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银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析 预览
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作者 冯磊 石元豹 +1 位作者 汪贵斌 曹福亮 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期400-411,共12页
以银杏基因组数据为基础,对银杏bHLH转录因子进行筛选和分析,从银杏基因组中鉴定出72条bHLH转录因子。进一步分析发现,不同bHLH转录因子序列长度和分子量差异较大,而理论等电点及亲水性等比较接近;各家族成员均含有N端碱性氨基酸区和C... 以银杏基因组数据为基础,对银杏bHLH转录因子进行筛选和分析,从银杏基因组中鉴定出72条bHLH转录因子。进一步分析发现,不同bHLH转录因子序列长度和分子量差异较大,而理论等电点及亲水性等比较接近;各家族成员均含有N端碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区;该家族可分为17个亚家族,相同亚家族成员保守基序的类型十分相似。通过启动子分析发现,多数银杏bHLH基因启动子均含有光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件等。表达分析结果显示,有7条银杏bHLH基因的表达具有组织特异性,有6条基因在各组织中表达水平都比较高,预测其在银杏生物学过程中具有十分重要的作用。 展开更多
关键词 银杏 bHLH转录因子 进化分析 表达分析
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甘蓝型油菜PEBP基因家族的鉴定与表达分析 预览
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作者 荐红举 杨博 +4 位作者 李阳阳 杨鸿 刘列钊 徐新福 李加纳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期354-364,共11页
植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein, PEBP)基因对于控制开花时间具有重要作用。油菜作为世界上最重要的油料作物之一,与模式植物拟南芥具有相似的开花习性。但有关油菜开花基因的功能研究相对较少。... 植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein, PEBP)基因对于控制开花时间具有重要作用。油菜作为世界上最重要的油料作物之一,与模式植物拟南芥具有相似的开花习性。但有关油菜开花基因的功能研究相对较少。本研究利用拟南芥PEBP 基因家族蛋白序列在油菜基因组内进行BlastP 分析,获得油菜PEBP家族成员,并对其进行基因结构分析、motif 预测、复制事件、进化树构建、选择压力分析和组织表达分析。结果表明,共有26 个油菜PEBP 基因成员得到鉴定,大部分成员含有4 个外显子和3 个内含子, motif-1 和motif -2 是PEBP成员的特征基序,超过76.9%的成员属于片段复制扩增事件。进化树分析显示, PEBP 分为3 个亚家族,基于转录组测序的组织表达数据表明油菜26 个PEBP 成员具有非常明显的组织表达特性。以上研究结果,极大丰富了我们对甘蓝型油菜开花基因及调控模式的认识,为进一步的分子育种提供了理论基础。 展开更多
关键词 油菜 开花基因 PEBP 进化 表达
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一株重配型H1N2猪流感病毒的进化分析及对小鼠的致病性 预览
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作者 许程志 吴运谱 +7 位作者 贾云慧 杨时鳗 何利昆 陈艳 周晨阳 杨焕良 乔传玲 陈化兰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期802-810,共9页
