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不同碳氮磷源改良剂对铅锌尾矿废弃地土壤微生物群落结构的影响 预览
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作者 杨胜香 李凤梅 +2 位作者 彭禧柱 曹建兵 高智席 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1256-1264,共9页
为分析土壤微生物群落结构对退化生态系统恢复过程的价值,开展野外田间实验,添加不同碳氮磷源改良剂对铅锌尾矿废弃地进行生态恢复,研究其对土壤微生物群落结构的影响。结果表明:与对照相比,添加碳氮磷源改良剂显著提高了土壤微生物OTU... 为分析土壤微生物群落结构对退化生态系统恢复过程的价值,开展野外田间实验,添加不同碳氮磷源改良剂对铅锌尾矿废弃地进行生态恢复,研究其对土壤微生物群落结构的影响。结果表明:与对照相比,添加碳氮磷源改良剂显著提高了土壤微生物OTU数,微生物多样性指数(Chao1、ACE、Simpson、Shannon),微生物活性和微生物生物量。与对照相比,添加碳氮磷源改良剂显著改变了土壤微生物群落组成,相对丰度增加的微生物门有Bacteroidetes、Euryarchaeota、Verrucomicrobia、Acidobacteria和Candidate_division_OD1,相对丰度增加的微生物属有Solitalea、Sphingomonas、Blastocatella、Planctomyces、Opitutus、Ohtaekwangia和Gemmata;相对丰度降低的微生物门是Cyanobacteria,相对丰度降低的微生物属是Gaiella。Pearson相关性分析表明:在门水平上,Bacteroidetes、Planctomycetes、Euryarchaeota、Verrucomicrobia与微生物活性、微生物生物量呈显著正相关,Chloroflexi、Cyanobacteria与微生物活性、微生物生物量呈显著负相关;在属水平上,Solitalea、Opitutus、Blastocatella、Ohtaekwangia与微生物活性、微生物生物量呈显著正相关;Gaiella与微生物活性、微生物生物量呈极显著负相关。聚合促进树分析表明:在门水平上,尾矿(CK)、尾矿+尿素(N)、尾矿+中药渣+尿素(MHR+N)处理聚在一起,尾矿+磷肥(P)、尾矿+中药渣(MHR)、尾矿+中药渣+磷肥(MHR+P)和尾矿+中药渣+尿素+磷肥(MHR+N+P)处理聚在一起;在属水平上,CK单列,N、P、MHR、MHR+N、MHR+P和MHR+N+P处理聚在一起。综合分析表明,添加不同碳氮磷源改良剂对土壤微生物群落组成、多样性、微生物活性和微生物生物量均有显著性影响,其中MHR+P和MHR+N+P处理效果最好。 展开更多
关键词 铅锌尾矿 碳氮磷源改良剂 微生物群落 微生物多样性 微生物活性 微生物生物量
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青藏高原高寒草地土壤微生物群落及影响因子
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作者 薛凯 张彪 +12 位作者 周姝彤 冉沁蔚 唐立 车荣晓 庞哲 王芳 王頔 张静 姜丽丽 胡容海 崔骁勇 郝彦宾 王艳芬 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第27期2915-2927,共13页
青藏高原是我国生态安全的重要屏障,但目前青藏高原上大尺度上的微生物地理学研究还很缺乏.因此,采用高通量测序技术,在跨越2121 km的尺度上针对高寒草地不同生态系统类型研究了土壤原核生物(细菌和古菌)微生物量、多样性和群落组成的... 青藏高原是我国生态安全的重要屏障,但目前青藏高原上大尺度上的微生物地理学研究还很缺乏.因此,采用高通量测序技术,在跨越2121 km的尺度上针对高寒草地不同生态系统类型研究了土壤原核生物(细菌和古菌)微生物量、多样性和群落组成的分布格局,及与气候、植物和土壤因子的关系.在高寒草甸、高寒草原、高寒灌丛和高寒荒漠中,高寒荒漠具有最低的微生物多样性,而高寒草甸具有最高的微生物量碳.高寒草地土壤微生物的多样性与大气温度而非降水显著相关,说明其在高寒条件下可能受温度而非水分控制.微生物多样性随耦合了水、热要素的干旱指数的增加而降低,解释量比单一要素更高.此外,植物功能群多样性与微生物多样性有显著的正相关关系,解释量比植物物种多样性更高.结构方程模型显示,干旱指数和年均温通过影响植物功能群多样性和地上生物量而改变土壤表层的碳氮比,从而直接或间接影响到微生物多样性.与多样性不同,土壤微生物量碳与可溶性有机碳、氨态氮、速效磷及碳氮比等土壤营养指标和植物地上生物量具有显著的相关性.这些结果意味着微生物多样性和微生物量可能有着不同的控制因子;随着未来青藏高原的'暖湿化',干旱指数的降低可能提高土壤微生物的多样性. 展开更多
