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β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响 预览
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作者 张帅 曲永利 +3 位作者 李伟 辛小月 王璐 殷术鑫 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第1期39-46,共8页
为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液... 为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液,构建犊牛瘤胃细菌宏基因组文库,并使用illumina MiSeq测序后通过NOG、KEGG和CAZy数据库进行生物信息学分析和功能注释。结果显示:①9个样品在eggNOG数据库中比对共有86 145条基因得到了相应的功能注释;CAZy数据库在9个功能类共获得33 980条注释;在KEGG通路注释得到1 905条。②T1-T2、T1-T3、B1-B2和B1-B3四组分别含有318、1 398、30和24个差异表达基因(DEGs)。T1-T2组和T1-T3组DEGs在细胞周期及氨基酸生物合成代谢途径中明显富集,其中细胞周期代谢主要的DEGs为糖原合酶激酶-3β基因(Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β);周期蛋白依赖性激酶2基因(Cyclin-dependent kinase 2,CDK2)和周期蛋白依赖性激酶7基因(Cyclin-dependent kinase 7,CDK7)。③试验共检测到6类抗生素抗性基因,共19种基因型。进一步分析抗生素耐药性产生机制,其中由外排泵(Efflux pump)引起的所占比例最大。说明牦牛随日龄的增加瘤胃菌群丰度提高,瘤胃菌群中的差异表达基因GSK-3β、CDK2和CDK7可能影响犊牛早期生长的乳脂代谢。 展开更多
关键词 犊牛 抗奶 瘤胃菌群 差异表达基因 抗性基因
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宁波地区沙门氏菌耐药性监测及毒力基因筛查
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作者 张芬 周秀娟 +5 位作者 宋启发 何守魁 徐景野 石秀清 周敏 史贤明 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期216-222,共7页
目前宁波地区沙门氏菌对常用抗生素的耐受情况及主要毒力基因携带率的系统检测尚未见报道。本研究选取2006—2013年间宁波地区分离获得的121株沙门氏菌(共27个血清型),对其进行耐药谱检测,相关耐药基因及毒力基因筛查。结果显示:对12种... 目前宁波地区沙门氏菌对常用抗生素的耐受情况及主要毒力基因携带率的系统检测尚未见报道。本研究选取2006—2013年间宁波地区分离获得的121株沙门氏菌(共27个血清型),对其进行耐药谱检测,相关耐药基因及毒力基因筛查。结果显示:对12种常见抗生素的耐药率依次是:氨苄西林19.8%,四环素13.2%,强力霉素12.4%,复方新诺明11.6%,氯霉素8.7%,链霉素6.6%,妥布霉素3.3%,头孢曲松2.5%,环丙沙星0.8%,诺氟沙星0%,庆大霉素0%,阿米卡星0%。耐药基因携带率:blaTEM100%,blaPSE29.2%,blaCMY-24.2%,blaCTX8.3%,blaSHV0%,tet A 100%,tet B 100%,tet G 70.8%,tet C 20.8%,sul I 100%,sul II 100%,sul III 80%。毒力基因avr A、ssa Q、gip A、sod C1、mgt C的携带率均达100%,sop E 96.9%,ssi D 93.8%,spo B 93.8%,spv C 21.9%。上述结果表明:宁波地区沙门氏菌耐药情况比较严重,耐药基因与毒力基因携带率较高。本研究为宁波地区沙门氏菌疫情的防控提供数据支持。 展开更多
关键词 沙门氏菌 耐药谱 耐药基因 毒力基因
分离自老年病房的鲍曼不动杆菌耐药机制初步研究
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作者 周玉 龚美亮 +2 位作者 闫中强 丛玉隆 邓新立 《现代生物医学进展》 CAS 2019年第1期99-103,98共6页
