期刊文献+
共找到12,606篇文章
< 1 2 250 >
每页显示 20 50 100
Single-nucleotide polymorphism screening and RNA sequencing of key messenger RNAs associated with neonatal hypoxic-ischemia brain damage 预览
1
作者 Liu-Lin Xiong Lu-Lu Xue +7 位作者 Mohammed Al-Hawwas Jin Huang Rui-Ze Niu Ya-Xin Tan Yang Xu Ying-Ying Su Jia Liu Ting-Hua Wang 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期86-95,共10页
A single-nucleotide polymorphism(SNP)is an alteration in one nucleotide in a certain position within a genome.SNPs are associated with disease susceptibility.However,the influences of SNPs on the pathogenesis of neona... A single-nucleotide polymorphism(SNP)is an alteration in one nucleotide in a certain position within a genome.SNPs are associated with disease susceptibility.However,the influences of SNPs on the pathogenesis of neonatal hypoxic-ischemic brain damage remain elusive.Seven-day-old rats were used to establish a hypoxic ischemic encephalopathy model.SNPs and expression profiles of mRNAs were analyzed in hypoxic ischemic encephalopathy model rats using RNA sequencing.Genes exhibiting SNPs associated with hypoxic ischemic encephalopathy were identified and studied by gene ontology and pathway analysis to identify their possible involvement in the disease mechanism.We identified 89 up-regulated genes containing SNPs that were mainly located on chromosome 1 and 2.Gene ontology analysis indicated that the up-regulated genes containing SNPs are mainly involved in angiogenesis,wound healing and glutamatergic synapse and biological processing of calcium-activated chloride channels.Signaling pathway analysis indicated that the differentially expressed genes play a role in glutamatergic synapses,long-term depression and oxytocin signaling.Moreover,intersection analysis of high throughput screening following PubMed retrieval and RNA sequencing for SNPs showed that CSRNP1,DUSP5 and LRRC25 were most relevant to hypoxic ischemic encephalopathy.Significant up-regulation of genes was confirmed by quantitative real-time polymerase chain reaction analysis of oxygen-glucose-deprived human fetal cortical neurons.Our results indicate that CSRNP1,DUSP5 and LRRC25,containing SNPs,may be involved in the pathogenesis of hypoxic ischemic