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Heterogeneity in the regenerative abilities of central nervous system axons within species:why do some neurons regenerate better than others? 预览
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作者 William Rodemer Jianli Hu +1 位作者 Michael E.Selzer Michael I.Shifman 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期996-1005,共10页
Some neurons,especially in mammalian peripheral nervous system or in lower vertebrate or in vertebrate central nervous system(CNS)regenerate after axotomy,while most mammalian CNS neurons fail to regenerate.There is a... Some neurons,especially in mammalian peripheral nervous system or in lower vertebrate or in vertebrate central nervous system(CNS)regenerate after axotomy,while most mammalian CNS neurons fail to regenerate.There is an emerging consensus that neurons have different intrinsic regenerative capabilities,which theoretically could be manipulated therapeutically to improve regeneration.Population-based comparisons between"good regenerating"and"bad regenerating"neurons in the CNS and peripheral nervous system of most vertebrates yield results that are inconclusive or difficult to interpret.At least in part,this reflects the great diversity of cells in the mammalian CNS.Using mammalian nervous system imposes several methodical limitations.First,the small sizes and large numbers of neurons in the CNS make it very difficult to distinguish regenerating neurons from non-regenerating ones.Second,the lack of identifiable neurons makes it impossible to correlate biochemical changes in a neuron with axonal damage of the same neuron,and therefore,to dissect the molecular mechanisms of regeneration on the level of single neurons.This review will survey the reported responses to axon injury and the determinants of axon regeneration,emphasizing non-mammalian model organisms,which are often under-utilized,but in which the data are especially easy to interpret. 展开更多
关键词 axonal regeneration identifiable neurons intrinsic factors LAMPREY Mauthner cell Müller cell neuronal death non-mammalian model organisms spinal cord injury zebrafish
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Role of axon resealing in retrograde neuronal death and regeneration after spinal cord injury 预览