目的:检测老年住院患者分离的鲍曼不动杆菌的主要耐药基因,并研究不同耐药基因型与耐药表型之间的对应关系。方法:用PCR方法检测分离自老年住院患者的不同标本来源的170例非重复鲍曼不动杆菌的耐药基因。检测的耐药基因包括D类碳青霉烯... 目的:检测老年住院患者分离的鲍曼不动杆菌的主要耐药基因,并研究不同耐药基因型与耐药表型之间的对应关系。方法:用PCR方法检测分离自老年住院患者的不同标本来源的170例非重复鲍曼不动杆菌的耐药基因。检测的耐药基因包括D类碳青霉烯酶:blaOXA-51,blaOXA-23,blaOXA-24,blaOXA-58,B类金属碳青霉烯酶:blaVIM,blaIMP,blaSIM,blaGIM,blaDIM,blaNDM-1,以及A类超广谱β-内酰胺酶:blaKPC,共计11种。根据检测结果对菌株进行基因分型,并研究不同基因型与CRAB和CSAB这两种耐药表型之间的对应关系。结果:170株鲍曼不动杆菌的固有基因blaOXA-51均为阳性,此外,主要检出基因为blaOXA-23,共124株。另外检测出blaKPC12株,bla OXA-58 6株,blaNDM-13株,blaSIM2株,blaOXA-24、blaVIM和blaDIM各1株,IMP和GIM未检出。根据检出耐药基因的不同组合,分为bla OXA-51+blaOXA-23阳性为基础的A型(124株)及blaOXA-23阴性为基础的B型(blaOXA-51,39株)、C型(blaOXA-51+blaOXA-58,6株)、D型(blaOXA-51+blaOXA-24,1株)共计四类基因型。从耐药表型来看,128株碳青霉烯耐药菌中有122株blaOXA-23为阳性,在CRAB中占95.3%(122/128),42株碳青霉烯敏感株中,有40株blaOXA-23为阴性,在CSAB中占95.2%(40/42)。结论:老年病房流行的耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌的耐药基因型以blaOXA-23阳性为主。其与鲍曼不动杆菌CRAB耐药表型、blaOXA-23阴性与CSAB耐药表型之间有良好的对应关系。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 老年患者 耐药基因
猪源大肠杆菌floR、CTX-M、mcr-1耐药基因多重PCR检测方法的建立 预览
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作者 李孟 李金磊 +4 位作者 申水莹 杨鹏霞 彭丽 李慧素 吴志明 《中国兽药杂志》 2019年第7期1-7,共7页
为了建立猪源大肠杆菌对氟苯尼考、β-内酰胺类与粘杆菌素耐药基因的多重PCR检测方法,本研究以氟苯尼考耐药基因floR、β-内酰胺耐药基因CTX-M、粘杆菌素耐药基因mcr-1作为目的基因,设计3对特异性引物,通过对多重PCR反应体系及条件的优... 为了建立猪源大肠杆菌对氟苯尼考、β-内酰胺类与粘杆菌素耐药基因的多重PCR检测方法,本研究以氟苯尼考耐药基因floR、β-内酰胺耐药基因CTX-M、粘杆菌素耐药基因mcr-1作为目的基因,设计3对特异性引物,通过对多重PCR反应体系及条件的优化,成功建立了多重PCR检测方法。该方法的灵敏度为1.46×10^5CFU/m L,具有高度特异性、敏感性和可重复性。本方法的建立为大肠杆菌中常见耐药基因的快速检测及分子流行病学调查提供了新的手段。 展开更多
关键词 大肠杆菌 耐药基因 floR CTX-M mcr-1 多重PCR
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华北地区部分省(市)奶牛乳房炎乳中链球菌耐药表型和耐药基因研究
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作者 田晓英 甄天元 +4 位作者 于忠娜 孙萍 王军 韩荣伟 王世清 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第1期1-7,共7页
为了解华北地区4个省(市)奶牛乳房炎乳中链球菌的感染情况及对常用抗生素的耐药性,试验采用EN液体培养基、5%绵羊鲜血琼脂培养基、触酶试验、6.5%NaCl试验、七叶苷试验i马尿酸钠试验和CAMP试验对2016年华北地区240批次乳房炎奶牛乳样进... 为了解华北地区4个省(市)奶牛乳房炎乳中链球菌的感染情况及对常用抗生素的耐药性,试验采用EN液体培养基、5%绵羊鲜血琼脂培养基、触酶试验、6.5%NaCl试验、七叶苷试验i马尿酸钠试验和CAMP试验对2016年华北地区240批次乳房炎奶牛乳样进行链球菌的分离鉴定和分型;采用纸片扩散法对2016年华北地区分离出的链球菌进行药敏试验,对华北地区上下半年及4个省(市)链球菌的药敏情况进行对比;并通过PCR扩增技术研究链球菌的耐药基因,计算链球菌表型耐药率与所携带相关耐药基因的阳性率,比较两者的相符率。