encephalopathy.These findings indicate a novel direction for further hypoxic ischemic encephalopathy research.This animal study was approved on February 5,2017 by the Animal Care and Use Committee of Kunming Medical University,Yunnan Province,China(approval No.kmmu2019038).Cerebral tissue collection from a human fetus was approved on September 30,2015 by the Ethics Committee of Kunming Medical University,Chin 展开更多
关键词 CSRNP1 DUSP5 gene ontology ANALYSIS human FETAL CORTICAL neurons LRRC25 mRNA NEONATAL HYPOXIC ischemic ENCEPHALOPATHY pathogenesis signaling pathway ANALYSIS
在线阅读 下载PDF
口腔鳞状细胞癌组织PRSS8基因启动子甲基化状态及其临床意义
2
作者 张素欣 李天客 +4 位作者 郭杰 包阳 宋艳 常晴晴 陈中 《现代口腔医学杂志》 CAS 2019年第1期14-18,共5页
目的本实验通过分析口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)组织、癌旁组织中PRSS8基因启动子甲基化状态及其mRNA的表达情况,初步探索口腔鳞癌的发生、发展机制。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation Specific P... 目的本实验通过分析口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)组织、癌旁组织中PRSS8基因启动子甲基化状态及其mRNA的表达情况,初步探索口腔鳞癌的发生、发展机制。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation Specific PCR,MSP)检测52例(河北医科大学第四医院)经术后病理诊断为OSCC的癌组织及癌旁组织中PRSS8基因启动子区甲基化状态,分析其与临床病理分期的关系。应用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-PCR,RT-PCR)技术检测OSCC组织及癌旁组织中PRSS8的mRNA相对表达情况,分析其与临床病理分期的关系。结果 OSCC组织PRSS8基因启动子甲基化率均明显高于癌旁组织,(57.7%vs 34.6%χ~2=5.571,P=0.018),PRSS8基因甲基化状态与分化程度、淋巴结转移、病理分级相关(P<0.05),OSCC组织中PRSS8mRNA的表达水平明显低于癌旁组织,差异具有统计学意义(t=-10.620, P=0.000),OSCC组织中PRSS8基因mRNA的表达与分化程度、淋巴结转移、病理分级相关(P<0.05)。结论 PRSS8基因启动子区高甲基化可能与口腔鳞癌的发生及进展相关,有可能成为口腔鳞癌预后的重要指标。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 PRSS8 甲基化 MRNA
转录组数据分析肺腺癌和肺鳞状细胞癌中基因的差异表达 预览
3
作者 彭淑贤 李浔 +5 位作者 刘琴 张颖恒 邹黎明 龚小莉 王苗淼 马晓冬 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期641-649,共9页
目的对非小细胞肺癌两种亚型肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因差异表达进行生物信息学分析,寻找非小细胞肺癌潜在的生物学标志物运用于临床诊断,进而提高患者生存率。方法获取肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因表达谱分析数据集,使用R语言处理,t检... 目的对非小细胞肺癌两种亚型肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因差异表达进行生物信息学分析,寻找非小细胞肺癌潜在的生物学标志物运用于临床诊断,进而提高患者生存率。方法获取肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因表达谱分析数据集,使用R语言处理,t检验分析鉴定肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间的转录组差异,并通过维恩图显示所鉴定的基因差异表达。从GEO获得差异表达的基因,用DAVID及IPA进行分析,进一步确定潜在可用于鉴别肺腺癌和肺鳞状细胞癌的几种信号通路和生物标记。