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母体肠道菌群失调及其子宫内转移对母胎影响的研究进展 预览
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作者 吕莉娟 李慧 +2 位作者 何薇 段红丽 尹爱华 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2019年第1期116-120,共5页
子宫内有细菌存在,并且可能对胎儿产生影响。母胎间菌群转移的具体作用机制迄今尚未阐明。胎儿肠道菌群的主要来源除了母体血液、胎盘和羊水外,母体肠道亦可能是胎儿肠道菌群的主要来源之一。母体肠道菌群通过血液等途径转移至子宫内,... 子宫内有细菌存在,并且可能对胎儿产生影响。母胎间菌群转移的具体作用机制迄今尚未阐明。胎儿肠道菌群的主要来源除了母体血液、胎盘和羊水外,母体肠道亦可能是胎儿肠道菌群的主要来源之一。母体肠道菌群通过血液等途径转移至子宫内,再经过胎盘血液循环和羊水等途径转移至胎儿肠道和免疫系统。母体孕期肠道菌群的结构与数量,可对孕妇及其子代肥胖、神经系统发育异常和血压调节产生影响。随着基因测序技术的发展,有助于更深入探讨母体肠道菌群失调及其子宫内转移与母胎疾病之间的关系,为胎源性疾病的预防和干预提供理论依据。笔者拟就母体肠道菌群失调及其子宫内转移对母胎影响的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 肠道病毒属 肥胖症 高血压 妊娠性 细菌结构 细菌移位 胎儿 孕妇
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基于高通量测序的黄河三角洲4种人工林土壤细菌结构及多样性研究 预览 被引量:2
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作者 丁新景 黄雅丽 +4 位作者 敬如岩 马风云 安然 田琪 陈博杰 《生态学报》 CSCD 北大核心 2018年第16期5857-5864,共8页
为研究黄河三角洲不同人工林土壤细菌群落特征,应用高通量测序技术,比较分析了刺槐、榆树、白蜡、臭椿4种人工林土壤细菌结构及多样性,并结合土壤理化性质进行相关性分析。结果表明:人工林土壤中共有31门细菌;4种人工林土壤中酸杆菌门... 为研究黄河三角洲不同人工林土壤细菌群落特征,应用高通量测序技术,比较分析了刺槐、榆树、白蜡、臭椿4种人工林土壤细菌结构及多样性,并结合土壤理化性质进行相关性分析。结果表明:人工林土壤中共有31门细菌;4种人工林土壤中酸杆菌门、变形菌门、放线菌门细菌以及刺槐、臭椿人工林土壤中硝化螺旋菌门细菌是土壤中的优势群落。不同人工林土壤中酸杆菌门、变形菌门、硝化螺旋菌门、芽单胞菌门、拟杆菌门、广古菌门、泉古菌门、蓝藻菌门细菌丰度差异显著。刺槐人工林土壤细菌多样性最高;白蜡人工林土壤细菌多样性最低。土壤pH、含水量、有机质含量与酸杆菌门细菌丰度呈显著负相关关系,土壤pH与变形菌门、硝化螺旋菌门、芽单胞菌门细菌丰度呈极显著正相关关系;土壤pH、有效磷含量与人工林细菌多样性呈显著正相关关系。以上研究结果表明,黄河三角洲不同人工林土壤细菌群落存在一定差异,土壤pH、含水量、有机质、有效磷含量是影响土壤细菌结构和多样性的主要土壤因素。 展开更多
关键词 黄河三角洲 人工林土壤 细菌结构 多样性 高通量测序
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水体细菌微生物多波长散射光谱快速定量检测 预览 被引量:2
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作者 王久悦 赵南京 +8 位作者 段静波 孟德硕 方丽 杨瑞芳 肖雪 殷高方 马明俊 刘建国 刘文清 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第2期333-337,共5页
通过分析细菌细胞的结构特征,将细菌菌体的多波长散射分为外部结构散射和内部结构散射两个部分,建立了细菌菌体前向散射光谱解释模型。利用该模型对大肠杆菌400-900nm波段的前向散射光进行了快速解析,得到了大肠杆菌外部结构、内部结构... 通过分析细菌细胞的结构特征,将细菌菌体的多波长散射分为外部结构散射和内部结构散射两个部分,建立了细菌菌体前向散射光谱解释模型。利用该模型对大肠杆菌400-900nm波段的前向散射光进行了快速解析,得到了大肠杆菌外部结构、内部结构的平均粒径大小及两结构占细菌体前向散射的比例;基于单细胞的散射光密度与整体细菌悬浮液光密度之间的关系可以快速检测出细菌的浓度。多次细菌浓度测量结果之间的最大差异为1.83%,且与平板法相比较,测量结果在同一量级,相对误差为3.44%。对不同生长时期的大肠杆菌和肺炎克雷伯菌进行了光谱解析,得到了两种细菌浓度及菌体大小随时间的变化曲线。研究结果不仅为细菌微生物生长过程的科学研究提供了一种快捷方法,而且为水体细菌微生物的快速检测与预警提供了技术手段。 展开更多
