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核桃转录因子JrDof3的克隆及渗透胁迫表达分析 认领
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作者 马凯恒 张彤 +3 位作者 闫鹏宇 李文凯 李大培 杨桂燕 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期35-41,共7页
【目的】Dof转录因子普遍存在于植物,含有特殊的C2-C2型单锌指结构(C2-C2-Dof domain),在调控植物生命过程中发挥着重要作用,参与激素应答、碳固定和氮同化与吸收、开花结实等过程。但目前有关Dof转录因子响应逆境胁迫的研究报道较少,... 【目的】Dof转录因子普遍存在于植物,含有特殊的C2-C2型单锌指结构(C2-C2-Dof domain),在调控植物生命过程中发挥着重要作用,参与激素应答、碳固定和氮同化与吸收、开花结实等过程。但目前有关Dof转录因子响应逆境胁迫的研究报道较少,旨在探讨核桃Dof转录因子响应逆境胁迫的表达情况,探讨其响应逆境的潜在能力,为核桃抗逆优良品种选育及产业科学管理筛选重要的候选基因,并提供理论基础。【方法】从‘香玲’核桃转录组中鉴定出1条Dof基因(命名:JrDof3),对JrDof3基因上游启动子包含的顺式作用元件进行分析,预测其潜在的逆境响应功能;对该基因进行BLASTP搜索获得同源蛋白,利用MEGA构建进化树;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法对JrDof3基因在盐、干旱及ABA胁迫下的表达进行分析。【结果】JrDof3基因的完整开放读码框(ORF)长为873 bp,编码的多肽包含291个氨基酸,蛋白分子量为30.54 ku,理论等电点为9.36。系统发育分析发现JrDof3蛋白与来自壳斗科栎属的欧洲栓皮栎Quercus suber QsDof2.4蛋白具有较近的进化关系。其上游1 299 bp启动子包含逆境响应相关的DOF、MYB、MYC、WRKY等顺式作用元件和激素响应相关的ARFAT等元件。非生物胁迫下的表达分析发现JrDof3基因受NaCl、PEG6000及ABA诱导,且分别在处理24 h、3 d、48 h被诱导最为明显,分别为对照的6.56、7.82、6.08倍。【结论】JrDof3基因能积极响应渗透(盐和干旱)胁迫,并受上游启动子调控;且其逆境响应调控可能涉及ABA信号通路;JrDof3可作为核桃逆境响应调控的重要候选基因。 展开更多
关键词 核桃 渗透胁迫 Dof转录因子 表达分析
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大豆转录因子基因GmDof3的克隆及非生物胁迫诱导表达分析 认领
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作者 翟莹 何佳琦 +5 位作者 张军 邱爽 赵艳 张梅娟 马天意 孙天国 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第18期5894-5900,共7页
植物Dof(DNA binding with one finger)转录因子在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为了探索大豆Dof转录因子与非生物胁迫的关系,本研究利用RT-PCR技术克隆了一个大豆中Dof转录因子基因GmDof3。GmDof3编码含有483个氨基酸残基的... 植物Dof(DNA binding with one finger)转录因子在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为了探索大豆Dof转录因子与非生物胁迫的关系,本研究利用RT-PCR技术克隆了一个大豆中Dof转录因子基因GmDof3。GmDof3编码含有483个氨基酸残基的蛋白质,分子量为52.91 kD,等电点为8.11。蛋白结构预测发现,该蛋白含有一个典型Dof结合域,定位于细胞核中且含有大量磷酸化位点。进化分析表明大豆GmDof3蛋白与木豆CcDof3蛋白的同源性最高。顺式作用元件预测结果显示,GmDof3启动子序列中含多种逆境响应元件。实时荧光定量PCR表明,高盐、干旱、低温和高温均可诱导GmDof3的表达。本研究结果可以为大豆Dof转录因子在植物抗逆基因工程中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 大豆 Dof转录因子 非生物胁迫 表达分析
8个大豆Dof转录因子的生物信息学分析及干旱诱导表达 认领
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作者 刘蓓 邱爽 +2 位作者 何佳琦 李铭杨 翟莹 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期377-383,共7页