利用TCGA数据和临床肺癌样本中的生物标记表达,验证Osteoarthritis pathway和LXR/RXR分别在肺腺癌和肺鳞状细胞癌的基因差异表达;挑选miR-181b-5p及其靶基因WNT5A和MBD2进行验证,收集23例肺鳞癌患者的肺肿瘤组织(23例肿瘤组织,实验组)及其邻近肺组织(23例癌旁肺组织,对照组),检测miR-181b-5p和其靶基因WNT5A和MBD2的表达差异用于鉴别肺腺癌和肺鳞状细胞癌。结果GEO数据分析结果揭示肺腺癌和肺鳞状细胞癌的差异表达基因:肺腺癌中有851个DEGs(276个上调,575个下调),而肺鳞状细胞癌中有885个DEGs(406个上调,479个下调)。DAVID和IPA分析差异表达基因结果显示,白细胞迁移和炎症反应在肺腺癌中比肺鳞状细胞癌富集程度更高,Osteoarthritis pathway在肺腺癌中是抑制状态,而在肺鳞状细胞癌中显示是激活状态。IPA对重要转录因子、细胞因子和miRNA的分析结果显示肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间的区别主要是:转录因子(GATA4,RELA,YBX1,TP63和MBD2);细胞因子(WNT5A和IL-1A)和microRNA(miR-34a,miR-181b和miR-15a)。其中miR-34a和IL-1A、miR-15a和YBX1、miR-181b和WNT5A和MBD2可作为鉴别非小细胞肺癌亚型的成对microRNA和mRNA靶点。临床样本实验结果支持miR-181b-5p的表达上升和WNT5A的表达下调可视为诊断肺鳞状细胞癌的分子标记物。结论通过对转录组数据分析,发 展开更多
关键词 肺腺癌 肺鳞状细胞癌 转录组 MICRORNAS MRNA
在线阅读 免费下载
拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析
4
作者 陈健 侯昕 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期3894-3901,共8页
为研究拟南芥子叶与真叶的发育过程,本研究以模式植物拟南芥为研究材料,通过二代测序、富集分析等生物信息学的方法探索子叶与真叶基因表达的不同。在拟南芥真叶相较于子叶的差异基因分析中,共得到了 673个差异基因,其中上调的基因有570... 为研究拟南芥子叶与真叶的发育过程,本研究以模式植物拟南芥为研究材料,通过二代测序、富集分析等生物信息学的方法探索子叶与真叶基因表达的不同。在拟南芥真叶相较于子叶的差异基因分析中,共得到了 673个差异基因,其中上调的基因有570个,下调的基因有103个。进一步富集分析表明,拟南芥的真叶与子叶相比,真叶在光合作用以及细胞结构方面有大量差异基因富集,子叶则在糖原代谢以及一些次级代谢通路有大量差异基因富集。本研究结果为研究子叶特有的代谢通路提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 拟南芥 mRNA 生物信息
银屑病皮损mRNA与miRNA表达谱及网络调控分析
5
作者 张静 徐丽敏 +1 位作者 张红宇 邢卫斌 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期990-995,共6页
目的探讨银屑病患者皮损与正常皮肤组织mRNA和miRNA表达谱差异。方法利用人类基因组表达谱芯片和miRNA表达谱芯片结合基因组学和生物信息学分析银屑病皮损和正常皮肤组织差异表达的mRNA和miRNA,建立两者之间调控网络,筛选可能的核心基... 目的探讨银屑病患者皮损与正常皮肤组织mRNA和miRNA表达谱差异。方法利用人类基因组表达谱芯片和miRNA表达谱芯片结合基因组学和生物信息学分析银屑病皮损和正常皮肤组织差异表达的mRNA和miRNA,建立两者之间调控网络,筛选可能的核心基因。结果差异表达的mRNA 1 139个,miRNA 16个,其中3个miRNA 匹配入数据库并调节168个mRNA,筛选的核心基因为IGF1、IRF1、MCL1、SERPINA1和NEK2。结论差异的miRNA调控多个mRNA参与多种生物学过程和信号通路可能促使银屑病的发生和发展。 展开更多
关键词 银屑病 基因表达谱芯片 MRNA MIRNA
缺氧对耳蜗听神经元电压门控性钠通道及凋亡因子表达的影响 预览
6
作者 冯爽 陈敬伟 +2 位作者 黄振云 邵剑波 罗仁忠 《现代医药卫生》 2019年第11期1616-1618,共3页
