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文章速递金丝楸优良无性系遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析 认领
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作者 马庆国 王治军 +4 位作者 徐慧敏 李明昆 李慧民 张俊佩 张建国 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2020年第5期145-153,共9页
[目的]为了加深对金丝楸(Catalpa bungei C.A.Mey.)优良无性系资源遗传背景的认识,[方法]本研究运用荧光扩增片段长度多态性(AFLP)技术,筛选10对Eco RⅠ+3/MseⅠ+3引物组合,以梓树属的梓树(C.ovata G.Don)、灰楸(C.fargesii Bur.)、光... [目的]为了加深对金丝楸(Catalpa bungei C.A.Mey.)优良无性系资源遗传背景的认识,[方法]本研究运用荧光扩增片段长度多态性(AFLP)技术,筛选10对Eco RⅠ+3/MseⅠ+3引物组合,以梓树属的梓树(C.ovata G.Don)、灰楸(C.fargesii Bur.)、光叶楸和‘豫楸1号’良种为对照,在基因组水平上检测定植于河南省洛宁县的75个金丝楸无性系的遗传变异。[结果]总体水平上,在获得的1177条可统计条带中,1130条呈多态性,多态性带百分率(PPBs)达96.01%;不同位点的有效等位基因数为1.00~1.99,平均为1.48±0.03;基因多样度为0.00~0.49,平均为0.28±0.01;Shannon信息指数为0.00~0.69,平均为0.43±0.02。当遗传相似系数为0.8277时可将供试样品分为8组,其中,71个无性系聚为一组,显示出金丝楸无性系遗传背景较狭窄。各无性系的遗传距离和地理距离呈极显著正相关,表明地理隔离对楸树遗传多样性有明显的影响。结合聚类分析结果,金丝楸无性系当中的63号与其他遗传距离最远,值得重点保护和推广。[结论]形态学性状观察和AFLP分子标记分析显示:金丝楸与普通楸树存在较显著的差异,因此,认为金丝楸的分类地位宜做更加深入的探讨。 展开更多
关键词 金丝楸 遗传多样性 亲缘关系 AFLP 指纹图谱
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文章速递Detection of Adaptive Genetic Diversity in Wild Potato Populations and Its Implications in Conservation of Potato Germplasm 认领
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作者 John B. Bamberg 《美国植物学期刊(英文)》 2020年第10期1562-1578,共17页
A better understanding on how genetic diversity is structured at natural habitats can be helpful for exploration and acquisition of plant germplasm. Historically, studies have relied on DNA markers to elucidate potato... A better understanding on how genetic diversity is structured at natural habitats can be helpful for exploration and acquisition of plant germplasm. Historically, studies have relied on DNA markers to elucidate potato genetic diversity. Current advances in genomics are broadening applications allowing the identification of markers linked to genomic regions under selection. Those markers, known as adaptive markers, unlock additional ways to value and organize germplasm diversity. For example, conservation priorities could be given to germplasm units containing markers associated to unique geographic identity, and/or linked to traits of tolerance to abiotic stresses. This study investigated if adaptive marker loci were possible to be identified in a large AFLP marker dataset of ninety-four populations of the wild potato species </span><i><span style="font-family:Verdana;">S. fendleri.