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应用整合药理学方法探讨半夏泻心汤治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制
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作者 许爱丽 唐彬 +2 位作者 王源 张平 魏玮 《北京中医药》 2019年第5期407-412,共6页
目的应用整合药理学方法探讨半夏泻心汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法运用整合药理学平台(TCMIP)的中药数据库,得到治疗CAG临床效果确切的经典方剂半夏泻心汤的化学成分及对应药物靶标,通过Human Phenotype Ontology数据库得... 目的应用整合药理学方法探讨半夏泻心汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法运用整合药理学平台(TCMIP)的中药数据库,得到治疗CAG临床效果确切的经典方剂半夏泻心汤的化学成分及对应药物靶标,通过Human Phenotype Ontology数据库得到CAG的疾病靶标并将其导入TCMIP,TCMIP基于蛋白质相互作用网络(PPI)数据库构建靶点相互作用网络,进而得到半夏泻心汤治疗CAG候选靶标,最后对候选靶标进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,并结合文献研究得出半夏泻心汤治疗CAG可能的生物途径和过程。结果得到复方中存在的420个化学成分,预测出1 228个药物作用的预测靶点,并构建了中药靶点相互作用网络及相应的GO、KEGG富集分析结果;将得到的5个疾病靶标与中药预测的作用靶标结合,预测得到半夏泻心汤治疗CAG的候选靶标,并构建得到'半夏泻心汤所含中药-候选靶标分子网络'及'半夏泻心汤-候选靶标-CAG相关分子网络'。结论半夏泻心汤治疗CAG的作用机制可能与白介素、环氧化酶-2、MAPK级联激活、ERK蛋白磷酸化等生物学途径有关。 展开更多
关键词 半夏泻心汤 慢性萎缩性胃炎 整合药理学 网络药理学
采用网络药理学研究桃仁-红花药对治疗股骨头坏死的分子机制 预览
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作者 董航 谢铱子 +6 位作者 黄嘉华 纪树亮 孙伟鹏 孙治中 曾夏诗 沈丹婷 林梓凌 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第7期917-922,共6页
目的:研究桃仁-红花药对治疗股骨头坏死(ONFH)的作用机制。方法:采用网络药理学方法。以化合物口服利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为标准,通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)、人类基因数据库(Ge... 目的:研究桃仁-红花药对治疗股骨头坏死(ONFH)的作用机制。方法:采用网络药理学方法。以化合物口服利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为标准,通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)、人类基因数据库(GeneCards)和在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM)筛选桃仁-红花药对的活性成分及治疗ONFH的作用靶标。借助网络拓扑属性分析软件Cytoscape3.6.0构建活性成分-ONFH靶标网络。结合STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络,筛选连接度排名前5的靶蛋白,并利用分子对接服务器预测其与桃仁-红花药对活性成分的结合活性。利用生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因本体(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)中代谢通路进行富集分析。结果:从桃仁-红花药对中筛选出活性成分44个,包括黄芩苷、槲皮素等,与ONFH相关的作用靶点78个,包括血管内皮生长因子(VEGF)、内皮细胞生长抑制因子(VEGI)、急性C反应蛋白(CRP)等。经分子对接服务器分析发现,桃仁-红花药对的活性成分与靶蛋白结合能力较强。经GO和KEGG通路富集分析发现,桃仁-红花药对治疗ONFH的生物过程与凋亡过程负向调节、核转录因子κB活动的正向调节等有关,主要通过调节分泌型糖蛋白信号通路、黑色素生成信号通路、VEGF信号通路、基底部细胞癌信号通路、腺苷酸活化蛋白激酶信号通路等发挥作用。结论:本研究初步明确了桃仁-红花药对治疗ONFH的主要靶标和通路,可为后续进一步研究其药理作用奠定基础。 展开更多
关键词 桃仁-红花 股骨头坏死 作用机制 网络药理学 系统药理学分析平台 通路
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中药血清药物化学的应用现状概述