关键词 土壤微生物 微生物多样性 微生物量碳 干旱指数 植物功能群多样性
不同连作年限对烟草根际土壤微生物区系的影响 预览 被引量:1
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作者 朱金峰 樊祖清 +5 位作者 陈启龙 王洁琼 陈冲 芦阿虔 李红丽 王岩 《北方农业学报》 2019年第1期42-48,共7页
为探究不同连作年限对烟草根际土壤微生物区系的变化,利用基因多样性测序技术,分析烟草在连作2年、4年和6年时对根际土壤微生物的数量、群落结构以及物种多样性的影响。结果表明:烟草连作年限的增加会导致根际土壤中可培养细菌和放线菌... 为探究不同连作年限对烟草根际土壤微生物区系的变化,利用基因多样性测序技术,分析烟草在连作2年、4年和6年时对根际土壤微生物的数量、群落结构以及物种多样性的影响。结果表明:烟草连作年限的增加会导致根际土壤中可培养细菌和放线菌数量的减少,真菌数量的增多。基因测序结果显示,随着烟草连作年限的增加,微生物群落多样性逐渐下降,群落结构发生改变,微生物类别相对丰度的改变可能是造成不同连作年限间真菌群落结构差异性的原因。不同连作年限下烟草根际土壤细菌群落优势菌属的种类变化比较小,而真菌的群落优势菌属种类变化较大。结合群落结构分布图可知烟草连作年限的增加会增加根际土壤中病原微生物、同时减少有益微生物。 展开更多
关键词 连作 烟草 根际土壤 微生物多样性 微生物群落结构
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基于免培养的微生物群落多样性研究方法概述 预览
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作者 李冬娟 《长沙大学学报》 2019年第5期73-76,共4页
微生物群落多样性问题已成为现在的研究热点.有关微生物群落多样性的研究方法由最初的传统培养方法、生化鉴定、分子测序逐渐发展为免培养方法.通过对免培养方法进行概述,并对各类方法的优缺点进行简单阐述.免培养方法主要分为两类:一... 微生物群落多样性问题已成为现在的研究热点.有关微生物群落多样性的研究方法由最初的传统培养方法、生化鉴定、分子测序逐渐发展为免培养方法.通过对免培养方法进行概述,并对各类方法的优缺点进行简单阐述.免培养方法主要分为两类:一类是不基于微生物总基因组DNA的分析方法;另一类是基于微生物总基因组DNA的分析方法.目前研究微生物群落多样性主要采用高通量测序技术. 展开更多
关键词 微生物群落 微生物多样性 免培养方法
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砷污染湿地生境下土壤微生物多样性及群落结构特征 预览 被引量:1
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作者 赵立君 任伟 +4 位作者 郑毅 赵蓉 王妍 李佳璇 齐丹卉 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期150-158,共9页
为研究As(砷)污染对微生物多样性的影响,找寻有利于As污染修复的抗As菌种,利用高通量测序技术分析As胁迫〔w(As)分别为0、80、100、150、200和400mgkg,依次记为AT0组、AT80组、AT100组、AT150组、AT200组和AT400组〕对湿地生境中土壤微... 为研究As(砷)污染对微生物多样性的影响,找寻有利于As污染修复的抗As菌种,利用高通量测序技术分析As胁迫〔w(As)分别为0、80、100、150、200和400mgkg,依次记为AT0组、AT80组、AT100组、AT150组、AT200组和AT400组〕对湿地生境中土壤微生物多样性及群落结构特征的影响.结果表明:As污染会引起微生物多样性和群落结构的变化,但并不是简单的负相关.在各处理组中,AT80组的土壤中微生物多样性最高,OTU(operational taxonomic units)数高达1849,较未经As处理的AT0组增加了58.9%,说明低As胁迫在一定程度上会刺激As敏感微生物的生长繁殖,如Desulfovibrio(脱硫弧菌属)和Allobaculum等菌属,使群落结构更加复杂多样.高w(As)(400mg/kg)对微生物有明显的抑制作用,导致某些物种消亡和多样性下降.As胁迫会诱导抗As微生物〔如Pseuomonas(假单胞菌属)〕成为优势类群,群落结构趋于稳定、单一.微生物群落结构对不同w(As)胁迫有明显的响应特征,可作为As污染湿地土壤质量评价的灵敏指标.在AT400组中存在大量的Pseudomonas veronii,可为As污染湿地微生物修复提供借鉴.研究显示,微生物对As污染具有较为敏感的响应,其中,Proteobacteria(变形菌门)和Firmicutes(厚壁菌门)为As污染生境中微生物优势门类并且与非专性吸附态As和谷胱甘肽含量呈正相关. 展开更多
关键词 湿地 微生物多样性 微生物群落结构 高通量测序
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微生物型育苗垫片对水稻根围土壤微生物多样性的影响