目的研究缺氧对大鼠螺旋神经节神经元(SGN)电压门控性钠通道及凋亡因子表达水平的影响。方法分离出生3dSD大鼠SGN并进行原代培养,对照组给予常规培养处理,实验组给予无氧培养处理24h,提取总RNA,采用荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测凋亡... 目的研究缺氧对大鼠螺旋神经节神经元(SGN)电压门控性钠通道及凋亡因子表达水平的影响。方法分离出生3dSD大鼠SGN并进行原代培养,对照组给予常规培养处理,实验组给予无氧培养处理24h,提取总RNA,采用荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测凋亡因子Caspase-3,电压门控性钠通道Nav1.1、Nav1.6及Nav1.7α亚单位mRNA表达水平,比较实验组和对照组各基因mRNA表达水平。结果与对照组相比,实验组大鼠SGN Caspase-3、Nav1.1和Nav1.7α亚单位mRNA表达上调,Nav1.6α亚单位mRNA表达下调(P<0.05)。结论缺氧可能促进Caspase介导的SGN凋亡过程,并调控电压门控性钠通道的表达,该调控作用具有亚型选择性特点,可能是缺氧引起听力下降的机制之一。 展开更多
关键词 缺氧 电压门控性钠通道 螺旋神经节 凋亡因子 mRNA
在线阅读 下载PDF
多种RNA分子在肿瘤热疗研究中的进展 预览
7
作者 刘佳佳 蒙洁 +2 位作者 陈彻 李莉 王晶 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第12期2185-2188,共4页
随着热疗技术的发展和进步,热疗在肿瘤治疗领域发挥重大作用。RNA分子运载着基因和调控信息,并能反映细胞的实时状态,因此敏感特异性的RNA分子在临床精准医疗中显得尤为重要。关键RNA分子在肿瘤细胞热疗中的特异性表达,一方面可以揭示... 随着热疗技术的发展和进步,热疗在肿瘤治疗领域发挥重大作用。RNA分子运载着基因和调控信息,并能反映细胞的实时状态,因此敏感特异性的RNA分子在临床精准医疗中显得尤为重要。关键RNA分子在肿瘤细胞热疗中的特异性表达,一方面可以揭示肿瘤热疗的分子机制,另一方面也作为肿瘤预后和诊断的重要标记。 展开更多
关键词 肿瘤 热疗 mRNA 微小RNA 长链RNA
在线阅读 下载PDF
mRNA疗法在肿瘤免疫治疗中的应用 预览
8
作者 潘燕平 张昊 +2 位作者 向虹 阳小胡 胡勇 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期154-158,共5页
mRNA疗法以mRNA为制剂治疗疾病,是一种新兴的基因疗法,既可通过功能性蛋白的表达治疗基因缺陷性疾病或组织修复,又可通过抗原或抗体或受体的表达应用于免疫治疗,具有极大的应用价值。在肿瘤免疫治疗中,编码肿瘤相关抗原、特异性抗原、... mRNA疗法以mRNA为制剂治疗疾病,是一种新兴的基因疗法,既可通过功能性蛋白的表达治疗基因缺陷性疾病或组织修复,又可通过抗原或抗体或受体的表达应用于免疫治疗,具有极大的应用价值。在肿瘤免疫治疗中,编码肿瘤相关抗原、特异性抗原、抗体或受体的mRNA进入细胞质后翻译成蛋白质,进而诱导特定免疫反应,实现疾病的预防与治疗。随着免疫治疗技术和mRNA的技术发展,针对恶性肿瘤和传染性疾病等的mRNA免疫治疗已步入临床应用阶段。本文将就mRNA的合成、纯化及修饰,基于mRNA的肿瘤免疫疗法、临床试验结果及开发新药所遇到的关键性机遇与挑战进行综述。 展开更多
关键词 MRNA 肿瘤疫苗 肿瘤免疫治疗 临床应用
在线阅读 免费下载
钴60照射治疗大鼠胶质瘤后脑水肿与erb-B1基因转录水平的关系 预览
9
作者 石新东 胡胜 冯军 《神经损伤与功能重建》 2019年第10期510-512,共3页
目的:探讨钴60(Co60)照射治疗大鼠胶质瘤后放射性脑水肿与erb-B1(EGFR)基因转录水平的关系。方法:SD大鼠40只,随机分为对照组10只和放疗组30只。右侧尾状核注射C6细胞制作脑胶质瘤大鼠模型。造模后15 d,放疗组行Co60放疗,对照组不予治疗... 目的:探讨钴60(Co60)照射治疗大鼠胶质瘤后放射性脑水肿与erb-B1(EGFR)基因转录水平的关系。方法:SD大鼠40只,随机分为对照组10只和放疗组30只。右侧尾状核注射C6细胞制作脑胶质瘤大鼠模型。造模后15 d,放疗组行Co60放疗,对照组不予治疗。Co60照射后第6天,处死全部大鼠,取肿瘤组织行RT-PCR,检测erb-B1转录水平;右侧大脑半球剩余组织行HE染色,观察水肿情况。结果:放疗组明显脑水肿12只,无脑水肿11只。放疗组明显脑水肿大鼠erb-B1转录水平显著高于对照组和放疗组无脑水肿大鼠(均P<0.01)。结论:erb-B1基因转录水平可能与胶质瘤大鼠Co60放疗后放射性脑水肿的发生有关。 展开更多
关键词 胶质瘤 钴60 脑水肿 erb-B1 mRNA
在线阅读 免费下载
RT-qPCR检测Wistar大鼠黄嘌呤脱氢酶/氧化酶基因转录水平方法的建立
10
作者 王陈芸 李哲丽 +4 位作者 叶尤松 蔡发晶 肖涵 谢季平 唐东红 《实验动物科学》 2019年第1期26-30,共5页
目的建立实时荧光定量(RT-qPCR)检测Wistar大鼠黄嘌呤脱氢酶/氧化酶(XDH/XO)基因转录水平的方法,以在转录水平上对XDH/XO基因进行定量检测。方法提取Wistar大鼠肝脏组织中总RNA,经逆转录得到cDNA,以10倍为稀释因子稀释为5个浓度梯度,使... 目的建立实时荧光定量(RT-qPCR)检测Wistar大鼠黄嘌呤脱氢酶/氧化酶(XDH/XO)基因转录水平的方法,以在转录水平上对XDH/XO基因进行定量检测。方法提取Wistar大鼠肝脏组织中总RNA,经逆转录得到cDNA,以10倍为稀释因子稀释为5个浓度梯度,使用设计的引物序列和内参基因进行RT-qPCR检测,得到XDH/XO基因表达的标准曲线。进而检测Wistar大鼠高尿酸血症动物模型中XDH/XO基因转录水平的变化。结果 RT-qPCR法检测得到的XDH/XO基因标准曲线溶解峰单一,R^2接近1,能检测出高尿酸动物模型中XDH/XO基因转录水平的变化。结论 RT-qPCR检测Wistar大鼠XDH/XO基因转录水平的方法具有定量准确,重复性好的特点,可应用于高尿酸血症的发病机理、新药研究等方面。 展开更多