关键词 散射光谱 MIE散射 细菌结构 细菌浓度
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气体等离子体对细菌损伤作用的电镜观察 预览 被引量:6
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作者 石兴民 郝炳华 +2 位作者 袁育康 李辛庆 薛晚利 《中国消毒学杂志》 CAS 2003年第4期 284-286,共3页
为探索气体等离子体杀灭细菌的机理,利用扫描电镜技术对紫外线、臭氧以及气体等离子体处理过的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌菌体表面结构进行了分析和比较.结果,紫外线和臭氧处理后,两试验菌表面结构完整,大小形态基本正常,但两者作用后... 为探索气体等离子体杀灭细菌的机理,利用扫描电镜技术对紫外线、臭氧以及气体等离子体处理过的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌菌体表面结构进行了分析和比较.结果,紫外线和臭氧处理后,两试验菌表面结构完整,大小形态基本正常,但两者作用后的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌细胞质比较疏松;等离子体处理后的金黄色葡萄球菌体积比正常菌增大,胞质变疏松,且菌体间出现融合现象,而大肠埃希菌细胞间隔模糊、融合,细菌形态已难以辨认,且菌体间出现中等密度物质.结果显示,臭氧、紫外线处理过的细菌菌体表面结构完整,空气放电等离子体作用后使细菌的表面结构受到破坏;等离子体对革兰阴性菌细胞壁损伤比对革兰阳性菌细胞壁的损伤明显. 展开更多
关键词 等离子体 电镜 细菌结构 大肠埃希菌 金黄色葡萄球菌
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氧化锰集合体的生物矿物微结构 预览
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作者 Г И +1 位作者 Лысюк 朱佛宏 《海洋地质动态》 2005年第4期 21,共1页
关于生物因素在矿物生成中的作用已从不同的角度进行了广泛的讨论.微生物被认为是在一定的条件下一系列矿物形成时所需元素的沉淀剂.在物质表面生成生物薄膜时,微生物起着积极的作用.最后,微生物本身在其生命活动时期,也能形成某些矿物... 关于生物因素在矿物生成中的作用已从不同的角度进行了广泛的讨论.微生物被认为是在一定的条件下一系列矿物形成时所需元素的沉淀剂.在物质表面生成生物薄膜时,微生物起着积极的作用.最后,微生物本身在其生命活动时期,也能形成某些矿物,然而,它们对风化过程也有着实质性的影响. 展开更多
关键词 氧化锰集合体 生物矿物 铁锰结核 海洋矿物 细菌结构
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翻压不同绿肥对植烟土壤细菌类群的影响 预览
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作者 王飞 徐茜 +3 位作者 陈志厚 陈乾锦 杨秋菊 陈爱玲 《江苏农业科学》 2019年第11期317-321,共5页
为探讨绿肥对植烟土壤细菌的影响,以烤烟K326为研究对象,设置CK(不翻压绿肥)、T1(翻压光叶苕子)、T2(翻压黑麦草)和T3(翻压紫云英)等4个处理。结果表明,与CK相比,T2处理土壤细菌在种分类水平上丰度增加得最多;T1、T2、T3处理明显提高土... 为探讨绿肥对植烟土壤细菌的影响,以烤烟K326为研究对象,设置CK(不翻压绿肥)、T1(翻压光叶苕子)、T2(翻压黑麦草)和T3(翻压紫云英)等4个处理。结果表明,与CK相比,T2处理土壤细菌在种分类水平上丰度增加得最多;T1、T2、T3处理明显提高土壤细菌α多样性;旺长期土壤细菌丰度超过2%的属分别是浮霉状菌属(Planctomyces)、假丝酵母菌属(Candidatus Solibacter)、罗丹菌属(Rhodanobacter)、红游动菌属(Rhodoplanes),成熟期土壤细菌丰度超过2%的属为水恒杆菌属(Mizugakiibacter)、Planctomyces、普雷沃氏菌属(Prevotella_9);冗余分析结果表明,旺长期土壤速效钾含量解释了细菌23.50%的变化,成熟期土壤有机质含量解释了细菌群落23.50%的变化;T1、T2、T3处理在旺长期均能显著降低烟草青枯病致病菌(Ralstonia)丰度,T3处理显著增加了旺长期和成熟期土壤中苯基杆菌属(Phenylobacterium)、固氮螺菌属(Inquilinus)、贪铜菌属(Cupriavidus)等3个固氮菌属丰度。说明翻压绿肥可以在一定程度上改善植烟土壤细菌结构。 展开更多