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作者 李晶 胡基华 +6 位作者 王峥鉴 陈静宇 刘宇帅 姜威 曹旭 孟利强 张淑梅 《生物技术》 CAS 2019年第3期277-282,250共7页
[目的]分析微生物型育苗垫片对水稻根围土壤微生物多样性和群落组成的影响,为微生物型育苗垫片的示范应用提供科学参考。[方法]采用水稻秧盘育苗试验,基于常规微生物培养和高通量测序技术测定微生物型垫片育苗对水稻根围土壤微生物种群... [目的]分析微生物型育苗垫片对水稻根围土壤微生物多样性和群落组成的影响,为微生物型育苗垫片的示范应用提供科学参考。[方法]采用水稻秧盘育苗试验,基于常规微生物培养和高通量测序技术测定微生物型垫片育苗对水稻根围土壤微生物种群数量、多样性及群落组成变化。[结果]与普通壮秧剂育苗相比,微生物型垫片育苗的水稻根围土壤细菌数量在出苗后第7 d增加了36. 59%,第14 d和第21 d时降低但差异不显著;放线菌数量分别显著增加了271. 11%、702. 48%和100%;真菌数量在第7 d和第14 d分别降低了127. 05%和740%,第21 d时明显增加了160. 98%。在水稻幼苗根围微生物群落组成中,变形菌门、放线菌门、酸杆菌门和螺旋体菌门为优势细菌,子囊菌门、担子菌门、接合菌门和壶菌门为优势真菌;与对照相比,微生物型育苗垫片组中变形菌门增加,螺旋体菌门和酸杆菌门减少,其中高丰度的假单胞菌属、根瘤菌属、节杆菌属、克雷伯氏菌属等根围促生菌均为水稻幼苗根围优势菌;真菌的子囊菌门增加,担子菌门、接合菌门和壶菌门减少,后期子囊菌门成为单一优势菌,该门的腐质霉属、假裸囊菌属和接合菌门的被孢霉属菌为优势菌。[结论]微生物型垫片育苗在水稻幼苗前期可提高土壤细菌的丰富度,后期降低土壤真菌的丰富度和多样性,具有改善水稻幼苗根围微生态环境的作用。 展开更多
关键词 微生物型育苗垫片 水稻根围土壤 微生物多样性
邵武烟田土壤微生物群落结构变化与烟草青枯病发生关系初报 预览 被引量:1
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作者 陈乾锦 林书震 +5 位作者 李红丽 李小龙 芦阿虔 沈建平 郭夏丽 王岩 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期64-71,共8页
为了研究健康和发病烟田土壤微生物群落结构的差异,分别在烟株不同生长时期采取健康和发病烟田土壤,对土壤微生物进行16S rRNA和18S rRNA基因测序,分析其群落结构和多样性的变化。结果表明:与移栽前相比,烟株旺长期土壤微生物群落结构... 为了研究健康和发病烟田土壤微生物群落结构的差异,分别在烟株不同生长时期采取健康和发病烟田土壤,对土壤微生物进行16S rRNA和18S rRNA基因测序,分析其群落结构和多样性的变化。结果表明:与移栽前相比,烟株旺长期土壤微生物群落结构已发生了较大变化,旺长期土壤中酸杆菌门(Acidobacteria)相对丰度平均减少了5.4%,放线菌门(Actinobacteria)增多了8.0%,子囊菌门(Ascomycota)增多了22.8%;健康土壤中unclassified_f__Micrococcaceae相对丰度是发病土壤的2倍,而发病土壤中假霉样真菌属(Pseudallescheria)相对丰度是健康土壤的2倍;健康土壤微生物多样性较高于发病土壤。微生物群落结构在健康和发病土壤之间存在较大差异,unclassified_f__Micrococcaceae、假霉样真菌属(Pseudallescheria)等土壤微生物是造成差异的主要物种。 展开更多
关键词 土壤微生物 烟草青枯病 微生物群落结构 微生物多样性
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包埋活性污泥实现短程硝化微生物结构特点 预览
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作者 赵昕燕 《节能与环保》 2019年第6期53-55,共3页
为了探讨包埋固定化过程对微生物种群的影响,以接种污泥和各个阶段包埋硝化污泥为对象,利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)技术对比分析上述污泥中的微生物群落结构,结果表明:短程硝化逐渐稳定的过程会增加包埋颗粒中... 为了探讨包埋固定化过程对微生物种群的影响,以接种污泥和各个阶段包埋硝化污泥为对象,利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)技术对比分析上述污泥中的微生物群落结构,结果表明:短程硝化逐渐稳定的过程会增加包埋颗粒中微生物种群多样性,影响污泥稳定性的细菌被淘汰,而脱氮菌、聚磷菌、溶藻菌和硫自养反硝化菌等污水处理功能微生物都在反应过程中得到保留。短程硝化过程实现了对AOB一定程度的富集,与接种污泥相比,驯化中的短程包埋硝化污泥和稳定短程包埋硝化污泥中AOB的多样性指数、均匀性指数均有提高。接种污泥和各个阶段短程硝化污泥中的优势菌群主要分布于变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和未培养菌(uncultured bacterium)。其中AOB均属于β-Proteobacteria的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)。 展开更多