结果表明:共分离得到致病性链球菌28株,总分离率为11.67%,其中无乳链球菌7株、停乳链球菌5株和乳房链球菌16株;链球菌分离株对苯唑西林和青霉素G表现出完全耐药;对四环素类药物耐药性较高,强力霉素和四环素的耐药率分别为85.71%和82.14%;对氯霉素类药物高度敏感,敏感率为92.86%;对喹诺酮类和氨基糖苷类药物耐药性较低,平均耐药率分别为8.93%和10.20%;除磺胺类药物外,其他类药物耐药率下半年均低于上半年;在4个省(市)中,天津市链球菌分离株对各类抗生素的平均耐药率高于其他省(市);经PCR扩增检测,耐药基因阳性率在7.14%~26.79%之间,整体检出率较低,耐药基因与耐药表型相符率在0~100%之间,其中氯霉素相符率为0,并不能完全拟合。说明2016年我国华北地区链球菌总检出率较低,乳房链球菌为主要致病菌,链球菌分离株表现出不同程度的耐药性,且多为多重耐药,耐药基因与耐药表型的相符率较低。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 链球菌 分型 抗生素 耐药性 耐药基因
五个抗稻瘟病基因在浙江省水稻品种中的分布和抗性评价 预览
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作者 何海燕 柴荣耀 +3 位作者 邱海萍 毛雪琴 王艳丽 孙国仓 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第6期922-929,共8页
为了明确浙江省部分水稻主栽品种和中国稻瘟菌生理小种鉴别品种中稻瘟病抗性基因分布情况,本研究采用5个基于稻瘟病抗感等位基因序列设计的功能性分子标记,对40份浙江省水稻主栽品种和6份稻瘟菌鉴别品种中Pit、Pib、Pii/Pi3/Pi5、Pia、... 为了明确浙江省部分水稻主栽品种和中国稻瘟菌生理小种鉴别品种中稻瘟病抗性基因分布情况,本研究采用5个基于稻瘟病抗感等位基因序列设计的功能性分子标记,对40份浙江省水稻主栽品种和6份稻瘟菌鉴别品种中Pit、Pib、Pii/Pi3/Pi5、Pia、Pi1等5个稻瘟病抗性基因进行了分子检测。结果发现,这5个抗性基因在浙江省栽培品种中分布频率不同,其中Pib基因分布最广,占63.04%;其次是Pia,占58.70%;携带Pii/Pi3/Pi5和Pit抗性基因的材料较少,分别为21.74%和10.87%。同时用2015—2017年田间采集到的141个稻瘟菌菌株检测46个水稻品种苗瘟抗性水平,结果显示,其中仅15个品种的抗性频率在70%以上,大部分品种携带其中1~2个抗性基因。聚合了多个抗性基因的品种抗性水平相对较高。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 抗病基因 分子标记
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草莓抗枯萎病分子标记初定位 预览
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作者 史芳芳 《湖北农业科学》 2019年第13期72-75,共4页
为加快草莓(Fragaria×ananassaDuch.)枯萎病抗病分子育种进程,以草莓优系后代为试材进行抗病试验分析,对父母本及不同优系后代进行抗病基因的筛选,并结合SSR分子标记技术,最终筛选出抗病品系。结果表明,抗病试验中,优系13-53-100和... 为加快草莓(Fragaria×ananassaDuch.)枯萎病抗病分子育种进程,以草莓优系后代为试材进行抗病试验分析,对父母本及不同优系后代进行抗病基因的筛选,并结合SSR分子标记技术,最终筛选出抗病品系。结果表明,抗病试验中,优系13-53-100和13-52-407具有很强的抗枯萎病特性,优系13-65-265抗枯萎病特性最差;抗病基因筛选出亲本中紫金四季和甜查理含有抗病性基因,优系后代中13-53-100和13-52-407含有抗病基因,可能遗传了甜查理的抗病性。 展开更多
关键词 草莓(Fragaria×ananassaDuch.) 枯萎病 抗性基因 SSR分子标记
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78份冬小麦区试品种抗条锈病基因的分子检测 预览
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作者 杨亨 康晓慧 +5 位作者 陈万权 李杰 蒋欣东 高利 刘博 刘太国 《湖南师范大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2019年第3期34-41,共8页