</span></i><span style="font-family:Verdana;"> These populations originated from six different mountain ranges in southern Arizona, USA. A total of 2094 polymorphic AFLP markers were used to co</span><span style="font-family:Verdana;">nduct genetic diversity analyses of populations and mountain ranges. Adaptive markers were detected using Bayesian methods which distinguished marker loci departing significantly from frequencies expected under neutral models of genetic differentiation. This identified 16 AFLP loci that </span><span style="font-family:Verdana;">were considered to be adaptive. To contrast diversity p</span><span style="font-family:Verdana;">arameters generated with each set of markers, analyses that included all the 2094 AFLP markers, and only the 16 adaptive markers were conducted. The results showed that both were efficient for establishing genetic associations among populations and mountain ranges. However, adaptive markers were better on revealing geographic patterns and identity which would suggest these markers were linked to selection at the natural sites. An additional test to determine if adaptive markers associated to climate variables found two loci associated to specific climate variables in populations from different regions but sharing similar environmental structure. The distribution of adaptive markers among populations revealed that only two were needed to build a core subset able to keep all the markers. This preliminary assessment shows that adaptive genetic diversity could offer an additional way to measure diversity in potato germplasm and to set up options for conservation and research. 展开更多
关键词 Adaptive Genetic Diversity AFLP Markers Plant Population Structure Potato Germplasm Solanum fendleri
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90份鳄梨种质资源AFLP遗传多样性分析 认领
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作者 董美超 杨帆 +7 位作者 李进学 付小猛 高俊燕 周东果 王绍华 龙春瑞 郭莉娜 岳建强 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期13-19,共7页
【目的】本研究对采自中国云南德宏、保山、西双版纳、普洱、红河和缅甸克钦邦、掸邦地区共90份鳄梨种资资源进行遗传多样性分析,为其新品种选育和种质创新提供参考依据。【方法】采用CTAB法提取鳄梨叶片基因组DNA,利用扩增片段长度多... 【目的】本研究对采自中国云南德宏、保山、西双版纳、普洱、红河和缅甸克钦邦、掸邦地区共90份鳄梨种资资源进行遗传多样性分析,为其新品种选育和种质创新提供参考依据。【方法】采用CTAB法提取鳄梨叶片基因组DNA,利用扩增片段长度多态性分子标记技术,对90份种质资源的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增,电泳分离,银染显色。电泳结果得到"0,1"矩阵,使用POPGENE 32软件计算每对引物的多态性条带、多态性比率、有效等位基因数、遗传多样性指数等指标,同时使用NTSYSpc-2.11F计算种质间遗传相似系数,根据相似性系数进行UPGMA聚类分析和PCA主效应分析,对鳄梨种质资源进行分类。【结果】从24对AFLP引物组合中,筛选出8对扩增条带清晰、多态性高的引物组合,8对引物共扩增出1 165个条带,其中多态性条带有1 163个,多态位点百分率为99.83%;有效等位基因数(Ne)平均1.294 4个;Nei’s基因多样性指数(H)平均0.209 5;Shannon信息指数(I)平均0.353 0。根据遗传相似系数进行聚类分析,在遗传相似系数0.752处可划分为4个类群,第Ⅰ类群有1份保山种质70号;第Ⅱ类群有24份种质;第Ⅲ类群有1份西双版纳种质59号;第Ⅳ类群有64份种质。在遗传相似系数0.763处可将第Ⅳ类群划分为3个亚群(A、B和C)。用PCA法对90份鳄梨种质AFLP标记结果进行主效应分析,显示了不同种质的分类位置,主效应分析结果与分子聚类结果基本一致,呈一定的地域性分布规律。【结论】90份种质资源的遗传多样性较为丰富,59号和70号相对特殊,在种质创新中应给予重点关注。 展开更多
关键词 鳄梨 AFLP 遗传多样性
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AFLP银染法和荧光标记法对文蛤遗传多样性评价的效果分析 认领
