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内侧前额叶皮质DNA甲基化调控大鼠酒精相关行为 预览
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作者 崔亨贞 孙蜜烛 +4 位作者 王润芝 李辰雨 黄予暄 黄秋菊 乔晓孟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期112-125,共14页
酒精滥用不仅导致组织器官损伤,还易诱发神经精神疾病。研究表明,DNA甲基化在酒精诱导基因表达和行为改变中发挥重要作用,但具体的神经生物学机制尚未被阐明。为了探索DNA甲基化在酒精滥用中的作用机制,本研究选取健康成年雄性SD大鼠(Ra... 酒精滥用不仅导致组织器官损伤,还易诱发神经精神疾病。研究表明,DNA甲基化在酒精诱导基因表达和行为改变中发挥重要作用,但具体的神经生物学机制尚未被阐明。为了探索DNA甲基化在酒精滥用中的作用机制,本研究选取健康成年雄性SD大鼠(Rattus norvegicus)32只,随机分为饮水对照组(n=16)和慢性酒精暴露组(n=16),运用双瓶选择实验(two bottle choice test,TBCT)评估大鼠酒精偏爱率(alcohol preference),通过旷场行为(open field test,OFT)评估活动状态并检测血酒精浓度。分离两组大鼠内侧前额叶皮质(medial prefrontal cortex,mPFC),提取总DNA,利用简化代表性重亚硫酸盐测序技术(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)构建mPFC甲基化谱,对差异基因进行功能富集和通路分析,筛选与酒精滥用密切相关的甲基化差异基因,运用qRT-PCR技术检测差异基因的表达,验证DNA甲基化对基因的表达调控;利用qRT-PCR和Western blot检测甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)和甲基化CpG位点结合蛋白2(methyl CpG binding protein 2,MeCP2)的表达;同时,还检测了短期酒精暴露(7 d)对大鼠mPFC内DNMTs和MeCP2的影响(n=8/组)。结果表明,慢性酒精暴露大鼠mPFC内基因启动子区甲基化水平显著升高。与酒精滥用密切相关的差异基因中,慢性酒精暴露组Ntf3和Ppm1G启动子区甲基化水平升高,mRNA表达降低;Hap1和DUSP1启动子区甲基化水平降低,mRNA表达升高。慢性酒精暴露使DNMT3B和MeCP2 mRNA和蛋白表达升高,而短期内酒精暴露不影响它们的表达。本研究初步证实DNA甲基化与酒精滥用的发展相关,可能受DNMT3B和MeCP2分子的调控,并发现了与酒精滥用相关的靶基因Ntf3、Ppm1G、Hap1和DUSP1,为研究酒精滥用的神经生物学机制提供了新见解,同时为酒精滥用治疗提供了可能的药理学靶点。 展开更多
关键词 酒精滥用 DNA甲基化 DNA甲基转移酶 内侧前额叶皮质
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UHRF1基因在甲基化调控与血管新生中的作用
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作者 郭梓 莫朝晖 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期200-204,共5页
近年来大量研究证实泛素样含植物同源结构域和环指结构域1(ubiquitin-like with PHD and RING finger domains 1,UHRFl)是一种与肿瘤发生相关的核蛋白基因,在表观遗传修饰过程中具有重要的调控作用,尤其是在DNA甲基化与组蛋白甲基化的... 近年来大量研究证实泛素样含植物同源结构域和环指结构域1(ubiquitin-like with PHD and RING finger domains 1,UHRFl)是一种与肿瘤发生相关的核蛋白基因,在表观遗传修饰过程中具有重要的调控作用,尤其是在DNA甲基化与组蛋白甲基化的调控方面。UHRF1由于其特有的结构域,在细胞生物学功能调控中起到非常重要的作用,如细胞增殖、周期和凋亡等。另外,在多种肿瘤组织和细胞中异常高表达的UHRF1可能与肿瘤血管新生密切相关。本文主要综述UHRF1对DNA甲基化及组蛋白甲基化的调控作用,并探讨了UHRF1在血管新生过程中可能发挥的表观遗传学调控作用。 展开更多
关键词 UHRF1基因 表观遗传学调控 DNA甲基化 组蛋白甲基化 血管新生
急性胰腺炎与表观遗传调控机制 预览
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作者 赵先林 朱世峰 +3 位作者 康鸿鑫 李娟 唐文富 万美华 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2020年第1期227-230,共4页