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作者 张雯霞 冯敏 +2 位作者 苗雨露 张文智 倪艳 《药物评价研究》 CAS 2019年第7期1448-1453,共6页
中药血清药物化学是通过对实验动物口服给药后的含药血清进行分析,对药效物质基础及复方配伍机制进行快速筛选的一项新型技术,在中药质量控制、中药炮制研究等领域都发挥重要作用。随着不断的发展创新,将其与血清药理学、药动学等学科... 中药血清药物化学是通过对实验动物口服给药后的含药血清进行分析,对药效物质基础及复方配伍机制进行快速筛选的一项新型技术,在中药质量控制、中药炮制研究等领域都发挥重要作用。随着不断的发展创新,将其与血清药理学、药动学等学科相互融合,为中药及复方的研究提供了更加完善的手段。对中药血清药物化学的主要技术手段、应用研究及其与一些学科的联合使用现状进行综述,为中药血清药物化学的发展提供新的研究思路。 展开更多
关键词 血清物化学 血清药理学 动学 谱效关系 网络药理学 中医方证代谢组学
仔泻康口服液药效学和分子机制研究 预览
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作者 雒利蓉 崔东安 +2 位作者 王慧 郝智慧 王胜义 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第2期608-620,共13页
试验旨在探讨仔泻康口服液治疗仔猪腹泻的药效学和分子机制,为药物的进一步开发提供试验依据。通过小肠推进试验、止泻试验、耳廓肿胀抑制试验、镇痛试验及体外抑菌试验验证仔泻康口服液的药理作用,同时利用网络药理学对仔泻康口服液活... 试验旨在探讨仔泻康口服液治疗仔猪腹泻的药效学和分子机制,为药物的进一步开发提供试验依据。通过小肠推进试验、止泻试验、耳廓肿胀抑制试验、镇痛试验及体外抑菌试验验证仔泻康口服液的药理作用,同时利用网络药理学对仔泻康口服液活性成分进行筛选和靶点预测,并结合生物信息学手段确定仔泻康口服液治疗腹泻的特异性靶点,通过信号通路富集分析探讨其治疗腹泻的分子机制。结果显示,随着剂量的增多,仔泻康口服液抗炎及镇痛效果呈上升趋势,与空白对照组相比差异显著(P<0.05);与空白对照组相比,仔泻康口服液低、中、高剂量组均能显著抑制小鼠小肠碳素墨汁推进距离及推进率,低剂量组差异显著(P<0.05)。仔泻康口服液对大肠杆菌及金黄色葡萄球菌均有抑菌作用,对大肠杆菌效果更明显。本试验利用网络药理学预测了仔泻康口服液的止泻机制,其参与Wnt信号通路,调控细菌侵袭上皮细胞,同时也影响致病性大肠杆菌感染信号等通路;MAPK信号通路通过促进或抑制基因的转录来调控其他炎症介质的生成,同时炎症介质可通过激活MAPK通路和增加细胞表面多种黏附分子的表达促进细胞间黏附和炎症的进展等;NRG/ErbB信号参与神经病理性疼痛的多个方面,在中枢神经系统,主要通过MEK/ERK通路激活小胶质细胞,释放一系列细胞因子和炎性介质,促进神经性疼痛;同时通过调节突触可塑性及中枢去抑制等方式参与神经病理性疼痛;在外周神经系统,NRG/ErbB信号通过调节非髓鞘形成细胞和髓鞘形成施万细胞功能,参与外周神经痛ErbB信号,对镇痛起重要作用等。综上所述,仔泻康口服液可能从肠蠕动、抗炎、镇痛及抑菌4个方面来抑制腹泻。 展开更多
关键词 仔泻康口服液 仔猪腹泻 系统药理学 网络药理学 分子机制
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乌头汤治疗骨关节炎作用机制的网络药理学研究 预览
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作者 骆帝 梁学振 +2 位作者 刘金豹 许波 李刚 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第19期2632-2638,共7页
目的:研究乌头汤治疗骨关节炎的作用机制,为骨关节炎的治疗提供新的方向与靶点。方法:以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为指标,借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选乌头汤中川乌、麻黄、黄芪、白芍与甘草的活性... 目的:研究乌头汤治疗骨关节炎的作用机制,为骨关节炎的治疗提供新的方向与靶点。方法:以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为指标,借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选乌头汤中川乌、麻黄、黄芪、白芍与甘草的活性成分;通过检索治疗靶点数据库(TTD)等数据库和挖掘基因表达数据库(GEO)中的芯片数据获取骨关节炎的作用靶点;利用生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从乌头汤中共筛选出活性成分30个,包括槲皮素、丁子香萜、栀子醇等,与骨关节炎相关的作用靶点31个,包括β2肾上腺素能受体、花生四烯酸5-脂氧合酶、雄激素受体等。乌头汤治疗骨关节炎的生物过程与白细胞介素1受体信号转导、过氧化物酶增殖激活受体的协同激活作用、酪氨酸激酶受体2的信号转导作用等有关。乌头汤主要通过调节肿瘤坏死因子信号通路、血管内皮生长因子信号通路、破骨细胞分化信号通路、核转录因子κB信号通路、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究采用网络药理学分析了乌头汤治疗骨关节炎的潜在作用机制,可为进一步研究乌头汤治疗骨关节炎的药效物质基础及作用靶点提供参考。 展开更多