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作者 William Rodemer Michael E.Selzer 《中国神经再生研究:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第3期399-404,共6页
Spinal cord injury leads to persistent behavioral deficits because mammalian central nervous system axons fail to regenerate.A neuron's response to axon injury results from a complex interplay of neuron-intrinsic ... Spinal cord injury leads to persistent behavioral deficits because mammalian central nervous system axons fail to regenerate.A neuron's response to axon injury results from a complex interplay of neuron-intrinsic and environmental factors.The contribution of axotomy to the death of neurons in spinal cord injury is controversial because very remote axotomy is unlikely to result in neuronal death,whereas death of neurons near an injury may reflect environmental factors such as ischemia and inflammation.In lampreys, axotomy due to spinal cord injury results in delayed apoptosis of spinal-projecting neurons in the brain, beyond the extent of these environmental factors.This retrograde apoptosis correlates with delayed resealing of the axon,and can be reversed by inducing rapid membrane resealing with polyethylene glycol. Studies in mammals also suggest that polyethylene glycol may be neuroprotective,although the mechanism(s)remain unclear.This review examines the early,mechanical,responses to axon injury in both mammals and lampreys,and the potential of polyethylene glycol to reduce injury-induced pathology.Identifying the mechanisms underlying a neuron's response to axotomy will potentially reveal new therapeutic targets to enhance regeneration and functional recovery in humans with spinal cord injury. 展开更多
关键词 AXON resealing REGENERATION RETROGRADE NEURONAL death spinal cord injury sea LAMPREY PEG mitochondrial dysfunction calcium signaling
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七鳃鳗KCTD基因家族成员全基因组鉴定及进化分析
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作者 邢璐璐 祖尧 +1 位作者 李伟明 任建峰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期2437-2449,共13页