为及时动态掌握我国小麦培育过程中对抗性基因的使用情况以及对优势生理小种的抗性水平,同时为小麦的安全生产和育种提供一定的参考资料,采用Yr5,Yr9,Yr10,Yr18及Yr26的分子标记对78份2017—2018年国家冬小麦区试品种中可能含有的抗性... 为及时动态掌握我国小麦培育过程中对抗性基因的使用情况以及对优势生理小种的抗性水平,同时为小麦的安全生产和育种提供一定的参考资料,采用Yr5,Yr9,Yr10,Yr18及Yr26的分子标记对78份2017—2018年国家冬小麦区试品种中可能含有的抗性基因进行检测,配合使用我国当前流行生理小种CYR32和CYR34进行成株期抗性鉴定,了解我国新培育品种对条锈病的抗性情况以及抗性基因的分布。在供试的78份材料中,成株期对CYR32具有抗性的有52份;对CYR34具有抗性的有42份;同时对CYR32和CYR34具有抗性的有26份(包括来自四川麦区的全部13份材料);分别占鉴定材料的66.7%,53.8%和33.3%。分子检测结果表明,在78份鉴定材料中,可能携带Yr5,Yr9,Yr10,Yr18及Yr26的材料分别为0,21,5,1及9份,分别占鉴定材料的0%,26.9%,6.4%,1.3%及11.5%。鉴定材料中有效抗性基因的使用率低,1B/1R易位系的使用率高,成株期对当前流行小种CYR32以及新小种CYR34的抗性偏低。 展开更多
关键词 小麦条锈病 成株期抗性 抗性基因 分子检测
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2个抗病相关基因与高油酸油菜病害关系分析 预览 被引量:1
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作者 王晓丹 陈浩 +1 位作者 张振乾 官春云 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期894-901,共8页
为快速筛选抗病性强的高油酸油菜品种,本研究以20个高油酸油菜品系为试验材料,调查不同材料的抗病情况,并通过RT-qPCR测定经miRNA测序筛选得到的与抗病相关基因HSP90和ATG3的表达情况,同时分析其与病情指数的关系。结果表明,20个高油酸... 为快速筛选抗病性强的高油酸油菜品种,本研究以20个高油酸油菜品系为试验材料,调查不同材料的抗病情况,并通过RT-qPCR测定经miRNA测序筛选得到的与抗病相关基因HSP90和ATG3的表达情况,同时分析其与病情指数的关系。结果表明,20个高油酸油菜品系的发病率与病情指数呈线性正相关关系,且差异极显著;HSP90基因从苗期至花期表达量呈逐渐降低的趋势,角果期有先升高后降低和逐渐升高2种表达模式;ATG3基因从苗期至花期表达量也呈逐渐升高的趋势,角果期表达模式与HSP90基因相同。用HSP90基因在花期-叶中表达量≥1. 5倍内参时进行抗病材料筛选,有95%的准确率;用ATG3基因在花期-叶中表达量≥1. 8倍内参时进行抗病材料筛选,有80%的准确率,此外,也可用HSP90在花期-叶结合ATG3在五~六叶期-叶中表达情况进行预测,有80%的准确率。本研究结果为高油酸油菜抗病材料的早期筛选和油酸油菜育种提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 高油酸油菜 抗病基因 表达规律 病害
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大黄鱼中哈维氏弧菌毒力及耐药特性分析
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作者 吴立婷 廖金轩 +5 位作者 庞茂达 包红朵 周艳 孙利厂 王冉 张辉 《食品安全质量检测学报》 CAS 2019年第8期2111-2119,共9页
目的分析鉴定海产养殖中主要病原哈维氏弧菌的毒力及耐药特性。方法采集来自于网箱养殖区病死大黄鱼,分离幵鉴定哈维氏弧菌,利用微量肉汤稀释法分析分离株对13种抗生素的敏感特性,PCR鉴定耐药基因(tetA、tetB、ermA、ermB、ermC、mecA、... 目的分析鉴定海产养殖中主要病原哈维氏弧菌的毒力及耐药特性。方法采集来自于网箱养殖区病死大黄鱼,分离幵鉴定哈维氏弧菌,利用微量肉汤稀释法分析分离株对13种抗生素的敏感特性,PCR鉴定耐药基因(tetA、tetB、ermA、ermB、ermC、mecA、aac(6’)-Ib、oqxA、sul1、sul2、mcr-1)及其毒力基因。结果从病料中分离幵鉴定出54株哈维氏弧菌,耐药分析表明对硫酸粘杆菌素、庆大霉素、四环素、氨苄西林、复方新诺明和阿莫西林均耐药, 96.2%的分离株对头孢噻呋, 92.6%的分离株对链霉素、阿米卡星表现为耐药, 88.9%的分离株对恩诺沙星, 87.1%的分离株对卡那霉素呈现高度耐受特性。