 悬浮颗粒物 太湖 qPCR
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青菜泡菜工业发酵过程中微生物群落结构变化分析 预览
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作者 于文平 张亚豪 +2 位作者 吴正云 宫尾茂雄 张文学 《中国调味品》 CAS 北大核心 2019年第6期30-35,共6页
采用PCR-DGGE和qPCR技术检测四川工业青菜泡菜发酵过程中微生物群落组成。细菌DGGE条带表明,工业青菜泡菜中含有2个门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria);共有12个细菌属,包括乳杆菌属(Lactobacillus)、盐单胞菌属(... 采用PCR-DGGE和qPCR技术检测四川工业青菜泡菜发酵过程中微生物群落组成。细菌DGGE条带表明,工业青菜泡菜中含有2个门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria);共有12个细菌属,包括乳杆菌属(Lactobacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)和假单胞菌属(Pseudomonas)等,其中乳杆菌属的相对丰度最高,qPCR检测其含量为10^7~10^11 copies/mL。真菌DGGE条带表明,工业青菜泡菜的真菌属有5个,分别是德巴利氏酵母属(Debaryomyces)、假丝酵母属(Candida)、酵母属(Saccharomyces)、柯达酵母属(Kodamaea)、Cystofilobasidium,其中德巴利氏酵母属的相对丰度最高。 展开更多
关键词 工业泡菜 细菌群落 真菌群落 DGGE qPCR
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NSCLC患者尿液中游离miRNAsqPCR内参基因的选择 预览
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作者 钟鹏 郁霞青 +3 位作者 陈志刚 易婉婉 贾成友 吕中伟 《同济大学学报:医学版》 CAS 2019年第4期419-424,共6页
目的探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者和健康志愿者尿液中微小RNA(miRNA)内参基因的稳定性。方法分别收集NSCLC患者(12名)和健康志愿者(7名)尿液样本,经膜浓缩过滤后提取其中的总RNA。通过BGISEQ-500 miRNA建... 目的探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者和健康志愿者尿液中微小RNA(miRNA)内参基因的稳定性。方法分别收集NSCLC患者(12名)和健康志愿者(7名)尿液样本,经膜浓缩过滤后提取其中的总RNA。通过BGISEQ-500 miRNA建库和二代测序技术(NGS)测定尿液样本中miRNA的表达谱,基于测序表达量(transcript per million, TPM)值筛选出前5个高丰度的候选内参基因,包括常用的内参基因U6,通过实时荧光定量PCR(qPCR)技术在另一组样本中进行验证。利用geNorm软件、NormFinder软件和BestKeeper软件评价候选内参基因表达的稳定性。结果 geNorm软件和NormFinder软件分析结果一致,候选内参基因的稳定性由高到低的顺序为:真核生物核糖体大亚基(28S rRNA)、真核生物核糖体小亚基(18S rRNA)、U6、5S rRNA和tRNA。BestKeeper软件分析结果显示28S rRNA和U6的稳定性优于其它候选内参基因,tRNA的表达不稳定,18S rRNA最适合与其它候选内参基因联合使用。结论 28S rRNA是最稳定的内参基因,28S rRNA和18S rRNA可联合使用作为尿液样本中qPCR的内参基因;这为尿液中游离miRNAs在疾病诊断中的定量分析提供了重要依据。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 尿液 游离miRNA qPCR 内参基因
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水稻与纹枯病菌互作中免疫相关基因的表达研究 预览
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作者 刘列 秦蔚 +6 位作者 孙玚 刘欣茹 罗琼 韩光煜 李成云 杨根华 董文汉 《云南农业大学学报:自然科学版》 CSCD 北大核心 2019年第5期731-737,共7页