关键词 包埋 短程硝化 PCR-DGGE 微生物多样性 微生物群落结构
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海草根际微生物与海草植株的互作效应
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作者 周卫国 丁德文 +6 位作者 凌娟 林显程 杨清松 张颖 Manzoor Ahmad 张燕英 董俊德 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2117-2129,共13页
【目的】本文以三亚湾泰来草根际沉积物为主要研究对象,研究室内培养条件下泰来草根际沉积物微生物对于高温处理和海草定殖的响应。【方法】通过对培养过程中水体物理化学参数(如pH、溶解氧、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐和铵盐)的监测以... 【目的】本文以三亚湾泰来草根际沉积物为主要研究对象,研究室内培养条件下泰来草根际沉积物微生物对于高温处理和海草定殖的响应。【方法】通过对培养过程中水体物理化学参数(如pH、溶解氧、磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐和铵盐)的监测以分析环境因子的变化;16S rRNA扩增子测序研究微生物群落结构的动态响应;通过荧光定量分析16SrRNA基因丰度变化。【结果】研究表明高温处理组在培养35 d后海水中磷酸盐、硝酸盐、亚硝酸盐和铵盐含量以及pH均要高于模拟原位环境的对照组,高温处理组根际沉积物微生物丰度在培养过程中呈现先上升后降低的趋势,同时,高温处理组根际微生物中初始阶段由厚壁菌门(32.4%)、变形菌门(22.92%)和梭杆菌门(27.21%)占据优势,培养一段时间后,厚壁菌门和梭杆菌门大幅度减少,逐渐被蓝细菌门和放线菌门所替代,最终由变形菌门(51.1%)占据主导地位,其中,属于硫还原细菌的脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)和硫氧化细菌的螺杆菌科(Helicobacteraceae)的细菌丰度不断提高。【结论】揭示了海草的定殖会提高高温处理后沉积物的多样性,并塑造和改善其根际沉积物微生物群落组成。 展开更多
关键词 海草 高温处理 海草定殖 根际沉积物 微生物多样性 微生物丰度
分子生物学技术在热泉地质微生物学研究中的应用
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作者 何晴 王尚 邓晔 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期996-1011,共16页
陆地热泉是一类典型的极端生命-环境互作的地质系统,是我们认识生命与环境协同演化的天然实验室。然而,受限于有限的研究手段,热泉中仍存在大量未解密的微生物“暗物质”。这种困境随着技术的革新得到了改善,尤其是近几年来基于组学、... 陆地热泉是一类典型的极端生命-环境互作的地质系统,是我们认识生命与环境协同演化的天然实验室。然而,受限于有限的研究手段,热泉中仍存在大量未解密的微生物“暗物质”。这种困境随着技术的革新得到了改善,尤其是近几年来基于组学、探针和同位素标记的多元化检测手段在嗜热微生物多样性的挖掘、新物种和新代谢途径的发现以及嗜热微生物对元素地球化学循环的调控和响应等方面取得了一系列令人瞩目的研究成果,使得热泉极端微生物和地质环境内在联系的研究也成为地质微生物学研究的热点。立足于前人研究成果,本文将简述常用于热泉地质微生物学研究的分子生物学手段的发展,重点总结其在挖掘热泉微生物多样性和热泉微生物的环境功能研究中的应用及进展,最后对未来研究方向提出展望。 展开更多
关键词 陆地热泉 微生物多样性 微生物功能 组学技术 探针技术 同位素标记技术
传统发酵豆酱的微生物群落结构和游离氨基酸组成及其相关性分析 预览
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作者 张慧林 王永胜 李冲伟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第14期192-197,共6页