为探究大豆Dof转录因子的功能,本研究对大豆中8个Dof转录因子的基因序列进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR检测编码基因在干旱胁迫下的表达,并分析主要应答基因的启动子序列中的顺式作用元件。研究结果显示:8个Dof转录因子编码基... 为探究大豆Dof转录因子的功能,本研究对大豆中8个Dof转录因子的基因序列进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR检测编码基因在干旱胁迫下的表达,并分析主要应答基因的启动子序列中的顺式作用元件。研究结果显示:8个Dof转录因子编码基因分别位于大豆5、8、11、13、15和16号染色体上,编码蛋白序列的氨基酸残基为213~403个,等电点为6.61~9.36,主要定位于细胞核中。GmDof2与番茄SlDof5.4具有较近的亲缘关系,GmDof1、GmDof8、GmDof3和GmDof5之间具有较近的亲缘关系,GmDof7与黄瓜CsDof1.4具有较近的亲缘关系,而GmDof4和GmDof6具有较近的亲缘关系。GmDof1和GmDof3的表达量在干旱胁迫下上升幅度最明显,启动子序列中均含有多种逆境相关的顺式作用元件。研究结果证明大豆Dof转录因子具有在植物抗旱基因工程中的应用前景。 展开更多
关键词 大豆 苗期 Dof转录因子 干旱胁迫 表达分析
转基因PnDof30拟南芥非生物胁迫下的抗性分析 认领
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作者 张雨晴 刘野 +3 位作者 曲春浦 刘关君 杨天天 杨成君 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期407-415,共9页
Dof(DNA-binding with one finger)转录因子是植物中特有的一类转录因子,是锌指蛋白家族中的一个具有众多成员的家族,氨基酸长度一般在200~400,含有非常保守的N端和较为多变的C端。已有研究表明,Dof转录因子家族在参与植物发育的多种生... Dof(DNA-binding with one finger)转录因子是植物中特有的一类转录因子,是锌指蛋白家族中的一个具有众多成员的家族,氨基酸长度一般在200~400,含有非常保守的N端和较为多变的C端。已有研究表明,Dof转录因子家族在参与植物发育的多种生理途径和调节碳氮代谢、增加氮素的吸收与利用,提高植株抗逆能力中起着重要作用。为了探究小黑杨(Populus simonii×P.nigra)中Dof30基因的抗逆能力,本研究以转基因PnDof30拟南芥为研究对象,对干旱、盐和渗透胁迫后过表达PnDof30拟南芥株系L2和野生型拟南芥WT的生理指标进行比较。发现胁迫后拟南芥株系L2的种子萌发率、根长和鲜重等指标均高于WT;同时SOD、POD、脯氨酸含量高于WT,叶绿素和MDA含量下降;胁迫后L2中的PnDof30基因表达量显著提高。这些结果表明了PnDof30基因具有抗旱、耐盐和渗透胁迫的能力,对全面了解Dof转录因子的抗逆胁迫功能具有重要的意义。 展开更多
关键词 小黑杨 Dof转录因子 转基因PnDof30拟南芥 非生物胁迫
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小麦Dof转录因子家族全基因组鉴定和表达分析 认领
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作者 任永康 牛瑜琦 +1 位作者 逯成芳 唐朝晖 《河南农业科学》 北大核心 2020年第9期11-19,共9页
利用生物信息学方法对小麦Dof转录因子家族进行全基因组鉴定,并对其保守结构域、系统进化关系、共线性和表达模式进行分析,以期为小麦Dof转录因子的功能研究奠定基础。结果表明,在小麦基因组水平上共鉴定到86个Dof基因,它们在小麦染色... 利用生物信息学方法对小麦Dof转录因子家族进行全基因组鉴定,并对其保守结构域、系统进化关系、共线性和表达模式进行分析,以期为小麦Dof转录因子的功能研究奠定基础。结果表明,在小麦基因组水平上共鉴定到86个Dof基因,它们在小麦染色体上不均等分布,A、B、D染色体组中分别含有30、29、27个Dof转录因子;小麦Dof转录因子可被分成A、B、C1、C2、C3、D1、D2七个亚组,其中亚组D1是最大的一个亚组,含有29个Dof转录因子;多序列比对结果显示,所有的Dof转录因子都包含有一个C-X2-C-X21-CX2-C保守基序;共线性结果表明,有23个Dof基因组成了29对共线性基因对,暗示Dof基因在进化过程中发生了复制;表达模式分析表明,Dof基因在不同生长发育时期的组织和胁迫条件下均存在差异表达,说明Dof基因广泛参与小麦生长发育,且在响应生物和非生物胁迫中可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 小麦 Dof转录因子 全基因组鉴定 表达模式
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植物Dof基因结构特点及功能研究进展 认领
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作者 刘俊 金钰 +5 位作者 吴耀松 刘燕 王文彬 任闪闪 刁松锋 陈玉龙 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期180-190,共11页