【目的】近年来水稻纹枯病的危害不断加重,在一些地区已成为水稻最严重的病害,严重威胁到中国水稻的产量和品质。由于引起水稻纹枯病的立枯丝核菌具有强腐生性和广寄主范围的特性,利用传统方法至今尚未筛选到高抗的资源品种。为了找到... 【目的】近年来水稻纹枯病的危害不断加重,在一些地区已成为水稻最严重的病害,严重威胁到中国水稻的产量和品质。由于引起水稻纹枯病的立枯丝核菌具有强腐生性和广寄主范围的特性,利用传统方法至今尚未筛选到高抗的资源品种。为了找到与抗性相关的基因和为抗性研究及抗病育种提供帮助。【方法】本研究在苗期和成株期接种抗病性不同的4 个水稻品种,利用qPCR 方法研究了在2 个生育期接种纹枯病菌后24 h 和48 h 水稻免疫相关基因的表达量变化。【结果】初步明确WARK71 和WARK53 是介导水稻纹枯病抗性的关键基因,可作为抗性相关的标记基因。【结论】水稻与纹枯病菌的互作中可能存在受水稻发育时期调控的开关基因。进一步系统分析水稻对纹枯病菌的抗性组分可为抗性基因的合理利用、水稻抗病品种的培育和预防纹枯病研究提供理论基础。 展开更多
关键词 水稻纹枯病 抗性相关基因 qPCR 相对基因表达量
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实时荧光定量PCR在皮肤结核诊断中的应用 预览
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作者 满春花 糜自豪 +8 位作者 孙乐乐 卢宪梅 王川 王建文 陈学超 刘永霞 陈声利 刘红 张福仁 《中国麻风皮肤病杂志》 2019年第4期215-218,共4页
目的:比较实时荧光定量PCR(qPCR)技术在皮肤结核(CTB)石蜡包埋组织及新鲜组织中的敏感性,以探讨在CTB石蜡包埋组织中开展结核分枝杆菌(MTB)检测的可行性。方法:应用qPCR技术检测临床确诊为CTB的6例新鲜组织样本和20例石蜡包埋组织样本的... 目的:比较实时荧光定量PCR(qPCR)技术在皮肤结核(CTB)石蜡包埋组织及新鲜组织中的敏感性,以探讨在CTB石蜡包埋组织中开展结核分枝杆菌(MTB)检测的可行性。方法:应用qPCR技术检测临床确诊为CTB的6例新鲜组织样本和20例石蜡包埋组织样本的MTB阳性率。结果:新鲜组织敏感性为50%,石蜡包埋组织敏感性为35%。结论:qPCR技术可检测CTB新鲜组织和石蜡包埋组织中的MTB,前者的敏感性高于后者。 展开更多
关键词 结核 皮肤结核 qPCR
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玉米ZmGRAS31基因的克隆及功能研究 预览
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作者 殷龙飞 王朝阳 +2 位作者 吴忠义 张中保 于荣 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1029-1037,共9页
GRAS 蛋白家族是一类植物特有的转录调控因子,在多种植物中均有报道。为了探究玉米 GRAS 基因家族在逆境胁迫下的功能,本研究从玉米根中克隆获得 ZmGRAS31 (AC: NC_024462),该基因全长 1422 bp,编码 473 个氨基酸。生物信息学分析表明 Z... GRAS 蛋白家族是一类植物特有的转录调控因子,在多种植物中均有报道。为了探究玉米 GRAS 基因家族在逆境胁迫下的功能,本研究从玉米根中克隆获得 ZmGRAS31 (AC: NC_024462),该基因全长 1422 bp,编码 473 个氨基酸。生物信息学分析表明 ZmGRAS31 蛋白分子量为 51,700.38 Da,理论等电点为 4.73,具有 GRAS 转录因子家族特有的保守结构域,但不具跨膜结构,亲水性较差。玉米原生质体瞬时表达实验表明 ZmGRAS31 定位于细胞核内。实时荧光定量 PCR (qPCR)分析表明,在低温、脱水、高盐、干旱处理下, ZmGRAS31 在玉米幼苗均上调表达;不同浓度NaCl 处理过表达 ZmGRAS31 转基因拟南芥植株,其根长优于野生型,由此推测该基因可能参与玉米非生物胁迫应答。 展开更多
关键词 玉米 ZmGRAS31 转录因子 原生质体 qPCR 非生物胁迫
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石柱参人参皂苷合成酶基因的克隆及表达量测定 预览
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作者 王丹丹 冷春玲 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期743-752,共10页