钾离子通道四聚化结构域(KCTD)蛋白基因家族是一个保守的基因家族,该家族成员的共同特征是具有一个含有BTB保守结构域的N-末端和一个可变的C-末端。KCTD基因的突变或不正常调控与人类多种疾病相关。七鳃鳗是现存最原始的脊椎动物,作为... 钾离子通道四聚化结构域(KCTD)蛋白基因家族是一个保守的基因家族,该家族成员的共同特征是具有一个含有BTB保守结构域的N-末端和一个可变的C-末端。KCTD基因的突变或不正常调控与人类多种疾病相关。七鳃鳗是现存最原始的脊椎动物,作为联系无脊椎动物和脊椎动物之间的桥梁,在生物进化研究中占有重要地位。本研究通过对海七鳃鳗(Petromyzon marinus)和日本七鳃鳗(Lethenteron japonicum)基因组和转录组数据分析,全面系统地鉴定了海七鳃鳗和日本七鳃鳗KCTD基因家族成员,并对其基因结构特征、蛋白保守基序和基因表达模式进行了分析。在海七鳃鳗和日本七鳃鳗中分别鉴定出13个和14个KCTD基因,基因长度和外显子数目在不同KCTD基因间变化很大,KCTD蛋白中4个基序保守性显著,大多数KCTD基因呈泛表达模式,并且在胚胎发育时期明显高表达。除七鳃鳗外,对12个无脊椎动物和脊椎动物代表物种KCTD基因家族成员进行了鉴定,并对KCTD基因家族成员的进化关系进行了分析。根据进化树聚类情况,将KCTD基因家族成员分为11个亚家族。进化分析结果显示,KCTD基因家族从低等的无脊椎动物线虫和果蝇到高等的人类都存在;线虫中仅有5个成员,果蝇中有8个成员,随着物种进化程度由低到高,KCTD家族成员数目呈现增加的趋势;从爬行类开始,脊椎动物KCTD基因数目稳定在24个左右。硬骨鱼类特有的全基因组复制事件影响鱼类KCTD基因数目。本研究结果不仅丰富了七鳃鳗KCTD基因家族信息,同时也对KCTD家族基因间的进化关系进行了探究,为深入研究该家族基因功能提供了一定的依据。 展开更多
关键词 七鳃鳗 KCTD基因家族 基因结构 表达模式 进化
Identification and characterization of lamprey nucleolin-like gene
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作者 Huan Zhao Yang Tian +1 位作者 Qingwei Li Yang Xu 《生物化学与生物物理学报:英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期112-115,共4页
Nucleolin was first described in 1973 as a protein involved in ribosome biogenesis and in DNA and RNA metabolism.It is a wellknown major non-ribosomal protein in the nucleolus,and is mainly distributed in the dense fi... Nucleolin was first described in 1973 as a protein involved in ribosome biogenesis and in DNA and RNA metabolism.It is a wellknown major non-ribosomal protein in the nucleolus,and is mainly distributed in the dense fibrillar and granular regions of the nucleolus. 展开更多
关键词 IDENTIFICATION CHARACTERIZATION LAMPREY nucleolin-like GENE
鳗鲡模式游动的鱼体变形曲率波的传播特性研究 预览
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作者 沈昊嫣 朱博闻 +1 位作者 王智慧 余永亮 《力学学报》 EI CSCD 北大核心 2019年第4期1022-1030,共9页
将鳗鲡模式游动的七鳃鳗简化成材料性质均匀的变截面黏弹性梁,通过数值方法求解鱼体在主动弯矩波(作为激励的驱动波)的驱动下匀速游动时身体变形曲率波的传播特性.结果表明,当主动弯矩的驱动频率高于鱼体结构基频时,可以观察到曲率波相... 将鳗鲡模式游动的七鳃鳗简化成材料性质均匀的变截面黏弹性梁,通过数值方法求解鱼体在主动弯矩波(作为激励的驱动波)的驱动下匀速游动时身体变形曲率波的传播特性.结果表明,当主动弯矩的驱动频率高于鱼体结构基频时,可以观察到曲率波相对于驱动波存在相位滞后,且越靠近尾部滞后现象越明显,这意味着曲率波的波速小于驱动波的波速,也间接地验证了前人的实验结果.通过参数研究发现,鱼体变形曲率波与驱动波的波速比与表征流体黏性作用的雷诺数无关,而与表征驱动波和鱼体材料属性的无量纲激励频率、激励波长及鱼体黏性系数有关.对于鳗鲡模式游动的鱼类,曲率波与驱动波的波速比随着无量纲激励频率和波长的增大而降低,随着鱼体黏性系数的增大而增大.进一步研究发现,通过小扰动分析得到的组合相似性参数Π可以统一描述波速比与激励参数、材料参数之间的关系. 展开更多
关键词 鳗鲡模式游动 七鳃鳗 主动弯矩波 曲率波
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七鳃鳗myd88基因的生物学特性及其下游分子的表达模式分析 预览
6
作者 赵春晖 赵培哲 +1 位作者 刘欣 李庆伟 《水生生物学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期690-697,共8页
