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基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究 预览
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作者 赵彦花 区又君 +2 位作者 温久福 李加儿 周慧 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期127-132,共6页
文章利用微卫星标记对珠江口海域19 个黄唇鱼(Bahaba flavolabiata) DNA 样品进行了遗传多样性研究,以期为黄唇鱼的种质鉴定和保育等研究奠定基础。结果显示,29 个微卫星位点的等位基因数(Na)分别为2~7 个,等位基因总数为121 个,平均等... 文章利用微卫星标记对珠江口海域19 个黄唇鱼(Bahaba flavolabiata) DNA 样品进行了遗传多样性研究,以期为黄唇鱼的种质鉴定和保育等研究奠定基础。结果显示,29 个微卫星位点的等位基因数(Na)分别为2~7 个,等位基因总数为121 个,平均等位基因数为4.17 个。有效等位基因数(Ne)介于1.060 6~6.056 1,总和为85.205 0。平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.659 3 和0.597 3。多态性信息含量(PIC)介于0.055 5~0.813 7,平均值为0.542 3,其中19 个位点表现出高度多态性。5 个位点显著偏离Hardy-Weinberg 平衡(校正P≤0.036)。基因丰富度(Rs)介于2~6.976,总和为119.638。基因多样性(GD)介于0.059~0.856。这些数据显示黄唇鱼群体遗传多样性处于较高水平。 展开更多
关键词 黄唇鱼 微卫星标记 遗传多样性
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冬虫夏草生物学及生态学研究中的关键科学问题研究进展 预览
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作者 徐梦 徐明 李仁强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1853-1862,共10页
冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体... 冬虫夏草是一种具有极高药用和食用价值的珍稀菌类,其生物学特性和可持续发展关键技术一直是冬虫夏草研究关注的重点。总结了冬虫夏草生物学及生态学中的几个重要科学问题,包括冬虫夏草菌侵染蝙蝠蛾幼虫的途径及机制、冬虫夏草菌子实体形成及生长过程中的关键调控因子、冬虫夏草菌遗传多样性及基因组学研究、天然冬虫夏草及其微环境中的微生物群落组成、全球变暖背景下未来青藏高原地区的气候变化对冬虫夏草资源的影响等的研究进展,并分析了现有研究中尚未明确和不足之处。未来在冬虫夏草生物学及生态学的研究中,需要利用和研发更加先进的观测设备及试验方法,以实现天然冬虫夏草发生发育的原位观测和机理研究;充分利用冬虫夏草人工培植技术,结合分子生物学研究,从基因水平上揭示冬虫夏草菌生态适应性及侵染蝙蝠蛾幼虫的机理;建立冬虫夏草科学研究基地,开展长期定位观测试验并结合生态学模型构建明确未来气候变化对冬虫夏草资源的影响,以期进一步深入冬虫夏草生物学和生态学研究、推进我国冬虫夏草资源的合理利用及可持续发展的政策制定。 展开更多
关键词 冬虫夏草菌 发生发育 遗传多样性 基因组学 微生物群落 气候变化 可持续利用
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昌黎产区酒类酒球菌(Oenococcus oeni)的遗传多样性及系统发育分析 预览
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作者 余东亮 石侃 +2 位作者 孟强 刘树文 何玲 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第16期137-143,共7页
对我国昌黎产区5家具有代表性酒庄进行酒类酒球菌(Oenococcus oeni)菌株的分离,采用Species-specific聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴定O. oeni,运用荧光标记扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphi... 对我国昌黎产区5家具有代表性酒庄进行酒类酒球菌(Oenococcus oeni)菌株的分离,采用Species-specific聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)鉴定O. oeni,运用荧光标记扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术进行分子遗传学研究。结果表明:在分离具有表型差异的226株葡萄酒乳酸菌中,通过Species-specific PCR,鉴定出222株O. oeni。对分离的O. oeni菌株进行荧光标记AFLP分析,结果显示,经筛选的荧光标记选择性扩增引物可将222株O. oeni分为221个AFLP遗传型,其相似性系数在74%~98%。在81.7%的相似性水平上,分离菌株存在2个主要的进化类群。分离自同一酒庄的O. oeni菌株种群形成了独特的簇群结构,呈现出遗传发育和分离起源的典型特异性关系,证实了O. oeni资源是葡萄酒"风土"的重要组成之一。本研究证实了昌黎产区存在丰富的O. oeni资源,且不同酒庄分离的O. oeni菌株种群呈现出遗传特异性,这为开发我国具有地域特色的O. oeni资源提供了技术和理论支持。 展开更多