为了进一步了解我国辽宁省猪流感(SI)的流行情况及病原的进化规律,对2016年年末在辽宁省某生猪屠宰场进行SI病原学监测时分离到的一株H1N2亚型猪流感病毒(SIV)A/swine/Liaoning/FX575/2016(简称FX575)进行全基因组序列测定,通过对其8个... 为了进一步了解我国辽宁省猪流感(SI)的流行情况及病原的进化规律,对2016年年末在辽宁省某生猪屠宰场进行SI病原学监测时分离到的一株H1N2亚型猪流感病毒(SIV)A/swine/Liaoning/FX575/2016(简称FX575)进行全基因组序列测定,通过对其8个基因片段的基因来源进行分析,确定基因型;构建系统进化树;分析相关分子特征;进一步以6周龄雌性BALB/c小鼠为感染模型,通过测定感染后小鼠的体重变化和脏器病毒含量评估病毒的致病性。结果显示:FX575为一株三重重配型的H1N2病毒,遗传进化分析结果显示病毒的HA基因来自于欧亚类禽型H1N1(EAH1N1)分支的SIV,NA基因来自于北美三重配型H1N2分支的SIV,6个内部基因(PB2、PB1、PA、NP、M和NS)均来自于2009/H1N1分支的病毒。以106EID50的剂量经鼻腔途径感染小鼠后,能够引起小鼠出现明显的体重下降,其中有1只小鼠在感染后第7天体重下降的比率超过25%,判为死亡;感染后第3天在小鼠肺及鼻甲骨中均检测到较高滴度的病毒,含量分别为4.82、4.20log10EID50·mL^-1。结果表明SIV在不断流行的过程中,不同基因型病毒之间发生重组导致出现基因三重配的病毒,病毒对小鼠呈现中等致病力特征,提示应进一步加强对SI的主动监测,从而降低病毒对兽医及公共卫生学风险。 展开更多
关键词 猪流感病毒 H1N2亚型 进化分析 致病性
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物流企业主导型跨境电商生态系统的构建——多案例研究 预览
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作者 曹武军 闫梦娜 薛朝改 《科技管理研究》 CSSCI 北大核心 2019年第16期212-222,共11页
采用多案例研究的方法,从跨境进口物流和跨境出口物流两个角度,探讨物流企业主导型跨境电商生态系统构建路径,并揭示物流企业主导型跨境电商生态系统的一般演化规律。研究发现,物流企业主导型跨境电商生态系统可分为物流企业主导的融合... 采用多案例研究的方法,从跨境进口物流和跨境出口物流两个角度,探讨物流企业主导型跨境电商生态系统构建路径,并揭示物流企业主导型跨境电商生态系统的一般演化规律。研究发现,物流企业主导型跨境电商生态系统可分为物流企业主导的融合型跨境电商生态系统和物流企业主导的独立型跨境电商生态系统;跨境电商平台是物流企业主导型跨境电商生态系统的核心物种,其产生的新的资源及需求是系统演化发展的动力;物流企业主导型跨境电商生态系统的演化路径是:量贩式微利发展阶段-嵌入式服务增值阶段-集成式综合服务阶段,随着发展阶段的演进,物流企业与跨境电商生态系统中其他物种的关系日渐紧密。 展开更多
关键词 跨境电商 跨境物流 物流企业 生态系统 演化分析
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基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的小蜡螟系统进化分析
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作者 张永红 朱峰 +3 位作者 唐芬芬 邵榆岚 杨爽 白兴荣 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期107-113,共7页
【目的】小蜡螟Achroia Grisella Fabricius作为蜂业生产中的主要虫害,为确认它在鳞翅目昆虫中的遗传地位,本研究克隆了小蜡螟细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因COⅠ,并对其序列进行相关生物信息学分析。【方法】根据NCBI已登录鳞翅目昆虫线粒... 【目的】小蜡螟Achroia Grisella Fabricius作为蜂业生产中的主要虫害,为确认它在鳞翅目昆虫中的遗传地位,本研究克隆了小蜡螟细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因COⅠ,并对其序列进行相关生物信息学分析。【方法】根据NCBI已登录鳞翅目昆虫线粒体基因组mtDNA中COⅠ基因保守序列设计简并引物,以小蜡螟基因组为模板进行PCR,克隆并测序得到小蜡螟mtDNA CO Ⅰ基因序列(GenBank登录号:MF509586)。【结果】对CO Ⅰ基因编码区进行序列分析发现,其翻译的起始码子为TTG,以碱基T作为不完全终止;通过CO Ⅰ基因同源性和遗传距离分析发现,小蜡螟与大蜡螟Galleria mellonella同源性最高且遗传距离最近,分别为88.3%、0.117。系统进化分析发现,小蜡螟与其它鳞翅目昆虫聚为一支,其中螟蛾科昆虫大蜡螟、小蜡螟、米蛾Corcyra cephalonica和梢斑螟Corcyra cephalonica聚在一个小的分支。【结论】小蜡螟与大蜡螟的进化地位最为相近,也说明了利用CO Ⅰ基因可以区分同属不同种的蜡螟,研究结果为了解小蜡螟的遗传背景提供理论基础。 展开更多