关键词 骨关节炎 乌头汤 网络药理学 作用机制 系统药理学数据库及分析平台
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基于网络药理学的独活治疗骨关节炎的作用机制研究 预览
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作者 程晓平 郑文伟 倪国新 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2019年第11期1641-1646,共6页
背景:独活被广泛地应用于骨关节炎的治疗,但其分子作用机制不明确。目的:采用网络药理学方法筛选中药独活中主要化学成分,构建化学成分-作用靶点网络,对其治疗骨关节炎的分子作用机制进行科学阐明。方法:采用中药系统药理学数据库筛选... 背景:独活被广泛地应用于骨关节炎的治疗,但其分子作用机制不明确。目的:采用网络药理学方法筛选中药独活中主要化学成分,构建化学成分-作用靶点网络,对其治疗骨关节炎的分子作用机制进行科学阐明。方法:采用中药系统药理学数据库筛选独活中主要活性成分,利用OMIM,TTD和pharmGKB数据库查找治疗骨关节炎的相关靶点。通过Cytoscape3.6.1软件构建独活主要化学成分-化学成分作用靶点和骨关节炎治疗靶点-骨关节炎网络,并利用基因GO功能和KEGG通路富集对参与两网络的共同作用靶点进行分析。结果与结论:从中药系统药理学数据库共筛选出8种主要化学成分,其相对应的化学作用靶点共52个。从OMIM,TTD,pharmGKB数据库筛选出与骨关节炎疾病密切相关的靶点共有120个。参与独活主要化学成分-化学成分作用靶点和骨关节炎治疗靶点-骨关节炎的共同作用靶点共有20个。网络结果分析显示独活涉及与脂肪分解、钙离子运输、T细胞稳定、胚胎期细胞分化、细胞凋亡等生物过程,同时也能对钙、肿瘤坏死因子、催产素、环磷酸腺苷、丝裂原活化蛋白激酶、凋亡等信号通路进行调控。提示实验从分子水平方向进一步揭示独活治疗骨关节炎的潜在化学成分及作用机制,能为后续从独活中开发治疗骨关节炎的新药提供一定依据。 展开更多
关键词 骨关节炎 独活 治疗靶点 网络药理学 独活化学成分 系统药理学 靶点筛选 钙离子运输 T细胞稳定 计算生物学 组织工程
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基于网络药理学的柿果药理功能定位及作用机制 预览
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作者 刘方 段灿灿 +2 位作者 李晓飞 晏仁义 张建永 《生物资源》 CAS 2019年第2期157-165,共9页
基于网络药理学,通过国内外文献检索获取柿果中的化合物,采用Swiss target prediction数据库对化合物进行潜在靶点垂钓以探讨柿果的药理功能定位及作用机制。以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,靶点-疾病名称-疾病分类网络,同时对靶... 基于网络药理学,通过国内外文献检索获取柿果中的化合物,采用Swiss target prediction数据库对化合物进行潜在靶点垂钓以探讨柿果的药理功能定位及作用机制。以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,靶点-疾病名称-疾病分类网络,同时对靶点进行蛋白相互作用(PPI)网络构建,采用DAVID数据库对靶点进行通路富集分析。本研究共收集到柿果中16个化合物,可作用于68个靶点,这些靶点主要作用于心血管疾病、神经精神性疾病等。PPI网络图包含84个节点,226条边,其中degree值排前10的关键蛋白分别为ERS1、PGS2、MMP2、TIMP1、MMP9、MMP1、AR、SLC6A3、PRKCB、CYP19A1。上述靶点可调节氮素代谢、血清素能突触以及TRP通道炎症介质的调节等信号通路。本研究为阐明柿果的药理功能定位及其作用机制研究提供了可靠的依据。 展开更多
关键词 柿果 网络药理学 蛋白相互作用(PPI)网络 富集分析 作用机制
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基于网络药理学的豨莶通栓胶囊作用机制解析及抗炎作用研究
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作者 陈茜 吴东雪 +1 位作者 赵帅 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1904-1910,共7页