关键词 葡萄酒 酒类酒球菌 扩增片段长度多态性 遗传多样性 遗传特异性 葡萄酒“风土”
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西藏春小麦SSR遗传多样性分析 预览
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作者 于明寨 张永鹏 +3 位作者 梁艳华 王兰 王菊花 魏迎春 《西藏农业科技》 2019年第3期45-48,共4页
小麦作为西藏主要的粮食作物,为了解西藏春小麦遗传背景,选用均衡分布于21条染色体的105对SSR引物,其中64对多态性较好,对73份大麦亲本材料进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明:多态信息含量(PIC)的变幅为0.375~0.887,平均为0.673... 小麦作为西藏主要的粮食作物,为了解西藏春小麦遗传背景,选用均衡分布于21条染色体的105对SSR引物,其中64对多态性较好,对73份大麦亲本材料进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明:多态信息含量(PIC)的变幅为0.375~0.887,平均为0.673。遗传相似系数(GS)变异范围为0.635~0.916,聚类分析表明73个冬小麦亲本材料在GS值为0.752水平上聚为3个大类,各大类分别包括15、20和38份材料,通过来源分析发现,各大类材料来源基本相同,说明本地品系来源结构单一,有待进一步引进异质资源,为育种工作突破提供基础。 展开更多
关键词 西藏 小麦 SSR 遗传多样性
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基于线粒体Cyt b基因的龙头鱼群体遗传结构分析 预览
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作者 郭易佳 杨天燕 +2 位作者 孟玮 韩志强 高天翔 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期945-952,共8页
在我国黄海、东海和南海海岸带上,选取青岛、南通、舟山、三门、宁德、泉州和湛江共7个群体164尾龙头鱼(Harpadon nehereus)为研究对象,通过PCR扩增共获得长度为1112 bp的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因序列,共检测到32个变异位点,其中... 在我国黄海、东海和南海海岸带上,选取青岛、南通、舟山、三门、宁德、泉州和湛江共7个群体164尾龙头鱼(Harpadon nehereus)为研究对象,通过PCR扩增共获得长度为1112 bp的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因序列,共检测到32个变异位点,其中单变异位点27个,简约信息位点1个。164条序列定义了29个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.3026±0.0479和0.000371±0.000379,其中泉州群体的单倍型多样性和核苷酸多样性均最低。分析比较了不同龙头鱼群体间遗传变异情况,发现群体间平均遗传距离为0.00035,遗传分化指数FST值均小于0.05,群体间没有发生明显的遗传分化。AMOVA分析结果显示龙头鱼群体遗传差异主要来源于群体内个体间的变异。中性检验的Tajima’s D和Fu’s Fs统计值均为负值且显著偏离中性,核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布,表明龙头鱼历史上经历了群体扩张事件,参考已知海洋鱼类Cyt b基因2%每百万年的进化速率,估算群体扩张发生的时间大约在0.08—0.32百万年前的第四纪更新世中晚期。 展开更多
关键词 龙头鱼 Cyt b基因 遗传多样性 遗传分化
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猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征的分析
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作者 尹彦文 施开创 +3 位作者 孙文超 莫胜兰 陆文俊 屈素洁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期484-492,共9页
猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因... 猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框(ORF)。同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH_2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016株、广东GD株核苷酸序列的同源性分别为98.2%、92.9%、83.4%、90.8%。GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国Bavaria_S5/9株、奥地利AUT-2016_C株、荷兰NL1株核苷酸序列的同源性分别为87.8%、90.7%、90.5%、90.7%。上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸序列的同源性分别为79.1%~97.2%、83.0%~98.4%、83.1%~96.8%。基于APPV全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图。来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支。表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异。 展开更多
关键词 猪非典型瘟病毒 基因组序列 遗传变异 遗传多样性 分子特征
利用InDel标记构建番茄新品种指纹图谱 预览
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作者 胡陶铸 林丽 +3 位作者 胡继军 邰连赛 王圣洁 刘杨 《上海交通大学学报:农业科学版》 2019年第2期24-29,共6页
利用优化的InDel技术体系对19份上海地区主栽番茄新品种进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果表明,19份番茄品种在遗传相似性系数为0.38时被分为2个主簇,供试品种遗传相似性系数在0.38到0.86之间,说明这些品种具有丰富的遗传多样性,... 利用优化的InDel技术体系对19份上海地区主栽番茄新品种进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果表明,19份番茄品种在遗传相似性系数为0.38时被分为2个主簇,供试品种遗传相似性系数在0.38到0.86之间,说明这些品种具有丰富的遗传多样性,聚类分析结果为番茄亲本选择选配提供了理论依据。利用5对InDel引物组合构建的指纹图谱将19份供试品种区分开,其中引物sli555可直接鉴定出品种‘浦珍’,引物sli608可直接鉴定出品种‘宇宙3号’和‘浦粉1号’,引物IndelF331可直接鉴定出品种‘凯旋’和‘改良粉妃’,表明InDel标记是一种构建番茄品种指纹图谱的理想标记,研究结果为番茄新品种的审认定、新品种保护权申请等工作提供了参考。 展开更多
关键词 番茄 INDEL标记 遗传多样性 指纹图谱
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山西谷子地方品种初选核心种质构建 预览
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作者 王海岗 温琪汾 +1 位作者 乔治军 穆志新 《农学学报》 2019年第4期26-31,共6页
为了构建山西谷子地方品种核心种质,提高资源利用效率,采用离差平方和法进行系统聚类后随机取样,构建的初选核心种质保留了原始种质11.34%的遗传资源。分析结果显示:核心种质与原始种质表型性状均值差异百分率为5.9%,极差符合率为87.4%... 为了构建山西谷子地方品种核心种质,提高资源利用效率,采用离差平方和法进行系统聚类后随机取样,构建的初选核心种质保留了原始种质11.34%的遗传资源。分析结果显示:核心种质与原始种质表型性状均值差异百分率为5.9%,极差符合率为87.4%,方差差异百分率为35.3%,变异系数变化率为102.0%;经多样性指数t检验,表明初选核心种质能够代表原始种质的遗传多样性。 展开更多
关键词 山西 谷子 地方品种 核心种质 遗传多样性
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不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析 预览
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作者 杨峰 冉茂林 +3 位作者 李晓梅 陈琳 雍小平 冉科 《江苏农业科学》 2019年第4期123-127,共5页