所有分离株同时对9种抗生素显示100%耐药,同时耐受10种抗生素的菌株有94.4%,同时对11和12种抗生素耐受的菌株分别达到85.2%和64.8%,对13种抗生素均产生耐药的菌株达到37.0%(20/54)。耐药基因分析表明四环素类tetA为主要耐药基因,检出率高达81.5%;氨基糖苷类aac(6’)-Ib,β-内酰胺类mecA,磺胺类sul1、sul2,喹诺酮类oqxA和大环内酯类ermA、ermC分别检出4~7株。毒力基因分析表明toxR携带率高达75.9%。结论本研究分析了海产养殖中主要病原哈维氏弧菌感染状况,其耐药严重且普遍携带毒力基因,表明哈维氏弧菌耐药和毒力对海产养殖造成重要威胁。同时本研究为弧菌病的有效防治提供参考依据。 展开更多
关键词 哈维氏弧菌 耐药特征 耐药基因 毒力基因
水稻白叶枯病抗性基因物理图谱定位与功能标记
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作者 向贤 陈露露 +2 位作者 张丹丹 翟文学 夏志辉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期509-516,共8页
分子标记辅助选择育种已成为水稻分子育种的主要策略。明确目标基因在染色体上的物理图谱定位与功能标记的开发应用是开展分子标记辅助选择育种的前提条件。本研究对已报道的40个抗白叶枯病基因在染色体上的定位、分子标记详情进行了整... 分子标记辅助选择育种已成为水稻分子育种的主要策略。明确目标基因在染色体上的物理图谱定位与功能标记的开发应用是开展分子标记辅助选择育种的前提条件。本研究对已报道的40个抗白叶枯病基因在染色体上的定位、分子标记详情进行了整理总结,并将31个水稻白叶枯病抗病基因在水稻基因组物理图谱上进行定位标注;此外,本研究还归纳xa5、xa13、Xa21、Xa27四个抗病基因的功能标记,新开发了抗性基因Xa10、Xa23的功能标记。本研究将给育种工作者更好地利用水稻抗白叶枯病基因与鉴定抗性材料提供便利。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病 抗病基因 物理图谱定位 功能标记
抗稻瘟病基因的克隆及其分子育种研究进展
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作者 王丹 沙岩 +2 位作者 胡俊峰 马凯 朴雪 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期4661-4666,共6页
水稻是世界上种植最广的农作物之一,而稻瘟病又是危害最严重的水稻病害之一,利用现有种质资源通过分子育种手段培育水稻抗性品种是防御稻瘟病菌最经济有效的方式。随着分子生物学尤其是基因工程技术的发展,通过对基因的直接操作使得水... 水稻是世界上种植最广的农作物之一,而稻瘟病又是危害最严重的水稻病害之一,利用现有种质资源通过分子育种手段培育水稻抗性品种是防御稻瘟病菌最经济有效的方式。随着分子生物学尤其是基因工程技术的发展,通过对基因的直接操作使得水稻具有抗病性成为可能。NBS-LRR类基因是水稻中最为重要的抗病基因,且具有很高的规律性,在水稻抗稻瘟病方面发挥着重要的作用。本综述主要综述了国内外分子育种与基因克隆相关研究进展与技术方法,描述了水稻已经克隆的稻瘟病抗性基因在染色体上的分布情况。并对通过分子育种培育水稻抗稻瘟病品种的研究方向和前景做了简要预测。 展开更多
关键词 抗病基因 水稻 稻瘟病 NBS-LRR 基因克隆
牧草白粉病的研究进展 预览
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作者 胡远彬 梁小玉 +1 位作者 季杨 易军 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第1期55-58,共4页
白粉病是由白粉菌引起的植物真菌病害,是牧草生产中常见的叶部病害之一,直接影响牧草的产量和品质,进而影响牧草产业乃至畜牧业的发展。文章综述了国内外牧草白粉病的病原菌、发病症状、发病规律、抗病机制、综合防治措施及牧草抗病基... 白粉病是由白粉菌引起的植物真菌病害,是牧草生产中常见的叶部病害之一,直接影响牧草的产量和品质,进而影响牧草产业乃至畜牧业的发展。文章综述了国内外牧草白粉病的病原菌、发病症状、发病规律、抗病机制、综合防治措施及牧草抗病基因相关研究现状,为我国牧草白粉病抗性机理深入研究、抗病新基因和抗源的发掘以及未来抗性育种工作的开展提供理论参考。 展开更多
关键词 牧草 白粉病 抗病机制 抗病基因
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黑龙江省主栽水稻品种抗稻瘟病基因的分子检测与分析