DNA结合单锌指(DNA binding with one zinc finger,Dof)蛋白是由多基因共同编码的只在植物中存在的一类转录因子,其N-末端含有高度保守的由52个氨基酸残基组成的C2-C2型单锌指结构域,可以与DNA和蛋白质结合并相互作用;C-末端是特异转录... DNA结合单锌指(DNA binding with one zinc finger,Dof)蛋白是由多基因共同编码的只在植物中存在的一类转录因子,其N-末端含有高度保守的由52个氨基酸残基组成的C2-C2型单锌指结构域,可以与DNA和蛋白质结合并相互作用;C-末端是特异转录调控结构域,因其序列具有多变性,导致Dof基因功能的多样性。随着基因组学和生物信息学的发展,近年来已有多个物种的Dof蛋白相继被报道出来。Dof基因主要参与植物的生长发育、碳氮代谢、非生物胁迫及开花调控等生物学过程。综述了植物Dof转录因子的结构特性、已经报道的Dof基因数目及生物学功能,在此基础上讨论了毛竹开花研究存在的问题,并提出未来的展望,以期为进一步研究Dof转录因子提供参考。 展开更多
关键词 植物 Dof转录因子 结构特点 功能研究
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Dof转录因子在植物中的调控作用 认领
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作者 郭彦秀 陈静 +3 位作者 王艳芳 孙春玉 王义 张美萍 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期146-156,共11页
DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一类转录因子,自1993年在玉米中发现该转录因子到如今已有26年的历史。Dof蛋白只有一个由52个氨基酸组成的单锌指保守结构域,该结构域包含4个保守的半胱氨酸残基和一个二价锌离子,... DNA binding with one finger(Dof)蛋白是植物中特有的一类转录因子,自1993年在玉米中发现该转录因子到如今已有26年的历史。Dof蛋白只有一个由52个氨基酸组成的单锌指保守结构域,该结构域包含4个保守的半胱氨酸残基和一个二价锌离子,这两者都是Dof转录因子重要的组成部分,二者缺一不可,若半胱氨酸发生突变,或存在其他二价离子螯合剂都将会影响锌指结构的生成,进而使Dof蛋白不能与DNA结合,导致其丧失活性。半胱氨酸残基和Zn2+可以共价结合构成CX2CX21CX2C基序,此基序能够特异识别启动子中的AAAG(或CTTT)序列,从而激活或抑制靶基因的表达。Dof蛋白C-末端氨基酸序列的多变性导致该转录因子进化的多样性,从而在植物的生长发育过程中发挥着不同且重要的功能,如种子萌发、维管的发育和叶片极性、花和花粉发育、光周期反应、参与碳和氮的代谢、合成次生代谢产物、植物的逆境响应过程等。围绕着Dof转录因子的结构、系统进化关系、motif的组成和在植物中发挥的功能展开综述,以期为后续Dof转录因子的研究奠定相应的理论基础。 展开更多
关键词 Dof转录因子 单锌指保守结构域 进化关系 调控 代谢
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大豆中3个Dof转录因子的生物信息学及表达分析 认领
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作者 翟莹 邱爽 +6 位作者 张军 刘春雨 赵艳 李珊珊 张梅娟 邱增城 任巍巍 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第6期14-19,共6页
植物Dof转录因子在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为探明Dof转录因子参与大豆对非生物胁迫的响应,对大豆中3个Dof转录因子(GmDof2.1、GmDof3.1和GmDof4.6)的基因序列进行生物信息学分析。3个Dof基因分别位于不同染色体上,它们... 植物Dof转录因子在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为探明Dof转录因子参与大豆对非生物胁迫的响应,对大豆中3个Dof转录因子(GmDof2.1、GmDof3.1和GmDof4.6)的基因序列进行生物信息学分析。3个Dof基因分别位于不同染色体上,它们所编码的蛋白序列长度为212~305个氨基酸残基,均具有1个保守的Dof结构域。3个Dof蛋白主要定位于细胞核中且含有不同数量的磷酸化位点。启动子序列分析表明,GmDof2.1启动子序列中含有3种与逆境和激素响应相关的元件(ARE、DRE1和MBS),GmDof3.1启动子序列中含有6种与逆境和激素响应相关的元件(ABRE、ARE、CGTCA-motif、TGACG-motif、W-box和WUN-motif),GmDof4.6启动子序列中含有7种与逆境和激素响应相关的元件(ABRE、ARE、CGTCA-motif、GARE-motif、MBS、TGACG-motif和WUN-motif)。实时荧光定量PCR结果显示,3个Dof基因均可不同程度的响应高盐、干旱、低温和高温胁迫。GmDof2.1和GmDof3.1在大豆根中的表达量最高,GmDof4.6在大豆茎中的表达量最高。由此推测3个Dof转录因子可能在大豆应对非生物胁迫过程中发挥转录调控作用。 展开更多
关键词 大豆 Dof转录因子 非生物胁迫 表达分析