为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95... 为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95条,多态性条带百分率为93.14%。POPGENE分析结果表明,平均观测等位基因数为2.9674,平均有效等位基因数为2.4191,有效等位基因比例为81.52%;平均Nei基因多样性指数为0.3555,平均Shannon多态性指数为0.5289。UPGMA法聚类结果把供试萝卜材料分为3个类群,5个亚类:第Ⅰ类为来源于德国的极耐抽薹材料,第Ⅱ类为来源于韩国和日本的耐抽薹材料,第Ⅲ类为来源于我国的材料,其中第3亚类共有45份,占材料总数的78.95%,第4亚类为5份极易抽薹材料,第5亚类仅有1份。各材料间平均遗传相似系数为0.6381,变幅范围0.3478~0.9348,>0.7的仅22.87%,遗传差异较大。不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。 展开更多
关键词 萝卜 抽薹 SSR标记 遗传多样性
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5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析 预览
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作者 白云 王妍 +5 位作者 胡莹 张兴华 金万昆 高永平 杨建新 董仕 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期498-505,共8页
采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA D-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481~... 采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA D-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481~MG786483,MG786485~MG786487,KC292935,KC292936)。使用Mega 6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树。线粒体DNA D-loop及邻近区段、单独D-loop区段的碱基序列分析结果表明,单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统,碱基差异位点数较多,变异程度较高;单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统,碱基差异位点数较少,变异程度较低。在线粒体DNA D-loop及邻近区段内,德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462,核苷酸多样性指数为0.00458,平均核苷酸差异性为6.150,遗传多样性最大;州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065,核苷酸多样性指数为0.00065,平均核苷酸差异性为0.870,遗传多样性最低。 展开更多
关键词 乌克兰鳞鲤 德国镜鲤 框鳞镜鲤 红镜鲤 州河鲤 D-LOOP 遗传多样性
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菊花脑×甘菊种间F1杂种的鉴定和遗传多样性分析
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作者 刘颖鑫 李沛曈 +5 位作者 迟天华 王海滨 管志勇 房伟民 陈发棣 张飞 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1553-1564,共12页
利用SSR和SRAP标记及表型性状研究了二倍体菊花近缘种菊花脑(Chrysanthemum nankingense)与甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium)种间杂种的真实性和遗传多样性。结果表明,131个杂交F1代单株中,122个为真杂种,真杂种率为93.13%。42对SS... 利用SSR和SRAP标记及表型性状研究了二倍体菊花近缘种菊花脑(Chrysanthemum nankingense)与甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium)种间杂种的真实性和遗传多样性。结果表明,131个杂交F1代单株中,122个为真杂种,真杂种率为93.13%。42对SSR引物组合在菊花脑、甘菊及其122个F1杂种中扩增得到123个多态性条带,平均每对引物扩增出3条多态性条带;18对SRAP引物组合扩增得到55个多态性条带,平均每对引物扩增出3条多态性条带。菊花脑×甘菊种间F1杂种之间的遗传相似系数介于0.44~0.90,表型变异系数在10.16%~16.67%之间,且存在超亲个体,说明种间杂种的遗传变异丰富;杂种的叶片表型偏向于母本。基于表型性状和SSR、SRAP分子标记的UPGMA聚类分析将亲本和122个杂交后代都分为7类,绝大多数杂种后代与母本菊花脑聚在一起,而父本甘菊和少部分杂种株系分别单独聚在一起,表明F1代与母本更为相似。母本与种间杂种的平均遗传相似性系数(0.62)高于父本(0.54),说明该杂种群体在遗传上更接近母本,与表型观察结果相吻合。 展开更多