研究传统发酵豆酱产品质量的差异,通过定量描述分析法对吉林省长春、黑龙江省桦南、黑龙江省宝泉岭和黑龙江省黑河4个地区发酵豆酱样品(分别为ChangC、HuaN、BaoQL、HeiH)进行感官评价,运用高通量测序技术和氨基酸分析技术测定其微生物... 研究传统发酵豆酱产品质量的差异,通过定量描述分析法对吉林省长春、黑龙江省桦南、黑龙江省宝泉岭和黑龙江省黑河4个地区发酵豆酱样品(分别为ChangC、HuaN、BaoQL、HeiH)进行感官评价,运用高通量测序技术和氨基酸分析技术测定其微生物群落结构和游离氨基酸组成,并探讨两者的相互关系。结果表明:BaoQL感官评价最好。不同豆酱样品的菌群组成差异较大,菌群中优势细菌和优势真菌的种类也各不相同,其中样品HuaN和HeiH的优势细菌为四联球菌(Tetragenococcus),样品ChangC的优势细菌为乳杆菌(Lactobacillus),样品BaoQL的优势细菌为魏斯氏菌(Weissella);样品HuaN和HeiH的优势真菌为青霉菌(Penicillium),样品ChangC的优势真菌为unclassified-k-Fungi,样品BaoQL的优势真菌为曲霉菌(Aspergillus)。通过对其游离氨基酸进行主成分分析和综合性评价,可得东北不同地区传统发酵豆酱游离氨基酸含量存在差异,样品BaoQL的游离氨基酸综合评分最高,样品ChangC次之,HeiH评分最低。采用偏最小二乘回归模型分析豆酱的微生物多样性和游离氨基酸组成的相关性可知,菌群的种类和丰度对游离氨基酸的组成和含量影响较大,从而影响豆酱的质量,其中对游离氨基酸含量影响较大的细菌为Weissella,真菌为毕赤酵母菌(Millerozyma)和Aspergillus。本研究揭示了豆酱中游离氨基酸与微生物群落组成之间的相关性,为豆酱产品的工业化生产提供理论依据。 展开更多
关键词 发酵豆酱 群落结构 游离氨基酸 微生物多样性 感官评定
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乳酸菌复合制剂对盐碱地改良及土壤微生物群落的影响 预览 被引量:1
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作者 侯景清 王旭 +4 位作者 陈玉海 刘逸群 商庆祥 张文羿 孟和毕力格 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期710-718,共9页
[目的]探讨乳酸菌复合制剂对盐碱地改良、植物生长及土壤微生物群落变化的影响,为利用耐盐碱的乳酸菌研发新型微生物制剂及其大面积应用提供参考依据。[方法]以西红柿为供试作物进行田间试验,设菌剂组(含乳酸菌的菌剂)和对照组(不含乳... [目的]探讨乳酸菌复合制剂对盐碱地改良、植物生长及土壤微生物群落变化的影响,为利用耐盐碱的乳酸菌研发新型微生物制剂及其大面积应用提供参考依据。[方法]以西红柿为供试作物进行田间试验,设菌剂组(含乳酸菌的菌剂)和对照组(不含乳酸菌的菌剂),两个处理菌剂用量均为15 L/ha,加水稀释10倍,在西红柿种植前1 d喷施于土壤中,并在种植西红柿后每30 d喷施一次;西红柿成熟期测定其农艺性状;种植3个月后采集0~30 cm土样测定土壤的物理性质、养分含量及酸碱度,并对土壤样品进行宏基因组测序,分析土壤微生物的多样性及功能基因的变化。[结果]与对照组相比,菌剂组的土壤pH显著下降0.42(P<0.05,下同),铵态氮、硝态氮及有效磷的含量显著提高,但土壤物理性质无显著变化(P>0.05);供试西红柿的各项农艺性状均有所提高。土壤微生物多样性分析结果表明,在门分类水平上,共检测分类122个菌门,其中变形菌门(Proteobacteria)占有明显优势,相对丰度在50.00%以上,其次为拟杆菌门(Bacteroidetes)和绿弯菌门(Chloroflexi),菌剂组中厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度显著增加;在属分类水平上,菌剂组中乳杆菌属(Lactobacillus)的相对丰度(4.25%)较对照组(0.01%)明显增加。功能基因分析结果表明,菌剂组和对照组的碳水化合物活性酶(CAZy)中,糖苷水解酶(Glycoside hydrolases)的功能基因所占比例最高,分别为35.12%和34.16%,菌剂组6种碳水化合物活性酶基因序列数目均高于对照组;KEGG功能注释结果显示,菌剂组的碳水化合物代谢、氨基酸代谢、能量代谢及辅因子与维他命代谢的基因序列数目均高于对照组;此外,菌剂组土壤中毒素的基因序列数目较对照组明显降低。[结论]乳酸菌复合制剂能有效降低盐碱地的pH并增加养分含量,同时可增加土壤中的放线菌数量,降低病原微生物数量 展开更多
关键词 盐碱地 乳酸菌 微生物菌剂 微生物多样性 宏基因组学
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不同煤阶生物成因煤层气微生物群落的功能及多样性研究进展
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作者 聂志强 杨秀清 韩作颖 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1127-1135,共9页