关键词 实时荧光定量(RT-qPCR) 嘌呤脱氢酶/氧化酶(XDH/XO) WISTAR大鼠 肝脏 mRNA
基于大脑黑质纹状体内多巴胺受体亚型含量与表达观察针刺对大鼠脑卒中痉挛状态的影响
11
作者 郭斌 岳增辉 +4 位作者 谢志强 谢丽娜 王彭汉 陈乐乐 朱小珊 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期577-579,共3页
目的:观察分析针刺对脑卒中痉挛状态(SCA)大鼠大脑黑质纹状体中多巴胺(DA)及其受体亚型(D1、D2)含量与表达的影响,从而探讨针刺对缓解SCA的作用机制。方法:将32只SD大鼠随机分为空白组、假手术组、模型组、针刺组(针刺阳陵泉、曲池),每... 目的:观察分析针刺对脑卒中痉挛状态(SCA)大鼠大脑黑质纹状体中多巴胺(DA)及其受体亚型(D1、D2)含量与表达的影响,从而探讨针刺对缓解SCA的作用机制。方法:将32只SD大鼠随机分为空白组、假手术组、模型组、针刺组(针刺阳陵泉、曲池),每组8只。运用大脑中动脉线栓法制作SCA模型,造模成功后第1天开始治疗,连续3d。以肌张力评分评价模型和针刺疗效,运用ELISA法分析大鼠大脑黑质中DA及其D1、D2受体的含量,RT-PCR法观察大鼠大脑D1、D2 mRNA的表达。结果:治疗前,与空白组、假手术组比较,模型组、针刺组肌张力评分显著升高(P<0.01);治疗后,与模型组比较,针刺组评分显著降低(P<0.01)。与空白组、假手术组比较,模型组DA及其受体D1、D2 mRNA显著降低(P<0.01),与模型组比较,针刺组DA含量显著升高(P<0.01,P<0.05),DA受体D1 mRNA表达显著增加(P<0.05)。结论:针刺可调节大脑黑质纹状体中DA受体亚型含量与表达,从而对SCA产生良好的治疗效果。 展开更多
关键词 脑卒中痉挛状态 多巴胺 多巴胺D1受体 多巴胺D2受体 mRNA
T淋巴母细胞淋巴瘤/白血病患者PDL1蛋白/mRNA表达及其与临床病理参数和预后的关系 预览
12
作者 潘欢 陈晓燕 +1 位作者 张婷 洪鸣 《疑难病杂志》 CAS 2019年第12期1245-1248,共4页
目的分析程序性死亡配体1(PDL1)蛋白及其mRNA在T淋巴母细胞淋巴瘤/白血病(T-LBL/ALL)患者中的表达及其与临床病理参数和预后的关系。方法收集2016年1月-2018年12月江苏省人民医院血液内科三病区T-LBL/ALL患者50例(T-LBL/ALL组)的病变组... 目的分析程序性死亡配体1(PDL1)蛋白及其mRNA在T淋巴母细胞淋巴瘤/白血病(T-LBL/ALL)患者中的表达及其与临床病理参数和预后的关系。方法收集2016年1月-2018年12月江苏省人民医院血液内科三病区T-LBL/ALL患者50例(T-LBL/ALL组)的病变组织存档蜡块,另选择35例淋巴结反应性增生(LH)患者(LH组)存档蜡块作为对照,将2组蜡块均制成组织芯片,采用免疫组化法检测PDL1蛋白表达水平,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测PDL1 mRNA表达量,分析其与患者临床病理参数和预后的关系。结果T-LBL/ALL组PDL1蛋白表达阳性率高于LH组(χ^2=7.824,P=0.005),PDL1 mRNA表达量高于LH组(t=14.010,P=0.000)。有骨髓侵犯、IPI评分>2分的T-LBL/ALL患者PDL1蛋白表达阳性率和PDL1 mRNA表达量明显较高(χ^2/P=5.133/0.023、5.773/0.016,t/P=3.707/0.001、2.564/0.014)。Kaplan-Meier生存分析显示,PDL1蛋白表达阳性患者总生存时间短于PDL1蛋白表达阴性患者(log-rank=9.761,P=0.002)。相关性分析显示,PDL1 mRNA表达量与T-LBL/ALL总生存时间呈负相关(r=-0.718,P=0.000)。结论 PDL1蛋白及其mRNA在T-LBL/ALL患者中呈高表达,且与肿瘤进展及预后存在关联。 展开更多
关键词 程序性死亡配体1 mRNA T淋巴母细胞淋巴瘤/白血病
在线阅读 下载PDF
散发性低钾性周期性麻痹患者KCNJ12和KCNJ18基因测序比对及KCNJ12基因mRNA表达分析 预览
13
作者 林菡 余洁玲 +4 位作者 谭傍弟 方浩威 官少兵 陈建军 梅志忠 《中华临床医师杂志(电子版)》 CAS 2019年第1期60-64,共5页