关键词 菊花近缘种 菊花脑 甘菊 种间杂交 杂种鉴定 分子标记 遗传多样性
33份薄壳山核桃品种种质资源的遗传多样性分析 预览
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作者 焦思宇 赵珞珞 +4 位作者 刘晓倩 杜德意 金继良 聂传朋 崔亚东 《阜阳师范学院学报:自然科学版》 2019年第2期36-39,56共5页
以阜阳市林业科学技术推广站苗圃的33份薄壳山核桃品种为试材,利用ISSR分子标记技术对其进行了遗传多样性分析。结果表明用8条引物对33份样品进行扩增,共检测扩增位点58个,其中多态性位点45个,多态性位点百分率(PPB)为77.59%,Nei’s基... 以阜阳市林业科学技术推广站苗圃的33份薄壳山核桃品种为试材,利用ISSR分子标记技术对其进行了遗传多样性分析。结果表明用8条引物对33份样品进行扩增,共检测扩增位点58个,其中多态性位点45个,多态性位点百分率(PPB)为77.59%,Nei’s基因多样性(H)为0.301,Shannon信息指数(I)为0.418,各品种间UPGMA遗传距离在0.67~0.84之间。ISSR可以有效揭示薄壳山核桃品种间的遗传多样性,研究结果对于薄壳山核桃品种鉴定和杂交育种具有重要参考价值。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 ISSR 遗传多样性
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华北地区中华蒙潮虫(甲壳动物亚门:等足目)种群遗传多样性研究 预览
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作者 张瑞 王明晓 安建梅 《四川动物》 北大核心 2019年第2期139-148,共10页
中华蒙潮虫Mongoloniscus sinensis(Dollfus,1901)隶属于甲壳动物亚门Crustacea等足目Isopoda潮虫亚目Oniscidea,中国特有种。为了探究中华蒙潮虫的种群遗传分化和系统进化关系,采用PCR对采自华北地区10个地理种群89只个体线粒体2个基... 中华蒙潮虫Mongoloniscus sinensis(Dollfus,1901)隶属于甲壳动物亚门Crustacea等足目Isopoda潮虫亚目Oniscidea,中国特有种。为了探究中华蒙潮虫的种群遗传分化和系统进化关系,采用PCR对采自华北地区10个地理种群89只个体线粒体2个基因COⅠ和ND5进行联合分析。结果表明:1)中华蒙潮虫COⅠ部分基因长604 bp,ND5部分基因长615 bp,拼接序列长1 219 bp,T、C、A和G含量分别为41.0%、11.2%、30.8%和17.0%,具有显著的A+T偏倚;变异位点503个(占总核苷酸序列的41.3%),序列间的转换/颠换比值为2.8。2)89只个体共45种单倍型,单倍型多样性0.964,核苷酸多样性0.005 6,整体遗传多样性水平中等;单倍型H1、H15、H16、H21、H41为2~3个种群共享单倍型。3)联合基因(COⅠ+ND5)系统发育树表明,最早出现的是华北以北地区(山西大同、河北石家庄),最晚分化出的是华北以南地区(山西临汾、陕西西安未央区、河南新乡),演化路线为从北向南,个别种群单倍型未按地理来源形成明显的簇群。4)平均遗传分化指数为0.513,基因流为0.24;分子变异分析结果表明,种群的变异与分化主要来自种群内部,错配分布呈多峰,结合中性检验(Tajima's D=-1.429;Fu's Fs=6.499),发现中华蒙潮虫近期未经历扩张,但种群内部分化显著,增长平稳。本研究首次基于线粒体多基因联合分析了中华蒙潮虫种群遗传多样性。 展开更多
关键词 中华蒙潮虫 遗传多样性 COⅠ基因 ND5基因 华北地区
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城步峒茶资源主要生化成分遗传多样性分析 预览
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作者 宁静 刘振 +5 位作者 杨拥军 杨阳 沈程文 张曙光 肖敦旺 马良元 《茶叶通讯》 北大核心 2019年第3期269-275,共7页
为了深入研究湖南四大地方茶树群体资源之一的城步峒茶,从原产地收集筛选了17份有代表性的资源进行生化成分评价鉴定和遗传多样性分析。结果表明:17份资源生化成分存在丰富的多样性和变异,平均遗传多样性指数达2.34,平均变异系数达24.4... 为了深入研究湖南四大地方茶树群体资源之一的城步峒茶,从原产地收集筛选了17份有代表性的资源进行生化成分评价鉴定和遗传多样性分析。结果表明:17份资源生化成分存在丰富的多样性和变异,平均遗传多样性指数达2.34,平均变异系数达24.43%;多变量主成分分析,前4个主成分代表了17份资源生化成分多样性85.197%的信息;对17份资源15个生化成分进行聚类,可分为3大类群,第1大类群为红绿茶兼制的资源,第2大类群也是红绿茶兼制的资源,第3大类群为适制红茶的资源;并从中初步筛选出一批生化成分特异的资源,其中高茶多酚资源17份,高咖啡碱资源2份,高酯型儿茶素资源2份。 展开更多
关键词 城步峒茶 种质资源 生化成分 遗传多样性 主成分分析 聚类分析