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作者 姚韩韩 林志华 董迎辉 《浙江万里学院学报》 2020年第4期64-68,77,共6页
以文蛤山东种群(SD)和广西种群(GX)为实验材料,比较分析了AFLP银染法和荧光标记法对遗传多样性的评价效果。结果显示,AFLP荧光标记法在选择性扩增引物5’端加了FAM荧光标记,产物直接在DNA测序仪上检测,自动采集图像和数据,较银染法的数... 以文蛤山东种群(SD)和广西种群(GX)为实验材料,比较分析了AFLP银染法和荧光标记法对遗传多样性的评价效果。结果显示,AFLP荧光标记法在选择性扩增引物5’端加了FAM荧光标记,产物直接在DNA测序仪上检测,自动采集图像和数据,较银染法的数据准确度更高、稳定性更好。从遗传参数来看,银染法和荧光标记法获得的GX种群的多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和香侬信息指数均高于SD种群,表明两种方法遗传多样性评价的结果一致。AFLP荧光标记法在文蛤两种群中共获得244个扩增位点,多态位点比例为94.26%,均高于银染法(177个扩增位点,多态位点比例85.31%)。文蛤SD和GX种群的扩增位点数、多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和香侬信息指数均是荧光标记法>银染法。 展开更多
关键词 AFLP 荧光标记法 银染法 遗传多样性 文蛤
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薏苡种质资源的AFLP遗传多样性分析 认领
5
作者 杨成龙 周明强 +3 位作者 班秀文 李志芳 黎青 刘凡值 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第15期5134-5142,共9页
薏苡是传统药食兼用经济作物,本研究基于AFLP分子标记技术对来自贵州、云南、广西3省24份优良材料的遗传多样性和亲缘关系进行分析,以期为薏苡杂交组合选配和种质创制提供遗传基础。结果表明:我们筛选出的8对引物组合共扩增条带996个,... 薏苡是传统药食兼用经济作物,本研究基于AFLP分子标记技术对来自贵州、云南、广西3省24份优良材料的遗传多样性和亲缘关系进行分析,以期为薏苡杂交组合选配和种质创制提供遗传基础。结果表明:我们筛选出的8对引物组合共扩增条带996个,其中多态性为792条,多态性百分率的平均为79.52%,揭示薏苡种质中存在丰富遗传多样性;24份种质的遗传距离范围在0.189 6~0.485 4之间,相似系数变异范围为0.615 5~0.840 4,平均相似系数为0.730 9,薏苡种质资源的遗传相似系数较小;根据遗传相似性系数进行聚类分析,当遗传相似系数为0.718 5时,24份薏苡种质资源在遗传聚类上被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ大类,其中CK与S1种质资源分别为第Ⅰ、Ⅳ类群,由Y81、Y81F组成第Ⅲ类群,第Ⅱ类又可以分为3个亚类有20份种质;主成分分析发现材料间分布分散,说明24份薏苡种质资源之间存在较大遗传变异,分子主效应分析结果与分子聚类结果一致。从而说明AFLP是研究薏苡种质资源遗传多态性及亲缘关系的有效手段之一,为薏苡亲本组合选配、种质创制和遗传育种提供遗传基础数据。 展开更多
关键词 薏苡(Coix lacryma-jobi L.) AFLP 遗传多样性分析
红花绿绒蒿AFLP反应体系的建立与优化 认领
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作者 区智 严朋飞 +2 位作者 张莹欣 贾维嘉 屈燕 《北方园艺》 CAS 北大核心 2020年第9期131-139,共9页
以红花绿绒蒿为试材,采用正交实验设计,研究了酶切时间、Mg^2+用量、dNTPS用量、模板DNA稀释倍数等对AFLP反应体系的影响,以期建立一个适合红花绿绒蒿的AFLP反应体系,并用优化后的体系对64对AFLP引物进行筛选。结果表明:通过所建立的AFL... 以红花绿绒蒿为试材,采用正交实验设计,研究了酶切时间、Mg^2+用量、dNTPS用量、模板DNA稀释倍数等对AFLP反应体系的影响,以期建立一个适合红花绿绒蒿的AFLP反应体系,并用优化后的体系对64对AFLP引物进行筛选。结果表明:通过所建立的AFLP反应体系能够获得清晰的条带,并利用该体系筛选出8对适合于红花绿绒蒿AFLP分析的引物组合。该研究可为今后AFLP标记在绿绒蒿属植物的遗传多样性分析及种质鉴定提供参考依据。 展开更多
关键词 红花绿绒蒿 AFLP 体系建立与优化
基于AFLP分子标记对广东省番石榴种质资源多样性分析及指纹图谱构建 认领
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作者 邵雪花 刘牛 +2 位作者 赖多 肖维强 匡石滋 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期313-321,共9页
【目的】利用AFLP分子标记技术对广东省30份番石榴种质资源进行遗传多样性分析并构建指纹图谱。【方法】从80对AFLP引物中筛选得到8对核心引物用于番石榴分子标记,利用UPGMA聚类分析番石榴种质资源多样性,以核心引物E3-M6和E4-M2引物组... 【目的】利用AFLP分子标记技术对广东省30份番石榴种质资源进行遗传多样性分析并构建指纹图谱。【方法】从80对AFLP引物中筛选得到8对核心引物用于番石榴分子标记,利用UPGMA聚类分析番石榴种质资源多样性,以核心引物E3-M6和E4-M2引物组合构建番石榴DNA指纹图谱。【结果】8对AFLP核心引物扩增30份番石榴样品共得到条带1118条,多态性条带1114条,多态性比率为99.6%。通过聚类分析将30份番石榴样品聚为4类,其中广东省高州市野生品种‘胭脂红番石榴2号’遗传分化较大,单独聚为一类。利用核心引物E3-M6和E4-M2组合成功构建番石榴DNA指纹图谱,供试30份番石榴品种(系)每个都有一套唯一的指纹图谱编码。【结论】本研究构建的指纹图谱可用于番石榴种质的分类与鉴定,同时为番石榴杂交新品种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 番石榴 AFLP 种质资源 指纹图谱