急性胰腺炎是由酒精、胆结石、高脂及吸烟等多种生活环境因素诱导的胰腺局部及全身炎症反应疾病,具体发病机制仍不完全清楚。研究提示DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等表观遗传调控机制在急性胰腺炎发生及进展中发挥重要作用。介绍... 急性胰腺炎是由酒精、胆结石、高脂及吸烟等多种生活环境因素诱导的胰腺局部及全身炎症反应疾病,具体发病机制仍不完全清楚。研究提示DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等表观遗传调控机制在急性胰腺炎发生及进展中发挥重要作用。介绍了急性胰腺炎的常见诱因如酒精、胆结石、高脂、吸烟与表观遗传调控机制以及炎症反应与表观遗传调控机制,虽然急性胰腺炎的表观遗传学调控机制仍处于初步探索阶段,但仍为进一步理解急性胰腺炎的发生、发展及治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 胰腺炎 DNA甲基化 组蛋白修饰 RNA 长链非编码
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慢性尼古丁成瘾大鼠脑组织中Tet1蛋白水平及Npas4基因甲基化水平研究 预览
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作者 张明谦 李艳 +3 位作者 邓虹 陆爽 薛洁蕊 王锦 《脑与神经疾病杂志》 2020年第2期116-120,共5页
目的探讨慢性大鼠尼古丁成瘾过程中Tet1蛋白表达水平及Npas4基因甲基化水平变化及意义。方法通过背部连续注射尼古丁酒石酸氢盐构建大鼠慢性尼古丁成瘾动物模型,应用Western blot对各组实验大鼠脑组织Tet1蛋白表达水平进行测定;应用选... 目的探讨慢性大鼠尼古丁成瘾过程中Tet1蛋白表达水平及Npas4基因甲基化水平变化及意义。方法通过背部连续注射尼古丁酒石酸氢盐构建大鼠慢性尼古丁成瘾动物模型,应用Western blot对各组实验大鼠脑组织Tet1蛋白表达水平进行测定;应用选择性化学标记SMRT测序对大鼠海马区域及大脑皮质中5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)与5-甲基胞嘧啶(5mC)水平进行测定,获得5hmC与5mC在脑内的动态变化;应用甲基化特异性PCR(MSP)结合RT-PCR对大鼠海马区、大脑皮质中Npas4基因甲基化、mRNA和蛋白表达情况进行测定;应用荧光分光光度法对慢性尼古丁成瘾大鼠脑内神经递质多巴胺(DA)、乙酰胆碱(AC)、阿啡肽(EOPs)及五羟色胺(5-HT)含量进行测定。结果通过构建慢性尼古丁成瘾大鼠动物模型应用Western-blot对各组大鼠脑内Tet1蛋白表达水平测定结果发现,在大鼠海马区中尼古丁成瘾组大鼠Tet1蛋白表达水平明显低于非尼古丁成瘾大鼠(P<0.05),进一步对5hmC与5mC水平测定发现,大鼠海马区中尼古丁成瘾大鼠组出现5hmC显著下降而5mC明显升高(P<0.05);通过对Npas4基因甲基化及mRNA及蛋白表达水平进行测定发现,在大鼠海马区域中尼古丁成瘾大鼠脑内Npas4基因呈现高甲基化情况,而Npas4基因mRNA及蛋白表达水平下调(P<0.05);对各组大鼠脑内神经递质浓度检测发现,大鼠海马区中尼古丁成瘾组大鼠脑内神经递质浓度多巴胺(DA)、乙酰胆碱(AC)、内啡肽(EOPs)及五羟色胺(5-HT)均高于非尼古丁成瘾大鼠组(P<0.05)。结论在大鼠慢性尼古丁成瘾形成过程中大鼠脑组织海马区Tet1蛋白表达水平下降,且可以影响大鼠脑组织中5hmC与5mC水平,进而影响Npas4基因甲基化程度及神级递质变化从而参与尼古丁成瘾的形成。 展开更多
关键词 Tet1蛋白 Npas4基因 尼古丁成瘾 DNA甲基化
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基于MethylMix法探索结肠癌甲基化驱动基因 预览
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作者 康争春 朱良亮 +1 位作者 闫飞虎 于恩达 《海军医学杂志》 2020年第1期29-32,55,共5页