关键词 绿肥 烤烟 土壤细菌结构 丰度 16S rDNA测序 多样性指数 土壤微生物群落 连作障碍
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应用GC—MS技术测定细菌结构脂肪酸鉴定脂环酸芽孢杆菌的研究 被引量:1
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作者 李儒 张雅珩 张宇霞 《食品工业》 北大核心 2013年第5期222-224,共3页
脂环酸芽孢杆菌菌体细胞膜的主要脂肪酸成分是含6个或7个ω环状脂肪酸,将其转化为脂肪酸甲酯,通过皂化、甲基化后提取脂肪酸甲基酯,用气相色谱质谱仪测定脂肪酸的类型及含量,试验结果与笔者利用PcR方法和Ribmprinter核糖体基因分型... 脂环酸芽孢杆菌菌体细胞膜的主要脂肪酸成分是含6个或7个ω环状脂肪酸,将其转化为脂肪酸甲酯,通过皂化、甲基化后提取脂肪酸甲基酯,用气相色谱质谱仪测定脂肪酸的类型及含量,试验结果与笔者利用PcR方法和Ribmprinter核糖体基因分型结果相一致,可在实践中应用脂肪酸测定法鉴定脂环酸芽孢杆菌。 展开更多
关键词 细菌结构脂肪酸 气相色谱质谱仪 细菌鉴定
厌氧氨氧化微生物研究进展 预览 被引量:9
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作者 李祥 袁怡 +1 位作者 黄勇 王勇 《环境科技》 2009年第2期 58-61,共4页
厌氧氨氧化技术是近年来发展起来的新型生物脱氯技术。在这一过程中主要作用细菌是厌氧氨氧化菌。目前越来越多的学者开始研究厌氧氨氧化菌,这对于厌氧氨氧化技术发展与推广具有重要的意义。文章从目前厌氧氨氧化菌研究进展的角度,综... 厌氧氨氧化技术是近年来发展起来的新型生物脱氯技术。在这一过程中主要作用细菌是厌氧氨氧化菌。目前越来越多的学者开始研究厌氧氨氧化菌,这对于厌氧氨氧化技术发展与推广具有重要的意义。文章从目前厌氧氨氧化菌研究进展的角度,综述了目前发现的厌氧氨氧化菌种类,结构和部分结构的功能。以期待对工艺控制有所帮助。 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 厌氧氨氧化菌 厌氧氨氧化体 细菌结构功能
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茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响 预览
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作者 李艳春 林忠宁 +1 位作者 陆烝 刘明香 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期690-696,共7页
【目的】探讨茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响,为茶菌间作模式的应用提供科学依据。【方法】应用高通量测序技术分析比较了间作灵芝茶园与单作茶园之间土壤细菌群落变化。【结果】与单作茶园(CK)相比,间作灵芝茶园土壤的... 【目的】探讨茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响,为茶菌间作模式的应用提供科学依据。【方法】应用高通量测序技术分析比较了间作灵芝茶园与单作茶园之间土壤细菌群落变化。【结果】与单作茶园(CK)相比,间作灵芝茶园土壤的有机质、全氮、速效氮和有效磷含量显著提高,速效钾含量和pH显著降低,而全磷和全钾含量变化不显著。间作灵芝茶园处理的土壤细菌群落丰度指数和多样性指数与单作茶园相比无显著性差异。与单作茶园相比,间作灵芝茶园土壤的变形菌门相对丰度显著提高21.18%,而酸杆菌门和芽单胞菌门的相对丰度显著降低15.09%和53.52%,其他细菌门类变化不显著。在属水平上,间作灵芝处理显著提高了土壤有益微生物菌群伯克氏菌属Burkholderia、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas和戴氏菌属Dyella的相对丰度。相关性分析表明,土壤pH、全氮、全磷和速效钾对优势细菌群落的影响较大。【结论】茶园间作灵芝改变了土壤细菌群落结构并提高了土壤中有益微生物菌群的相对丰度,但对土壤细菌群落多样性的影响不明显。 展开更多