髓样分化因子88(Myeloid differentiation factor 88,MYD88)是Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)信号通路的关键接头分子,在先天性免疫和适应性免疫中都起到重要作用。为了揭示七鳃鳗Myd88的生物学功能,研究首次从七鳃鳗(Lampetra jap... 髓样分化因子88(Myeloid differentiation factor 88,MYD88)是Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)信号通路的关键接头分子,在先天性免疫和适应性免疫中都起到重要作用。为了揭示七鳃鳗Myd88的生物学功能,研究首次从七鳃鳗(Lampetra japonica)中克隆了myd88基因,其ORF为852 bp,共编码283个氨基酸,推测的分子量为32.432 kD,等电点为6.25,无信号肽。多重序列比对表明七鳃鳗Myd88的氨基酸序列与其他物种同源性较高,具有高度保守的N端死亡结构域和C端的TIR结构域的Box1、Box2和Box3基序。实时荧光定量PCR分析表明:myd88基因在七鳃鳗各组织中均有低水平转录表达,鳃中表达量最高,其次是肌肉、髓和肾。脂多糖(LPS)体内刺激七鳃鳗后,七鳃鳗myd88在白细胞中表达量升高最显著,其次是在鳃中的表达量也明显升高,表明七鳃鳗Myd88参与七鳃鳗的抗菌免疫过程。此外,LPS刺激七鳃鳗还能诱导TLR信号通路Myd88依赖途径的下游信号分子Irak1、Traf6、Ikkβ和Nfkb在各组织中的转录表达。研究结果表明七鳃鳗中可能存在TLR/Myd88信号通路,为进一步探究该信号通路参与免疫应答的起源与进化奠定了基础。 展开更多
关键词 七鳃鳗 髓样分化因子88 表达模式 免疫应答
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七鳃鳗CD63的分子克隆、生物学特性及表达分析 预览 被引量:1
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作者 赵春晖 袁晓飞 +1 位作者 刘欣 李庆伟 《辽宁师范大学学报:自然科学版》 CAS 2016年第2期247-253,共7页
从日本七鳃鳗和东北七鳃鳗中克隆得到了CD63基因的ORF区,预测了其编码的氨基酸序列.利用生物信息学方法进行了氨基酸序列分析并构建了进化树.实时定量PCR技术分析表明:CD63在日本七鳃鳗的心脏、肝脏、肌肉、髓、鳃、肠和卵中均有表达.... 从日本七鳃鳗和东北七鳃鳗中克隆得到了CD63基因的ORF区,预测了其编码的氨基酸序列.利用生物信息学方法进行了氨基酸序列分析并构建了进化树.实时定量PCR技术分析表明:CD63在日本七鳃鳗的心脏、肝脏、肌肉、髓、鳃、肠和卵中均有表达.其中,在卵中的表达量最高.脂多糖(LPS)体内刺激日本七鳃鳗后发现,CD63在肝脏和肌肉中的表达显著升高.本研究为进一步了解CD63分子在七鳃鳗的免疫方面的作用提供了实验依据. 展开更多
关键词 七鳃鳗 CD63 分子克隆 表达分析
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东北七鳃鳗Lm-PHB2的生物信息学分析及多克隆抗体制备 预览 被引量:1
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作者 李铁松 时颖 +3 位作者 高杨 李莹莹 刘欣 李庆伟 《辽宁师范大学学报:自然科学版》 CAS 2016年第4期522-528,共7页
在首次获得七鳃鳗Lm-PHB2的全长cDNA序列的基础上,对预测得到的LmPHB2氨基酸序列进行了生物信息学和进化分析;经原核表达并大量提纯获得重组蛋白rLm-PHB2,在此基础上,优化兔抗七鳃鳗抗体的免疫制备流程.结果表明:七鳃鳗LmPHB2蛋白的理... 在首次获得七鳃鳗Lm-PHB2的全长cDNA序列的基础上,对预测得到的LmPHB2氨基酸序列进行了生物信息学和进化分析;经原核表达并大量提纯获得重组蛋白rLm-PHB2,在此基础上,优化兔抗七鳃鳗抗体的免疫制备流程.结果表明:七鳃鳗LmPHB2蛋白的理论分子质量约为33.25ku,理论等电点为9.85,为亲水性蛋白;信号肽预测结果表明其ORF区中无信号肽.该蛋白有1个位点可能发生N型糖基化,不存在棕榈酰化位点;跨膜区预测表明Lm-PHB2仅在内膜区域存在跨膜结构.系统发育树分析表明Lm-PHB2的进化地位在头索动物与脊椎动物之间,与物种进化规律基本一致.制备了效价≥64万且与重组蛋白rLm-PHB2和天然Lm-PHB2蛋白均有很强的特异性结合能力的多克隆抗体.Western Blot表明,Lm-PHB2蛋白在七鳃鳗的心、肾、肝和肠中均有表达,其中,在心脏组织中表达量最高.本实验为PHB2基因的进化研究提供了理论依据,并为七鳃鳗Lm-PHB2蛋白功能研究奠定了基础. 展开更多
关键词 七鳃鳗 Lm-PHB2 生物信息学 抗体制备
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Lamprey: a model for vertebrate evolutionary research
9
作者 Yang XU 《动物学研究》 CAS CSCD 2016年第5期263-269,共7页