关键词 小蜡螟 COⅠ基因 同源性 进化分析
高原鼢鼠肺组织细胞凋亡相关基因的进化分析及其在不同海拔条件下的表达模式
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作者 安志芳 魏琳娜 +4 位作者 王志洁 李苏华 徐波 魏莲 魏登邦 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期549-566,共18页
高原鼢鼠(Myospalax baileyi)是青藏高原特有的地下鼠,其地下洞道严重缺氧。一般来说,低氧会促进细胞凋亡。为了探讨高原鼢鼠适应低氧环境的分子机制,本文应用生物信息学方法对p53下游凋亡促进基因Pidd、Fas、Bax、Puma、Apaf-1、Scotin... 高原鼢鼠(Myospalax baileyi)是青藏高原特有的地下鼠,其地下洞道严重缺氧。一般来说,低氧会促进细胞凋亡。为了探讨高原鼢鼠适应低氧环境的分子机制,本文应用生物信息学方法对p53下游凋亡促进基因Pidd、Fas、Bax、Puma、Apaf-1、Scotin、Perp、Igfbp3和凋亡抑制基因Bcl-2的序列和编码的氨基酸序列进行了进化分析,并以SD大鼠(Rattus norvegicus)为对照,研究了这些基因在不同海拔环境条件下(3 300 m和2 260 m)的表达模式。结果表明:(1)高原鼢鼠细胞凋亡基因的序列与以色列鼹鼠(Nannospalax galili)同源性最高;预测的PIDD、PUMA、Apaf-1、IGFBP3和BCL-2编码蛋白结构域与以色列鼹鼠的存在明显的趋同进化位点;SIFT评估发现,高原鼢鼠和以色列鼹鼠与其他物种相比,p53、PIDD、PUMA、Apaf-1和IGFBP3氨基酸序列分别在78、853、157、320和285号位点的变异对其功能有显著影响;(2)在高海拔条件下(3 300 m),高原鼢鼠肺组织中凋亡促进基因Pidd、Bax、Puma和Apaf-1表达水平显著下降,凋亡抑制基因Bcl-2表达水平显著升高,而在SD大鼠中凋亡促进基因和凋亡抑制基因的表达水平均没有变化;高原鼢鼠中Bcl-2/Bax比值随海拔的升高显著上升,而在SD大鼠中没有变化。以上结果提示,高原鼢鼠p53结构变异可能导致其下游基因表达模式与SD大鼠不同,其中凋亡促进基因Pidd、Bax、Puma和Apaf-1表达水平下降,凋亡抑制基因Bcl-2表达水平上升,从而抑制了细胞在低氧条件下的凋亡;在长期低氧的作用下,高原鼢鼠p53下游基因产物PIDD、PUMA、Apaf-1和IGFBP3产生了影响其功能的变异位点,这可能改变了它们与发挥功能的复合物的结合力,从而抑制了细胞凋亡。因此,通过长期的低氧适应,高原鼢鼠肺组织中与细胞凋亡相关的基因产物结构发生变异,导致其基因表达水平发生变化,从而抑制细胞凋亡,这是高原鼢鼠适应地下低氧洞道生境的分子机制� 展开更多
关键词 高原鼢鼠 细胞凋亡基因 进化分析 表达 低氧
苋菜AmMYB2基因密码子偏好性与进化分析 被引量:1
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作者 彭丽云 王云 +4 位作者 孙雪丽 赵春丽 王晓 赖钟雄 刘生财 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期679-686,共8页
为了解苋菜AmMYB2基因的密码子使用偏好性、与不同物种中调控色素相关的R2R3-MYB基因的同源关系及异源表达受体,利用Codon W与EMBOSS程序及Excel、SPSS、Origin等软件,分析苋菜与其他物种中调控色素代谢的R2R3-MYB基因的密码子使用偏好... 为了解苋菜AmMYB2基因的密码子使用偏好性、与不同物种中调控色素相关的R2R3-MYB基因的同源关系及异源表达受体,利用Codon W与EMBOSS程序及Excel、SPSS、Origin等软件,分析苋菜与其他物种中调控色素代谢的R2R3-MYB基因的密码子使用偏好性,比较苋菜AmMYB2基因与模式生物的密码子使用频率.结果显示:苋菜AmMYB2基因中,所有密码子的GC、GC1、GC2、GC3含量均低于50%,偏好性较强的密码子有17个(RSCU> 1),偏好性最强的有7个(RSCU> 2),其中以A/T结尾的密码子有19个,表明苋菜AmMYB2基因的密码子偏好以A/T结尾,一些氨基酸对密码子的使用具有较强的偏好性;苋菜AmMYB2基因密码子的有效密码子数(Effective number of codons,ENC)值为49.63,苋菜AmMYB2基因的密码子在ENC绘图中的基因位点更接近期望曲线,说明在进化过程中苋菜AmMYB2基因的密码子偏好性受突变压力的影响较大;苋菜基因与甜菜色素代谢相关的R2R3-MYB基因的密码子使用偏好性参数相近,同源关系较近物种密码子使用偏好性具有相似性;从密码子使用频率上分析得出,酵母菌表达系统更适合苋菜AmMYB2基因的异源表达,模式植物拟南芥、烟草、番茄均可作为苋菜AmMYB2基因的遗传转化受体,同苋菜代谢途径相似的甜菜也可以作为苋菜AmMYB2基因的瞬时表达受体.本研究可为苋菜AmMYB2基因功能的进一步研究提供重要参考. 展开更多