关键词 间作 细菌多样性 细菌群落结构 茶园 高通量测序
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南方红壤丘陵区土壤细菌对土壤水分和温度的响应差异 预览
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作者 杨杰 陈闻 +3 位作者 侯海军 陈春兰 秦红灵 吕殿青 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期609-615,共7页
红壤丘陵区稻田不同时期进行的水分管理导致土壤水分和温度同时变化,继而影响土壤微生物群落结构,二者对土壤微生物的影响机制目前还不清楚。本研究以中国科学院桃源农业生态实验站长期定位试验的稻田作为研究对象,同时以旱地农田作为对... 红壤丘陵区稻田不同时期进行的水分管理导致土壤水分和温度同时变化,继而影响土壤微生物群落结构,二者对土壤微生物的影响机制目前还不清楚。本研究以中国科学院桃源农业生态实验站长期定位试验的稻田作为研究对象,同时以旱地农田作为对照,利用末端限制性酶切片段长度多态性分析(T-RFLP)和荧光定量PCR(qPCR)方法,研究不同水分管理时期细菌群落结构与丰度的变化特征,进而分析其变化的影响因素,阐明水分和温度的相对贡献。结果表明,稻田土壤细菌受土壤水分状况的显著影响,淹水期土壤细菌群落结构明显区别于其他时期,且淹水期土壤细菌丰度和多样性指数均显著低于晒田期。稻田土壤细菌群落结构和多样性指数均受到土壤含水量和土壤温度的显著影响,但土壤含水量的相关性大于土壤温度。而作为对照的旱地农田土壤含水量在不同时期没有差异,土壤细菌群落结构也没有差异,仅土壤细菌丰度和多样性指数发生一定变化,但这种变化并不与土壤温度呈现相关性。因此,本研究认为,南方丘陵区农田土壤细菌对土壤水分的响应比对土壤温度更敏感。 展开更多
关键词 稻田 旱地 细菌群落结构 细菌丰度 土壤水分 土壤温度
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长期施氮对马铃薯田土壤剖面硝态氮积累及细菌群落结构的影响 预览
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作者 张健 董星晨 +4 位作者 张鹤 邓德雷 罗超越 张春红 邱慧珍 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期30-41,共12页
【目的】揭示长期连续施氮对半干旱地区马铃薯田土壤剖面中硝态氮积累及细菌群落结构的影响.【方法】通过大田试验设置了6个不同的施氮水平:N0(不施氮,对照)、N75(施氮量75 kg/hm2)、N150(施氮量150 kg/hm2)、N225(施氮量225 kg/hm2)、N... 【目的】揭示长期连续施氮对半干旱地区马铃薯田土壤剖面中硝态氮积累及细菌群落结构的影响.【方法】通过大田试验设置了6个不同的施氮水平:N0(不施氮,对照)、N75(施氮量75 kg/hm2)、N150(施氮量150 kg/hm2)、N225(施氮量225 kg/hm2)、N300(施氮量300 kg/hm2)和N375(施氮量375 kg/hm2),研究连续4年施氮对旱地马铃薯田土壤剖面中硝态氮的积累以及细菌群落结构的影响.【结果】随着施氮量增加,0~100 cm土壤剖面内NO3--N含量显著增加(P<0.05),尤其0~20 cm土壤表层各施氮处理的NO3--N含量分别比对照N0增加了55.8%,113.9%,162.8%,365.1%和988.4%.Miseq高通量测序结果显示,连续施氮显著改变了0~20 cm表层土壤的细菌群落结构,在门水平上的土壤优势细菌类群中,随着施氮量增加,各施氮处理土壤放线菌门和拟杆菌门的细菌的丰度分别比对照N0处理增加了6.1%~17.4%和16.4%~46.8%,酸杆菌门的丰度比对照降低了7.8%~26.4%;在纲水平上的土壤优势细菌类群中,与对照N0相比,各施氮处理拟杆菌纲细菌的丰度增加了33.8%~173.3%,AcidobacterGp4和Anaerolineae的相对丰度分别降低16.3%~33.8%、8.1%~22.7%;在属水平上的土壤优势细菌类群中,各施氮处理的Ohtaekwangia和Streptomyces细菌的丰度分别比对照增加了33.6%~173.1%和3.4%~66.4%,而Gaiella和Solirubrobacter细菌的丰度分别比对照N0降低了6.9%~30.8%和4.5%~27.6%.连续4 a过量施氮也显著降低了土壤细菌的群落多样性.RDA冗余分析及相关性分析结果表明,土壤NO3--N含量与放线菌门、拟杆菌门、拟杆菌纲、Ohtaekwangia、Streptomyces(链霉菌属)和Lysobacter(溶杆菌属)的细菌的丰度显著正相关,与酸杆菌门、Gaiella、Solirubrobacter(土壤红杆菌属)、Gemmatimonas(芽单胞菌属)的细菌的丰度显著负相关.【结论】连续4 a施氮,随着施氮量增加,显著地提高了土壤剖面中硝态氮的含量,与对照N0相比,0~20 cm表层土壤细菌丰度随着施氮量� 展开更多