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毛竹PheDof4-1基因克隆及表达分析 认领 被引量:1
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作者 刘俊 黄容 +3 位作者 程占超 牟少华 李雪平 高健 《安徽农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期398-403,共6页
Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,由多基因共同编码,参与植物转录调控、生长发育及胁迫响应等生物学过程。以毛竹为研究对象,克隆了1个DD厂基因,命名为PheDof4-J,基因长度为1473bp,推测其蛋白质... Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物特有的一类转录因子,由多基因共同编码,参与植物转录调控、生长发育及胁迫响应等生物学过程。以毛竹为研究对象,克隆了1个DD厂基因,命名为PheDof4-J,基因长度为1473bp,推测其蛋白质产物的分子量是53.2kDa,等电点为8.05。qRT—PCR结果显示,PheDof4-J在低温和250mmol·L-1 NaCl处理的幼茎中诱导表达,而在20%PEG8000处理的根中表达则受到强烈抑制。在叶片中不同处理条件下呈现不同的表达趋势。研究结果为PheDof4-1在非生物胁迫中的作用提供理论依据,为竹子分子育种提供参考。 展开更多
关键词 毛竹 Dof转录因子 非生物胁迫 表达模式
植物Dof转录因子的结构特点及功能研究进展 认领 被引量:3
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作者 张雪 尹悦佳 +3 位作者 范贝 李慧杰 费小钰 崔喜艳 《作物杂志》 CAS 北大核心 2016年第2期14-20,共7页
Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物中特有的转录因子,其N-末端具含保守锌指结构的Dof结构域,能够识别AAAG序列;Dof转录因子能够发挥多种功能,主要是由于其具有多变的C-末端,它是Dof蛋白的特异转录调控结构域。在植物中,Dof... Dof(DNA binding with one finger)蛋白是植物中特有的转录因子,其N-末端具含保守锌指结构的Dof结构域,能够识别AAAG序列;Dof转录因子能够发挥多种功能,主要是由于其具有多变的C-末端,它是Dof蛋白的特异转录调控结构域。在植物中,Dof转录因子的功能主要与维管发育、叶片极性、保卫细胞特异基因的调控、碳氮代谢、种子发育和萌发、光响应及光周期调控的开花和花粉发育、次生代谢物合成、防御反应、生长素响应等生理过程有关。将这些进程归纳为组织分化、种子发育和代谢调节三个方面,通过对植物Dof转录因子的结构特点及功能进行分析,为Dof转录因子的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 植物 Dof转录因子 结构特点 功能
Dof转录因子研究进展 认领 被引量:1
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作者 李跃 李国瑞 +5 位作者 黄凤兰 孙华军 邢超 丛安琪 李威 陈永胜 《安徽农业科学》 CAS 2016年第7期96-97,共2页
Dof(DNA Binding with one finger)转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程中扮演重要作用,如种子萌发、光响应、贮藏蛋白积累、生物胁迫、碳氮代谢等。介绍了Dof转录因子的结构,并综述了其对植物的调控作用,以期为Dof... Dof(DNA Binding with one finger)转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育过程中扮演重要作用,如种子萌发、光响应、贮藏蛋白积累、生物胁迫、碳氮代谢等。介绍了Dof转录因子的结构,并综述了其对植物的调控作用,以期为Dof转录因子的进一步研究提供理论依据。 展开更多
关键词 Dof转录因子 生长发育 结构 调控作用
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茶树两个Dof转录因子的分离及其在温度胁迫中的响应分析 认领 被引量:4
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作者 李辉 黄蔚 +3 位作者 刘志薇 王永鑫 吴致君 庄静 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期312-322,共11页
茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsD... 茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsDof1和CsDof2转录因子都具有典型的锌指结构域,分别位于第133-195和124-186个氨基酸位点之间.对CsDof1和CsDof2转录因子理化性质、亲/疏水性、二级和三级结构分析显示,两者都是亲水性蛋白且显偏碱性.空间结构分析显示,CsDof1和CsDof2均有1个α-螺旋,且Dof结构域的位点完全相同,均有4个半胱氨酸残基.实时定量PCR表明,CsDof1和CsDof2在不同茶树品种、不同温度胁迫下均能诱导表达,且表达呈现差异. 展开更多