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不同产地南药益智的AFLP分析 认领
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作者 苏增一 张娉 +3 位作者 王芳 章恩硕 吴昊 高炳淼 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1231-1233,共3页
目的通过对AFLP分子标记的引物筛选和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行优化和分析,获得一套适用于南药益智的AFLP技术体系。方法采用8对引物随机配对形成64对引物,以不同产地的益智基因组DNA为模板进行AFLP-PCR扩增,再利用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析... 目的通过对AFLP分子标记的引物筛选和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行优化和分析,获得一套适用于南药益智的AFLP技术体系。方法采用8对引物随机配对形成64对引物,以不同产地的益智基因组DNA为模板进行AFLP-PCR扩增,再利用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,筛选能够鉴定益智遗传多样性的核心引物,进一步采用NTSYS软件进行聚类分析。结果从64对引物中筛选了4对引物适合于益智AFLP分析,并以E3/M7引物组合效果最佳,扩增出104条多态性带,多态性带比率为94.54%,能够鉴定不同产地益智的种质资源。结论获得适合分析不同产地益智的AFLP技术体系,为研究南药益智遗传多样性奠定基础。 展开更多
关键词 益智 AFLP 引物筛选 聚丙烯酰胺凝胶电泳 聚类分析
通过显微介导将鳜总DNA片段导入镜鲤基因组的分子验证 认领
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作者 闫学春 栾培贤 何立川 《水产学杂志》 CAS 北大核心 2020年第4期1-6,共6页
利用外源基因导入技术,将1nL左右未经遗传修饰的鳜Siniperca chuatsi基因组DNA导入2500余粒镜鲤Cyprinus carpio受精卵核区附近,孵出仔鱼1500余尾,放入池塘300尾正常饲养。利用引物(E-AGG,M-CTA)对显微介导鳜基因镜鲤进行扩增片段长度... 利用外源基因导入技术,将1nL左右未经遗传修饰的鳜Siniperca chuatsi基因组DNA导入2500余粒镜鲤Cyprinus carpio受精卵核区附近,孵出仔鱼1500余尾,放入池塘300尾正常饲养。利用引物(E-AGG,M-CTA)对显微介导鳜基因镜鲤进行扩增片段长度多态性(AFLP)检测,研究显微介导外源总DNA转化当代的分子生物学结果。结果表明:在AFLP的15对引物中,显微介导鳜基因镜鲤中有3对引物扩增出了供体鳜基因片段,从DNA水平上验证了在受体鱼的基因组中整合了供体基因片段。将6尾阳性显微介导鳜基因镜鲤与供体鳜相同的AFLP条带进行切下、回收、克隆、测序,发现供体鳜片段序列与阳性显微介导鳜基因镜鲤片段序列完全一致,找到了精确的遗传证据。本研究结果为构建转全鳜基因镜鲤AFLP检测体系,从基因角度研究供体大片段在受体鱼中的导入情况提供了理论依据。 展开更多
关键词 显微介导 鳜总DNA 镜鲤 AFLP 分子验证
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矮凤梨短营养期突变体‘14-1’分子变异的AFLP分析 认领
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作者 栾爱萍 贺军虎 +3 位作者 刘佳柔 张伟 谢桃 何业华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期734-740,共7页
利用AFLP分子标记技术,在DNA水平分析矮凤梨(Ananas nanus)品种‘Hime Pineapple’与其短营养期突变体‘14-1’之间的差异,鉴定突变体变异的真实性,为短营养期菠萝的分子育种提供参考依据。以‘14-1’和‘Hime Pineapple’的幼叶为试材... 利用AFLP分子标记技术,在DNA水平分析矮凤梨(Ananas nanus)品种‘Hime Pineapple’与其短营养期突变体‘14-1’之间的差异,鉴定突变体变异的真实性,为短营养期菠萝的分子育种提供参考依据。以‘14-1’和‘Hime Pineapple’的幼叶为试材,采用改良CTAB法提取叶片基因组DNA,经64对AFLP引物组合的选择性扩增,共获得1952条清晰谱带,平均每对引物产生30.5条谱带,其中有18对检测出DNA分子多态性,获得多态性条带76条,差异片段主要集中在200~500 bp,多态性条带比例为4.54%,遗传相似系数为95.39%。76条AFLP扩增差异条带经筛选、回收、克隆、测序和同源比对分析后显示,其中2个差异条带序列与菠萝MADS-box transcription factor 6-like基因同源,表明‘14-1’和‘Hime Pineapple’之间的性状差异与遗传物质的改变相关,相应的特异条带可作为调控营养期时长或是与调控营养期时长基因相连锁的候选基因片段。该结果对后续挖掘早花关键基因,解析短营养期突变体早花变异机理具有较好的参考价值。 展开更多
关键词 菠萝 短营养期 突变体 DNA AFLP
基于AFLP遗传多样性和叶片内含物的银杏特异种质资源分析 认领
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作者 胡亚平 曹福亮 +1 位作者 汪贵斌 郭起荣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期466-472,共7页