豨莶通栓胶囊活血祛瘀、祛风化痰、舒筋活络、醒脑开窍,对中风病主症、中风病积分等有较好的疗效。该研究通过数据库检索获得豨莶通栓胶囊中药化学成分908个,基于反向找靶技术获得豨莶通栓胶囊潜在作用靶点337个,并利用其蛋白质相互作... 豨莶通栓胶囊活血祛瘀、祛风化痰、舒筋活络、醒脑开窍,对中风病主症、中风病积分等有较好的疗效。该研究通过数据库检索获得豨莶通栓胶囊中药化学成分908个,基于反向找靶技术获得豨莶通栓胶囊潜在作用靶点337个,并利用其蛋白质相互作用信息构建豨莶通栓胶囊蛋白互作网络,对网络进行模块分析及模块功能注释。结果显示,豨莶通栓胶囊通过对体内脂质代谢、血压系统的调节作用对脑卒中发病的最直接的危险因素高血脂、高血压发挥治疗作用;通过对血液循环系统及神经系统的调节作用治疗脑卒中引发的脑血管血栓及脑组织供血、供氧不足引起神经组织的不可逆性死亡;并通过对炎症免疫反应的调节作用治疗脑卒中导致的体内炎症及伴随着炎症发展而产生的免疫学反应。基于网络分析结果,采用脂多糖(LPS)刺激RAW264.7细胞构建体外细胞炎症反应模型,以Griess法检测NO的含量,探讨豨莶通栓胶囊抗炎作用,结果显示豨莶通栓胶囊可抑制炎症细胞对NO的释放能力,具有抗炎作用。该研究通过对豨莶通栓胶囊功能模块的分析,并通过部分实验验证,以期从分子网络水平上探讨豨莶通栓胶囊的作用机制,为其临床应用提供科学依据。 展开更多
关键词 网络药理学 豨莶通栓胶囊 蛋白互作网络 作用机制
基于网络药理学的“苍术-黄柏”药对治疗痛风作用机制研究 预览
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作者 张思旋 林茜 +3 位作者 吴嘉瑞 孟子琦 张景媛 黄星月 《中国医院用药评价与分析》 2019年第8期927-933,共7页
目的:探讨"苍术-黄柏"药对治疗痛风的作用机制。方法:首先选取"苍术-黄柏"药对含有的30个活性成分,预测其作用靶点;然后构建痛风相关的蛋白质-蛋白质相互作用网络;进而构建"苍术-黄柏"药对"活性成分... 目的:探讨"苍术-黄柏"药对治疗痛风的作用机制。方法:首先选取"苍术-黄柏"药对含有的30个活性成分,预测其作用靶点;然后构建痛风相关的蛋白质-蛋白质相互作用网络;进而构建"苍术-黄柏"药对"活性成分-预测靶点"网络,构建与痛风相关的"苍术-黄柏"药对"活性成分-潜在靶点"网络,进行基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的生物通路富集分析以及基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,研究"苍术-黄柏"药对治疗痛风的作用机制。结果:与痛风相关的"苍术-黄柏"药对"活性成分-潜在靶点"网络包含17个靶点,关键靶点涉及雌激素受体1、前列腺素内过氧化物合酶1、前列腺素内过氧化物合酶2和磷脂酰肌醇3-激酶等。KEGG通路富集分析得到通路23条,如肿瘤坏死因子信号通路、破骨细胞分化。GO功能富集分析得到GO条目149个,其中生物过程相关的条目105个,分子功能相关的条目35个,细胞组成相关的条目9个。结论:本研究结果初步验证和预测了"苍术-黄柏"药对治疗痛风的作用机制,并为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。 展开更多
关键词 苍术 黄柏 痛风 网络药理学 蛋白互作网络 靶点 信号通路
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归肾经补阳药的网络药理学机制研究
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作者 邹家丽 李安遥 +3 位作者 王启铭 赵怡 于净 项荣武 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1838-1847,共10页
目的运用网络药理学的方法对归肾经补阳药的分子作用机制进行预测。方法选择归肾经补阳中药肉苁蓉、菟丝子、冬虫夏草、韭菜子、沙苑子、仙茅、续断以及胡芦巴作为研究对象,通过TCMSP数据库检索中药化学成分,利用口服生物利用度(OB)、... 目的运用网络药理学的方法对归肾经补阳药的分子作用机制进行预测。方法选择归肾经补阳中药肉苁蓉、菟丝子、冬虫夏草、韭菜子、沙苑子、仙茅、续断以及胡芦巴作为研究对象,通过TCMSP数据库检索中药化学成分,利用口服生物利用度(OB)、类药性(DL)值筛选活性成分及Pub Chem数据库的化学相似性靶点预测方法对中药活性成分进行靶点预测;通过STRING数据库寻找归肾经补阳药靶蛋白之间的相互作用关系以及KEGG通路分析;通过加权Page Rank算法评价蛋白互作(PPI)网络中的节点,并对信号通路进行打分。基于通路富集分析及PPI分析筛选核心靶蛋白。利用Cytoscape 3.6.0软件,分别构建化合物-关键靶点网络、药材-关键靶点PPI网络和关键靶点-通路网络,并对其作用机制进行了初步探讨。结果筛选出归肾经补阳药核心靶蛋白21个,信号通路40条。归肾经补阳中药可能通过T细胞调节、性激素调节、免疫反应、延缓衰老等途径发挥温补肾阳的作用,其作用机制可能与甲状腺激素、神经营养因子、TNF及雌激素等信号通路有关。结论基于网络药理学的研究方法有助于寻找归肾经补阳药的关键靶点和信号通路,为深入诠释补肾阳药的分类含义提供有益的信息和数据支撑。 展开更多