生物成因煤层气是煤层气形成的主要途径之一,在各种煤阶的煤层气田中均发现有生物成因煤层气。高通量测序技术、宏基因组学等高新技术的应用逐步揭示了生物成因煤层气微生物群落的组成及多样性,为揭示煤层气资源的微生物生成机理提供了... 生物成因煤层气是煤层气形成的主要途径之一,在各种煤阶的煤层气田中均发现有生物成因煤层气。高通量测序技术、宏基因组学等高新技术的应用逐步揭示了生物成因煤层气微生物群落的组成及多样性,为揭示煤层气资源的微生物生成机理提供了理论依据。本文综述了近年来国内外针对不同煤阶条件下微生物群落结构及多样性方面的研究进展,总结了煤层气生物成因过程中主要微生物的功能及产气途径,并探讨了生物成因煤层气领域的研究前景。 展开更多
关键词 生物成因煤层气 煤阶 微生物功能 微生物多样性
冻融循环对亚高山森林土壤微生物生物量及群落结构的影响 预览
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作者 谌亚 贾雨桥 +7 位作者 王欣宇 杨万勤 吴福忠 张丽 卫芯宇 陈子豪 杨玉莲 谭波 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期686-694,共9页
土壤冻融循环过程释放的碳和养分是维持亚高山森林冬季土壤微生物活性的重要保障。为了解冻融循环对土壤微生物群落的影响,以川西亚高山针叶林、阔叶林和针阔混交林土壤为对象,采用微缩实验研究了冻融循环(?5℃冻结12 h,5℃解冻12 h为... 土壤冻融循环过程释放的碳和养分是维持亚高山森林冬季土壤微生物活性的重要保障。为了解冻融循环对土壤微生物群落的影响,以川西亚高山针叶林、阔叶林和针阔混交林土壤为对象,采用微缩实验研究了冻融循环(?5℃冻结12 h,5℃解冻12 h为一个冻融循环,共80次)对土壤微生物群落磷脂脂肪酸(PLFAs)含量和结构的短期影响。结果表明:土壤微生物群落对冻融循环响应随林型不同而存在差异。与5次冻融循环相比,3种林型的细菌、真菌、革兰氏阳性菌(G+)和革兰氏阴性菌(G^-)的PLFAs含量在经80次冻融循环后均出现降低,混交林、针叶林和阔叶林细菌PLFAs含量分别降低71.9%、73.7%和74.6%,真菌PLFAs含量降低55.5%、75.4%和84.7%,G+PLFAs含量降低77.1%、68.8%和73.7%,G^-PLFAs含量降低70.6%、78.1%和78.8%。冻融循环显著影响阔叶林的真菌/细菌比值,林型对真菌/细菌比值和G+/G^-影响不显著。Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数在混交林中随冻融循环次数增加而逐渐增加,在针叶林和阔叶林中则呈现降低趋势,且均受冻融循环显著影响。冗余分析(RDA)显示,冻融过程中土壤养分有效性与微生物生物量和群落结构显著相关。全球变暖导致冬季冻融循环格局变化可通过改变土壤养分有效性影响亚高山森林土壤微生物生物量和多样性。 展开更多
关键词 冻融循环 磷脂脂肪酸 微生物生物量 微生物多样性 亚高山森林
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脓毒症患者肠道菌群紊乱的临床研究
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作者 刘丹 王晓红 +5 位作者 张小彬 闫晶 杨小娟 刘勤富 孙婷 杨晓军 《中华急诊医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期736-742,共7页
目的分析ICU内脓毒症及非脓毒症患者肠道菌群紊乱特征。方法采用前瞻性观察性研究方法,纳入2017年2月至2017年6月收住宁夏医科大学总医院重症医学科(ICU)的脓毒症患者10例(脓毒症组)、同期入住宁夏医科大学总医院ICU内未并发脓毒症的患... 目的分析ICU内脓毒症及非脓毒症患者肠道菌群紊乱特征。方法采用前瞻性观察性研究方法,纳入2017年2月至2017年6月收住宁夏医科大学总医院重症医学科(ICU)的脓毒症患者10例(脓毒症组)、同期入住宁夏医科大学总医院ICU内未并发脓毒症的患者10例(非脓毒症组)以及健康人10例(对照组)。采集脓毒症、非脓毒症组患者入住ICU后2 d内的粪便标本,健康对照组为随机粪便样本,运用高通量16S rRNA基因测序技术进行肠道菌群检测。记录脓毒症组及非脓毒症组患者入ICU第1天急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHE Ⅱ)、序贯器官衰竭(SOFA)评分。结果与健康对照组比较,非脓毒症组、脓毒症组患者肠道菌群α多样性呈下降趋势,β多样性显示菌群结构均存在差异,且个体差异性更加明显。在菌门水平,非脓毒症组和脓毒症组患者肠道厚壁菌门+拟杆菌门比例均明显下降(P=0.013、0.028)、变形菌门比例升高(P=0.017、0.026),而梭杆菌门仅在非脓毒症组比例升高(P<0.01)。在菌属水平,非脓毒症、脓毒症患者均可见有益共生菌属比例均下降,如瘤胃球菌属(P=0.045、0.026)、假丁酸弧菌属(P=0.009、<0.01)、厌氧棒状菌属(P=0.011、0.003)、粪球菌属(P=0.045、0.011)、考拉杆菌属(P=0.008、0.022)、罕见小球菌属(P=0.006、0.026)。