目的应用MethylMix法,筛选结肠癌甲基化驱动基因,分析其潜在功能及通路。方法从癌症基因组图谱(TCGA)下载结肠腺癌甲基化阵列及表达谱数据,在R3.5.0环境下,利用MethylMix R包对结肠腺癌甲基化驱动基因进行挖掘,将有显著差异并与基因表... 目的应用MethylMix法,筛选结肠癌甲基化驱动基因,分析其潜在功能及通路。方法从癌症基因组图谱(TCGA)下载结肠腺癌甲基化阵列及表达谱数据,在R3.5.0环境下,利用MethylMix R包对结肠腺癌甲基化驱动基因进行挖掘,将有显著差异并与基因表达显著相关的基因看成甲基化驱动基因,最后对筛选的甲基化驱动基因进行功能及通路富集分析,分析其潜在的生物学功能及通路。结果基于MethylMix算法,共发现323个甲基化驱动基因,包括ZNF43、FAM72B、CAHM等,通过对甲基化驱动基因的功能富集分析显示,发现这些甲基化驱动基因可能与转录的调控、DNA模板、结合DNA、核酸结合、代谢途径、癌症途径等信号有关。结论基于MethylMix法探索甲基化驱动基因的方法是科学、高效的,本研究发现的甲基化驱动基因为结肠癌表观遗传学调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 结肠癌 DNA甲基化 驱动基因
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基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法 预览
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作者 侯维岩 刘超 +1 位作者 宋杨 孙燚 《安徽大学学报:自然科学版》 CAS 北大核心 2020年第1期37-43,共7页
为解决癌症基因组图谱中DNA甲基化数据不平衡导致假阴率上升的问题,提出一种基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法.使用合成少数类过采样技术和Tomek Link算法进行混合采样,解决数据不平衡问题.在此基础上,将经特征选择后的训练集数... 为解决癌症基因组图谱中DNA甲基化数据不平衡导致假阴率上升的问题,提出一种基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法.使用合成少数类过采样技术和Tomek Link算法进行混合采样,解决数据不平衡问题.在此基础上,将经特征选择后的训练集数据输入改进模型进行训练、学习及分类.基于TCGA数据库6种癌症DNA甲基化数据的实验结果表明:改进方法对少数类样本的分类性能有显著提高,对多数类样本的分类性能也有一定的提升. 展开更多
关键词 DNA甲基化 数据不平衡 TCGA Tomek Link算法
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原发性高血压11β-HSD2基因甲基化的研究进展 预览
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作者 李小芳 朱金玲 +1 位作者 彭博 李娟 《广东化工》 CAS 2020年第1期97-97,91,共2页
11β-类固醇脱氢酶2(11 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 2,11β-HSD2)基因甲基化的表达与原发性高血压(essential hypertension,EH)的发病机制紧密相关。同时,EH中不同血浆肾素水平的11β-HSD2基因启动子区甲基化的表达水平不... 11β-类固醇脱氢酶2(11 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 2,11β-HSD2)基因甲基化的表达与原发性高血压(essential hypertension,EH)的发病机制紧密相关。同时,EH中不同血浆肾素水平的11β-HSD2基因启动子区甲基化的表达水平不同。国内外研究表明,11β-HSD2基因启动子区甲基化水平的发生参与EH的发生机制。 展开更多
关键词 原发性高血压 11β-类固醇脱氢酶2 DNA甲基化 肾素
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微生境对鼎湖山锥表观遗传变异的影响 预览
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作者 李文琪 姜楚 +3 位作者 欧阳学军 林永标 练琚瑜 刘卫 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期62-69,共8页
为了解种群内水平上影响植物的适应机制与空间格局关系的因素,对鼎湖山2个演替阶段林分锥(Castanopsis chinensis)种群通过DNA甲基敏感扩增片段多态性进行表观遗传特征分析,结果表明,微生境对表观遗传变异的贡献由成熟林的20.2%降低为... 为了解种群内水平上影响植物的适应机制与空间格局关系的因素,对鼎湖山2个演替阶段林分锥(Castanopsis chinensis)种群通过DNA甲基敏感扩增片段多态性进行表观遗传特征分析,结果表明,微生境对表观遗传变异的贡献由成熟林的20.2%降低为过熟林的15.7%,但地形因素的影响却增大,同时微生境中具体起显著作用的环境因素在两个林分也不同。因此,微生境特征对种群适应机制和分布格局有显著影响,对演替阶段也有影响。 展开更多