以人参为对照组,采用HPLC法测定5a生石柱参样品中6种人参皂苷(Rb1、Rb2、Rc、Re、Rg1、Rg2)的质量分数,采用实时荧光定量PCR技术对不同生长期人参皂苷合成酶基因(SS、CYP82D47、CYP716A42)的表达量进行比较,以探究石柱参人参皂苷质量分... 以人参为对照组,采用HPLC法测定5a生石柱参样品中6种人参皂苷(Rb1、Rb2、Rc、Re、Rg1、Rg2)的质量分数,采用实时荧光定量PCR技术对不同生长期人参皂苷合成酶基因(SS、CYP82D47、CYP716A42)的表达量进行比较,以探究石柱参人参皂苷质量分数较低的原因;并对石柱参CYP82D47基因进行克隆、测序及生物信息学分析,获得石柱参系统发育树。结果表明:石柱参人参皂苷合成酶基因的表达量在根、茎、叶组织中具有高度相似性,却也具有高度组织差异性,比如SS基因在石柱参根、叶中表达活跃,在茎中表达量有限;CYP82D47基因在石柱参中的表达部位主要是茎、叶组织;而CYP82D47基因在在根、茎、叶组织中表达较活跃,尤其是根、叶中;此外,人参皂苷合成酶基因CYP82D47的表达量相对较低是造成石柱参人参皂苷质量分数较低的原因之一;由系统进化树可见,石柱参与竹节参、西洋参、三七及刺五加的亲缘关系较近,结果与物种进化程度相符合。 展开更多
关键词 石柱参 人参皂苷 克隆 qPCR 基因表达量
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miRNA在自体细胞移植治疗扩张型心肌病的意义 预览
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作者 周红 董莉 《内蒙古医科大学学报》 2019年第1期100-103,107共5页
扩张型心肌病是一类以左心室或双心室扩大伴收缩功能障碍为特征的心肌病,本病患病率约为1/2500,预后差,是心力衰竭的第三位原因,确诊后5 a生存约50%,10 a生存约25%。心脏再同步化治疗(CRT)植入同步化治疗除颤器(CRTD)等治疗手段与... 扩张型心肌病是一类以左心室或双心室扩大伴收缩功能障碍为特征的心肌病,本病患病率约为1/2500,预后差,是心力衰竭的第三位原因,确诊后5 a生存约50%,10 a生存约25%。心脏再同步化治疗(CRT)植入同步化治疗除颤器(CRTD)等治疗手段与单纯药物治疗可有效预防心脏性猝死、降低死亡率、改善心功能,但价格昂贵、不能根本改善预后,基因治疗尚处于研究阶段,难度较大。心脏移植是最有效的根治方法,但因供体短缺、排异反应等无法广泛开展。自体骨髓单核细胞移植治疗可实现心肌细胞再生、改善新功能,进而提高生存率。同时,miRNA与扩张型心肌病的发生转归有相应的影响,本文就miRNA在自体骨髓单核细胞移植治疗扩张型心肌病中意义进行综述。 展开更多
关键词 MIRNA 扩张型心肌病 细胞移植 QPCR
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钾高效利用烤烟品种的筛选及其qPCR分析
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作者 刘加红 高华锋 +4 位作者 解燕 蔺忠龙 余磊 孔垂思 杨涛 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期2939-2942,共4页
钾是影响烤烟品质的重要元素之一,为筛选钾高效利用品种,研究其钾高效利用的分子机制,提高品种对钾的高效利用,本研究选取10个烤烟品种,通过水培试验,筛选钾高效利用品种,并在此基础上,对钾高效、钾低效品种进行钾离子通道的qRT-PCR分析... 钾是影响烤烟品质的重要元素之一,为筛选钾高效利用品种,研究其钾高效利用的分子机制,提高品种对钾的高效利用,本研究选取10个烤烟品种,通过水培试验,筛选钾高效利用品种,并在此基础上,对钾高效、钾低效品种进行钾离子通道的qRT-PCR分析,研究其钾高效利用的分子基础。结果表明:筛选出钾高效利用品种‘红花大金元’,钾低效品种‘MSK326’。钾高效品种‘红花大金元’在低钾情况下NtHAK1基因,NtNKT2基因,NtNKT-J基因,NtTPK1-2基因均上调表达。而钾低效品种‘MSK326’在低钾情况下NtHKAKS1基因,NtHKAKS基因,NtNKT2基因,NtTORK1基因均下调表达。 展开更多
关键词 烤烟 品种筛选 qPCR
PMA-qPCR方法检测陕西猕猴桃溃疡菌优势病原菌活菌的研究 预览
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作者 肖妍 刘芸宏 +4 位作者 高贵田 曹凡 马燕萍 赵武奇 雷玉山 《食品与机械》 北大核心 2019年第4期48-53,59共7页