而乳酸杆菌属、多尔菌属、粪杆菌属、罗斯菌属、布劳特菌属在非脓毒症组、脓毒症组均呈下降趋势,但乳酸杆菌属仅在非脓毒症组下降具有统计学意义(P=0.005),而多尔菌属、粪杆菌属、罗斯菌属、布劳特菌属仅在脓毒症组下降具有统计学意义(P分别为0.037、0.038、0.002和0.017)。非脓毒症组患者肠道菌群中的梭杆菌属、放线菌属、消化链球菌属、链球菌属等条件致病菌比例升高(P分别为0.001、0.019、0.011和0.014),而致病葡萄球菌属(P=0.035、0.006)、肠球菌属(P=0.001、0.001)、厌氧球菌属(P=0.006� 展开更多
关键词 脓毒症 肠道微生态 肠道菌群 16S RRNA 菌群紊乱 菌群多样性 有益菌属 致病菌属
渤海湾日晒盐场细菌群落结构和多样性分析
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作者 薄振兴 高美荣 +2 位作者 邓元告 王振乾 隋丽英 《海洋湖沼通报》 CSCD 北大核心 2019年第1期95-101,共7页
采用16S rRNA基因PCR-DGGE方法,比较了我国渤海湾产盐区辽宁复州湾盐场、天津汉沽盐场和山东埕口盐场中不同盐度盐田卤水中细菌多样性与群落结构。DGGE结果表明,3个盐田卤水中细菌多样性指数(Rr)和香农维纳指数(H′)与卤水盐度密切有关... 采用16S rRNA基因PCR-DGGE方法,比较了我国渤海湾产盐区辽宁复州湾盐场、天津汉沽盐场和山东埕口盐场中不同盐度盐田卤水中细菌多样性与群落结构。DGGE结果表明,3个盐田卤水中细菌多样性指数(Rr)和香农维纳指数(H′)与卤水盐度密切有关,但无明显区域相关性。汉沽盐场盐田卤水样本的Rr随盐度升高有逐渐降低的趋势,大连复州湾盐场与山东埕口盐场盐田卤水样本的Rr随盐度升高呈现先升高后降低的趋势。3个盐场H’差异不大,变化趋势与Rr相似。主要DGGE条带割胶回收测序结果表明,渤海湾盐田卤水中大部分为变形菌门和拟杆菌门嗜盐细菌。典范性对应性分析显示,盐度是影响盐田卤水细菌多样性的主要环境因子,盐场地理位置对卤水细菌多样性的影响不显著。 展开更多
关键词 渤海湾盐田 嗜盐细菌 微生物多样性 群落结构 盐度式
茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响 预览
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作者 李艳春 林忠宁 +1 位作者 陆烝 刘明香 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期690-696,共7页
【目的】探讨茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响,为茶菌间作模式的应用提供科学依据。【方法】应用高通量测序技术分析比较了间作灵芝茶园与单作茶园之间土壤细菌群落变化。【结果】与单作茶园(CK)相比,间作灵芝茶园土壤的... 【目的】探讨茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响,为茶菌间作模式的应用提供科学依据。【方法】应用高通量测序技术分析比较了间作灵芝茶园与单作茶园之间土壤细菌群落变化。【结果】与单作茶园(CK)相比,间作灵芝茶园土壤的有机质、全氮、速效氮和有效磷含量显著提高,速效钾含量和pH显著降低,而全磷和全钾含量变化不显著。间作灵芝茶园处理的土壤细菌群落丰度指数和多样性指数与单作茶园相比无显著性差异。与单作茶园相比,间作灵芝茶园土壤的变形菌门相对丰度显著提高21.18%,而酸杆菌门和芽单胞菌门的相对丰度显著降低15.09%和53.52%,其他细菌门类变化不显著。在属水平上,间作灵芝处理显著提高了土壤有益微生物菌群伯克氏菌属Burkholderia、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas和戴氏菌属Dyella的相对丰度。相关性分析表明,土壤pH、全氮、全磷和速效钾对优势细菌群落的影响较大。【结论】茶园间作灵芝改变了土壤细菌群落结构并提高了土壤中有益微生物菌群的相对丰度,但对土壤细菌群落多样性的影响不明显。 展开更多
关键词 间作 细菌多样性 细菌群落结构 茶园 高通量测序
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西藏地区荞麦与玉米混合青贮对发酵品质和微生物多样性的影响 预览
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作者 商振达 谭占坤 +5 位作者 李家奎 卓嘎 王宏辉 巴桑 谢国平 刘锁珠 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期95-105,共11页