目的通过对散发性低钾性周期性麻痹(SPP)患者KCNJ18和KCNJ12基因测序比对分析,并对KCNJ12基因mRNA进行实时荧光定量PCR分析,研究SPP的病因和发病机制。方法选取东莞市厚街医院2016年5月至2018年4月收治的SPP患者42例,并以20例健康志愿... 目的通过对散发性低钾性周期性麻痹(SPP)患者KCNJ18和KCNJ12基因测序比对分析,并对KCNJ12基因mRNA进行实时荧光定量PCR分析,研究SPP的病因和发病机制。方法选取东莞市厚街医院2016年5月至2018年4月收治的SPP患者42例,并以20例健康志愿者作为对照组,均进行KCNJ18、KCNJ12基因DNA编码区Sanger法双向测序比对和KCNJ12基因mRNA实时荧光定量PCR分析。对SPP患者组和健康对照组KCNJ12基因mRNA起始拷贝数Ct值采用独立样本t检验进行比较。结果SPP患者KCNJ18、KCNJ12基因DNA编码区与健康人群比较无差异。KCNJ12基因mRNA实时荧光定量PCR分析显示,SPP患者组KCNJ12基因mRNA的起始拷贝数Ct值较健康对照组显著降低,差异具有统计学意义[(0.62±0.24)vs(1.11±0.15),P=0.02)],表明SPP患者KCNJ12基因mRNA表达水平与健康对照组比较明显降低。结论SPP患者KCNJ18、KCNJ12基因编码区不存在基因突变,但KCNJ12基因mRNA表达显著低于健康人群,提示SPP可能由内向整流性钾离子通道基因表达异常所致,尚需进一步研究。 展开更多
关键词 散发性低钾性周期性麻痹 KCNJ12基因 突变 聚合酶链反应 MRNA
在线阅读 下载PDF
长链非编码RNA与mRNA在胰腺癌中的差异表达及其预后价值 预览 被引量:1
14
作者 魏超 张晓 高杰 《癌变.畸变.突变》 CAS 2019年第2期119-126,132共9页
目的:对基因芯片表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的胰腺癌数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA在胰腺癌中的差异表达和预后价值。方法:首先对GEO数据库中的胰腺癌数据注释获得mRNA和lncRNA,并... 目的:对基因芯片表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的胰腺癌数据进行生物信息学分析,探讨长链非编码RNA(lncRNA)与mRNA在胰腺癌中的差异表达和预后价值。方法:首先对GEO数据库中的胰腺癌数据注释获得mRNA和lncRNA,并对芯片中的mRNA和lncRNA取交集获得差异mRNA和lncRNA。然后对差异mRNA和lncRNA进行基因分析,同时对TCGA数据库中胰腺癌的相关数据进行生存分析。结果:通过基因分析获得与胰腺癌相关可信度高的差异mRNA 1147个,lncRNA 336个,通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建lncRNA-mRNA共表达网络、lncRNA-mRNApathway网络、信号通路关系网络及蛋白质相互作用网络,结果证明mRNA和lncRNA对胰腺癌的发生发展有着重要影响;生存分析发现有12个lncRNA与胰腺癌的预后相关,分别是ATP1A1-AS1、CBR3-AS1、CTD-3080P12.3、FAM66D、FAM87A、FLJ38576、LINC00476、LINC00574、LINC01554、PYY2、LINC00857、OVOL1-AS1。结论:lncRNA对胰腺癌的发生发展及预后有显著影响,有望为胰腺癌的靶向治疗和预后评估提供新的治疗靶点和分子标志物。 展开更多
关键词 胰腺癌 长链非编码RNA MRNA 预后评估
在线阅读 下载PDF
mRNA单分子动态成像技术研究进展 预览
15
作者 赵艳霞 何丽娜 +2 位作者 崔亚宁 李晓娟 林金星 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期201-207,共7页
转录后成熟的mRNA与RNA结合蛋白结合,形成信使核糖核蛋白复合物,之后在胞质内沿细胞骨架转运并定位到亚细胞特定区域。在此过程中,mRNA的转运及调控对于mRNA的功能、蛋白质的定位和细胞极性生长的维持发挥着重要的作用。近年来,活细胞... 转录后成熟的mRNA与RNA结合蛋白结合,形成信使核糖核蛋白复合物,之后在胞质内沿细胞骨架转运并定位到亚细胞特定区域。在此过程中,mRNA的转运及调控对于mRNA的功能、蛋白质的定位和细胞极性生长的维持发挥着重要的作用。近年来,活细胞单分子成像技术的发展,为人们深入了解mRNA的动态调控提供了新的契机。通过对活细胞中mRNA和RNA结合蛋白的标记,我们不仅可以检测mRNA的动力学特征,还可以原位检测新合成的蛋白质。本文主要介绍mRNA的定位和翻译过程,重点叙述单分子动态成像技术在分析mRNA动态调控中的应用。活细胞单分子成像技术可以揭示mRNA翻译的动力学特性,并促进我们对mRNA命运的理解,为后续研究mRNA的动态调控提供参考。 展开更多
关键词 MRNA 活细胞单分子成像技术 动态调控
在线阅读 下载PDF
启动子对枯草芽孢杆菌表达环糊精葡萄糖基转移酶的影响
16