将叠氮溴化丙啶(PMA)与实时荧光定量(qPCR)相结合定量检测陕西猕猴桃溃疡菌优势病原菌(Psa)活菌的数量。通过优化PMA最佳浓度、暗孵育时间、曝光时间,确定PMA-qPCR区别溃疡菌活、死菌的最佳条件。结果表明,Psa经98.3℃沸水浴处理13min... 将叠氮溴化丙啶(PMA)与实时荧光定量(qPCR)相结合定量检测陕西猕猴桃溃疡菌优势病原菌(Psa)活菌的数量。通过优化PMA最佳浓度、暗孵育时间、曝光时间,确定PMA-qPCR区别溃疡菌活、死菌的最佳条件。结果表明,Psa经98.3℃沸水浴处理13min可完全致死,Psa死菌浓度为1×10^7 CFU/mL时PMA与死菌共价交联的最佳浓度为105μg/mL,最佳暗育时间为8min,最佳曝光时间为20min,在此条件下死菌DNA无扩增,而对活菌DNA扩增无影响;Psa质粒标准品建立的线性回归方程为Y=-3.220 4x+37.73,R2=0.9955,最低可检出6.39×10^2拷贝/μL的溃疡菌;建立的PMA-qPCR方法最低可检出2.38×10^2拷贝/μL的溃疡菌;采用人工染菌枝条样品的最低检出限为6.30×10^4 CFU/mL,与菌落计数检测结果相符。 展开更多
关键词 PMA qPCR 猕猴桃溃疡菌 活菌检测
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霍山石斛GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因克隆及表达分析
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作者 韩荣春 刘路路 +3 位作者 刘峻麟 谢冬梅 彭代银 俞年军 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1552-1557,共6页
为明确GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GMPP)基因的功能及其在石斛多糖生物合成中的表达调控机制,该研究以霍山石斛为原材料,克隆GMPP基因且对该c DNA序列进行分析,利用qPCR技术检测霍山产地3种石斛(霍山石斛、铁皮石斛、铜皮石斛)中GMPP基因的... 为明确GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GMPP)基因的功能及其在石斛多糖生物合成中的表达调控机制,该研究以霍山石斛为原材料,克隆GMPP基因且对该c DNA序列进行分析,利用qPCR技术检测霍山产地3种石斛(霍山石斛、铁皮石斛、铜皮石斛)中GMPP基因的表达情况。结果显示霍山石斛GMPP基因c DNA序列长1 867 bp,包含1 245 bp的开放阅读框(ORF),编码415个氨基酸;序列分析表明霍山石斛GMPP与铁皮石斛、黄花石斛相似性高达99%;进化树分析该基因与铁皮石斛、黄花石斛等植物的GMPP亲缘关系较近;qPCR结果显示GMPP基因在霍山石斛茎中表达量最高,其次是叶,然后是花,根中表达量最低,且在霍山产3种石斛中霍山石斛的相对表达量最高,铁皮石斛的表达量最低。该研究发现霍山石斛GMPP基因表达水平与其茎、叶、花、根中多糖含量呈高度相关性,对进一步研究霍山石斛多糖生物合成机制将起到积极的促进作用。 展开更多
关键词 霍山石斛 GMPP qPCR 基因表达
龙眼MSIL全基因组鉴定及表达分析 预览
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作者 许小琼 陈晓慧 +3 位作者 申序 徐小萍 林玉玲 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1938-1948,共11页
MSIL(Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like)基因是WD重复蛋白的一个亚家族,在植物生长发育过程中发挥重要的作用。为了解龙眼MSIL(DlMSIL)基因家族的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析法对DlMSIL基... MSIL(Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like)基因是WD重复蛋白的一个亚家族,在植物生长发育过程中发挥重要的作用。为了解龙眼MSIL(DlMSIL)基因家族的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析法对DlMSIL基因成员进行鉴定,并进行蛋白质结构及理化性质分析、系统发育进化树构建、启动子顺式作用元件分析、龙眼体胚阶段和不同组织器官表达情况以及GA3处理下的定量表达分析。结果表明:DlMSIL基因家族含有6个成员属于WD40和CAF1C_H4-bd超家族,可分为3类;DlMSIL蛋白编码393~551 aa,等电点为4.68~7.62,该家族成员均不属于分泌蛋白;基因家族成员的内含子数目在4~14之间;DlMSIL启动子序列包含大量非生物胁迫响应元件及MYB结合位点,推测DlMSIL基因家族可能参与多种非生物胁迫反应;DlMSIL可能参与不同胚胎的发育过程和不同组织器官的形态建成。GA3处理下的表达分析显示高浓度时,DlMSI1a与DlMSI1c的表达受到了一定的抑制,而DlMSI4a的表达量呈现先下降后上升再下降的趋势,推测DlMSIL可能参与激素响应途径。本研究表明,DlMSIL基因家族成员可能参与胚胎发育、激素信号通路以及非生物胁迫反应等多种生物学功能,体现了龙眼MSIL基因家族功能具有多样性。 展开更多