Lampreys belong to the superclass Cyclostomata and represent the most ancient group of vertebrates. Existing for over 360 million years, they are known as living fossils due to their many evolutionally conserved featu... Lampreys belong to the superclass Cyclostomata and represent the most ancient group of vertebrates. Existing for over 360 million years, they are known as living fossils due to their many evolutionally conserved features. They are not only a keystone species for studying the origin and evolution of vertebrates, but also one of the best models for researching vertebrate embryonic development and organ differentiation. From the perspective of genetic information, the lamprey genome remains primitive compared with that of other higher vertebrates, and possesses abundant functional genes. Through scientific and technological progress, scientists have conducted in-depth studies on the nervous, endocrine, and immune systems of lampreys. Such research has significance for understanding and revealing the origin and evolution of vertebrates, and could contribute to a greater understanding of human diseases and treatments. This review presents the current progress and significance of lamprey research. 展开更多
关键词 脊椎动物 动物进化 最佳模型 七鳃鳗 器官分化 胚胎发育 遗传信息 功能基因
东北七鳃鳗肠道应答气单胞菌免疫刺激相关蛋白的鉴定
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作者 李莹莹 解文放 +1 位作者 朱婷 李庆伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1256-1263,共8页
动物肠道中寄生的微生物与宿主的营养、免疫及防御功能密切相关。本研究在东北七鳃鳗肠道中分离获得一株优势细菌,并鉴定为气单胞菌属(Aeromonads sp.)。建立了荧光定量PCR快速检测气单胞菌拷贝数的方法,经poly(I∶C)刺激后,气单胞... 动物肠道中寄生的微生物与宿主的营养、免疫及防御功能密切相关。本研究在东北七鳃鳗肠道中分离获得一株优势细菌,并鉴定为气单胞菌属(Aeromonads sp.)。建立了荧光定量PCR快速检测气单胞菌拷贝数的方法,经poly(I∶C)刺激后,气单胞菌数量下降1.15倍。因此,该肠道气单胞菌被认为是七鳃鳗肠道适应性免疫系统进化的关键菌群之一。为了进一步分析气单胞菌对东北七鳃鳗肠道适应性免疫影响的分子机制,将分离菌株腹腔注射七鳃鳗,利用双向电泳技术鉴定了七鳃鳗肠道应答气单胞菌免疫刺激的相关蛋白。共鉴定19个差异表达蛋白质,其中12个蛋白质表达上调,5个蛋白质表达下调,1个蛋白质刺激后消失,1个新增蛋白质,并对蛋白质功能进行分类。七鳃鳗肠道应答气单胞菌免疫刺激的差异表达蛋白分别参与了七鳃鳗适应性免疫调控、信号转导及能量代谢等。该研究可拓宽对七鳃鳗免疫研究的途径,为深入探讨适应性免疫系统发育提供理论基础和新的研究思路。 展开更多
关键词 七鳃鳗 肠道气单胞菌 肠道蛋白质组 肠道免疫
Cloning and identification of an Ubiquitinconjugatingenzyme E2 D2 gene fromJapanese lamprey Lampetra japonica 预览
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作者 Liyong Chen Fenfang Wu Bo Feng 《生物技术世界》 2015年第3期63-65,共3页