作者 李云菲 宿玲恰 吴敬 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期3540-3547,共8页
以质粒pHY300PLK为骨架构建Bacillus stearothermophilus来源的α/β-环糊精葡萄糖基转移酶(α/β-CGTase)在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)表达系统的表达质粒。为了提高α/β-CGTase的表达量,考察了9个单启动子(PamyQ, PamyQ’, Pap... 以质粒pHY300PLK为骨架构建Bacillus stearothermophilus来源的α/β-环糊精葡萄糖基转移酶(α/β-CGTase)在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)表达系统的表达质粒。为了提高α/β-CGTase的表达量,考察了9个单启动子(PamyQ, PamyQ’, Papr E, Pgsi B, Phpa Ⅱ, Pnpr E, Psrf, Pxyl, Pxyl’)对α/β-CGTase表达量的影响,摇瓶发酵表明最优单启动子为PamyQ’,α/β-CGTase表达量为6.52 U/mL,其次为Phpa Ⅱ和Pnpr E,分别对应酶活5.80 U/mL和5.73 U/mL。用PamyQ’与PamyQ’、Phpa Ⅱ、Pnpr E两两组合,构建双启动子PamyQ’-PamyQ’、Phpa Ⅱ-PamyQ’、Pnpr E-PamyQ’,摇瓶发酵表明最优双启动子为Phpa Ⅱ-PamyQ’,α/β-CGTase表达量为11.15 U/mL,是用单启动子PamyQ’表达时的1.7倍。测定Phpa Ⅱ-PamyQ’、PamyQ’-PamyQ’、PamyQ’-PamyQ’、PamyQ’、Pgsi B、Phpa Ⅱ为启动子时,α/β-CGTase m RNA转录水平,结果表明α/β-CGTase表达量随m RNA转录水平的提高而提高。使用含有启动子Phpa Ⅱ-PamyQ’的表达质粒进行3 L罐发酵,培养96 h时,α/β-CGTase酶活达到最高110.4 U/mL。 展开更多
关键词 环糊精葡萄糖基转移酶 枯草芽孢杆菌 启动子 MRNA
牦牛BoLA-I基因mRNA及其相关miRNAs在牦牛不同组织器官中表达分析
17
作者 徐业芬 孙宏宇 +9 位作者 索朗斯珠 牛家强 贡嘎 郭敏 王玉恒 张鹏宇 张雷 旦巴次仁 王刚 罗润波 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期47-56,共10页
为了解牦牛BoLA-I基因mRNA组织表达谱,并探索可能靶定BoLA-I基因的miRNAs,利用RT-PCR技术对牦牛BoLA-I基因mRNA在牦牛肝、脾、肺、肾、肌肉、卵巢、小肠、下颌淋巴结、大肠和肠系膜淋巴结等10种组织的表达谱进行分析,再通过Targetscan和... 为了解牦牛BoLA-I基因mRNA组织表达谱,并探索可能靶定BoLA-I基因的miRNAs,利用RT-PCR技术对牦牛BoLA-I基因mRNA在牦牛肝、脾、肺、肾、肌肉、卵巢、小肠、下颌淋巴结、大肠和肠系膜淋巴结等10种组织的表达谱进行分析,再通过Targetscan和miRBase软件来预测可能靶定BoLA-I基因的miRNAs,检测其在10种牦牛组织中的表达情况。结果表明:BoLA-I基因mRNA在检测的10种牦牛组织中均有表达,尤其在免疫器官组织中广泛表达,在牦牛的肠系膜淋巴结组织表达水平极显著高于小肠和大肠组织(P<0.01);预测到的可能靶定牦牛BoLA-I基因的miRNA共有28个,从中选择了6个进行组织表达谱分析,发现bta-miR-759、bta-miR-142-5p、bta-miR-665、bta-miR-2322-5p、bta-miR-199a-3p与牦牛BoLA-I基因共表达;除卵巢外,bta-miR-219-5p在其他组织中均有表达,且在肝脏组织中的表达水平极显著高于其他组织(P<0.01)。bta-miR-142-5p在肠系膜淋巴结中表达量极显著高于其他组织(P<0.01)。由此推测,牦牛BoLA-I基因及其预测的miRNA可能在牦牛组织中起重要作用。 展开更多
关键词 牦牛 BoLA-I MRNA miRNA 组织表达谱
MITF在白色北极狐不同组织器官中的差异表达
18
作者 李寒妹 葛丛丛 +3 位作者 王国森 王子贤 刘铮铸 巩元芳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第11期151-153,157共4页
为了探索小眼畸形相关转录因子(MITF)基因与狐狸毛色形成间的关系,试验采用实时荧光定量PCR技术,对MITF基因在白色北极狐皮肤、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉7个组织器官中的表达量进行了测定。结果表明:MITF基因在皮肤中表达量最... 为了探索小眼畸形相关转录因子(MITF)基因与狐狸毛色形成间的关系,试验采用实时荧光定量PCR技术,对MITF基因在白色北极狐皮肤、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉7个组织器官中的表达量进行了测定。结果表明:MITF基因在皮肤中表达量最高,其表达水平分别是心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉的19.5倍、3.2倍、1.8倍、5.3倍、9.7倍和31.0倍,差异达极显著水平(P<0.01)。推测MITF基因可能与白色北极狐的白色毛皮形成有密切联系。 展开更多