关键词 表观遗传 DNA甲基化 鼎湖山 微环境
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miR-30a-5p启动子区DNA甲基化在同型半胱氨酸致肝损伤中的作用 预览
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作者 孙磊 郭伟 +5 位作者 马鹏俊 马胜超 杜星辰 张鸣号 郝银菊 姜怡邓 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期119-126,共8页
目的:探讨微小RNA-30a-5p(miR-30a-5p)启动子区DNA甲基化在肝损伤中的作用。方法:随机选取4周龄胱硫醚β-合成酶(CBS)基因正常(CBS+/+)小鼠(n=12)及单基因敲除(CBS+/-)小鼠(n=12),均给予高蛋氨酸饮食8周。HL-7702细胞体外常规培养,分为... 目的:探讨微小RNA-30a-5p(miR-30a-5p)启动子区DNA甲基化在肝损伤中的作用。方法:随机选取4周龄胱硫醚β-合成酶(CBS)基因正常(CBS+/+)小鼠(n=12)及单基因敲除(CBS+/-)小鼠(n=12),均给予高蛋氨酸饮食8周。HL-7702细胞体外常规培养,分为对照(control)组、同型半胱氨酸(Hcy)组和Hcy+5-氮杂胞苷(AZC)组。全自动生化分析仪检测小鼠血清Hcy、丙氨酸氨基转移酶(ALT)和天门冬氨酸氨基转移酶(AST)水平;微板法测定肝细胞ALT和AST水平;小鼠肝脏石蜡切片行HE染色观察肝脏损伤情况;细胞活力染色检测肝细胞活力;RT-qPCR法检测小鼠肝脏组织和肝细胞中miR-30a-5p的表达;Pearson相关性分析肝脏miR-30a-5p表达与血清ALT和AST水平的相关性;巢式降落式甲基化特异性PCR(nMS-PCR)检测小鼠肝脏组织以及肝细胞中miR-30a-5p启动子区DNA甲基化水平的变化。结果:与CBS+/+对照组相比,CBS+/-组小鼠血清的Hcy、ALT和AST水平显著升高(P<0.05);HE染色显示肝细胞肿胀,可见核碎裂、溶解;肝脏miR-30a-5p表达明显降低(P<0.01);小鼠肝脏组织中miR-30a-5p的表达与血清ALT和AST的水平呈负相关(r2=0.4557,P=0.0003;r2=0.4626,P=0.0003);miR-30a-5p启动子区DNA的甲基化水平升高(P<0.01)。在细胞水平,与control组相比,Hcy组的ALT和AST水平升高(P<0.05,P<0.01),细胞活力显著降低,肝细胞miR-30a-5p启动子区DNA的甲基化水平升高(P<0.01),而使用AZC后miR-30a-5p启动子区DNA的甲基化水平降低(P<0.05),miR-30a-5p的表达上调(P<0.05)。结论:miR-30a-5p启动子区DNA高甲基化可能在肝损伤中发挥重要作用。 展开更多
关键词 微小RNA-30a-5p DNA甲基化 胱硫醚Β-合成酶 肝脏损伤 同型半胱氨酸
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番茄DNA甲基转移酶SlDNMT2基因RNAi表达载体的构建 预览
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作者 张玉 汪宏涛 +2 位作者 刘嘉荔 刘永胜 唐晓凤 《安徽农业科学》 CAS 2020年第3期97-100,共4页
DNA甲基化是发生在基因5′端5′-CpG-3′胞嘧啶上的DNA共价修饰作用,可调节基因转录,与植物的生长、发育、成熟、衰老有着密切关系。DNMT2是首先从拟南芥中发现的DNA甲基转移酶。该研究通过NCBI序列比对获得番茄中DNMT2的同源基因SlDNMT... DNA甲基化是发生在基因5′端5′-CpG-3′胞嘧啶上的DNA共价修饰作用,可调节基因转录,与植物的生长、发育、成熟、衰老有着密切关系。DNMT2是首先从拟南芥中发现的DNA甲基转移酶。该研究通过NCBI序列比对获得番茄中DNMT2的同源基因SlDNMT2的编码区序列;通过Primer5设计引物,PCR技术扩增获得SlDNMT2基因高度特异性序列(长度约500 bp);利用一系列分子生物学试验研究方法最终成功构建SlDNMT2 RNAi表达载体,并命名为pBI121-35S∷siRNA1-siRNA2。该RNAi表达载体的构建为进一步探究SlDNMT2基因在植物生长发育过程中的功能奠定了一定的理论基础并提供了一条高效、迅速的载体构建途径。 展开更多
关键词 番茄 DNA甲基化 SlDNMT2 RNAI 载体构建
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血DAPK和MGMT DNA水平对肺癌转移的相关性 预览
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作者 马会博 杜晶晶 《临床输血与检验》 CAS 2020年第1期51-54,共4页