关键词 茶树 Dof转录因子 锌指结构 温度胁迫 基因表达
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马铃薯基因组中Dof转录因子家族的鉴定与表达特征分析 认领 被引量:3
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作者 吴智明 张圣旭 梁关生 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1260-1270,共11页
Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用。为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定... Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白是植物特有的一类转录因子,在多种代谢途径中发挥着重要作用。为全面了解Dof基因在马铃薯基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了马铃薯Dof基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域进行了预测,分析了Dof基因在不同组织和系列胁迫下的表达特征。结果表明,马铃薯Dof转录因子家族由35个基因编码43个蛋白质;基因分布于除7号和12号染色体外的其余10条染色体上;STDOF蛋白长度在165~503个氨基酸之间,等电点介于4.72~10.04;系统发生分析表明,STDOF蛋白分为4个亚族;转录组数据分析显示,St Dof基因的表达具有组织特异性,在不同胁迫条件下,多数St Dof基因的表达也呈现有不同程度的差异。本研究为深入探讨St Dof基因的功能及在马铃薯的遗传改良中的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 马铃薯 Dof转录因子 生物信息学 基因表达
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胡萝卜中DcDofD1转录因子的克隆及其对非生物逆境胁迫的响应分析 认领 被引量:3
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作者 却枫 黄莹 +3 位作者 王枫 徐志胜 王广龙 熊爱生 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1073-1079,共7页
Dof(DNA-binding with one finger)转录因子是植物特有的一类转录因子,该类转录因子在植物生长发育过程中起重要作用。本试验以胡萝卜黑田五寸和君川红为试验材料,分别从中克隆获得Dc Dof D1转录因子基因。采用生物信息学方法对Dc Dof... Dof(DNA-binding with one finger)转录因子是植物特有的一类转录因子,该类转录因子在植物生长发育过程中起重要作用。本试验以胡萝卜黑田五寸和君川红为试验材料,分别从中克隆获得Dc Dof D1转录因子基因。采用生物信息学方法对Dc Dof D1转录因子氨基酸组成、理化性质、进化关系进行了分析。并利用实时定量PCR方法对Dc Dof D1基因在非生物胁迫下的表达量进行了分析。结果表明,黑田五寸和君川红中的Dc Dof D1转录因子具有明显的单锌指结构,保守域的氨基酸序列比较保守。进化分析显示,Dc Dof D1属于Dof家族的D1亚族。在胡萝卜黑田五寸和君川红中,Dc Dof D1基因对高温、低温、干旱、盐等非生物胁迫有响应。而不同胡萝卜材料中,Dc Dof D1基因对非生物逆境响应的强度和速度不同。 展开更多
关键词 胡萝卜 Dof转录因子 基因克隆 非生物胁迫 实时定量PCR 基因表达
刚毛柽柳Dof基因的克隆及盐胁迫表达谱 认领 被引量:5
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作者 杨桂燕 王玉成 +1 位作者 王超 高彩球 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期 1-3,共3页
Dof蛋白是植物所特有的一类DNA结合蛋白,参与多个生物学过程。通过对7个柽柳转录组分析,获得14个Dof全长基因序列,这些基因推导蛋白氨基酸残基数为263—507,编码蛋白的相对分子质量为27.52—55.24kD,理论等电点为5.94~9.51。... Dof蛋白是植物所特有的一类DNA结合蛋白,参与多个生物学过程。通过对7个柽柳转录组分析,获得14个Dof全长基因序列,这些基因推导蛋白氨基酸残基数为263—507,编码蛋白的相对分子质量为27.52—55.24kD,理论等电点为5.94~9.51。对7个柽柳转录组中D矿基因表达的分析表明,ThDof3、ThDof4、ThDoJ7和ThDof14基因的表达受盐胁迫调控,能对盐胁迫作出应答。而ThDof6基因特异的在根中表达。 展开更多
关键词 非生物胁迫 Dof转录因子 表达谱 刚毛柽柳