关键词 归肾经补阳 网络药理学 PPI网络 靶蛋白 信号通路
基于网络药理学探讨骨碎补抗骨质疏松的物质基础及作用机制
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作者 甘东浩 陈德强 +1 位作者 冯蓬 徐展望 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第13期186-191,共6页
目的:通过网络药理学思路,预测骨碎补活性成分的作用靶点,结合骨质疏松(OP)相关靶点进行映射,拓扑出相互作用的关键节点进行富集分析,全方位探讨骨碎补抗OP的药理作用机制。方法:首先,在中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中基于药... 目的:通过网络药理学思路,预测骨碎补活性成分的作用靶点,结合骨质疏松(OP)相关靶点进行映射,拓扑出相互作用的关键节点进行富集分析,全方位探讨骨碎补抗OP的药理作用机制。方法:首先,在中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中基于药代动力学特征筛选出骨碎补的主要活性成分,并使用有机小分子生物活性数据库(Pub Chem)和Swiss Target Prediction数据库根据二维或三维结构相似性预测出相关作用靶点,然后通过人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和Pubmed文本挖掘已知的OP治疗靶点,结合预测靶点导入String数据库构建骨碎补治疗OP靶点相互作用网络图,借助Cyto NCA软件根据相关节点参数拓扑出相互作用的关键节点,再次导入String构建蛋白质相互作用网络图,最后通过DAVID数据库对关键节点进行生物功能及代谢通路分析。结果:筛选出16个骨碎补活性成分,根据靶点预测技术预测出相关靶点118个;经过文本挖掘检索出OP相关靶点316个,根据String网络数据库构建蛋白相互作用网络,经Cyto NCA拓扑后,筛选出关键节点97个,富集分析显示骨碎补可能通过多条通路,从增殖、分化、免疫、氧化应激等多个方面,对干细胞、成骨细胞、破骨细胞、免疫细胞等产生调控作用。结论:基于网络药理学研究表明,骨碎补可能通过直接或间接作用靶点,参与调控多条主要信号通路,影响多类细胞的增殖、分化,从而起到抗OP的作用,为阐释其抗骨质疏松的物质基础与作用机制提供了科学依据。 展开更多
关键词 骨碎补 骨质疏松 网络药理学 物质基础 作用机制 蛋白质相互作用网络
桂枝芍药知母汤缓解类风湿关节炎的网络调控机制研究 预览
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作者 谢健 谭丽雯 +2 位作者 江福能 钟惟德 梁宇翔 《广东药科大学学报》 CAS 2019年第4期529-534,共6页
目的研究桂枝芍药知母汤(GSZD)用于治疗类风湿关节炎(RA)的网络调控机制。方法收集GSZD所含中药的509个化学成分,并预测获得718个候选靶标。基于GSZD候选靶标与已知RA治疗靶标之间的相互作用信息,建立“GSZD候选靶标-已知RA治疗靶标”... 目的研究桂枝芍药知母汤(GSZD)用于治疗类风湿关节炎(RA)的网络调控机制。方法收集GSZD所含中药的509个化学成分,并预测获得718个候选靶标。基于GSZD候选靶标与已知RA治疗靶标之间的相互作用信息,建立“GSZD候选靶标-已知RA治疗靶标”互作网络,通过hub节点的节点连接度(degree)、节点紧密度(closeness)和节点介度(betweenness)中位数卡值筛选,获得45个关键网络靶标。结果GO功能和KEGG通路富集分析的结果表明,GSZD缓解RA关键网络靶标主要参与代谢类通路、免疫-炎症调节通路、骨破坏相关通路和血管新生相关通路。结论GSZD抗RA作用可能是通过逆转炎症-免疫系统的失衡、调节机体代谢、缓解骨破坏和抑制血管新生而实现。 展开更多
关键词 网络药理学 桂枝芍知母汤 类风湿关节炎 网络靶标 信号通路
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基于网络药理学探究蒲参胶囊治疗高脂血症的作用机制 预览
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作者 黄帅 成鹏 +4 位作者 杨宇 王蔚 时行 王爱云 陆茵 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期290-296,共7页