关键词 NO3--N含量 细菌Alpha多样性 细菌群落结构 相关性分析
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肝硬化患者肠道细菌群落结构及其影响因素的研究
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作者 张磊 吴永娜 +3 位作者 张静 陈拓 李汛 刘光琇 《中华消化内镜杂志》 CSCD 北大核心 2019年第4期277-282,共6页
目的探讨肝硬化患者肠道细菌群落结构及其影响因素。方法2016—2017年兰州大学第一医院普外科、肝病科24名肝硬化患者(LC组)及同期陪床家属23名(HC组),运用16S rRNA基因高通量测序方法,对肝硬化患者(LC)和健康人(HC)肠道细菌群落结构进... 目的探讨肝硬化患者肠道细菌群落结构及其影响因素。方法2016—2017年兰州大学第一医院普外科、肝病科24名肝硬化患者(LC组)及同期陪床家属23名(HC组),运用16S rRNA基因高通量测序方法,对肝硬化患者(LC)和健康人(HC)肠道细菌群落结构进行了比较研究。结合LEfSe分析和NMDS分析,筛选差异标记物,探究肝硬化肠道细菌群落结构影响因素。结果在门水平上LC和HC肠道细菌优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroides)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、梭菌门(Fusobacteria)和软壁菌门(Tenericutes)等6个菌门。其中,厚壁菌门在LC显著降低,拟杆菌门在LC显著升高。LC肠道细菌多样性降低,厚壁菌门/拟杆菌门比显著下降,肝硬化患者肠道细菌群落结构发生了改变。LEfSe分析表明肠球菌属(Enterococcus)、乳酸菌目(Lactobacillales)、芽孢杆菌纲(Bacilli)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度在LC组呈现出显著差异,可作为潜在的标记细菌类群。NMDS分析表明LC组中镉与铅元素浓度与肠道细菌丰度呈正相关。结论肝硬化患者肠道细菌群落结构发生了改变。肠球菌属、乳酸菌目、芽孢杆菌纲和拟杆菌门作为潜在的标记细菌类群。LC组肠道镉和铅浓度可能与细菌丰度与结构发生相互作用,进而影响肝硬化的发生与发展。 展开更多
关键词 肝硬化 肠道细菌 细菌群落结构 影响因素
永定河怀来段冬季表层沉积物细菌群落特征及其主要影响因子 预览
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作者 赵建国 翟学正 +4 位作者 郭祥 王叶姣 王江华 周紫梦 姜甜甜 《环境工程技术学报》 CAS 2019年第5期544-551,共8页
对永定河怀来段冬季表层沉积物及上覆水水质指标进行分析,通过高通量测序技术研究沉积物细菌群落结构及多样性,并对沉积物细菌群落结构与环境因子进行相关性分析。结果表明:永定河怀来段冬季表层沉积物OTUs数量平均为7357;表层沉积物门... 对永定河怀来段冬季表层沉积物及上覆水水质指标进行分析,通过高通量测序技术研究沉积物细菌群落结构及多样性,并对沉积物细菌群落结构与环境因子进行相关性分析。结果表明:永定河怀来段冬季表层沉积物OTUs数量平均为7357;表层沉积物门水平的细菌优势种群包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)和厚壁菌门(Firmicutes)等,表层沉积物属水平细菌优势种群并不明显;沉积物细菌Shannon指数为8.135~10.647,ACE指数为6060.643~7182.679,Chao1指数为5553.562~6967.912,香蒲湿地沉积物中细菌的种类最为丰富,支流冰封水体表层沉积物中细菌种类较少;沉积物有机磷(OP)与氨氮(NH4^+-N)浓度,上覆水总磷(TP)与亚硝氮(NO-2-N)浓度是沉积物中细菌丰度的主要影响因子,沉积物中细菌丰度与沉积物OP、NH4^+-N浓度呈负相关,与上覆水TP、NO-2-N浓度呈正相关。 展开更多
关键词 永定河流域 表层沉积物 细菌群落结构 高通量测序