目的 探讨血DAPK和MGMT DNA水平对肺癌病理特征的相关性。方法 研究时间为2015年1月~2018年2月,采用回顾性总结研究方法,选择在我院诊治的非小细胞肺癌(NSCLC)患者78例作为观察组,同期选择在我院进行健康体检的健康人100例作为对照组,... 目的 探讨血DAPK和MGMT DNA水平对肺癌病理特征的相关性。方法 研究时间为2015年1月~2018年2月,采用回顾性总结研究方法,选择在我院诊治的非小细胞肺癌(NSCLC)患者78例作为观察组,同期选择在我院进行健康体检的健康人100例作为对照组,采集两组入选者的外周血标本,检测血DNA甲基化分子标志物-DAPK和MGMT水平。结果 观察组中血浆样本中的DAPK和MGMT甲基化比例为51.3%和53.8%,对照组分别为14.0%和15.0%,观察组显著高于对照组(P<0.05)。在观察组中,血浆DAPK和MGMT甲基化与病理组织学类型、淋巴结转移、远端转移有显著相关性(P<0.05)。结论 DAPK和MGMT甲基化与NSCLC患者病理特征有显著相关性。 展开更多
关键词 DNA甲基化 分子标志物 非小细胞肺癌 淋巴结转移 远端转移
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基于DNA甲基化的散发性子宫内膜癌生物学标志物的荟萃分析 预览
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作者 范宇 王南 +3 位作者 高原 王宇 傅少志 文庆莲 《海南医学》 CAS 2020年第3期379-388,共10页
目的系统评价甲基化基因作为散发性子宫内膜癌标志物的诊断准确性及其临床意义。方法使用PubMed等数据库系统地搜索了相关文献,时间截至2018年10月31日。采用Meta-DiSc软件合并诊断准确度变量并进行分析。利用Review Manager软件进行敏... 目的系统评价甲基化基因作为散发性子宫内膜癌标志物的诊断准确性及其临床意义。方法使用PubMed等数据库系统地搜索了相关文献,时间截至2018年10月31日。采用Meta-DiSc软件合并诊断准确度变量并进行分析。利用Review Manager软件进行敏感性分析和发表偏倚评价。结果共有26项研究,包括2299例参与者(散发性子宫内膜癌患者和正常对照人群)符合纳入标准;合并敏感性和特异性分别为0.92(95%置信区间:0.91~0.94)和0.48(95%置信区间:0.46~0.50);受试者工作特性曲线下面积为0.8743。基因甲基化与子宫内膜癌患者的淋巴结转移(合并比值比:0.34,95%置信区间:0.19~0.59,P<0.001)和肿瘤分期(合并比值比:0.34,95%置信区间:0.19~0.59,P<0.001)显著相关。结论本荟萃分析证实,DNA甲基化与淋巴结转移相关,并且揭示了其与肿瘤分期的关系。DNA甲基化在散发性子宫内膜癌诊断中具有高灵敏度,但特异性相对较低。 展开更多
关键词 DNA甲基化 子宫内膜癌 生物学标志物 诊断 荟萃分析
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DNA甲基化动态模式在重编码过程中的作用 预览
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作者 王巍 易军 +4 位作者 唐慧 甘佳 方东辉 王淮 付茂忠 《草学》 2020年第1期66-69,共4页
DNA甲基化作为主要的表观遗传修饰方式在细胞分裂与分化过程中扮演着重要角色。在生殖细胞生成与胚胎的早期发育过程中,DNA甲基化具有动态变化的特征,其动态模式直接影响细胞核重编码程序的,控制胚胎的成活率及发育状况。本文综述了DNA... DNA甲基化作为主要的表观遗传修饰方式在细胞分裂与分化过程中扮演着重要角色。在生殖细胞生成与胚胎的早期发育过程中,DNA甲基化具有动态变化的特征,其动态模式直接影响细胞核重编码程序的,控制胚胎的成活率及发育状况。本文综述了DNA甲基化修饰在核重编程过程中的动态模式、相关酶及甲基化结合蛋白的作用模式等。 展开更多
关键词 DNA甲基化 重编码 早期胚胎 分化
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急性肺损伤的表观遗传学研究进展 预览
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作者 詹兰 黄强 《医学综述》 2020年第3期453-457,463,共6页
