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茉莉生殖发育与分子生物学特性研究分析 预览
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作者 邓衍明 齐香玉 苏家乐 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期270-277,共8页
茉莉花的观赏、茶用和药用价值均较高,是重要的花茶和香精原料,目前生产上使用的主要为双瓣茉莉,但双瓣茉莉经过多年的无性繁殖和长期使用会出现品种性退化,导致其抗性和产花量均降低。为全面了解茉莉生殖发育特性和分子生物学特性研究... 茉莉花的观赏、茶用和药用价值均较高,是重要的花茶和香精原料,目前生产上使用的主要为双瓣茉莉,但双瓣茉莉经过多年的无性繁殖和长期使用会出现品种性退化,导致其抗性和产花量均降低。为全面了解茉莉生殖发育特性和分子生物学特性研究现状,本文综述了国内外关于茉莉雌、雄性生殖器官的发育,分子标记开发,遗传多样性分析及功能基因克隆等基础研究方面的进展,并对今后茉莉生殖发育和分子生物学特性方面的主要研究方向和研究重点进行了展望,以期为克服茉莉结实障碍,实现品种改良、种质创新和重要性状的分子解析及分子设计育种等提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 茉莉花 生殖发育 分子标记 遗传多样性 次生代谢
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滇中牛Y-SNPs和Y-STRs遗传多样性研究 预览
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作者 贾鹏 王凯悦 +5 位作者 亐开兴 张继才 黄必志 苏相生 陈宏 雷初朝 《中国牛业科学》 2019年第4期7-9,62共4页
[目的]为探究云南滇中牛的Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]采用PCR扩增和荧光分型方法,对27头滇中牛的Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行分析。[结果]27头... [目的]为探究云南滇中牛的Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据。[方法]采用PCR扩增和荧光分型方法,对27头滇中牛的Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行分析。[结果]27头滇中牛包含Y2和Y3两种单倍型组,其频率分别为22.22%和77.78%。结合Y-SNPs和Y-STRs的分型结果,发现这27头滇中牛存在Y2-90-158、Y3-88-156和Y3-90-156共3种Y染色体单倍型(Y-SNP-INRA189-BM861),Y染色体单倍型多样度为0.5128±0.0904,其遗传多样性较高。[结论]滇中牛Y染色体遗传多样性较高,有普通牛和瘤牛2个父系起源,以瘤牛血统为主。 展开更多
关键词 滇中牛 Y-SNPS Y-STRS 遗传多样性 父系起源
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不同天然居群小蓬竹的遗传多样性 预览
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作者 管睿婷 刘济明 +3 位作者 王敏 陈敬忠 武梦瑶 童炳丽 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期740-751,共12页
从分子水平探讨不同居群小蓬竹的遗传多样性以及与环境因子的相关性,揭示其濒危原因,为小蓬竹的保护和后续开发利用提供理论支撑,助力实施极危物种最佳保护策略。运用RAPD标记技术和POPGENE32对16个小蓬竹天然居群进行遗传多样性研究和... 从分子水平探讨不同居群小蓬竹的遗传多样性以及与环境因子的相关性,揭示其濒危原因,为小蓬竹的保护和后续开发利用提供理论支撑,助力实施极危物种最佳保护策略。运用RAPD标记技术和POPGENE32对16个小蓬竹天然居群进行遗传多样性研究和遗传变异分析。结果表明,8个RAPD随机引物共扩增出105条清晰、重复性高的条带,其中多态性条带有98条,分子量300~2000bp;物种水平多态性位点百分率PPL=93.33%,有效等位基因数Ne=1.4942,Nei’s基因多样性H=0.3005,Shannon多样性指数I=0.4586;落湾(ZY1)居群的遗传多样性水平最高(PPL=60.95%,H=0.2329,I=0.3451),[JP3]桃坡(PT1)居群的最低(PPL=44.76%,H=0.1700,[JP]I=0.2523);16个天然居群的遗传分化系数Gst=0.3231,基因流Nm=1.0478,基于Shannon’s多样性指数的分化系数[(HSP-HPOP)/HSP]为0.3429。小蓬竹居群内存在丰富的遗传多样性,各个天然居群间具有一定的遗传分化但分化水平并不高,主要的遗传变异存在于居群内部。 展开更多
关键词 极危植物 天然居群 遗传多样性 RAPD 基因
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基于线粒体基因nd5对长江上游黑尾近红鲌遗传多样性分析 预览
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作者 严太明 王雄延 +6 位作者 罗杰 李松 张骞 何亮 张松培 何佳洋 何智 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期717-722,共6页