关键词 龙眼 体胚 MSIL 生物信息学分析 qPCR
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DNA Gene Expression to Study Immunologic Mechanisms for the Long-Term Cure of Malaria in Babies and Children in South-Western Nigeria 预览
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作者 Jerry T. Thornthwaite Akanni E. Olufemi +1 位作者 Ayankunle A. Ademola O. A. T. Alli 《生物化学进展(英文)》 2019年第2期68-87,共20页
Malaria infection has been a very serious public health problem in Nigeria and most parts of Africa. Development of antimalarial treatments capable of providing a permanent cure for malaria has been a herculean task f... Malaria infection has been a very serious public health problem in Nigeria and most parts of Africa. Development of antimalarial treatments capable of providing a permanent cure for malaria has been a herculean task for drug researchers. A trial of a novel, proprietary blend formulation (TriantimalTM) in gel caps for children (n = 112) and water-soluble, 18.51 nm diameter, NutraNanoSphereTM encapsulated TriantimalTM drops for babies (19.9 Months ± 8.7 SD, n = 15) was conducted in Osogbo, Nigeria. The enrolled subjects were screened for malaria, treated with TriantimalTM for 16 consecutive days and sera collected on days 0, 5, 10, 16, 30, 60, and 730. Also, 31 of the children donated buffy coat samples for the gene expression studies when sera were collected. The children showed 90.2% parasite-free at 60 days and 85.1% at 730 days. The babies revealed 93.3% parasite-free at 60 days. These data show for the first time a real possibility for a cure of malaria in Nigeria. The one-time, low dose, extended treatment and synergism of the natural components minimize the ability of the parasites to develop resistance, while boosting the immune system. Indeed, the DNA amplification data showed that all aspects of the humoral, innate, and innate defensin immunity are involved in the long-term immunity against P. falciparum in which may be termed a type of “in vivo immunization”. 展开更多