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DOF转录因子AtDof1.7RNA干扰载体的构建及拟南芥的遗传转化 认领 被引量:4
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作者 尹明智 官梅 +2 位作者 肖钢 李栒 官春云 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期 1196-1204,共9页
DOF(DNA binding with one finger)转录因子是植物特有的转录因子家族,含有一个独特的富含Cys残基的单锌指DNA结合区域,在植物生长发育中参与多种生物学过程。本研究根据拟南芥AtDof1.7基因(GenBank登录号为AT1G51700)序列设计含有... DOF(DNA binding with one finger)转录因子是植物特有的转录因子家族,含有一个独特的富含Cys残基的单锌指DNA结合区域,在植物生长发育中参与多种生物学过程。本研究根据拟南芥AtDof1.7基因(GenBank登录号为AT1G51700)序列设计含有不同酶切位点的特异性扩增引物,以拟南芥总DNA为模板,扩增AtDof1.7基因片段,将AtDof1.7基因正向反向分别插入表达载体的相应位置,构建成AtDof1.7基因的RNA干扰载体pADOF1。利用改良的floral-dip方法将干扰载体pADOF1成功转入野生型拟南芥,经草甘膦抗性筛选和PCR检测获得5株阳性转基因植株。利用RT-PCR技术和气相色谱法分别分析了AtDof1.7基因的表达和种子脂肪酸组成,结果表明,5株转基因植株中AtDof1.7基因的表达量不同程度低于野生型植株,种子油酸含量明显上升,亚麻酸含量明显下降,说明AtDof1.7转录因子与拟南芥种子脂肪酸代谢途径有一定的关系,为进一步研究其在脂肪酸代谢过程中的调控作用以及在油菜中研究该类转录因子的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 DOF转录因子 AtDof1.7 拟南芥 RNA干扰载体 脂肪酸代谢途径
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玉米Dof转录因子家族基因的全基因组分析 认领 被引量:7
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作者 江海洋 骆晨 +2 位作者 江腾 程备久 朱苏文 《生物信息学》 2010年第3期 198-201,共4页
Dof转录因子家族在植物生长发育和基因表达调控过程中具有重要的作用,本文利用公布的玉米基因组草图数据,利用生物信息学方法对玉米全基因组Dof基因的结构、系统进化关系和保守motif进行了分析。结果表明:玉米中共有18个Dof类型基因,... Dof转录因子家族在植物生长发育和基因表达调控过程中具有重要的作用,本文利用公布的玉米基因组草图数据,利用生物信息学方法对玉米全基因组Dof基因的结构、系统进化关系和保守motif进行了分析。结果表明:玉米中共有18个Dof类型基因,命名为ZmDof1-ZmDof18,其蛋白质长度在211aa至618aa之间,通过系统进化树分析后,18个Dof基因可以明显的分为三类,此外玉米Dof基因的数目远远小于水稻和拟南芥,基因复制现象较少是玉米Dof基因数量较少的原因之一,MEME分析证实了Dof基因含有三个保守的motif。对玉米Dof类型基因的系统分析,将有助于玉米Dof类型基因的克隆和功能的进一步研究。 展开更多
关键词 玉米 Dof转录因子 生物信息学
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水稻Dof转录因子家族的鉴定与生物信息学分析 认领
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作者 纪剑辉 周颖君 +3 位作者 杨雯 谢晶 华慧 杨立明 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期1191-1198,共8页
为了在全基因组水平上鉴定水稻Dof转录因子家族基本生物学特征,本研究对30个水稻Dof转录因子进行了聚类及功能结构域的分析。结合蛋白质氨基酸序列比对结果,明确了该家族所有基因均具有高度保守的Dof结构域;此外,对水稻、拟南芥、二穗... 为了在全基因组水平上鉴定水稻Dof转录因子家族基本生物学特征,本研究对30个水稻Dof转录因子进行了聚类及功能结构域的分析。结合蛋白质氨基酸序列比对结果,明确了该家族所有基因均具有高度保守的Dof结构域;此外,对水稻、拟南芥、二穗短柄草和高粱中Dof家族同源基因的聚类分析表明该家族基因在植物中具有高度同源性。利用Me Me程序进一步分析了水稻Dof转录因子家族的基序特征,结果与聚类分析具有一致性;通过对染色体复制情况的研究,明确了部分Dof基因在水稻本身以及水稻与其他物种之间存在种内和种间的局部染色体复制;结合生物芯片数据,进一步研究了水稻Dof基因在不同组织中的表达,结果显示部分Dof基因在叶片或根、茎部位呈现高表达,部分Dof基因在生殖器官呈现高表达,推测这些Dof基因可能参与这些特定组织的发育。 展开更多
关键词 水稻 Dof转录因子家族 进化分析
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