表观遗传学是研究DNA序列不发生变化(即基因结构不发生变化)而表达发生变化的学科。表观遗传常见的修饰有DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。与经典遗传学中碱基序列异常相对应,异常的表观遗传学修饰可能会与各种疾病相关。近年来,... 表观遗传学是研究DNA序列不发生变化(即基因结构不发生变化)而表达发生变化的学科。表观遗传常见的修饰有DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。与经典遗传学中碱基序列异常相对应,异常的表观遗传学修饰可能会与各种疾病相关。近年来,急性肺损伤(ALI)的表观遗传学研究表明,多种表观遗传修饰参与了ALI的发病机制,而一些表观遗传抑制剂的使用可以缓解ALI的病情。另外,非编码RNA也具有成为临床ALI生物标志物的潜力。 展开更多
关键词 急性肺损伤 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码
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血浆游离DNA全基因组甲基化测序的实用稳定性评估
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作者 方欢 钟碧溪 +3 位作者 魏磊 张祥林 张威 汪小我 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2284-2294,共11页
随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA... 随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA,在不同实验平台分别进行DNA甲基化的重亚硫酸盐转化前建库(Pre-BS)、转化后建库(Post-BS)和常规DNA建库,获取多因素影响下的测序数据样本。在此基础上,建立了一套血浆游离DNA测序数据分析的质量控制参考流程,综合评估了血液采集提取、游离DNA建库测序过程的实用稳定性,为血浆游离DNA全基因组甲基化测序应用于临床液体活检提供实用性的基础参考。 展开更多
关键词 血浆游离DNA 全基因组 DNA甲基化 片段化模式 微量DNA建库
胸腺嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶的研究现状及进展
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作者 葛长宇 徐鹏 +1 位作者 宫榭阳 匡野 《中华全科医学》 2019年第2期272-275,共4页
胸腺嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶(thymine DNA glycosylase,TDG)属于单功能尿嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶(uracil DNA glycosidase,UDG)超家族中的成员,在基因组稳定和表观遗传调控中具有双重作用。TDG参与调控DNA甲基化(DNA methylation)... 胸腺嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶(thymine DNA glycosylase,TDG)属于单功能尿嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶(uracil DNA glycosidase,UDG)超家族中的成员,在基因组稳定和表观遗传调控中具有双重作用。TDG参与调控DNA甲基化(DNA methylation)和去甲基化(DNA demethylation)。DNA甲基化主要为胞嘧啶(cytosine,C)甲基化,是指胞嘧啶以S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl Methionine,SAM)为甲基供体,在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMTs)的作用下,在胞嘧啶第5位碳原子上加上一个甲基,形成5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。5mC广泛存在于哺乳动物基因组中,并在基因组稳定性维持、组织特异性基因沉默、逆转录转座子沉默等诸多生物学过程中发挥重要作用。DNA去甲基化是指5mC还原为C,这个过程也是由DNMTs完成的。DNA去甲基化包括被动去甲基化和主动去甲基化2种途径。被动DNA去甲基化是指在DNA复制过程中,新合成的子链DNA未能维持甲基化状态,导致DNA甲基化的被动稀释(passive dilution);DNA主动去甲基化过程不涉及DNA复制,是指通过TDG等酶的作用去除5mC和5-羧基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)的氧化产物,即5-甲羟基胞嘧啶(5-formylcytosine,5fC)和5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)。TDG还通过碱基切除修复途径(base excision repair,BER)切割糖与靶碱之间的N-糖苷键,在纠正错配及损伤的DNA碱基对(base pair,bp)中起重要作用。最近的研究表明TDG还在转录调控、胚胎发育及肿瘤治疗等领域发挥重要作用。本文总结了近年来TDG的研究现状及进展,为进一步的深入研究提供理论支持。 展开更多