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作者 周弋力 张亚玲 +1 位作者 赵宏森 靳学慧 《作物杂志》 CAS 北大核心 2019年第3期172-177,共6页
了解品种本身的抗性基因型对于水稻品种合理布局具有重要意义。为了明确稻瘟病抗性基因Pi-ta、Pi-b、Pik-m、Pi9、Pii、Pi-d3在黑龙江省水稻品种中的分布情况,选取34份主栽品种,利用这6个抗瘟基因的功能标记,对供试材料进行分子标记检... 了解品种本身的抗性基因型对于水稻品种合理布局具有重要意义。为了明确稻瘟病抗性基因Pi-ta、Pi-b、Pik-m、Pi9、Pii、Pi-d3在黑龙江省水稻品种中的分布情况,选取34份主栽品种,利用这6个抗瘟基因的功能标记,对供试材料进行分子标记检测。结果表明,Pi9的分布频率最高,其次是Pi-ta和Pik-m,Pi-b和Pii抗性基因分布频率较低,Pi-d3的分布频率最低;供试的34份水稻材料中,被检测出最多含有5个抗性基因,而最少只含有1个抗性基因,含有2个抗性基因的品种所占比例最大,龙粳40和龙粳42不含有待检测基因。 展开更多
关键词 水稻 抗性基因 分子检测 分布 稻瘟病
水稻条斑病菌内源质粒分析 预览
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作者 曾晨 李康佳 +5 位作者 尹朝群 牛祥娜 赵嘉城 朱平川 姜伟 何勇强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1718-1727,共10页
【目的】明确水稻条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzicola,简称Xoc)内源质粒分布状况、类型及其含有的主要功能基因,为下一步开展该菌与质粒相关的毒力进化研究、抗逆机制分析及穿梭载体构建打下基础。【方法】采用数据库检索法和... 【目的】明确水稻条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzicola,简称Xoc)内源质粒分布状况、类型及其含有的主要功能基因,为下一步开展该菌与质粒相关的毒力进化研究、抗逆机制分析及穿梭载体构建打下基础。【方法】采用数据库检索法和质粒分离鉴定法,调查水稻条斑病菌内源质粒的分布状况;以GenBank数据库中Xoc菌株基因组序列为研究对象,开展质粒信息检索,并对已发表的Xoc内源质粒序列进行系统进化分析;以Xoc中国菌株菌种库为研究对象,采用碱裂解法提取质粒,进行质粒酶切带型分析和主要功能基因鉴定。【结果】GenBank全基因组数据库中Xoc菌株内源质粒检出率为11.76%,系统进化分析结果表明这些质粒属于不同的进化分支。在257株Xoc中国菌株中,有29株菌株含有质粒,质粒检出率为11.28%,带有内源质粒的菌株均来自于华南稻区,且大部分来自广西。通过质粒酶切图谱比较,确认新发现的质粒属于9种新型Xoc内源质粒。按照已知Xoc内源质粒pXOCgx01上主要功能基因序列设计引物,PCR扩增结果表明新鉴定的Xoc质粒含有重金属抗性和DNA转移相关的基因,但在菌株间存在明显的多样性。【结论】部分Xoc菌株中含有一定数量的内源质粒,质粒类型和所含功能基因等具有一定的多样性,携带内源质粒的Xoc菌株有明显地域性。 展开更多
关键词 水稻条斑病菌 内源质粒 调查 酶切图谱 抗逆基因
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聚合白背飞虱和褐飞虱抗性基因创制杂交水稻恢复系 预览
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作者 朱永生 白建林 +8 位作者 谢鸿光 吴方喜 罗曦 姜身飞 何炜 陈丽萍 蔡秋华 谢华安 张建福 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期421-428,共8页
【目的】为了创制兼抗白背飞虱和褐飞虱的水稻恢复系,【方法】分别以抗褐飞虱材料B5(携带褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15)及携带白背飞虱抗性位点qsI-4的籼型恢复系福恢7011为供体亲本,以骨干恢复系福恢676为轮回亲本,应用低世代分离群体... 【目的】为了创制兼抗白背飞虱和褐飞虱的水稻恢复系,【方法】分别以抗褐飞虱材料B5(携带褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15)及携带白背飞虱抗性位点qsI-4的籼型恢复系福恢7011为供体亲本,以骨干恢复系福恢676为轮回亲本,应用低世代分离群体田间表型结合单株鉴定与高世代稳定株系室内筛选和分子标记辅助选择相结合的方法,并对抗虫株系及其测交后代进行考查和农艺性状分析。【结果】选育出聚合Bph14、Bph15和qsI-4的恢复系材料3份,携带2个抗虫基因的恢复系材料3份。其中6份恢复系的褐飞虱抗性鉴定结果均表现中抗以上。通过抗性鉴定和杂交后代农艺性状分析筛选出具有生产应用潜力的恢复系材料2份。【结论】为褐飞虱和白背飞虱抗性聚合新种质的创制和应用提供了基础材料。 展开更多
