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猕猴桃病毒A和B在陕西省的分布、分子变异与基因组研究 认领
1
作者 赵磊 张元乐 +5 位作者 黄倩茹 侯彩婷 吴宽 曹孟籍 王乔春 吴云锋 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1383-1390,共8页
系统调查了中国陕西省猕猴桃主产区周至、眉县、杨凌和汉中‘徐香’、‘海沃德’、‘华优’和‘秦美’猕猴桃上猕猴桃病毒A(Ac VA)和猕猴桃病毒B(Ac VB)的带毒率和分布情况。结果表明,Ac VA和Ac VB在4个产区均有广泛地分布和较高的带毒... 系统调查了中国陕西省猕猴桃主产区周至、眉县、杨凌和汉中‘徐香’、‘海沃德’、‘华优’和‘秦美’猕猴桃上猕猴桃病毒A(Ac VA)和猕猴桃病毒B(Ac VB)的带毒率和分布情况。结果表明,Ac VA和Ac VB在4个产区均有广泛地分布和较高的带毒率。其中,Ac VA和Ac VB分别在杨凌(36.7%)和眉县(36.9%)有最高的带毒率。按照品种划分,Ac VA(32.3%)和Ac VB(32.9%)均在‘徐香’品种上有最高的带毒率。通过高通量测序与分析获得了Ac VA和Ac VB的基因组序列,其分别由7654和7454个核苷酸组成,与之前报道的TP7-93A和TP7-93B分离物对应的同源率分别为82.7%和78.5%。Ac VA和Ac VB外壳蛋白基因系统发育树显示,2种病毒分成2个组,存在较大的分子变异。 展开更多
关键词 猕猴桃 猕猴桃病毒A 猕猴桃病毒B 基因组 分子变异 病毒检测
四川省猕猴桃病毒A外壳蛋白基因的序列分析、原核表达及抗血清制备 认领
2
作者 吕蕊 彭期定 +3 位作者 杨婷 林宏辉 董家红 席德慧 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1121-1129,共9页
【目的】研究猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,AcVA)的发生及其多样性,为我国猕猴桃产业中AcVA病毒的快速检测、科学防控以及猕猴桃品种选育提供科学依据。【方法】通过巢式PCR从四川省猕猴桃感病叶片中扩增AcVA CP基因序列,进行序列分... 【目的】研究猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,AcVA)的发生及其多样性,为我国猕猴桃产业中AcVA病毒的快速检测、科学防控以及猕猴桃品种选育提供科学依据。【方法】通过巢式PCR从四川省猕猴桃感病叶片中扩增AcVA CP基因序列,进行序列分析和同源性比对;构建AcVA CP基因的原核表达载体,诱导目的蛋白表达后制备抗血清,用Western blot检测效价。【结果】克隆到3个AcVA四川分离株的完整CP基因序列,成功构建了pET28a-AcVA-DJY4-CP重组质粒,原核表达目的蛋白并制备出特异性抗血清,效价达到1∶5 000。【结论】首次获得了3个AcVA四川分离株,丰富了AcVA的序列多样性,并探索了原核表达的最佳条件,制备了高效价抗血清,为今后AcVA病毒的快速检测和防控提供了技术支撑。 展开更多
关键词 猕猴桃病毒A 外壳蛋白 序列分析 原核表达 抗血清制备
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猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究 认领 被引量：5
3
作者 郑亚洲 王国平 +4 位作者 周菊芳 朱晨熹 王利平 徐文兴 洪霓 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期665-671,共7页
为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集... 为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现Ac VA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3%~99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,Ac VA分离物聚为2~3组。采用引物Ac VB5F/5R扩增获得20个Ac VB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81%~100%,与新西兰Ac VB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9%~99.7%,在系统进化树中聚为3组。 展开更多
关键词 猕猴桃 猕猴桃病毒A 猕猴桃病毒B RT-PCR 序列分析
四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析 认领 被引量：1
4
作者 彭期定 吕蕊 +2 位作者 杨婷 林宏辉 席德慧 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期120-126,共7页
为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1(Actinidia virus 1,AcV-1)在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性,采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检... 为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1(Actinidia virus 1,AcV-1)在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性,采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检测。结果表明,22份样品为AcV-1阳性,检出率为24.4%。将获得的5个AcV-1分离物和已报道的新西兰分离物K75的外壳蛋白(coatprotein,CP)基因序列进行比对,结果表明,分离物间核苷酸序列和氨基酸序列的相似性分别为84.8%~97.1%和89.7%~99.6%,其中除邛崃分离物HYH5与新西兰分离物K75的核苷酸序列相似性较高(97.1%)外,其余4个分离物均低于91%。系统进化分析结果显示,这些分离物主要聚集在3个分支上,分离物HYH5与新西兰分离物K75位于同一分支,其余分离物位于另外2个分支。 展开更多
关键词 猕猴桃 猕猴桃病毒1 RT-PCR CP基因 分子特征
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