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滇杨种群遗传多样性与遗传结构
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作者 张亚红 贾会霞 +3 位作者 王志彬 孙佩 曹德美 胡建军 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期355-365,共11页
滇杨(Populus yunnanensis)是我国西南地区的特有树种,具有速生、易无性繁殖、适应性强等优良特性,是典型的南方型杨属树种。研究滇杨遗传多样性及种群结构对其种质资源的收集、保存和利用具有重要的意义。本研究从我国滇杨主要分布区... 滇杨(Populus yunnanensis)是我国西南地区的特有树种,具有速生、易无性繁殖、适应性强等优良特性,是典型的南方型杨属树种。研究滇杨遗传多样性及种群结构对其种质资源的收集、保存和利用具有重要的意义。本研究从我国滇杨主要分布区云南和四川共采集了6个种群,包括云南的昭通(ZT)、会泽(HZ)、嵩明(SM)、洱源(EY)、拉市海(LS)以及四川的美姑(MG),共64个个体,利用34对SSR分子标记和3对cp DNA叶绿体标记开展遗传多样性与遗传结构研究。SSR引物共检测到154个等位基因,平均等位基因数为4.529,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)分别为0.552和0.472,遗传分化系数(Fst)平均值为0.238,多态性信息含量指数(PIC)平均值为0.421,基因流(Nm)为0.806。滇杨的遗传结构分析(DAPC)与遗传距离的主坐标分析(PCo A)、UPGMA聚类分析均将6个种群划分为3个亚类:第?亚类包括昭通种群、会泽种群和嵩明种群的4个个体,第??亚类包括嵩明种群的6个个体以及洱源种群和拉市海种群,第III亚类为美姑种群;嵩明种群包含第?和第??两个亚类的混合遗传成分。3个cp DNA联合序列中共检测到35个变异位点,分为13个单倍型,其中单倍型H5在种群中分布最为广泛,其余的单倍型均为种群特有的单倍型。分子方差分析(AMOVA)表明种群内的遗传变异大于种群间变异。研究表明滇杨不同种群的遗传分化具有地域性,可选择就地保护;昭通种群遗传多样性最高,且包含7种叶绿体单倍型,单倍型类型最多,应优先保护。 展开更多
关键词 滇杨 遗传多样性 遗传结构 分子标记 SSR CPDNA
南丹牛Y-SNPs与Y-STRs遗传多样性研究 预览
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作者 李秀良 张俸伟 +5 位作者 曹艳红 吴柱月 党瑞华 李绍波 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第2期26-28,共3页
[目的]分析南丹牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]用PCR扩增、测序及生物信息学方法进行分析。[结果]通过对25头南丹牛的Y-SNPs和Y-STRs分析,发现南丹牛仅包含瘤牛Y3单倍型组,细分为Y3-88-156和Y3-90-156两种单倍型,单倍型频率... [目的]分析南丹牛的Y染色体遗传多样性及父系起源。[方法]用PCR扩增、测序及生物信息学方法进行分析。[结果]通过对25头南丹牛的Y-SNPs和Y-STRs分析,发现南丹牛仅包含瘤牛Y3单倍型组,细分为Y3-88-156和Y3-90-156两种单倍型,单倍型频率分别为92%和8%,南丹牛的Y染色体单倍型多样度为0.1533±0.0915。[结论]南丹牛是瘤牛父系起源,其遗传基础很稳定。 展开更多
关键词 南丹牛 Y-SNPS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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基于ISSR和SRAP标记的栀子种质遗传多样性研究
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作者 姜武 吴志刚 +1 位作者 陶正明 蔡胡敏 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期510-516,共7页
目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物... 目的对栀子遗传多样性进行研究,为栀子资源保护和新品种培育提供依据。方法采用12条ISSR和9对SRAP分子标记,以3个居群21份栀子种质资源为材料,通过多态性检测水平、遗传多样性比较和聚类分析,揭示栀子种质资源遗传多样性。结果 ISSR引物和SRAP引物分别扩增出125和80条带数,多态性条带数分别为100和74,多态性比率(PPB)分别为80.00%和92.50%,栀子居群的总体物种水平的等位基因观察数(Na)分别为1.461 3和1.579 2,有效等位基因数(Ne)分别为1.307 7和1.342 1,Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.173 1和0.197 4,Shannon’s指数(I)分别为0.254 5和0.295 9;遗传多样性分析结果表明,ISSR和SRAP标记中3个居群之间的遗传多样性(Ht)分别为0.239 1和0.289 9,种间遗传多样性(Hs)分别为0.173 1和0.197 4,基因分化系数(Gst)分别为0.276 2和0.318 9,即72.38%和68.11%的遗传变异在种群内进行,居群间基因流(Nm)分别为1.310 3和1.068 0,证明居群间存在一定的基因流动(Nm>1);UPGMA聚类分析表明,ISSR和SRAP标记将栀子资源分为2个类群,且以SRAP分析的聚类结果更符合实际居群。结论取样栀子种质有丰富的遗传多样性,遗传分化主要发生在居群内,SRAP标记更适合用于栀子遗传多样性分析,对栀子资源的保护和育种提供了参考。 展开更多