关键词 苋菜 AmMYB2基因 密码子偏好性 进化分析
凌河保护区地表覆盖变化监测设计与研究 预览
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作者 刘珊珊 方德涛 《测绘与空间地理信息》 2019年第6期97-99,共3页
现阶段凌河保护区治理已取得一定成效,但环境污染监测、保护区自然生态环境变化尤其是地表覆盖的监测相对比较落后,地表自然基础数据库的建设滞后,生态分布规律和时间空间变化以及其与生态环境和土地利用之间的关系还有待深入研究。本... 现阶段凌河保护区治理已取得一定成效,但环境污染监测、保护区自然生态环境变化尤其是地表覆盖的监测相对比较落后,地表自然基础数据库的建设滞后,生态分布规律和时间空间变化以及其与生态环境和土地利用之间的关系还有待深入研究。本文主要研究凌河保护区地表覆盖变化监测的设计思路,从建立保护区地表覆盖分类指标体系、构建保护区地表覆盖监测信息数据库和开展地表覆盖、污染源及土地利用结构等综合分析3个方面展开论述。 展开更多
关键词 地表覆盖 变化监测 演变分析
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多维特征融合的网络舆情突发事件演化话题图谱研究 预览
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作者 刘雅姝 张海涛 +1 位作者 徐海玲 魏萍 《情报学报》 CSSCI CSCD 北大核心 2019年第8期798-806,共9页
探索网络舆情突发事件中网民意见观点变化,挖掘事件发展特点,可以促使舆情导控工作有的放矢,实现全面控制精准引导的目标,这对于新时期网络舆论管理工作具有重大意义。本研究基于知识图谱方法,选取网络舆情突发事件评论数据构建舆情话... 探索网络舆情突发事件中网民意见观点变化,挖掘事件发展特点,可以促使舆情导控工作有的放矢,实现全面控制精准引导的目标,这对于新时期网络舆论管理工作具有重大意义。本研究基于知识图谱方法,选取网络舆情突发事件评论数据构建舆情话题图谱,利用LDA方法对图谱中实体的话题属性进行划分,从Neo4j图数据库中提取话题图谱实体的话题、时间属性,以多维特征融合分析视角全方位追踪舆情话题的演化情况。所构建的舆情话题图谱可以有效识别话题讨论内容并对话题演化过程进行准确追踪,基于知识图谱方法构建的网络舆情话题图谱在动态追踪民意了解网络舆情突发事件发展方向上发挥了重大作用;网络舆情突发事件发展过程根据评论数量规模可以分为潜伏期、爆发期和衰退期三个阶段,各个阶段话题讨论数量、热度及内容等多维特征遵循着其独特的发展规律。 展开更多
关键词 话题图谱 网络舆情 演化分析
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知识网络演化分析及其应用研究进展
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作者 逯万辉 《情报理论与实践》 CSSCI 北大核心 2019年第8期138-143,共6页
[目的/意义]大数据背景下,知识网络演化分析技术已成为当前环境下遏制信息爆炸危机、加强智能化的信息利用、提高情报研究效率等复杂问题的一种有效手段。[方法/过程]通过对知识网络概念与类型、特征与表现、演化分析方法与指标等相关... [目的/意义]大数据背景下,知识网络演化分析技术已成为当前环境下遏制信息爆炸危机、加强智能化的信息利用、提高情报研究效率等复杂问题的一种有效手段。[方法/过程]通过对知识网络概念与类型、特征与表现、演化分析方法与指标等相关研究的梳理,分析了知识网络挖掘技术在知识组织与管理、科学知识图谱构建和学科发展态势监测等领域的应用与挑战。[结果/结论]为后续该方法在情报研究、战略分析决策与科研管理支撑等方面的应用实践提供理论和方法支撑。 展开更多
关键词 知识网络 演化分析 应用研究 研究进展
亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉NRAMP基因家族的鉴定和进化分析
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作者 卢婷婷 王文佳 +1 位作者 李存法 侯春彬 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期2077-2085,共9页