关键词 TriantimalTM NutraNanoSpheresTM Immunity qPCR Gene Expression PLASMODIUM FALCIPARUM
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酿酒酵母菌及其灭活菌对绵羊瘤胃外植体β-防御素-1(SBD-1)表达的影响 预览
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作者 王云鹤 金鑫 +4 位作者 张曼 魏方 温婧怡 赵霏霏 杨银凤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期581-591,共11页
旨在探索益生性酿酒酵母菌及其灭活菌对绵羊瘤胃外植体内β-防御素-1(sheep beta-defensin-1,SBD-1)表达的影响。本研究建立了绵羊瘤胃外植体培养方法,将不同浓度(10 4 、10 5 、10 6 、10 7 、10 8 、10 9 CFU·mL -1 )的酿酒酵母... 旨在探索益生性酿酒酵母菌及其灭活菌对绵羊瘤胃外植体内β-防御素-1(sheep beta-defensin-1,SBD-1)表达的影响。本研究建立了绵羊瘤胃外植体培养方法,将不同浓度(10 4 、10 5 、10 6 、10 7 、10 8 、10 9 CFU·mL -1 )的酿酒酵母菌及其灭活菌与外植体共培养24 h后,通过qPCR和ELISA方法检测瘤胃外植体内SBD-1 mRNA和蛋白的表达变化,以分别确定活菌及其灭活菌诱导SBD-1表达最高的菌液浓度;然后用该浓度的活菌及其灭活菌对瘤胃外植体进行不同时间(2、4、8、12、16、20、24 h)的刺激,同样用qPCR和ELISA方法检测瘤胃外植体内SBD-1 mRNA 及蛋白的表达变化,从而筛选出活菌及其灭活菌诱导SBD-1表达的最佳时间。结果表明,益生性酿酒酵母菌及其灭活菌均能显著促进绵羊瘤胃外植体SBD-1的表达( P <0.05)。当酿酒酵母菌浓度为10 7 CFU·mL -1 、灭活菌浓度为10 8 CFU·mL -1 分别诱导绵羊瘤胃外植体16 h时,SBD-1表达量分别达到最大,且二者与对照相比均呈极显著差异( P <0.01)。在最佳诱导条件下对比二者的诱导效果,酿酒酵母菌活菌高于其灭活菌。因此,益生性酿酒酵母菌及其灭活菌均能促进绵羊瘤胃外植体内SBD-1的表达,且活菌浓度为10 7 CFU·mL -1 、灭活菌浓度为 10 8 CFU·mL -1 分别诱导16 h时,绵羊瘤胃外植体内的SBD-1的表达量分别达到最大,并且益生性酿酒酵母菌的诱导效果高于其灭活菌。 展开更多
关键词 酿酒酵母菌 β-防御素-1 绵羊瘤胃外植体 qPCR ELISA
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异化Mn(IV)还原菌激活及其对有机药物去除 预览
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作者 翟俊 王熔 +3 位作者 黄泽金 王泉峰 刘文博 陈怡璇 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期298-305,共8页
以嘉陵江沉积物为菌源,利用荧光绝对定量(qPCR)技术探究了不同碳源(葡萄糖和乙酸钠)和不同形态的锰氧化物(δ-MnO2和锰矿粉)对异化Mn(IV)还原菌激活效果的影响.在此基础上,研究了激活效果最佳的异化Mn(IV)还原菌对卡马西平、布洛芬、萘... 以嘉陵江沉积物为菌源,利用荧光绝对定量(qPCR)技术探究了不同碳源(葡萄糖和乙酸钠)和不同形态的锰氧化物(δ-MnO2和锰矿粉)对异化Mn(IV)还原菌激活效果的影响.在此基础上,研究了激活效果最佳的异化Mn(IV)还原菌对卡马西平、布洛芬、萘普生、雌激素和双氯芬酸5种有机药物的去除效果.结果表明,葡萄糖作为碳源,δ-MnO2作为电子受体时激活效果最佳,Mn^2+10d累计生成浓度达416.03mg/L,TOC消耗率达88.24%.激活后的异化金属还原菌在有无外加碳源时对卡马西平和布洛芬均无明显去除,对萘普生在外加碳源时能实现11.88%的去除.雌二醇和双氯芬酸可以作为异化Mn(IV)还原菌唯一碳源,其去除率可达75.70%和58.25%. 展开更多
关键词 异化Mn(IV)还原 有机药物 生物去除 qPCR
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基于TaqMan qPCR检测凡纳滨对虾样品中虾肝肠胞虫并样检测方法的评价 预览