关键词 白色北极狐 小眼畸形相关转录因子 MRNA 实时荧光定量PCR 表达
基于公共数据库分析脯氨酸羟化酶3在非小细胞肺癌中的表达及预后价值
19
作者 秦远 黄丹丹 +1 位作者 付彬玉 罗杨坤 《肿瘤预防与治疗》 2019年第5期409-414,共6页
目的:探讨脯氨酸羟化酶3(prolyl hydroxylase 3,PHD3)在非小细胞肺癌中的表达及预后价值。方法:应用Oncomine和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库对PHD3 mRNA在NSCLC中表达水平及其与临床病理参数的关系进行分析,通过Kaplan-Meier Pl... 目的:探讨脯氨酸羟化酶3(prolyl hydroxylase 3,PHD3)在非小细胞肺癌中的表达及预后价值。方法:应用Oncomine和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库对PHD3 mRNA在NSCLC中表达水平及其与临床病理参数的关系进行分析,通过Kaplan-Meier Plotter和SurvExpress分析PHD3 mRNA表达水平与NSCLC预后的关系。结果:PHD3 mRNA在NSCLC组织中高表达(P=0.028)。PHD3高表达与鳞癌亚型,较晚的临床分期和男性患者相关(P<0.001,P=0.001)。Kaplan-Meier Plotter分析显示PHD3高表达提示腺癌较差的总生存率(P=0.003),SurvExpress分析结果也显示PHD3主要影响腺癌的预后(P=0.013),且在高危组中其表达水平显著上调(P<0.001)。Kaplan-Meier Plotter和SurvExpress分析结果均显示PHD3 mRNA表达水平与鳞癌预后无相关性。结论:PHD3可以作为一个潜在的分子标记预测NSCLC主要是肺腺癌的预后。 展开更多
关键词 脯氨酸羟化酶3 非小细胞肺癌 预后 MRNA
西洋参醇提物对慢性萎缩性胃炎大鼠的逆转效应研究
20
作者 龙华晴 赵文慧 +5 位作者 聂晓静 马津真 吴悦 陈璇 陈宇 吴人照 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第17期2131-2135,共5页
目的探讨西洋参醇提物对亚硝基胍(N-methyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidine,MNNG)诱发慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)模型大鼠的萎缩逆转作用及对PCNA蛋白、Bcl-2蛋白、PCNA mRNA、Bcl-2 mRNA、TFF3 mRNA、TNF-αmRNA... 目的探讨西洋参醇提物对亚硝基胍(N-methyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidine,MNNG)诱发慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)模型大鼠的萎缩逆转作用及对PCNA蛋白、Bcl-2蛋白、PCNA mRNA、Bcl-2 mRNA、TFF3 mRNA、TNF-αmRNA的影响。方法Wistar大鼠自由饮用浓度为167μg mL的MNNG饮用液,实验造模12周。确定成模后,将大鼠分为模型组、正常组、西洋参醇提物组。并分别给予药物干预后,观察大鼠体质量,胃组织病理组织学,血清胃泌素(gastrin,GAS),胃组织PCNA蛋白、Bcl-2蛋白、PCNA mRNA、Bcl-2 mRNA、TFF3 mRNA、TNF-αmRNA表达情况。结果治疗第8周西洋参醇提物组体质量恢复显著高于模型组(P<0.05)。西洋参醇提物组腺体萎缩、不典型增生、肠化显著减轻(P<0.01)。西洋参醇提物组炎症等级、GAS较模型组无显著性差异。西洋参醇提物组PCNA蛋白、Bcl-2蛋白较模型组显著降低(P<0.01)。西洋参醇提物组PCNA mRNA、TFF3 mRNA、TNF-αmRNA较模型组均有下降,但差异无统计学意义;Bcl-2 mRNA较模型组有显著升高(P<0.01)。结论西洋参醇提物对CAG模型大鼠具有良好的治疗作用,减轻体质量丢失,减轻胃黏膜萎缩和肠化生,其作用机制之一可能是通过下调胃黏膜PCNA蛋白、Bcl-2蛋白的高表达,起到改善乃至逆转CAG病理状态的作用。 展开更多
关键词 西洋参 醇提物 慢性萎缩性胃炎 增殖细胞核抗原 Bcl-2 三叶因子 肿瘤坏死因子-α 蛋白 mRNA
上一页 1 2 250 下一页 到第
使用帮助 返回顶部 意见反馈