自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花NRAMP基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三... 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花NRAMP基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三个棉种中的NRAMP家族成员进行鉴定,分析了NRAMP家族的种类、理化性质、进化关系、基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系和选择压力。结果显示,在二倍体亚洲棉基因组(A)中确定12个成员,在二倍体雷蒙德棉基因组(D)中确定15个成员,在四倍体陆地棉基因组(At, Dt)中确定23个成员。按照进化关系的远近将这50个成员分为3个亚类,进化关系较近的成员之间具有更为相似的理化性质、基因结构和蛋白质基序;通过和其他植物的进化关系分析发现,NRAMP基因在单子叶和双子叶植物分离前已经产生;染色体定位发现NRAMP在染色体上的分布并不规律;共线性分析和选择压力分析表明,片段复制在棉花NRAMP基因的遗传进化过程中发挥主导作用,同源基因对在进化过程中处于纯化选择。 展开更多
关键词 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP) 基因家族 鉴定 进化分析 棉花(Gossypium)
北京地区犬冠状病毒的分离鉴定及遗传进化分析
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作者 王静 秦彤 +5 位作者 由欣月 刘畅 史利军 梁琳 李金祥 崔尚金 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期92-98,共7页
采集北京地区宠物医院2~4周龄发生腹泻的幼犬粪便样品,经胶体金和PCR,将其初筛为犬冠状病毒(CCoV)阳性。然后,将其处理液接种于MDCK细胞和CRFK细胞,进行连续传代培养,出现特征性细胞病变。通过形态学观察、RT-PCR鉴定、间接免疫荧光试验... 采集北京地区宠物医院2~4周龄发生腹泻的幼犬粪便样品,经胶体金和PCR,将其初筛为犬冠状病毒(CCoV)阳性。然后,将其处理液接种于MDCK细胞和CRFK细胞,进行连续传代培养,出现特征性细胞病变。通过形态学观察、RT-PCR鉴定、间接免疫荧光试验,证明该分离株为犬冠状病毒,遂将其命名为CCoV BJ02株。针对M基因通过RT-PCR法鉴定分离株的基因型,证明其为CCoV-Ⅱ型。Reed-Muench法测得CCoV BJ02株的TCID50为10^-5.2/100μL。通过绘制一步生长曲线发现,该病毒在48小时左右收毒效果最好。遗传进化分析表明,CCoV BJ02株与日本分离株CCoV fc1株位于同一分支中,同源性最高,有较近亲缘关系。上述研究结果为深入了解北京地区CCoV的流行情况,给犬冠状病毒病的诊断、防治及后续研究奠定了基础。 展开更多
关键词 犬冠状病毒 分离鉴定 进化分析
基于主题过滤与主题关联的学科主题演化分析 被引量:4
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作者 曲佳彬 欧石燕 《数据分析与知识发现》 CSSCI CSCD 北大核心 2018年第1期64-75,共12页
【目的】针对采用LDA模型识别出的主题中往往含有一些无意义的主题,严重影响演化分析的精确性问题,本文提出采用主题过滤和主题关联的方式,构建学科主题在时间序列上的演化路径,并分析主题在内容上的演化情况。【方法】计算主题在所有... 【目的】针对采用LDA模型识别出的主题中往往含有一些无意义的主题,严重影响演化分析的精确性问题,本文提出采用主题过滤和主题关联的方式,构建学科主题在时间序列上的演化路径,并分析主题在内容上的演化情况。【方法】计算主题在所有文献中出现的概率,识别并过滤边缘主题;根据主题中词汇分布的倾向性,识别并过滤无意义的噪音主题。将过滤后的主题作为主题演化分析的主题,通过计算相邻时间段中主题间的JS散度识别相关主题,从而根据主题间的相关关系构建主题演化路径。【结果】以"机器学习"领域的文献为例,构建学科主题演化路径,展示主题间的新生、消亡、继承、分裂和合并5种演化方式,并以微观的"图像识别"为例,验证了方法的有效性。【局限】在构建主题演化路径时,采用人工判断方法设置阈值,具有一定的主观性。【结论】本文方法避免了不重要的边缘主题和无意义的噪音主题对相邻时间段中相关主题识别造成的干扰,提高了所构建的主题演化路径的准确性,能够更为准确地展示学科主题的演化规律。 展开更多