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作者 宋增磊 董宣 +5 位作者 赵若恒 王秀华 武和英 于党辉 谢国驷 黄倢 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2019年第3期122-132,共11页
对山东海阳和潍坊的2个养殖凡纳滨对虾群体取样,采用TaqMan qPCR逐尾检测肝胰腺中的虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)载量,再将提取的DNA样品按5并1(5∶1)、25并1(25∶1)、50并1(50∶1)、100并1(100∶1)和150并1(150∶1)进... 对山东海阳和潍坊的2个养殖凡纳滨对虾群体取样,采用TaqMan qPCR逐尾检测肝胰腺中的虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)载量,再将提取的DNA样品按5并1(5∶1)、25并1(25∶1)、50并1(50∶1)、100并1(100∶1)和150并1(150∶1)进行并样,检测并样的EHP载量。设定不同临界循环数为假定灵敏度,定性判断各单尾检测阳性及并样组阳性,比较不同并样模式与检测阳性率、诊断灵敏度、诊断特异性等之间的关系以及定量的准确性。结果表明,检测灵敏度过低,会降低高并样率检测的准确性;阳性率在30%以上时,高并样率的检测结果与单样品检测相符性很好;高载量感染的阳性率不低于6.7%时,50∶1以内的并样能准确得出检测结果;低载量感染的阳性率不低于16%时,25∶1以内的并样能得出较好结果;高载量感染的1.3%阳性率和低载量感染的8%阳性率可能导致所有并样出现假阴性结果;各种并样模式均有很好的诊断特异性,50∶1并样的诊断灵敏度与OIE标准推荐的5∶1并样的接近;各并样检测的EHP载量与单样品检测平均值之比在0.27~2.83范围,二者存在极显著相关性,各种并样模式的定量检测结果在数量级水平能大致反映样品的平均EHP载量。本研究为水生动物疫病诊断和流行病学调查的样品检测提供了参考依据。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 虾肝肠胞虫(EHP) qPCR 并样检测
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利用PCR-DGGE分析有机物对厌氧氨氧化菌群的影响
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作者 刘凯 王凡 +3 位作者 李祥 毕玮 刘恒蔚 黄勇 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期205-211,共7页
为了研究有机物对Anammox菌群的影响,以及微生物与脱氮的关系,为工艺改进提供依据。使用SBR厌氧氨氧化反应器,从反应器不同TOC/NH4+-N阶段采集活性污泥样品,利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析了样品中微生物种群... 为了研究有机物对Anammox菌群的影响,以及微生物与脱氮的关系,为工艺改进提供依据。使用SBR厌氧氨氧化反应器,从反应器不同TOC/NH4+-N阶段采集活性污泥样品,利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析了样品中微生物种群结构。结果表明反应器中主要微生物包含变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和绿菌门(Chlorobi);其中变形菌门(β-变形菌和γ-变形菌)为优势菌群。TOC/NH4+-N从0逐渐增加至2.0的过程中,反应器中的反硝化菌(变形菌门)不断增长,Anammox菌群在TOC/NH4+-N为0.4阶段得到最大程度的富集,此时反应器内部微生物多样性也最高;随着有机物含量增加,Anammox菌生长受到严重抑制,反应器微生物物种多样性也逐渐下降。荧光定量(qPCR)分析表明Anammox菌含量从1.30×10^11 copies/mL下降至3.18×10^9 copies/mL,而DB含量从1.57×10^9copies/mL增加至3.74×10^10 copies/mL。说明随着C/N的增加,反应器脱氮能力逐渐从Anammox过渡到反硝化过程。通过测定反应器内壁附着污泥,还发现其微生物丰度和含量均高于同时期反应器内部活性污泥样品,推测厌氧微生物菌群更适宜在静态基质生长。 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 PCR-DGGE 有机物 qPCR
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