目的 基于网络药理学方法,构建蒲参胶囊药效物质靶点网络,分析其功效物质基础和作用靶标,阐述其治疗高脂血症的可能分子机制,为蒲参胶囊抗高脂血症的实验研究提供思路。方法 首先基于Arrowsmith非文献预测工具探讨蒲参胶囊各味中药及其... 目的 基于网络药理学方法,构建蒲参胶囊药效物质靶点网络,分析其功效物质基础和作用靶标,阐述其治疗高脂血症的可能分子机制,为蒲参胶囊抗高脂血症的实验研究提供思路。方法 首先基于Arrowsmith非文献预测工具探讨蒲参胶囊各味中药及其组分和高脂血症的相关性。其次运用中药成分数据库联合Percepta平台ADME/T预测功能筛选蒲参胶囊药效活性成分,于Similarity Ensemble Approach,STITCH和Benchmark Database分子靶点网站确定活性成分作用靶点。接着使用GeneCards搜索高脂血症相关疾病靶点,联合活性化合物作用靶点,确定药物作用与高脂血症的共同潜在靶标,并使用Cytoscape将结果可视化展示,最后通过使用KEGG数据库及DAVID数据库进行靶标注释与分类。结果 通过Arrowsmith分析得出,蒲参胶囊各味中药药物作用靶点和高脂血症以及其相关疾病如“动脉粥样硬化”“糖尿病”等具有显著相关性,提示蒲参胶囊对这些疾病具有治疗作用。通过药理学方法筛选出活性成分共75个,主要作用靶标有261个,关键靶点和炎症反应相关。基于KEGG和DAVID数据库总结蒲参胶囊发挥活血化瘀,滋阴化浊的治疗作用主要可能是通过以下几条信号通路:①AGE RAGE信号通路;②Malaria相关途径;③乙型肝炎相关途径;④VEGF信号通路;⑤肿瘤相关途径。结论 蒲参胶囊治疗高脂血症是通过多靶点、多通路共同作用,主要作用环节集中在抑制慢性炎症的发生发展。 展开更多
关键词 蒲参胶囊 高脂血症 疾病 靶点网络 网络药理学 分子机制
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基于网络药理学的心惠通方治疗冠心病的作用机制研究 预览
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作者 吴华英 张臣 +5 位作者 王朝华 张世鹰 李静 李丰 黄惠勇 李亮 《数字中医药(英文)》 2019年第2期86-96,共11页
目的采用网络药理学和生物信息学方法,研究心惠通方(XHTF)治疗冠心病可能的分子机制。方法通过Therapeutic Target Database, Drugbank 等构建冠心病的靶点网络, TCMSP 挖掘XHTF 药效分子-靶点网络及XHTF 药效分子-冠心病靶点网络,采用... 目的采用网络药理学和生物信息学方法,研究心惠通方(XHTF)治疗冠心病可能的分子机制。方法通过Therapeutic Target Database, Drugbank 等构建冠心病的靶点网络, TCMSP 挖掘XHTF 药效分子-靶点网络及XHTF 药效分子-冠心病靶点网络,采用GO 分析及KEGG 通路富集分析工具从多个角度探索XHTF 治疗冠心病的多靶点作用机制和分子调控网络。结果利用TherapeuticTargets Database 及Drugbank 数据库共获得88 个冠心病的靶点。从TCMSP 数据库检索到XHTF393 个化合物以及对应的205 个药物靶点;通过相关数据库共检索到XHTF 可直接作用于13 个冠心病的靶点,分别为: TP53、MAPK14、NFKB1、HSPA5、PLG、PTGS2、ADRB1、NOS2、CYP3A4、GRIA2、CYP2A6、GRIA1、PTGS1。同时,XHTF 还含有118 个与冠心病疾病靶点直接相互作用的药物靶点。通过GO 分析发现13 个直接靶点蛋白的生物学过程主要富集在药物反应,生物刺激的细胞反应,长链脂肪酸的代谢过程,脂肪酸代谢过程,血压调控等。KEGG 通路富集分析发现心惠通直接作用冠心病的通路主要包括cAMP 信号通路、调节脂肪细胞中的脂肪分解等信号通路。结论心惠通方可通过多靶点、多途径发挥防治冠心病的作用,其主要与调节能量代谢、抗凋亡、抗氧化应激等途径相关,为进一步探讨其药效物质基础分析和作用机制研究提供了依据。 展开更多
关键词 心惠通方 冠心病 网络药理学 网络分析 生物信息学
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基于网络药理学预测北沙参治疗肺癌的作用机制
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作者 曹亚娟 方媛 +4 位作者 吴建春 骆莹滨 陈皖晴 方志红 李雁 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2019年第6期1302-1305,1541-1542共5页
目的:预测北沙参治疗原发性支气管肺癌的潜在靶点及信号通路。方法:检索北沙参的化学成分及药物作用靶点及原发支气管肺癌的疾病靶基因。构建蛋白互作网络(PPI)。进而行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,构建可视化的'化合物-靶点... 目的:预测北沙参治疗原发性支气管肺癌的潜在靶点及信号通路。方法:检索北沙参的化学成分及药物作用靶点及原发支气管肺癌的疾病靶基因。构建蛋白互作网络(PPI)。进而行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,构建可视化的'化合物-靶点-通路'网络,并对网络进行拓扑分析。结果:获得8个化合物,173个化合物靶点,1885个肺癌相关靶基因。PPI蛋白互作网络共98个节点,11个关键节点。GO功能富集分析得到100个GO条目,KEGG通路富集分析得到68条信号通路。PPI蛋白互作网路中的11个关键靶点有5个富集在前10位信号通路中,依次为:JUN、EGF、TNF、FOS、MYC。结论:初步预测北沙参治疗原发性支气管肺癌之间的作用途径可能通过靶向JUN、EGF、TNF、FOS、MYC五个关键蛋白起作用。 展开更多