关键词 学科主题演化 主题过滤 LDA主题模型 演化分析
中国图书情报领域专利研究的计量分析 预览 被引量:1
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作者 刘玉琴 刘晶 张勇斌 《情报工程》 2018年第6期87-97,共11页
为发现国内图书情报领域专利研究的现状与趋势,论文基于文本分析与可视化工具ITGInsight对中国图书情报领域22 种核心学术期刊2000年1月-2018年4月专利研究相关论文进行计量分析,采用数据统计、文本挖掘、信息可视化方法,分析该领域研... 为发现国内图书情报领域专利研究的现状与趋势,论文基于文本分析与可视化工具ITGInsight对中国图书情报领域22 种核心学术期刊2000年1月-2018年4月专利研究相关论文进行计量分析,采用数据统计、文本挖掘、信息可视化方法,分析该领域研究趋势、主题分布和演化、期刊关联和演化、机构关联和演化、作者分布和演化,挖掘国内图书情报领域专利研究的特征。研究发现:中国图书情报领域专利研究的热度经过2009-2014 年快速发展后,在最近5 年有所减弱;早期侧重专利检索、知识产权,中期、后期侧重专利分析、专利地图,近期侧重高校图书馆知识服务;整体研究重点以专利分析方法与领域专利分析为主;情报类期刊研究偏重于专利分析、专利地图,图书馆类期刊偏重于知识产权、高校图书馆知识服务、专利检索;文献主要集中在情报类期刊;突出的研究机构包括中国科学技术信息研究所、北京工业大学经济与管理学院、中科院成都文献情报中心等单位。 展开更多
关键词 ITGInsight 专利分析 可视化 演化分析
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基于有效专利的专利丛林测度及演进分析
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作者 张米尔 李海鹏 国伟 《科研管理》 CSSCI CSCD 北大核心 2018年第5期156-164,共9页
在专利数量快速增长的背景下,由大量专利形成的专利群成为专利领域的新现象,由于类似生长茂盛的灌木丛,被形象地称为专利丛林。面对海量的专利数据,如何测度专利丛林和分析演进过程是亟待研究的问题。通过分析专利丛林的生成机制,基于... 在专利数量快速增长的背景下,由大量专利形成的专利群成为专利领域的新现象,由于类似生长茂盛的灌木丛,被形象地称为专利丛林。面对海量的专利数据,如何测度专利丛林和分析演进过程是亟待研究的问题。通过分析专利丛林的生成机制,基于有效专利构建专利丛林的测度指标,采用层次聚类分析方法,定量划分专利丛林的演进阶段。运用以上构建的分析方法,选择喷墨打印技术为研究样本,基于长周期的时间序列数据,对专利丛林进行分析测度并揭示其演进过程。 展开更多
关键词 专利丛林 有效专利 演进分析 层次聚类分析
miR-1/133基因簇的进化及其调控网络 预览
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作者 陈怡香 岳虎 +1 位作者 张超文 刘杰 《华中师范大学学报:自然科学版》 北大核心 2018年第2期231-239,共9页
miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1... miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据. 展开更多
关键词 miR-1/133基因簇 生物信息学分析 进化分析 靶基因预测
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荞麦ARF基因家族的鉴定及生物信息学分析 预览 被引量:2
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作者 李洪有 霍冬敖 +4 位作者 蔡芳 张晓娜 石桃雄 陈其皎 陈庆富 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期7-13,共7页