关键词 水稻 白背飞虱 褐飞虱 抗性基因 聚合育种
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鹅致病性大肠杆菌的分离鉴定、毒力基因和耐药基因的检测及药敏试验
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作者 王洪彬 张志强 +3 位作者 吴同垒 杨楠 高桂生 史秋梅 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第8期55-60,169共7页
为了确定发病鹅感染的病原菌及了解病原菌的耐药情况,试验检查发病鹅的临床症状及剖检病变,采集发病鹅的肝脏、脾脏等器官进行病原菌的分离培养、生化鉴定,同时对分离的病原菌进行16S rDNA序列分析、动物致病性试验、毒力基因和耐药基... 为了确定发病鹅感染的病原菌及了解病原菌的耐药情况,试验检查发病鹅的临床症状及剖检病变,采集发病鹅的肝脏、脾脏等器官进行病原菌的分离培养、生化鉴定,同时对分离的病原菌进行16S rDNA序列分析、动物致病性试验、毒力基因和耐药基因检测及药敏试验。结果表明:此次分离到一株优势菌株,命名为CL-1,是短杆状、中等大小的革兰氏阴性菌,且菌落形态特征和生化鉴定结果与大肠杆菌相符。经16S rDNA序列分析进一步证实分离菌株CL-1为大肠杆菌。分离菌株CL-1能够引起雏鹅和小白鼠感染发病,且雏鹅的感染症状与临床自然感染病例的症状相似。分离菌株CL-1携带eaeA、irp2、FyuA毒力基因,同时携带blaCTX-M、blaTEM、blaTEM1、blaOXA1、strA-strB、sul1耐药基因。分离菌株CL-1对大观霉素敏感;对环丙沙星、青霉素、阿莫西林、多西环素、磺胺二甲氧嘧啶、恩诺沙星、土霉素、新霉素、林可霉素耐药。说明发病鹅为大肠杆菌感染,且该分离菌株有较强的致病性,毒力基因及耐药基因检测结果可能与分离菌株的强致病性和多重耐药性有关,可以选择敏感药物大观霉素进行防控。 展开更多
关键词 大肠杆菌 分离与鉴定 毒力基因 耐药基因 药敏试验
O157:H7型大肠埃希菌CRISPR结构及耐药基因和毒力基因分布分析
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作者 王鹏飞 王颖芳 +4 位作者 段广才 郗园林 徐亚珂 陈帅印 詹煜慧 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第7期761-764,772共5页
目的了解O157:H7型大肠埃希菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered Regularly Interspaced ShortPalindromic Repeats,CRISPR)结构特征以及耐药基因和毒力基因分布情况。 方法利用多序列比对、BLAST、RNA二级结构预测等多种生物... 目的了解O157:H7型大肠埃希菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered Regularly Interspaced ShortPalindromic Repeats,CRISPR)结构特征以及耐药基因和毒力基因分布情况。 方法利用多序列比对、BLAST、RNA二级结构预测等多种生物信息学方法对20株O157:H7型大肠埃希菌的全基因组序列进行分析。 结果从GenBank数据库获得2000-2014年20株O157:H7型大肠埃希菌全基因组序列,所有基因组中共存在3个CRISPR位点且每个CRISPR位点的基因序列具有高度一致性(均超过99.7%);CRISPR2被一段序列分隔为CRISPR2a和CRISPR2b;CRISPR1中存在3个不同的间隔序列,CRISPR2也有3个不同的间隔序列,CRISPR3有1个间隔序列;CRISPR1和CRISPR3的重复序列均可形成茎环结构,CRISPR2和CRISPR1的重复序列具有较高的一致性。共检测7个耐药基因,所有菌株ampc均阳性,4株菌株tetB和sul1阳性,其它4个基因均未检出;共检测6个毒力基因,有10株细菌stx1阳性,其他5个毒力基因20株细菌均阳性。 结论CRISPR在O157:H7型大肠埃希菌中广泛分布且结构稳定,毒力基因分布广,耐药性问题不可忽视。 展开更多