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芒草种植对土壤细菌群落结构和功能的影响
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作者 段鹏飞 陈彦 +4 位作者 张菲 韩辉 庞发虎 陈兆进 田伟 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期2030-2038,共9页
芒草作为第二代能源植物的代表,其生长过程中根际土壤细菌群落的结构与功能尚不清楚.本研究以种植5年的芒草(湘杂芒1号)为研究对象,选取裸地作为对照,采用16S rRNA基因Miseq测序技术研究其细菌群落组成,同时采用PICRUSt功能预测分析其功... 芒草作为第二代能源植物的代表,其生长过程中根际土壤细菌群落的结构与功能尚不清楚.本研究以种植5年的芒草(湘杂芒1号)为研究对象,选取裸地作为对照,采用16S rRNA基因Miseq测序技术研究其细菌群落组成,同时采用PICRUSt功能预测分析其功能.结果表明:芒草根际细菌由变形菌门、酸杆菌门、放线菌门、绿弯菌门、拟杆菌门和芽单胞菌门等23个门、231个属的细菌组成,表现出群落组成的丰富性.细菌群落分析表明,种植湘杂芒1号改变了根际细菌群落结构,其细菌群落多样性低于裸地对照.PICRUSt功能预测分析表明,湘杂芒1号根际细菌主要涉及氨基酸运输和代谢、细胞壁/细胞膜/膜结构的生物合成、信号转导机制等24个基因功能家族,表现出功能上的丰富性,并有22个基因功能家族预测基因相对丰度高于裸地,表明种植湘杂芒1号提高了根际细菌功能.对氮、磷循环相关基因进行分析表明,种植湘杂芒1号改变了土壤氮、磷代谢能力. 展开更多
关键词 芒草 细菌群落结构 高通量测序 PICRUSt分析
祁连山中段退化高寒草地土壤细菌群落分布特征 预览
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作者 李海云 姚拓 +6 位作者 马亚春 张慧荣 路晓雯 杨晓蕾 夏东慧 张建贵 高亚敏 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期170-179,共10页
为探究祁连山中段不同退化高寒草地土壤细菌群落分布特征,采用Illumina HiSeq PE250高通量测序平台对轻度、中度和重度退化草地土壤细菌群落变化特征进行研究,并对土壤细菌群落与土壤酶活性、土壤理化因子间关系进行分析。结果表明:随... 为探究祁连山中段不同退化高寒草地土壤细菌群落分布特征,采用Illumina HiSeq PE250高通量测序平台对轻度、中度和重度退化草地土壤细菌群落变化特征进行研究,并对土壤细菌群落与土壤酶活性、土壤理化因子间关系进行分析。结果表明:随着退化程度加剧,植被盖度、高度、地上生物量和多样性指数均明显降低(P<0.05);土壤理化性质和酶活性变化各异且差异显著(P<0.05)。高通量测序共得到257971条有效序列,219017条优质序列和2004个OTUs。细菌群落丰富度指数依次为轻度>中度>重度,多样性指数为轻度>重度>中度,Beta多样性分析表明各样地间差异为轻度>重度>中度。其中,放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)为3种退化草地土壤的优势菌门,在轻度、中度和重度退化草地土壤中分别占77.25%、84.27%和78.66%;乳球菌属为3种退化草地土壤的优势菌属,在轻度、中度和重度退化草地土壤中分别占14.29%、38.84%和7.39%。冗余分析表明:土壤酶活性和土壤理化性质均对细菌群落的组成具有影响,其中土壤pH是影响土壤细菌群落分布的主要驱动因子。祁连山中段不同退化高寒草地土壤细菌群落的变化主要受土壤理化性质和酶活性的影响。 展开更多
关键词 祁连山 高寒草地 退化草地 高通量测序 细菌群落结构
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灞河流域DOM荧光光谱特征及其对细菌组成的影响 预览
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作者 袁博 吴巍 +2 位作者 郭梦京 郑兴 周孝德 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第8期3383-3395,共13页