本研究以南京林业大学银杏种质资源库中新收集30份特异种质资源为材料,通过对AFLP遗传关系和叶片黄酮总量和3个主要单体(槲皮素,山奈酚,异鼠李素)及可溶性糖含量分析,探究各特异种质资源间遗传联系。研究表明各种质资源间存在不同程度... 本研究以南京林业大学银杏种质资源库中新收集30份特异种质资源为材料,通过对AFLP遗传关系和叶片黄酮总量和3个主要单体(槲皮素,山奈酚,异鼠李素)及可溶性糖含量分析,探究各特异种质资源间遗传联系。研究表明各种质资源间存在不同程度的遗传差异,不同种质资源黄酮总量和单体组成比例均具有较大差异,筛选出具有较高特异性的种质资源C16。以黄酮单体和可溶性糖含量进行系统聚类,与UPGMA聚类结果不能完全吻合,说明UPGMA聚类分析结果和叶片内含物含量聚类具有一定的差别。通过结合AFLP分子标记技术和生理特征探究特异种质资源遗传多样性,发掘银杏种质遗传变异,可以为选育银杏特异种质资源提供思路,后续种质资源筛选与鉴定提供依据。 展开更多
关键词 AFLP 银杏(Ginkgo biloba) 遗传多样性 特异种质资源
Phenotypic, Cytological and Molecular (AFLP) Analyses of the Cotton Synthetic Allohexaploid Hybrid (<i>G. hirsutum</i>×<i>G. longicalyx</i>)<sup>²</sup> 认领
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作者 N’Guessan Olivier Konan Jean-Marie Jacquemin +1 位作者 Jean-Pierre Baudoin Guy Mergeai 《遗传学期刊(英文)》 2020年第2期35-49,共15页
The wild cotton diploid species (2n = 2x = 26) are important sources of useful traits such as high fiber quality, resistance to biotic and abiotic stresses etc., which can be introgressed into the cultivated tetraploi... The wild cotton diploid species (2n = 2x = 26) are important sources of useful traits such as high fiber quality, resistance to biotic and abiotic stresses etc., which can be introgressed into the cultivated tetraploid cotton <i>Gossypium hirsutum</i> L (2n = 4x = 52), for its genetic improvement. The African wild diploid species <i>G. longicalyx</i> Hutchinson and Lee could be used as donor of the desirable traits of fiber fineness and resistance to reniform nematode. However, hybridization of wild diploid species and cultivated tetraploid cotton encounters a sterility problem of the triploid (2n = 3x = 59), mainly due to ploidy. The restoration of the fertility can be done by creating an allohexaploid (2n = 6x = 78) through the doubling with colchicine of the sterile triploid chromosomes. With this method, a synthetic allohexaploid hybrid (<i>G. hirsutum</i> × <i>G. longicalyx</i>)2 has been obtained. This genotype was studied using phenotypic, cytological and molecular (AFLP) analyses in order to confirm its hybridity and its caryotype, and also to verify the expression of the desirable traits coming from <i>G. longicalyx</i>. The studied genotype showed a quite good level of pollen fertility (83%), and apart from larger seeds and some minor seedling anomalies, most of its morphological characteristics were intermediate between the two parental species. It had 78 chromosomes, proving its hexaploid status. Molecular analysis revealed 136 AFLP loci in this hexaploid, all from <i>G. hirsutum</i> and <i>G. longicalyx</i>, demonstrating its hybrid status. In addition, the hexaploid exhibited the useful traits of <i>G. longicalyx</i> with regard to its remarkable fiber fineness and its high resistance to the reniform nematode. This allohexaploid hybrid constitutes an interesting agronomic material, which can be used as a bridge for the transfer of useful agronomic traits from wild species to varieties of <i>G. hirsutum</i>. 展开更多