关键词 网络药理学 北沙参 肺癌 蛋白互作网络 机制
基于网络药理学的如意珍宝片治疗中风作用机制研究 预览
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作者 张景媛 吴嘉瑞 +5 位作者 周唯 贾珊珊 郭思宇 倪梦蔚 刘殊羽 孟子琦 《中国医院用药评价与分析》 2019年第3期265-271,共7页
目的:基于网络药理学方法,初步探讨如意珍宝片治疗中风的作用机制。方法:构建中风相关的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;选取如意珍宝片含有的112个活性成分,预测其作用靶点;进而构建如意珍宝片"活... 目的:基于网络药理学方法,初步探讨如意珍宝片治疗中风的作用机制。方法:构建中风相关的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;选取如意珍宝片含有的112个活性成分,预测其作用靶点;进而构建如意珍宝片"活性成分-预测靶点"网络,构建与中风相关的如意珍宝片"活性成分-潜在靶点"网络,进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的生物通路富集分析,研究如意珍宝片治疗中风的作用机制。结果:与中风相关的如意珍宝片"活性成分-潜在靶点"网络包含29个靶点,关键靶点涉及诱导型一氧化氮合酶、内皮型一氧化氮合酶、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基、钠通道蛋白5型α亚基、转录因子AP-1、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3和雌激素受体等;GO条目12个,主要包括蛋白结合、酶结合和RNA聚合酶Ⅱ启动子转录调控;KEGG通路13条,主要涉及肿瘤信号通路、黏着斑和肿瘤中的蛋白多糖等。结论:本研究结果初步验证和预测了如意珍宝片治疗中风的作用机制,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 如意珍宝片 中风 网络药理学 蛋白质-蛋白质相互作用网络 靶点 信号通路
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基于网络药理学的栀子抗胆汁淤积的作用机制研究
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作者 陈浩 高璇 +4 位作者 赵威 俞浩 王宁生 刘汉珍 马世堂 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第13期2709-2718,共10页
运用网络数据挖掘技术筛选栀子治疗胆汁淤积活性成分,并对成分作用潜在靶点与机制进行整合与分析,探究栀子抗胆汁淤积作用机制。采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索21个栀子活性成分,并筛选出作用靶点,利用Cytoscape 3. 2. 1... 运用网络数据挖掘技术筛选栀子治疗胆汁淤积活性成分,并对成分作用潜在靶点与机制进行整合与分析,探究栀子抗胆汁淤积作用机制。采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索21个栀子活性成分,并筛选出作用靶点,利用Cytoscape 3. 2. 1构建成分与靶点网络。通过Dis Ge NET,KEGG,OMIM检索并筛选208个胆汁淤积疾病相关的靶点,整合筛选出栀子成分和胆汁淤积交集关键靶点,利用Cytoscape 3. 2. 1软件构建成分-靶点-疾病网络,以大于平均自由度为筛选条件筛选出核心网络。利用Cytoscape 3. 2. 1软件中Clue GO插件进行栀子抗胆汁淤积调控生物过程和通路富集分析,GO biological process分析得到17条生物过程,显著性筛选P<0. 01富集分析得到参与急性炎症反应、活性氧代谢调节、一氧化氮合成代谢等3条生物过程紧密相关;KEGG-KEEG-305 terms和REACTOME pathways分析得到17条调控通路,显著性筛选P<0. 01富集分析与细胞色素P450对外源化合物代谢、核受体转录、血小板糖蛋白介导激活级联和血小板活化等4条通路有关。通过大鼠实验验证发现,栀子水提物能改善胆汁淤积大鼠的血清生化异常,栀子水提物可以降低肝组织ESR1的蛋白和mRNA水平,升高PPARG,NOS2,F2R,NOS3,NR3C1的蛋白和mRNA水平。综上所述,栀子的抗胆汁淤积作用可能是通过参与急性炎症反应、活性氧代谢正调节、一氧化氮合成代谢生物过程以及细胞色素P450对外源化合物的代谢、核受体转录、血小板糖蛋白激活级联和血小板活化通路来发挥的。 展开更多
关键词 栀子 网络药理学 成分-靶点-疾病网络 胆汁淤积 通路分析
基于网络药理学探讨柴胡-黄芩药对治疗功能性消化不良的作用机制