关键词 栀子 分子标记 遗传多样性 育种 ISSR SRAP
甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性分析
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作者 李文斌 魏胜利 +5 位作者 罗琳 闫滨滨 侯俊玲 于福来 崔洁 王文全 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期517-525,共9页
目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分... 目的依据国内甘草种质主要的形态性状和化学成分,对其遗传多样性进行综合分析。方法收集移植于同一地点的42份多年生甘草种质的12个地上部分性状和5种化学成分含量,计算其遗传多样性指数和变异系数,运用聚类分析和主成分分析进行统计分析。结果 5种化学成分中,甘草苷含量的遗传多样性指数最高为2.05,异甘草苷含量的变异系数最大为99.50%,甘草苷含量与异甘草苷含量呈中度相关关系;在12个形态性状中,株高的遗传多样性指数最高为2.08,实际果序长的变异系数最大为37.09%,果型和株型性状的变异大于叶型性状;聚类分析将42份种质分为3类,第II类群种质品质较优;主成分分析将17个指标简化为6个因子,累积贡献率为72.96%,因子6为代表甘草酸、甘草苷、异甘草苷的因子。结论甘草种质主要形态性状和化学成分的遗传多样性较为丰富,筛选出V08、V10、V17、V34、V36、V38共6个品质优异的甘草种质。 展开更多
关键词 甘草 种质 形态 甘草酸 甘草苷 异甘草苷 遗传多样性
基于表型性状和CDDP分子标记延安万花山牡丹遗传多样性分析 预览
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作者 翟立娟 史倩倩 +3 位作者 李想 罗小宁 牛立新 张延龙 《江苏农业科学》 2019年第2期95-101,共7页
利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差... 利用28个表型性状和CDDP分子标记对延安万花山牡丹进行遗传多样性分析。结果表明,万花山牡丹的表型性状存在较大差异。质量性状的香农多样性指数变化范围为0.28~1.21,其中花色、叶端形态、叶片颜色、花型等较高;9个数量性状在样本中差异极显著,变异系数变化范围为12.10%~69.23%,其中花瓣数、雄蕊数的变异系数较大。CDDP分子标记分析结果表明,万花山牡丹有效等位基因数为1.5994,Neis基因多样性指数和香农多样性指数分别为0.3335和0.4861,表明延安万花山牡丹具有较高的遗传多样性。2种分析方法结果具有一致性,均可将延安万花山牡丹分为三大类,根据与紫斑牡丹和矮牡丹亲缘关系可划分为3个类型,即接近矮牡丹的类型、接近紫斑牡丹的类型和中间类型。 展开更多
关键词 牡丹 遗传多样性 表型性状 CDDP分子标记
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香蕉枯萎病菌致病机理研究进展 预览
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作者 李敏慧 苑曼琳 +1 位作者 姜子德 李华平 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期803-811,共9页
香蕉是世界重要的水果作物和第四大粮食作物,也是世界贸易第一大宗水果,具有很高的经济价值,然而目前由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense)引起的香蕉枯萎病正严重威胁着全世界的香蕉生产。由于病原菌通过土壤传... 香蕉是世界重要的水果作物和第四大粮食作物,也是世界贸易第一大宗水果,具有很高的经济价值,然而目前由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense)引起的香蕉枯萎病正严重威胁着全世界的香蕉生产。由于病原菌通过土壤传播,迄今该病害还没有有效的防治措施,且其致病机理尚未完全明确。本文对香蕉枯萎病菌的遗传多样性及其致病机理研究进展系统进行概述,以期为香蕉枯萎病的综合防控提供理论依据。 展开更多
关键词 香蕉枯萎病 尖孢镰刀菌古巴专化型 遗传多样性 致病机理
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