为了探讨溶解性有机质(DOM)来源组成对细菌群落结构和多样性的影响,以及细菌群落结构在控制DOM组成及降解中的作用,本研究基于三维荧光光谱-平行因子分析(EEM-PARAFAC)技术研究了灞河水体枯水期(12月)DOM的荧光组分特征及空间分布变化;... 为了探讨溶解性有机质(DOM)来源组成对细菌群落结构和多样性的影响,以及细菌群落结构在控制DOM组成及降解中的作用,本研究基于三维荧光光谱-平行因子分析(EEM-PARAFAC)技术研究了灞河水体枯水期(12月)DOM的荧光组分特征及空间分布变化;采用高通量测序技术分析了水体中细菌群落特征.结果表明:灞河水体DOM荧光组分中含有3个腐殖质类组分(C1:240,320/400nm;C2:260-295/478-504nm;C5:240/480nm)和2个蛋白类组分(C3:240,272~284/350~360nm;C4:255~275/326~336nm),5组分之间相关性较好,表明这2类荧光组分具有相似的来源属性;灞河水体门水平中相对丰度最高的为变形菌门(Proteobacteria,54.22%),其次为拟杆菌门(Bacteroidetes,19.40%)、厚壁菌门(Firmicutes,12.28%)、蓝藻菌门(Cyanobacteria,6.46%)和放线菌门(Actinobacteria,3.13%);河流水体中的营养盐含量、水温、电导率及pH值均对细菌群落组成有一定影响.DOM各组分与浮游菌群表现出一定相关关系,且腐殖类和蛋白类组分沿河流纵向梯度对比明显,不同细菌群落对DOM的质量和不稳定性可能有不同的反应.本研究可为河流生物地球化学过程对微生物种群组成和功能影响的研究提供一定的基础数据. 展开更多
关键词 溶解性有机质 细菌群落结构 高通量测序 环境影响因子
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不同饲粮条件下湖北黑头羊瘤胃细菌多样性及群落结构分析
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作者 张年 陈明新 索效军 《畜牧与兽医》 北大核心 2019年第5期17-23,共7页
旨在研究不同饲粮条件下湖北黑头羊瘤胃细菌多样性及群落结构。选取15只健康的湖北黑头山羊公羊,随机分为5组,每组3只,分别饲喂花生藤(A组)、苜蓿(B组)、苜蓿+花生藤(C组)为粗饲料来源的颗粒型全混合日粮以及进口苜蓿草颗粒(D组)和新疆... 旨在研究不同饲粮条件下湖北黑头羊瘤胃细菌多样性及群落结构。选取15只健康的湖北黑头山羊公羊,随机分为5组,每组3只,分别饲喂花生藤(A组)、苜蓿(B组)、苜蓿+花生藤(C组)为粗饲料来源的颗粒型全混合日粮以及进口苜蓿草颗粒(D组)和新疆苜蓿草颗粒(E组),试验期共45 d,其中预试期15 d。在试验结束后第1天,经口腔抽取瘤胃液抽提基因组DNA,采用Illumina Miseq PE300平台对瘤胃细菌进行分析。结果表明:1)在97%相似性水平下,5组样品共产生851个操作分类单元(OTU),共享295个OTU,占瘤胃液细菌总OTU数目的34.67%,D组在各组中α多样性指数指标(Ace指数、Chao1指数和Shannnon指数)最高,而3组颗粒型全混合日粮中A、C组高于B组(P<0.05,P<0.01);2)瘤胃中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、无壁菌门(Tenericutes)为各组优势菌门,D组中的拟杆菌门显著高于B组(P<0.05),而厚壁菌门显著低于D组(P<0.05),而A、B、C组间拟杆菌门、厚壁菌门含量差异不显著(P>0.05);3)普雷沃氏菌属1(Prevotella_1)、1种未鉴定的属(Unidentified genus)、理研菌属RC9(Rikenellaceae_RC9_gut_group)为优势菌属,其中D组普雷沃氏菌属含量较高,A组与C组,D组与E组的遗传距离更接近。综合得出,苜蓿草颗粒品质和颗粒型全混合日粮中精料含量能影响湖北黑头羊瘤胃细菌的多样性;全苜蓿饲粮条件下湖北黑头羊瘤胃存在独特的细菌群落结构,细菌多样性最高。 展开更多
关键词 细菌群落结构 高通量测序 饲粮组成 瘤胃
基于高通量测序的人工湿地微生物群落分析 预览
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作者 范海青 王凌文 +1 位作者 王丹 殷操 《科技通报》 2019年第2期213-219,共7页