The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation.Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 is a protein that is encoded by the UBE2... The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation.Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 is a protein that is encoded by the UBE2D2 gene. Here, we report a lamprey (LaUBE2D2) gene which contained 441-bp open reading frame (ORF) encoding 147 amino acids with a typical UBC domain. Real-time PCR assay showed that the highest expression of the protein inadult lamprey was in the leukocytes, the lowest expression was in the skin, kidney and liver. The high conservation in amino acid sequence of the LaUBE2D2protein with the UBE2D2s from Homo sapiens, Danio rerio, Oreochromis niloticus and Takifugu rubripes, implied that it had similar function with UBE2D2proteins from other species. 展开更多
关键词 Ubiquitin-conjugating enzymes UBE2D2 ubiquitin Lamprey.
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七鳃鳗口腔腺分泌液降解后纤溶活性研究 预览 被引量:1
12
作者 唐敏 李丽 +2 位作者 勾萌 李庆伟 肖蓉 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2015年第6期686-689,共4页
七鳃鳗(Lampetra japonica)是最原始的脊椎动物之一,通常以宿主鱼类的血肉为食,其口腔腺分泌液可能含有防止血液凝固的活性肽或蛋白质组分。将七鳃鳗口腔腺分泌液于37℃温育后,分别与纤维蛋白原或血清白蛋白反应。七鳃鳗口腔腺分泌液... 七鳃鳗(Lampetra japonica)是最原始的脊椎动物之一,通常以宿主鱼类的血肉为食,其口腔腺分泌液可能含有防止血液凝固的活性肽或蛋白质组分。将七鳃鳗口腔腺分泌液于37℃温育后,分别与纤维蛋白原或血清白蛋白反应。七鳃鳗口腔腺分泌液经37℃温育后发生降解,降解后分泌液的纤维蛋白原水解酶活性明显高于未降解的分泌液,并能够在短时间内降解纤维蛋白原的Aα链、Bβ链和γ链,但是对血清白蛋白则无降解作用,这表明七鳃鳗口腔腺分泌液经温育后能够产生一些具有较高纤溶活性的蛋白质或多肽组分。经温育后发生降解的七鳃鳗口腔腺分泌液具有较高的纤维蛋白原水解酶活性,为阐明七鳃鳗的抗凝机制以及新型抗凝血剂的筛选提供了有力的数据支持。 展开更多
关键词 七鳃鳗 口腔腺分泌液 抗凝 纤维蛋白原溶解
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七鳃鳗g型溶菌酶的分子特征和抗菌活性 被引量:1
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作者 赵春晖 徐玮 +2 位作者 冯斌 刘欣 李庆伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期495-504,共10页
溶菌酶是先天免疫系统中对抗细菌病原体感染的一种关键蛋白.本研究从七鳃鳗中克隆g型溶菌酶基因.其酶基因c DNA为701 bp(Gen Bank序列号KP204854),开放阅读框为555 bp,编码由184个氨基酸组成的多肽,理论分子质量为20.24 k D,等电点为5... 溶菌酶是先天免疫系统中对抗细菌病原体感染的一种关键蛋白.本研究从七鳃鳗中克隆g型溶菌酶基因.其酶基因c DNA为701 bp(Gen Bank序列号KP204854),开放阅读框为555 bp,编码由184个氨基酸组成的多肽,理论分子质量为20.24 k D,等电点为5.48,含有1个半胱氨酸残基,无信号肽.实时荧光定量PCR分析表明,七鳃鳗g型溶菌酶基因在各组织中广泛表达,其中在肠中表达量最高.脂多糖(LPS)体内刺激七鳃鳗后发现,溶菌酶在口腔腺和头肾表达量显著升高.以溶壁微球菌和哈维弧菌为底物检测重组g型溶菌酶的活性时,均表现出抗菌活性,最适p H为7.5,最适温度为35℃.扫描电镜分析表明,重组酶能够使溶壁微球菌破裂.以上结果均表明,g型溶菌酶在七鳃鳗的先天免疫系统防御病菌感染中起到重要作用. 展开更多
关键词 七鳃鳗 g型溶菌酶 表达分析 抗菌活性
七鳃鳗PHB2的真核表达与亚细胞定位 预览
14
作者 李庆伟 李铁松 +1 位作者 王颖 刘欣 《辽宁师范大学学报:自然科学版》 CAS 2015年第1期105-111,共7页