关键词 胸腺嘧啶脱氧核糖核酸糖基化酶 DNA甲基化 DNA主动去甲基化 表观遗传学
H2S通过诱导Klotho基因启动子去甲基化改善单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠肾脏纤维化 预览
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作者 顾玉露 陈静 +4 位作者 张函 沈子妍 徐灵菡 吕诗琦 章晓燕 《复旦学报:医学版》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期294-301,共8页
目的探讨硫化氢(hydrogen sulfide,H 2S)改善单侧输尿管梗阻(unilateral ureteral obstruction,UUO)小鼠肾脏纤维化的作用机制。方法采用C57BL/6小鼠单侧输尿管结扎建立肾脏纤维化小鼠模型。随机分为假手术(Sham)组、UUO组和UUO+硫氢化... 目的探讨硫化氢(hydrogen sulfide,H 2S)改善单侧输尿管梗阻(unilateral ureteral obstruction,UUO)小鼠肾脏纤维化的作用机制。方法采用C57BL/6小鼠单侧输尿管结扎建立肾脏纤维化小鼠模型。随机分为假手术(Sham)组、UUO组和UUO+硫氢化钠(NaHS)组。ELISA法检测血清H 2S浓度;HE染色和Masson染色观察肾脏病理改变;免疫组织化学和Western blot检测Klotho和DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)表达;RT-PCR检测双加氧酶(ten-eleven translocation,TET)表达;比色法检测TET活性;焦磷酸测序检测肾组织Klotho甲基化水平;羟甲基化DNA免疫共沉淀联合实时定量PCR法检测肾组织Klotho羟甲基化水平。结果与Sham组相比,UUO组血清H 2S浓度显著降低[(5.18±0.34)μmol/L vs.(4.23±0.21)μmol/L, P <0.05]。NaHS显著减轻UUO模型小鼠的肾小管间质纤维化( P <0.01),下调α平滑肌肌动蛋白( P <0.05)和纤连蛋白( P <0.05)表达,同时上调UUO小鼠肾组织Klotho表达( P <0.05),下调DNMT1表达( P <0.01),升高TET活性[(0.03±0.01) ng·min^-1·mg^-1 vs.(0.43±0.08) ng·min^-1·mg^-1 , P <0.05],降低 Klotho 基因启动子甲基化水平(11.83%±0.53% vs .7.39%±0.70%, P <0.01),升高 Klotho 基因启动子羟甲基化水平( P <0.05)。结论H 2S可通过增强TET活性,诱导 Klotho 基因启动子去甲基化,上调 Klotho 基因表达,从而减轻UUO小鼠肾脏纤维化。 展开更多
关键词 硫化氢(H2S) 单侧输尿管梗阻(UUO) KLOTHO DNA甲基化 DNA羟甲基化 肾脏纤维化
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DNA甲基化的分子机制及其研究进展 被引量:1
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作者 宋乔 高世超 王培昌 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期3317-3322,共6页
DNA甲基化作为一种重要的非永久性但相对长期可遗传的基因修饰,在维持细胞正常的转录活性、DNA损伤修复能力以及在遗传印记、胚胎发育和肿瘤的发生发展中都有不可替代的作用,是分子生物学及医学领域的研究热点。近年来随着高通量测序、... DNA甲基化作为一种重要的非永久性但相对长期可遗传的基因修饰,在维持细胞正常的转录活性、DNA损伤修复能力以及在遗传印记、胚胎发育和肿瘤的发生发展中都有不可替代的作用,是分子生物学及医学领域的研究热点。近年来随着高通量测序、表观遗传编辑以及结构分析等技术的飞速发展,对DNA甲基化分子机制层面的研究进一步深入。本研究总结了近年来对DNA甲基化分子机制的相关研究,归纳了全球范围内对DNA甲基化的位点、序列背景与范围近年来的研究进展,也归纳了近年来对影响DNA甲基化的因素的研究,以期对DNA甲基化这一表观遗传学热点进行深入的学习探讨。 展开更多