关键词 Gossypium spp Hexaploid Hybrid Chromosomes AFLP Marker Plant Breeding
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我国东南沿海野生坛紫菜遗传多样性的AFLP分析 认领
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作者 刘颖 张鹏 +1 位作者 王铁杆 任鹏 《浙江农业科学》 2020年第6期1189-1194,共6页
为了解中国东南沿海坛紫菜野生群体的遗传多样性现状,本研究采用AFLP分子标记技术对采自浙江、福建和广东三省的坛紫菜野生样品进行了遗传多样性分析。8对选择性引物在6个坛紫菜群体的83个样品中共检测到1261个有效位点,其中多态位点126... 为了解中国东南沿海坛紫菜野生群体的遗传多样性现状,本研究采用AFLP分子标记技术对采自浙江、福建和广东三省的坛紫菜野生样品进行了遗传多样性分析。8对选择性引物在6个坛紫菜群体的83个样品中共检测到1261个有效位点,其中多态位点1260个。6个群体整体水平上的多态位点百分率为96.63%,平均观测等位基因数为1.5045,平均有效等位基因数为1.2254,Shannon’s信息指数为0.2228,Nei’s遗传多样性指数为0.1417,平均无偏多样性为0.1534。基因流为1.5196,表明中国东南沿海坛紫菜野生群体间存在一定的基因交流。ANOVA分析显示,21.77%的变异来自群体间,78.23%的变异来自群体内,与群体间遗传分化系数(0.2480)结果相似。UPGMA聚类显示,6个群体聚为2大支,其中NR群体独立聚为一支,其他群体聚为另外一支。PCoA结果表明,NR群体与其他群体间的分化明显。该研究所获得的坛紫菜野生群体遗传多样性信息不仅为评估和保护坛紫菜自然资源提供了基础数据,也为选择具有优良性状的原始种质提供了重要参考。 展开更多
关键词 坛紫菜 AFLP 遗传多样性
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浙南坛紫菜实验品系与传统品系遗传多样性的AFLP分析 认领
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作者 刘颖 张鹏 +1 位作者 王铁杆 任鹏 《浙江农业科学》 2020年第6期1157-1161,共5页
本研究利用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术从基因组DNA水平上分析坛紫菜新品系浙南3号(ZN3)和浙江主要坛紫菜栽培品系(YH)的遗传差异,从16对选择性扩增引物中筛选出8对扩增效果好的引物,并用这8对引物对YH和ZN3 2个坛紫菜群体进... 本研究利用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术从基因组DNA水平上分析坛紫菜新品系浙南3号(ZN3)和浙江主要坛紫菜栽培品系(YH)的遗传差异,从16对选择性扩增引物中筛选出8对扩增效果好的引物,并用这8对引物对YH和ZN3 2个坛紫菜群体进行分析。结果显示,60个坛紫菜个体中共检测到964个有效位点,其中多态位点955个;坛紫菜2个群体整体水平上的多态位点百分率(PPL)为99.1%,2个群体各自的多态位点百分率分别是69.0%和81.5%,均值为75.3%。2个坛紫菜群体的Nei’s遗传多样性指数(H)为0.153 3和0.202 3,Shannon’s信息指数(I)为0.247 8和0.324 1,2个坛紫菜群体的总遗传变异(Ht)和群体内遗传变异(Hs)分别为0.240 2和0.177 8,群体间遗传分化系数(Gst)为0.252 6,即群体间遗传变异占总变异的25.3%,群体内遗传变异占总变异的74.7%,表明不同品系的群体间遗传分化程度较低。2个坛紫菜群体间基因流动系数(Nm)为1.593 0,表明坛紫菜不同品系间存在一定的基因交流。 展开更多
关键词 坛紫菜 AFLP 遗传多样性
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AFLP Analysis of Genetic Stability of Sugarcane Tissue Culture Clones 认领
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作者 Fangye LAO Huiyi HE +1 位作者 Rui LIU Yongwen QI 《农业生物技术:英文版》 CAS 2020年第1期1-5,共5页