以东北七鳃鳗心肌总RNA反转录得到的cDNA为模板,PCR扩增PHB2基因全长CDS区,并将其定向克隆至真核表达载体pEGFP-N1上,构建真核重组载体pEGFP-N1-Lm-PHB2.提取重组质粒,去除内毒素,利用脂质体介导的方法转染CHL、HeLa和MCF-7细胞,通过Wes... 以东北七鳃鳗心肌总RNA反转录得到的cDNA为模板,PCR扩增PHB2基因全长CDS区,并将其定向克隆至真核表达载体pEGFP-N1上,构建真核重组载体pEGFP-N1-Lm-PHB2.提取重组质粒,去除内毒素,利用脂质体介导的方法转染CHL、HeLa和MCF-7细胞,通过Western Blot检测转染后Lm-PHB2是否表达,Confocal观察EGFP融合蛋白在细胞中的表达及亚细胞定位.结果表明:PCR扩增片段与预期结果相符,双酶切和测序证明真核表达载体构建成功;Western Blot检测到Lm-PHB2蛋白条带,Confocal观察到绿色荧光蛋白GFP,证明真核重组载体成功表达;Lm-PHB2蛋白主要定位在CHL细胞的细胞核,少量存在于基质和线粒体中,而在HeLa和MCF-7细胞中,Lm-PHB2蛋白集中定位在细胞核中.本研究为七鳃鳗Lm-PHB2的功能研究奠定了重要基础. 展开更多
关键词 七鳃鳗 PHB2 真核表达 亚细胞定位
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基于基因表达谱芯片杂交分析免疫前后七鳃鳗白细胞的基因表达差异 预览
15
作者 赵春晖 史金杰 +3 位作者 王丹 王浩 刘欣 李庆伟 《辽宁师范大学学报:自然科学版》 CAS 2015年第4期507-516,共10页
七鳃鳗作为现存的圆口纲无颌类脊椎动物的代表,已成为研究脊椎动物适应性免疫系统起源和进化的新型模式生物.为筛选七鳃鳗白细胞中免疫防卫相关基因,利用人基因芯片分析脂多糖(LPS)免疫七鳃鳗前后白细胞中基因的差异表达.研究结果表... 七鳃鳗作为现存的圆口纲无颌类脊椎动物的代表,已成为研究脊椎动物适应性免疫系统起源和进化的新型模式生物.为筛选七鳃鳗白细胞中免疫防卫相关基因,利用人基因芯片分析脂多糖(LPS)免疫七鳃鳗前后白细胞中基因的差异表达.研究结果表明:免疫后七鳃鳗白细胞中共有155条差异表达基因,其中,上调的基因共92条,下调的基因共63条,涉及细胞生长分化、信号转导、细胞代谢、免疫防卫、细胞凋亡、增殖等多个方面.本研究首次应用人基因表达谱芯片杂交分析免疫前后七鳃鳗白细胞的基因表达差异,为探索无颌类免疫应答机制提供新的有价值的线索. 展开更多
关键词 七鳃鳗 基因表达谱芯片 免疫防卫 基因表达
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重组七鳃鳗PHB2蛋白的原核表达及纯化 预览 被引量:1
16
作者 李铁松 王颖 +1 位作者 高杨 李庆伟 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期37-42,共6页
为了研究PHB2蛋白的生物学活性及后续抗体的制备,作者以前期构建的p MD18-T-Lm-PHB2质粒为模板,PCR扩增Lm-PHB2基因全长CDS区,PCR产物经Hind III和Eco R I双酶切后连接至表达载体p ET-32a,构建重组质粒p ET-32a-Lm-PHB2。将鉴定正确的... 为了研究PHB2蛋白的生物学活性及后续抗体的制备,作者以前期构建的p MD18-T-Lm-PHB2质粒为模板,PCR扩增Lm-PHB2基因全长CDS区,PCR产物经Hind III和Eco R I双酶切后连接至表达载体p ET-32a,构建重组质粒p ET-32a-Lm-PHB2。将鉴定正确的重组质粒转化入大肠杆菌(Escherichia coli)Rosetta Blue,经IPTG诱导表达后,表达产物通过SDS-PAGE和Western blotting进行检测,利用镍柱亲和层析纯化得到纯度较高的目的蛋白r Lm-PHB2。结果表明,经PCR、双酶切和测序鉴定,所构建的重组质粒p ET-32a-Lm-PHB2序列正确,表达产物存在于裂解菌液的上清和沉淀中,经SDS-PAGE和Western blotting证实在约47 ku处有目的蛋白r Lm-PHB2的表达条带。本研究构建了重组七鳃鳗(Lampetra japonica)PHB2蛋白的原核表达载体,并大量表达和纯化目的蛋白,为该蛋白后续的抗体制备及生物活性研究奠定了基础。 展开更多
关键词 海洋生物学 七鳃鳗(Lampetra japonica) PHB2 原核表达 蛋白纯化
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支持向量机方法预测七鳃鳗miRNA前体 预览
17
作者 张洁 李庆伟 邹丽 《济南大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2015年第5期333-339,共7页
将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交叉法验证,平均敏感性和特异性分别为95%和95.9%,准确率为95.8%,接收者操作特征曲线(RO... 将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交叉法验证,平均敏感性和特异性分别为95%和95.9%,准确率为95.8%,接收者操作特征曲线(ROC)下的面积比约为98.9%。用Lj-miRSVM预测其他20个物种的pre-miRNA,平均正确率为78.5%。 展开更多