生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因应答了生长素信号,在植物生长发育中具有重要的调控作用。以荞麦基因组数据库为基础,利用BlastP比对程序共鉴定了21个荞麦ARF基因,并对其基因结构、编码蛋白理化性质、保守结构域、保守... 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因应答了生长素信号,在植物生长发育中具有重要的调控作用。以荞麦基因组数据库为基础,利用BlastP比对程序共鉴定了21个荞麦ARF基因,并对其基因结构、编码蛋白理化性质、保守结构域、保守基序、亚细胞定位、潜在磷酸化位点及系统进化关系进行了分析。基因结构分析表明,21个荞麦ARF基因均含有内含子,且不同基因间内含子数目存在较大差异。保守结构域分析显示,21个ARF蛋白均含有保守的B3和ARF结构域,部分ARF蛋白还含有Aux/IAA结构域。蛋白保守基序分析表明,21个ARF蛋白共有10个保守基序,基序长度在13~55个氨基酸之间。亚细胞定位分析表明,大多数ARF蛋白定位于细胞核,个别定位于叶绿体。潜在磷酸化位点分析显示,所有ARF蛋白均含有潜在的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点,但各蛋白的不同磷酸化位点的数目差异较大。系统进化分析表明,21个ARF基因可以分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个亚家族,其中,Ⅰ亚家族可以进一步分为Ⅰa和Ⅰb两个家族,Ⅱ亚家族可以进一步分为Ⅱa和Ⅱb两个家族。研究结果为进一步克隆荞麦ARF基因及深入研究它们在荞麦中的功能提供了参考。 展开更多
关键词 荞麦 ARF 生物信息学分析 保守结构域 进化分析
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社会化问答社区用户知识需求及其动态演化研究
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作者 张向先 李中梅 郭顺利 《情报理论与实践》 CSSCI 北大核心 2018年第11期38-44,50共8页
[目的/意义]解析社会化问答社区用户知识需求层级、特征及其动态演化过程,为面向用户知识需求开展用户行为、知识组织及服务等方面研究提供理论基础。[方法/过程]首先解析了用户知识需求的形成原因、层次和特征,然后分析了用户知识需求... [目的/意义]解析社会化问答社区用户知识需求层级、特征及其动态演化过程,为面向用户知识需求开展用户行为、知识组织及服务等方面研究提供理论基础。[方法/过程]首先解析了用户知识需求的形成原因、层次和特征,然后分析了用户知识需求动态演化的原因和方向,最后运用集合论思想解析互动交流、浏览查询和服务推荐情境下用户知识需求动态演化过程。[结果/结论]用户知识需求可以划分为客观状态知识需求、意识层次知识需求、表达出来的知识需求、折中知识需求、个性化知识需求5个层级,具有多样性和综合化、随机性和情景化、集成性和精准化、连续性和动态化等特点。社会化问答社区的社交和互动交流功能、用户认知水平和能力提升、任务进展等因素驱动用户知识需求朝向精确清晰化、高层次化、集聚化方向演化。 展开更多
关键词 社会化问答社区 用户 知识需求 演化分析
泉州屿头村传统民居聚落的演变分析 预览
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作者 陈希雯 《山西建筑》 2018年第10期14-16,共3页
对泉州地理文化及屿头村概况进行了简要介绍,通过对泉州屿头村的官式大厝、番仔楼、石厝三种传统民居的调研研究,从种类数量、建造年代、分布情况等方面分析了该民居聚落的演变情况。
关键词 聚落 闽南民居 演变分析
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基于遥感及地理国情数据的矿山环境监测研究 预览
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作者 杨波 朱树叶 《地理空间信息》 2018年第12期18-20,128共4页
利用多源遥感数据、野外调查数据以及地理国情普查数据,通过内业判读与外业核查进行银川市贺兰山东麓非煤矿山环境监测。通过此次监测,查明了监测区三期土地利用、矿山压占、破坏土地以及矿山恢复治理状况。通过数据对比得到监测区各土... 利用多源遥感数据、野外调查数据以及地理国情普查数据,通过内业判读与外业核查进行银川市贺兰山东麓非煤矿山环境监测。通过此次监测,查明了监测区三期土地利用、矿山压占、破坏土地以及矿山恢复治理状况。通过数据对比得到监测区各土地类型年变化率、相互转化度,综合已获取的数据进行演化分析,并以监测区植被覆盖率和矿山恢复治理率为评价要素,对监测区非煤矿山环境质量进行了评价。结果表明,2005~2016年,监测区的植被覆盖率在11a间持续降低,这对监测区的环境质量是不利的。非煤矿山的恢复治理率在逐年上升,但同期矿山破坏、压占土地也在增长,破坏和治理的不同步导致矿山环境质量进一步下降,直接对监测区的环境造成不利影响。 展开更多
关键词 非煤矿山 地理国情普查 土地利用 演化分析 环境质量评价
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