[Objectives] This study was conducted to better understand the variation law of sugarcane clones during tissue culture process,and to provide a reference for rapid propagation and detection of healthy sugarcane seedli... [Objectives] This study was conducted to better understand the variation law of sugarcane clones during tissue culture process,and to provide a reference for rapid propagation and detection of healthy sugarcane seedlings.[Methods] The genetic stability of tissue culture clones of three sugarcane varieties was analyzed using the AFLP molecular marker technique.[Results]The average number of polymorphic loci was 19. 58 for each primer pair,and the percentage of polymorphic loci was 41. 74%. Compared with the donor varieties,all tissue culture materials were mutated. There were 3-16 missing bands,with an average of 5. 2 bands,and there were 0-17 increased bands,with an average of 3. 3 bands. The total number of missing and increased bands was 4-33,with an average of 8. 5. The band difference rates were in the range of 0. 009 4%-0. 077 6%,with an average of 0. 020 6%. The genetic similarity coefficients between materials ranged from 0. 685 6 to 0. 998 2,with an average of 0. 818 4. The three sugarcane varieties and their tissue culture clones were clustered into three groups.[Conclusions] Although variations occur in tissue culture,the variations are not too obvious,and the genetic stability is relatively high. It is recommended to minimize the number of subculture generations and cultivation time to reduce the occurrence of variation during tissue culture for rapid propagation of sugarcane seedlings. 展开更多
关键词 SUGARCANE TISSUE culture CLONE AFLP Genetic stability
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萝卜叶缘裂刻性状分子标记的开发与应用 认领
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作者 张小康 张雪丽 熊秋芳 《广东农业科学》 CAS 2019年第7期17-22,共6页
【目的】明确萝卜裂叶性状的遗传特点,开发与裂叶性状连锁的分子标记。【方法】以萝卜“武青一号”作为母本,“新洲花叶”作为父本杂交得到F1,将F1分别套袋自交和回交,产生F2和BC1,探讨裂叶性状的遗传规律。【结果】F1植株叶型表现为裂... 【目的】明确萝卜裂叶性状的遗传特点,开发与裂叶性状连锁的分子标记。【方法】以萝卜“武青一号”作为母本,“新洲花叶”作为父本杂交得到F1,将F1分别套袋自交和回交,产生F2和BC1,探讨裂叶性状的遗传规律。【结果】F1植株叶型表现为裂叶,BC1(F1ד武青一号”)和F2中叶全裂与叶浅裂的植株分离比分别符合1∶1和3∶1,说明萝卜叶缘裂刻的表型符合显性基因遗传模式,萝卜叶缘缺裂受单个遗传位点控制。利用BSA与AFLP技术相结合筛选与萝卜叶缘裂刻基因紧密连锁的分子标记,制备的SCAR标记引物HY-18与萝卜叶缘裂刻基因紧密连锁,其遗传距离为3.32 cM。【结论】上述标记的获得为萝卜裂叶性状的分子标记辅助育种以及裂叶基因的克隆奠定了理论基础。 展开更多
关键词 萝卜 裂叶 分子标记 AFLP 开发与应用
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硬核资源遗传多样性的AFLP分析 认领
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作者 毛常丽 吴裕 +1 位作者 张凤良 何美莹 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期29-35,共7页
为了解云南省硬核[Scleropyrum wallichianum(Wight et Arn.)Arn.]的遗传多样性,采用AFLP标记分析了7个居群84份种质材料的遗传变异。结果表明,从64对引物组合中挑选出多态性较好的引物8对,共扩增出1 728条带,其中多态性条带1 388条,多... 为了解云南省硬核[Scleropyrum wallichianum(Wight et Arn.)Arn.]的遗传多样性,采用AFLP标记分析了7个居群84份种质材料的遗传变异。结果表明,从64对引物组合中挑选出多态性较好的引物8对,共扩增出1 728条带,其中多态性条带1 388条,多态性百分率为80.14%。硬核在物种水平的多样性指数分别为Na=1.416,Ne=1.179,H=0.137,I=0.225,在居群水平上分别为H=0.111,I=0.175;在遗传相似性系数为0.52时,这些种质材料可分为3组,其中易武居群具有丰富的遗传变异,大部分的遗传变异存在于居群内,而在0.05置信区间内居群间遗传变异仅为11.5%;居群间的遗传距离和地理距离无显著相关性(r=0.0323,P=0.5820)。因此,硬核资源可采用就地和迁地保护策略,以增加其遗传多样性。 展开更多