关键词 O157:H7型大肠埃希菌 CRISPR 毒力基因 耐药基因
黑龙江省83份小麦品种抗秆锈病基因的分子检测
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作者 李丹丹 高越 +4 位作者 徐晓凤 玄元虎 曹远银 李天亚 姚远 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期235-245,共11页
为了明确黑龙江省小麦品种(系)对中国秆锈菌的抗性水平和了解抗秆锈病基因在该区域的分布情况,本研究选用中国小麦秆锈菌流行小种21C3CTHQM、34MKGQM和34C3RTGQM对从该区域征集到的83份主要小麦品种(系)进行了苗期抗秆锈病的评价,并利... 为了明确黑龙江省小麦品种(系)对中国秆锈菌的抗性水平和了解抗秆锈病基因在该区域的分布情况,本研究选用中国小麦秆锈菌流行小种21C3CTHQM、34MKGQM和34C3RTGQM对从该区域征集到的83份主要小麦品种(系)进行了苗期抗秆锈病的评价,并利用与抗秆锈病基因Sr2、Sr24、Sr25、Sr26、Sr31和Sr38紧密连锁的分子标记分别进行了分子检测,结合苗期表型及系谱,推测这些品种(系)可能含有的抗病基因。结果表明,83份小麦品种(系)对供试秆锈菌小种均表现抗性,对21C3CTHQM、34MKGQM和34C3RTGQM表现免疫或近免疫的分别为57、53和60份,各占供试材料数量的68.68%、63.85%和72.29%,其他剩余材料对3个供试秆锈菌小种表现中抗或高抗。分子标记分析表明,83份主要小麦品种(系)中有12份可能含有Sr2;克旱3号可能含有Sr25;6份小麦品种可能含有Sr31;19份小麦品种可能含有Sr38;没有检测出含有Sr24和Sr26的品种。因此,黑龙江省小麦品种对中国小麦秆锈病抗性水平相对较高,含有抗秆锈病基因Sr2以及对我国小麦秆锈病表现良好抗性的基因Sr31和Sr38,可能含有其他未知抗秆锈病基因,这些优良抗源材料可作为未来小麦生产育种的种质资源。 展开更多
关键词 小麦秆锈菌 抗病基因 分子检测 小麦
志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系 预览
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作者 王颖芳 王鹏飞 +3 位作者 詹煜慧 张晓萌 段广才 郗园林 《西安交通大学学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期71-75,共5页
目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比... 目的探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系。方法从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比对等方法获得志贺菌中CRISPR1、CRISPR2和CRISPR-Q1的分布情况、重复序列和间隔序列信息,通过BLAST方法获得毒力基因和耐药基因在志贺菌中的分布情况,SPSS21.0软件分析CRISPR与毒力基因和耐药基因的关系。结果志贺菌中的CRISPR1和CRISPR2在不同菌株中的间隔序列差别较大,CRISPR-Q1分布更为广泛(超过99%)。毒力基因在志贺菌中分布比较广泛(均超过56%),耐药基因中的blaOXA-1、camr、Sul2、tetB分布也比较广(超过50%)。CRISPR1/CRISPR2与是否携带9种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05),CRISPR-Q1与是否携带3种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2和CRISPR-Q1均与志贺菌中存在的毒力基因和耐药基因的个数间有统计学关联(P<0.05)。CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目之间存在统计学关联(χ^2=61.6,P<0.001)。结论志贺菌中不同CRISPR的分布差异比较大,存在的间隔序列数目不等;志贺菌CRISPR与部分毒力基因和耐药基因之间存在负相关;CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目存在正相关。 展开更多
关键词 志贺菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 毒力基因 耐药基因
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