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作者 龙茜 刘乐平 +5 位作者 郭璇 王小娟 胡媚 王润欣 杨竞翔 田雪飞 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期815-819,共5页
通过临床调研,统计出柴胡-黄芩为治疗功能性消化不良最常用药对,在临床结果的基础上,利用网络药理学和文献调研,按照"药物-靶点-疾病"关联性研究,分析功能性消化不良相关蛋白的互作网络,构建药对活性成分-预测靶点网络,进而... 通过临床调研,统计出柴胡-黄芩为治疗功能性消化不良最常用药对,在临床结果的基础上,利用网络药理学和文献调研,按照"药物-靶点-疾病"关联性研究,分析功能性消化不良相关蛋白的互作网络,构建药对活性成分-预测靶点网络,进而对功能性消化不良相关的柴胡-黄芩药对活性成分-潜在靶点网络进行分析。分析出主要的潜在靶点网络包含18个靶点,关键靶点涉及乙酰胆碱酯酶、细胞色素P450、5-羟色胺受体2B、一氧化氮合酶2、b细胞CLL/淋巴瘤2、丝裂原活化蛋白激酶8、溶质载体家族6成员3等。对潜在靶点进行基因本体功能富集分析得出主要的生物过程及分子功能有调节蛋白质定位的建立、调节蛋白质定位、单一生物代谢过程、对化学品的反应、对含氧化合物的反应及酶结合等。进行KEGG富集通路分析主要通路有内分泌抵抗,癌症的途径,GnRH信号通路,5-羟色胺能突触,钙信号通路,cAMP信号通路等。结果表明柴胡-黄芩药对可以通过多成分、多靶点、多途径共同发挥治疗功能性消化不良的作用。 展开更多
关键词 柴胡-黄芩 功能性消化不良 网络药理学 蛋白互作网络 靶点
经典名方百合地黄汤的化学成分与网络药理学研究
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作者 丁腾 孙宇宏 +5 位作者 杜霞 王乐 龚伟玲 彭秀娟 党艳妮 刘峰 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1848-1856,共9页
目的利用色谱-质谱和网络药理学技术进行经典名方百合地黄汤的化学成分分析和药效成分作用机制的预测。方法利用LC-MS、GC-MS技术分析百合地黄汤化学成分,利用TCMSP数据库分析搜集化学成分、靶点信息,利用TTD、CTD数据库搜集与靶点相关... 目的利用色谱-质谱和网络药理学技术进行经典名方百合地黄汤的化学成分分析和药效成分作用机制的预测。方法利用LC-MS、GC-MS技术分析百合地黄汤化学成分,利用TCMSP数据库分析搜集化学成分、靶点信息,利用TTD、CTD数据库搜集与靶点相关联的疾病,并以抑郁症为目标进行筛选。Cytoscape软件进行'化学成分-靶点-疾病'的网络图的构建,通过DAVID在线分析,对靶点进行KEGG通路分析,并探究其药效成分和作用机制。结果通过色谱-质谱分析共得到了52种化学成分;通过网络药理手段得到百合地黄汤中的25种成分对应的31个靶点与抑郁症相关。结论百合地黄汤治疗抑郁症具有'多向药理学'效应和'叠加'效应,体现中药复杂系统的作用特点;可能通过作用于31个靶点,调节信号通路,参与炎症反应、细胞凋亡、神经递质调节等过程,发挥治疗抑郁症的作用。 展开更多
关键词 经典名方 百合地黄汤 抑郁症 色谱-质谱联用 网络药理学
基于网络药理学的厚朴“发汗”科学内涵探究
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作者 郑义蕾 王潇 +3 位作者 刘芳 章津铭 胡慧玲 傅超美 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1857-1862,共6页
目的利用网络药理学方法建立厚朴'发汗'前后的差异成分-靶点网络,并探究厚朴'发汗'前后药理作用差异的分子机制,进而揭示其发汗的科学内涵。方法通过查阅文献并筛选厚朴'发汗'前后的差异成分。利用SwissTarget ... 目的利用网络药理学方法建立厚朴'发汗'前后的差异成分-靶点网络,并探究厚朴'发汗'前后药理作用差异的分子机制,进而揭示其发汗的科学内涵。方法通过查阅文献并筛选厚朴'发汗'前后的差异成分。利用SwissTarget Prediction预测差异成分的潜在靶点。利用STRING数据库筛选出最高置信度(得分0.900)的靶点并通过Cytoscape 3.6.0软件构建蛋白-蛋白互作网络。最后利用RProject中的clusterProfiler包对蛋白-蛋白互作网络进行GO注释和KEGG通路富集分析。结果通过查阅文献共筛选出9种差异成分(阿西米诺宾、β-桉叶醇、和厚朴酚、厚朴三酚B、木兰花碱、厚朴酚、紫丁香苷、瑞枯灵和magnoloside A)并预测得到137个靶点(除重后共86个)。通过对蛋白-蛋白互作网络GO注释及通路富集分析,共得到550个GO注释和30条KEGG通路。结论数据分析结果表明,'发汗'后厚朴药理作用的改变是化学成分相互作用的最终结果。其中,厚朴主要是通过5-羟色胺能突触、花生四烯酸代谢和钙信号通路发挥镇痛和抗胃溃疡作用。厚朴酚、和厚朴酚及β-桉叶醇等化学成分含量的改变是厚朴'发汗'前后疗效差异的主要原因。 展开更多
关键词 厚朴 网络药理学 发汗 差异成分 靶点
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