为探究西藏林芝市全株荞麦与全株玉米混合青贮对青贮饲料发酵品质和微生物多样性的影响,分别设定全株荞麦单独青贮组(A)、全株荞麦∶全株玉米=4∶1混合青贮组(B)、全株荞麦∶全株玉米=3∶2混合青贮组(C)、全株荞麦∶全株玉米=2∶3混合... 为探究西藏林芝市全株荞麦与全株玉米混合青贮对青贮饲料发酵品质和微生物多样性的影响,分别设定全株荞麦单独青贮组(A)、全株荞麦∶全株玉米=4∶1混合青贮组(B)、全株荞麦∶全株玉米=3∶2混合青贮组(C)、全株荞麦∶全株玉米=2∶3混合青贮组(D)和全株荞麦∶全株玉米=1∶4混合青贮组(E)共5个处理组。分别在青贮第7、14、30和60天时,开窖取样,测定青贮饲料的发酵品质和微生物菌群结构。结果表明,与全株荞麦单独青贮组相比,全株荞麦与全株玉米混合青贮组在一定程度上改变了青贮的发酵品质,混合青贮组降低了青贮饲料的pH值,提高了乳酸含量,且氨态氮/总氮的值和丁酸含量均符合优质青贮饲料的要求量。从微生物菌群结构来看,混合青贮改变了青贮饲料的菌群结构,相比与全株荞麦单独青贮组,混合青贮组提高了厚壁菌门和LAB菌种的丰度,有效地抑制了腐败菌的生长,且这种效果随着全株玉米混合比例越高而越显著。综合考虑全株荞麦利用最大化和发酵品质,建议将全株荞麦和全株玉米以2∶3混合青贮较为适宜。 展开更多
关键词 全株荞麦 全株玉米 混合青贮 发酵品质 微生物多样性
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黄贮秸秆两相厌氧发酵系统微生物多样性研究 预览
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作者 刘伟 苏小红 +1 位作者 王欣 范超 《黑龙江科学》 2019年第14期1-5,9共6页
使用高通量测序技术,对黄贮秸秆为发酵原料的两相厌氧发酵体系中微生物的多样性进行了研究。在发酵不同时间取样分析了产酸相、产甲烷相系统内细菌、古菌、真菌群落结构。结果表明,两相厌氧发酵产酸相系统中芽孢八叠球菌属(Sporosarcina... 使用高通量测序技术,对黄贮秸秆为发酵原料的两相厌氧发酵体系中微生物的多样性进行了研究。在发酵不同时间取样分析了产酸相、产甲烷相系统内细菌、古菌、真菌群落结构。结果表明,两相厌氧发酵产酸相系统中芽孢八叠球菌属(Sporosarcina)、梭状芽胞杆菌属(ClostridiumIII)、根霉菌属(Rhizopus)、酵母目(unclassified_Saccharomycetales)、甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、甲烷囊菌属(Methanoculleus)、荧光甲烷球菌(Methanomassiliicoccus)等是优势菌群,这些菌群协同作用,可加速水解阶段的反应速率,加快有机物从固相向液相的溶出,为后续反应提供更多的可降解底物。甲烷相中细菌菌群以Ornatilinea、第三梭状芽胞杆菌属(ClostridiumIII)等为主要优势菌群,真菌为非优势菌,不具有指导性意义。古菌菌群以甲烷囊菌属(Methanoculleus)、荧光甲烷球菌属(Methanomassiliicoccus)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacte)、甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)等为主。 展开更多
关键词 黄贮 秸秆 两相厌氧发酵 微生物多样性
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不同苎麻品种根际微生物多样性群落结构分析 预览
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作者 苏小惠 白玉超 +5 位作者 佘玮 杨瑞芳 崔丹丹 李林林 王继龙 崔国贤 《中国麻业科学》 2019年第3期114-121,共8页
根际微生物数量巨大且种类繁多,为了解苎麻根系微生物的群落结构特征,研究采用高通量测序方法,对不同品种5龄麻的根际土壤进行研究。结果表明:苎麻根际细菌群落归属于24门,52纲,125目,213科,329属,569种,其中变形菌门、酸杆菌门、绿弯... 根际微生物数量巨大且种类繁多,为了解苎麻根系微生物的群落结构特征,研究采用高通量测序方法,对不同品种5龄麻的根际土壤进行研究。结果表明:苎麻根际细菌群落归属于24门,52纲,125目,213科,329属,569种,其中变形菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、拟杆菌门和放线菌门为优势门,约占细菌总数的88.92%~97.45%;真菌群落归属于43门,67纲,87目,102科,120属,174种,其中子囊菌门、接合菌门和担子菌门为优势门,约占真菌总数的65.59%~81.55%。研究初步探讨苎麻根际微生物多样性的特点,旨在为进一步探索根系分泌物介导下苎麻-土壤-微生物的互作关系提供理论依据。 展开更多
关键词 苎麻 根际土壤 微生物多样性
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