关键词 DNA甲基化 DNA甲基转移酶(DNMT) 组蛋白修饰 非编码RNA
1,10-邻二氮杂菲双过氧钒酸钾对HT22细胞增殖和周期的影响 预览
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作者 巴德仁贵 田小莉 +5 位作者 鲍牧兰 张晓璐 崔钧贺 许文强 苏娇 邵国 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2019年第5期334-340,共7页
目的探讨1,10-邻二氮杂菲双过氧钒酸钾〔BPV(phen)〕是否通过调节DNA甲基转移酶(DNMT)的表达,调控细胞周期相关基因表达,进而影响细胞周期。方法 BPV(phen)0.3和3.0μmol·L-1处理HT22细胞24 h,MTS法检测细胞存活;流式细胞术方法检... 目的探讨1,10-邻二氮杂菲双过氧钒酸钾〔BPV(phen)〕是否通过调节DNA甲基转移酶(DNMT)的表达,调控细胞周期相关基因表达,进而影响细胞周期。方法 BPV(phen)0.3和3.0μmol·L-1处理HT22细胞24 h,MTS法检测细胞存活;流式细胞术方法检测细胞周期;ELISA法检测DNMT活性;实时荧光定量PCR检测p21,DNMT1,DNMT3A和DNMT3B mRNA表达水平;Western印迹法分别检测相应蛋白表达水平。结果与DMSO对照组相比,BPV(phen)0.3μmol·L-1对细胞存活率无显著影响,BPV(phen)3.0μmol·L-1组细胞存活率显著降低(P<0.05)。细胞周期结果显示,与DMSO对照组相比,BPV(phen)0.3μmol·L-1组各细胞周期百分比无显著差异,BPV(phen)3.0μmol·L-1组S期细胞显著增加,为(76.1±1.6)%(P<0.05),G2期细胞显著降低(P<0.05),为(2.1±1.5)%。与DMSO对照组相比,BPV(phen)3.0μmol·L-1组细胞DNMT活性显著增加(P<0.05)。实时荧光定量PCR结果显示,与DMSO对照组相比,BPV(phen)0.3μmol·L-1组p21,DNMT1,DNMT3A和DNMT3B mRNA表达水平无显著差异,BPV(phen)3.0μmol·L-1组各基因表达水平均显著增加(P<0.05,P<0.01)。Western印迹结果显示,与DMSO对照组相比,BPV(phen)0.3μmol·L-1组各蛋白表达水平均无显著性差异,只有BPV(phen)3.0μmol·L-1组DNMT3B和P21蛋白表达显著增加(P<0.05)。结论 BPV能够通过改变DNMT的表达,调节下游与细胞周期相关基因的表达,进而影响HT22细胞的生长和增殖。 展开更多
关键词 1 10-邻二氮杂菲双过氧钒酸钾 DNA甲基转移酶 HT22细胞 DNA甲基化
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DNA甲基转移酶在前列腺癌中的表达及其对体外细胞增殖及侵袭能力的影响 预览
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作者 李亚林 刘冉录 《基础医学与临床》 CSCD 2019年第5期668-672,共5页
目的探讨DNA甲基转移酶(DNMTs)在前列腺癌(PCa)组织及前列腺癌细胞系中的表达情况及其对体外前列腺癌细胞增殖、凋亡、迁移及侵袭能力的影响。方法收集24例患者的前列腺组织样本,其中前列腺癌组织样本12例,良性前列腺增生组织样本12例... 目的探讨DNA甲基转移酶(DNMTs)在前列腺癌(PCa)组织及前列腺癌细胞系中的表达情况及其对体外前列腺癌细胞增殖、凋亡、迁移及侵袭能力的影响。方法收集24例患者的前列腺组织样本,其中前列腺癌组织样本12例,良性前列腺增生组织样本12例。免疫组织化学染色检测DNMT1、DNMT3b的表达。通过Westernblot及RT-qPCR检测前列腺癌细胞系(DU145、PC-3)及人正常前列腺上皮细胞系(RWPE-1)中DNMT1、DNMT3b的表达。采用siRNA分别下调DU145细胞系中DNMT1、DNMT3b表达,检测DU145细胞生物学行为的改变。结果DNMT1、DNMT3b在前列腺癌组织中的表达高于前列腺增生组织(P<0.05)。DNMT1、DNMT3b在DU145、PC-3细胞系中的表达高于RWPE-1细胞系(P<0.05),且DNMT1、DNMT3b在DU145中的表达高于PC-3(P<0.05)。下调DU145细胞中DNMT1、DNMT3b的表达,可显著抑制细胞增殖,促进细胞凋亡,减弱细胞迁移及侵袭能力(P<0.05),其中DNMT1抑制组效果最显著。结论DNA甲基转移酶(DNMT1、DNMT3b)在前列腺癌中的表达高于正常前列腺,其中DNMT1对细胞生物学行为影响最显著。 展开更多
关键词 前列腺癌 DNA甲基化 DNA甲基转移酶 SIRNA
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