为了深入探索农村生活污水人工湿地中微生物群落的物种多样性、结构多样性和功能多样性,利用高通量测序技术对系统中土壤、植物根系及砾石区域细菌16S rRNA的V3-V4区进行深度测序及PICRUSt基因功能预测。结果显示,农村生活污水人工湿地... 为了深入探索农村生活污水人工湿地中微生物群落的物种多样性、结构多样性和功能多样性,利用高通量测序技术对系统中土壤、植物根系及砾石区域细菌16S rRNA的V3-V4区进行深度测序及PICRUSt基因功能预测。结果显示,农村生活污水人工湿地处理系统中,土壤、根系及砾石生物膜上细菌群落多样性、组成和功能各有不同,而植物根系群落结构的演变更有利于污水处理:根系细菌群落物种多样性(OTU系列总数和Shannon指数)和优势细菌种类均大于砾石或土壤;两种湿地植物(滴水观音和美人蕉)的根系细菌群落表现出一定的差异:美人蕉根系中以产碱杆菌属(27%)、黄杆菌属(29%)、溶杆菌属(30%)和假单胞菌属(13%)为优势细菌,滴水观音根系以乳球菌属(28%)、黄杆菌属(20%)和假单胞菌属(34%)为优势细菌;KEGG结果表明根系代谢功能与土壤及砾石区均存在差异(p<0.05)差异且KO基因预测证实根系代谢能力最大。COG功能预测显示美人蕉根系代谢强度高于滴水观音。农村生活污水处理的主要代谢酶基因,如双加氧酶、脱氢酶、磷酸盐脱氢酶、脲酶、硝酸还原酶和过氧化氢酶基因中脱氢酶基因的丰度最高,并且美人蕉根系的功能基因丰度值最大。这些结果为高效构建处理农村生活污水生态系统提供理论依据。 展开更多
关键词 人工湿地 农村生活污水处理 细菌群落结构 高通量测序 16 s RRNA PICRUSt基因预测
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微生物膜法处理高含盐废水的细菌群落特征 预览
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作者 卜魁勇 帅异莹 +4 位作者 周少雄 郭巍 程萍 李平原 章春芳 《工业安全与环保》 2019年第8期92-95,共4页
新疆某油田公司某污水处理站采用生物膜法处理高含盐废水,经过2个月的运行调试,该生物处理系统能稳定高效地去除废水中COD、石油类、氨氮、BOD以及硫化物。为了了解该好氧接触氧化处理系统中起主要作用的微生物种群,采用高通量测序技术... 新疆某油田公司某污水处理站采用生物膜法处理高含盐废水,经过2个月的运行调试,该生物处理系统能稳定高效地去除废水中COD、石油类、氨氮、BOD以及硫化物。为了了解该好氧接触氧化处理系统中起主要作用的微生物种群,采用高通量测序技术分析了接触氧化池在不同阶段(调试期和正式运行期)与不同级别氧化池中微生物膜的细菌群落结构,并分析了其功能分区。 展开更多
关键词 高含盐废水 好氧接触氧化池 细菌群落结构 COD
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辽东山区典型人工针叶林土壤细菌群落多样性特征 预览
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作者 邓娇娇 周永斌 +3 位作者 殷有 魏亚伟 秦胜金 朱文旭 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期997-1008,共12页
为揭示不同人工林树种对土壤养分和土壤微生物群落的影响,采用Illumina MiSeq高通量测序和OTU分析法比较辽东山区白石砬子自然保护区落叶松人工林(LGe)和红松人工林(PKe),以及辽宁省森林经营研究所实验林场落叶松人工林(LGd)和红松人工... 为揭示不同人工林树种对土壤养分和土壤微生物群落的影响,采用Illumina MiSeq高通量测序和OTU分析法比较辽东山区白石砬子自然保护区落叶松人工林(LGe)和红松人工林(PKe),以及辽宁省森林经营研究所实验林场落叶松人工林(LGd)和红松人工林(PKd)土壤细菌群落结构的差异,同时测定土壤理化性质,探讨土壤细菌群落结构、树种和土壤环境因子的相关性。研究结果表明:(1)LGe和PKe土壤全碳、全氮和碱解氮的含量无显著差异,LGd显著高于PKd。(2)从群落组成来看,该地区落叶松和红松人工林中土壤主要由34个门类群的菌群组成,优势菌群包括变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门、疣微菌门和芽单胞菌门。(3)从群落结构来看,LGe和PKe土壤细菌的多样性和丰富度指数无显著差异,PKd的多样性指数显著极高于LGd,丰富度指数无显著差异,且Metastats分析结果表明,较LGd和PKd相比,LGe和PKe在门水平和属水平上显著差异的个数较少,表现为趋同性。(4)优势细菌类群相对丰度和土壤理化性质的RDA和相关性分析表明,土壤p H、全氮、碱解氮的含量以及C/N是本区针叶林细菌群落结构的主要影响因子。综合分析表明,在保护区选择单一树种落叶松或红松造林对改善土壤养分及优化微土壤细菌群落结构无显著差异,而在实验林场选择落叶松更有利于提高土壤肥力。 展开更多
关键词 辽东山区 针叶林 高通量测序 细菌群落结构
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