关键词 七鳃鳗 支持向量机 miRNA前体预测 ROC曲线
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日本七鳃鳗(Lampetra japonica)VLRB的克隆表达及单克隆抗体制备 预览 被引量:2
18
作者 吴芬芳 马宁 +2 位作者 陈立勇 苏鹏 李庆伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期 465-471,共7页
七鳃鳗(Lampetra japonica)和盲鳗(Hyperotreti)作为现存的无颌类脊椎动物的代表,其适应性免疫系统中的受体分子与哺乳动物的抗原受体分子不同,这种独特的受体分子称为可变淋巴细胞受体VLRs(Variable lym-phocyte receptors)。目... 七鳃鳗(Lampetra japonica)和盲鳗(Hyperotreti)作为现存的无颌类脊椎动物的代表,其适应性免疫系统中的受体分子与哺乳动物的抗原受体分子不同,这种独特的受体分子称为可变淋巴细胞受体VLRs(Variable lym-phocyte receptors)。目前VLRs分为3类,分别是VLRA、VLRB、VLRC,而VLRB由七鳃鳗类B淋巴细胞产生,是其体液免疫中主要成分,与IgM结构和功能类似。文章对日本七鳃鳗VLRB基因保守的C末端进行克隆、原核表达和重组蛋白纯化后,免疫Balb/c小鼠,通过细胞融合及间接酶联免疫吸附实验(Enzyme-linked immu-nosorbent assay,ELISA)筛选技术得到针对VLRB保守区的单克隆抗体细胞株。将杂交瘤细胞接种小鼠腹腔得到大量的单抗腹水,经Protein G亲和纯化后的单抗进行ELISA与Western blotting检测。经ELISA检测抗体效价为1:40000。Western blotting结果显示该单克隆抗体能够特异的检测重组VLRB蛋白及七鳃鳗血清中分泌型VLRB。流式细胞实验证明该单抗能特异识别七鳃鳗类淋巴细胞表面表达的膜型VLRB。VLRB单克隆抗体的成功制备和建株,为研究日本七鳃鳗基于VLR的适应性免疫系统提供了重要的工具。 展开更多
关键词 七鳃鳗 可变淋巴细胞受体(VLR) VLRB 单克隆抗体
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新的适应性免疫系统——可变淋巴受体研究进展 被引量:2
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作者 李默 吴芬芳 +1 位作者 刘欣 李庆伟 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期527-531,共5页
七鳃鳗是一种古老的脊椎动物,是脊椎动物进化的祖先。近年来,在其体内发现了一种新的适应性免疫形式受体——可变淋巴受体(variable lymphocyte receptor,VLR)。它类似于有颌类脊椎动物中的免疫球蛋白型抗原受体,是无颌类脊椎动物中... 七鳃鳗是一种古老的脊椎动物,是脊椎动物进化的祖先。近年来,在其体内发现了一种新的适应性免疫形式受体——可变淋巴受体(variable lymphocyte receptor,VLR)。它类似于有颌类脊椎动物中的免疫球蛋白型抗原受体,是无颌类脊椎动物中重要的免疫受体分子。与免疫球蛋白型抗原受体相似,它不仅可以形成多种多样的VLR来识别大量抗原,还具有与T/B淋巴细胞受体相似的功能。这种特殊受体的发现,对揭示免疫系统的起源与进化具有重要意义。研究表明,这种新型的可变淋巴受体具有其特殊的形成机制、结构和功能特性,现阶段通过大量的研究已经对其形成机制、结构和功能有了更进一步的了解,并证明了VLR与T/B淋巴细胞受体具有一定的相似性。本文就近年来对可变淋巴受体的研究进展进行概述,为进一步深入研究适应性免疫系统的起源与进化提供相关资料。 展开更多
关键词 七鳃鳗 无颌类脊椎动物 适应性免疫 可变淋巴受体 胚系基因
生物神经系统的编码特性和小世界特性 被引量:3
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作者 谢彬 刘深泉 +1 位作者 李炎烽 陈树春 《生物数学学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期507-512,共6页
本文主要研究视网膜神经系统和七鳃鳗脊椎神经系统的电位发放特性和网络特性,首先利用抑制神经系统的Winner Less Competition(WLC)模型,分析视网膜和七鳃鳗脊椎神经系统的电位发放.得到视网膜神经元和脊椎神经元的电位发放模式.... 本文主要研究视网膜神经系统和七鳃鳗脊椎神经系统的电位发放特性和网络特性,首先利用抑制神经系统的Winner Less Competition(WLC)模型,分析视网膜和七鳃鳗脊椎神经系统的电位发放.得到视网膜神经元和脊椎神经元的电位发放模式.然后利用Watts-Strogatz小世界网络的特性,分析两个生物神经系统的群集系数和特征路长,说明这些生物系统神经元之间的信息传递具有小世界网络的特性. 展开更多
关键词 小世界模型 视网膜 七鳃鳗 群集系数 特征路长
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