关键词 硬核 AFLP 遗传结构 遗传多样性 引种 保护策略
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青稞AFLP体系的建立及优化 认领
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作者 王姗姗 刘小娇 +5 位作者 靳玉龙 白婷 朱明霞 王波 张文会 张玉红 《现代农业科技》 2019年第5期3-6,共4页
本文以青稞为材料,对AFLP酶切连接、预扩增、选择性扩增过程进行优化。结果表明,酶切反应条件为DNA模板200 ng、限制性内切酶Eco RI/MseI 4U、酶切时间4h;连接反应条件为连接温度16℃,T4连接酶3 U,连接时间12 h以上;预扩增反应条件为rTa... 本文以青稞为材料,对AFLP酶切连接、预扩增、选择性扩增过程进行优化。结果表明,酶切反应条件为DNA模板200 ng、限制性内切酶Eco RI/MseI 4U、酶切时间4h;连接反应条件为连接温度16℃,T4连接酶3 U,连接时间12 h以上;预扩增反应条件为rTaq聚合酶3 U、dNTP 4 mmol/L、镁离子浓度1.00 mmol/L;选择性扩增反应条件为r Taq聚合酶4 U、d NTP 4 mmol/L、镁离子浓度1.25 mmol/L及预扩产物稀释10倍。利用优化后的AFLP体系,以藏青2000、冬青18这2个供试材料的基因组为模板,从100对引物组合中筛选出10对重复性好、稳定性强、扩增条带清晰、分布均匀、多态性高的引物组合,为青稞种质资源鉴定及遗传多样性分析提供了基础。 展开更多
关键词 青稞 AFLP PCR体系优化 引物筛选
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金花茶遗传多样性和遗传结构AFLP分析 认领 被引量:3
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作者 李辛雷 王洁 +2 位作者 殷恒福 范正琪 李纪元 《生态与农村环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期63-68,共6页
利用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子标记技术,对金花茶(Camellia nitidissima)4个天然种群的遗传多样性和遗传结构进行研究,为金花茶资源的有效保护和高效利用提供科学依据。结果表明,8对引物共... 利用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子标记技术,对金花茶(Camellia nitidissima)4个天然种群的遗传多样性和遗传结构进行研究,为金花茶资源的有效保护和高效利用提供科学依据。结果表明,8对引物共扩增出1619个DNA位点,其中1473个位点具多态性,多态性位点百分率为90.98%。金花茶物种水平基因多样性指数和Shannon信息指数为0.146和0.246,种群水平基因多样性指数和Shannon信息指数为0.131和0.215;4个金花茶种群的多态位点百分率、基因多样性指数和Shannon信息指数变化趋势一致,其中多态位点百分率介于56.83%~72.11%之间,基因多样性指数介于0.122~0.138之间,Shannon信息指数介于0.197~0.228之间。金花茶种群间的遗传分化系数介于0.139~0.289之间,遗传变异主要存在于种群内。分子变异分析(AMOVA)结果表明,金花茶种群内遗传变异为81.52%,种群间遗传变异为18.48%,遗传变异主要存在于种群内。非加权组平均法(UPGMA)聚类结果表明,种群间遗传变异与其地理距离无明显相关性。应加强现有金花茶种群的就地保护,促进种群自然更新,同时加强迁地保护。 展开更多
关键词 金花茶 遗传多样性 遗传结构 AFLP 资源保护
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银白杨×马氏杨杂交子代及亲本的AFLP分析 认领 被引量:1
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作者 李晓宇 梁德军 +2 位作者 纪纯阳 赵继梅 赵鑫闻 《辽宁林业科技》 2019年第4期1-4,74共5页
为了探讨银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代间的遗传多样性参数及个体聚类关系,利用8对引物对银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代4个样本进行了AFLP分析。结果表明,8对引物共扩增出780条扩增谱带,其中多态性条带数为... 为了探讨银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代间的遗传多样性参数及个体聚类关系,利用8对引物对银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代4个样本进行了AFLP分析。结果表明,8对引物共扩增出780条扩增谱带,其中多态性条带数为715条,多态性比例为91.65%,平均有效等位基因数为1.5017,Nei’s平均遗传多样性指数为0.3065,Shannon平均信息指数为0.4679。不同杂交子代在E-AAC/M-CAG引物对上均有特异性位点,这些特异位点可用于品种鉴定。聚类研究发现,在相似系数为0.76时,试验样品分成2个AFLP群,其中马氏杨为1个AFLP群,银白杨及2个杂交子代为1个AFLP群;当相似系数为0.78时,银白杨和2个杂交子代的AFLP群又划分为2个亚群,其中杂交子代1和杂交子代2聚合为亚群1,银白杨为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了指导借鉴价值。 展开更多
关键词 银白杨 马氏杨 AFLP 分析
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