【目的】了解长江上游黑尾近红鲌野生群体遗传资源现状。【方法】采用线粒体基因nd5序列分析法对采集自龙溪河(LOR)、濑溪河(LAR)和长江干流合江段(HJ)的89个黑尾近红鲌样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析。【结果】PCR扩增和产物测... 【目的】了解长江上游黑尾近红鲌野生群体遗传资源现状。【方法】采用线粒体基因nd5序列分析法对采集自龙溪河(LOR)、濑溪河(LAR)和长江干流合江段(HJ)的89个黑尾近红鲌样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析。【结果】PCR扩增和产物测序后,获得1 668 bp黑尾近红鲌nd5序列,各种群序列碱基组成均表现出明显的A+T偏倚性。多态性遗传参数分析显示,89尾个体中共检测到6个单倍型,干流种群特有单倍型数量明显高于支流种群。各群体均呈现高单倍型多样性(0.571~0.662)和低核苷酸多样性(0.000 45~0.000 69)的特征,且支流种群(LOR,LAR)核苷酸多样性低于干流种群(HJ)。Fst值和系统进化分析结果表明,黑尾近红鲌支流种群和干流种群已有显著的遗传分化。【结论】支流种群也具有保护的重要性,干流种群和支流种群可以作为不同遗传单元进行保护。 展开更多
关键词 nd5 遗传多样性 遗传结构 长江上游 黑尾近红鲌
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麋鹿的分类地位与遗传多样性研究概述 预览
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作者 张树苗 白加德 +5 位作者 李夷平 陈颀 梁兵宽 李俊芳 李俊生 常江 《野生动物学报》 北大核心 2019年第4期1035-1042,共8页
麋鹿是我国特有重点保护鹿科动物,是全球濒危物种保护的成功范例,具有重要的生态和文化价值。从乌邦寺建群到现今遍布世界的多个小种群来看,麋鹿的数量在逐步增长,生存力和繁殖力未发现有明显下降。麋鹿极小种群复壮造成其中性遗传多样... 麋鹿是我国特有重点保护鹿科动物,是全球濒危物种保护的成功范例,具有重要的生态和文化价值。从乌邦寺建群到现今遍布世界的多个小种群来看,麋鹿的数量在逐步增长,生存力和繁殖力未发现有明显下降。麋鹿极小种群复壮造成其中性遗传多样性极度趋同,种群内个体之间的遗传相似系数极高,理论上影响其可持续发展的生存潜力。这些问题引起了学者和保护管理者的极大关注。本文从麋鹿的分类地位、遗传多样性研究概况等方面进行综述,为深入了解我国麋鹿进化地位、遗传多样性状况,加强我国麋鹿遗传资源的保护与管理,以及种群的健康可持续发展提供参考。 展开更多
关键词 麋鹿 分类地位 遗传多样性
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不同生长优势等级云南松针叶表型多样性分析 预览
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作者 蔡年辉 李亚麒 +5 位作者 许玉兰 李伟 汪梦婷 陈诗 王亚楠 王大玮 《西南林业大学学报》 CAS 北大核心 2019年第5期1-7,共7页
为了充分了解云南松种质资源的遗传多样性,以林分内优势木、中等木和劣势木3类不同生长优势等级的云南松为研究对象,对其进行针叶表型性状的调查和分析。结果表明:云南松针叶性状变异比较丰富,林冠层优势木7个针叶性状变异系数波动于13.... 为了充分了解云南松种质资源的遗传多样性,以林分内优势木、中等木和劣势木3类不同生长优势等级的云南松为研究对象,对其进行针叶表型性状的调查和分析。结果表明:云南松针叶性状变异比较丰富,林冠层优势木7个针叶性状变异系数波动于13.28%~20.74%,平均16.96%;中等木波动于14.56%~20.00%,平均16.87%;劣势木的变化于13.41%~17.79%,平均15.58%。林冠层优势木7个针叶性状的Shannon-Wiener指数变化于1.342 4~1.427 0,平均为1.399 5;中等木变化于1.357 1~1.432 9,平均为1.394 1;劣势木为1.340 5~1.443 4,平均为1.412 7。不同生长优势等级间变异系数和Shannon-Wiener指数的差异不明显,云南松各针叶性状平均表型分化系数均较低,平均9.85%,组间方差分量(6.67%)远低于组内方差分量(51.90%),组内变异是云南松针叶表型变异的主要来源。综合来看,不同生长优势等级对云南松针叶表型多样性的影响较小。 展开更多
关键词 针叶 表型性状 遗传多样性 等级 云南松
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中药苦参种质资源的遗传多样性的ISSR-PAGE分析
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作者 张文龙 龙敏 +5 位作者 樊伟 陈晓利 熊鳞 吕丽娟 许健虹 罗永慧 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1138-1140,共3页
目的对收集的省内外的16个不同的苦参种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。方法基于ISSR-PAGE技术结合银染检测揭示不同苦参种质资源的间的亲缘关系。结果筛选获得10条多态性引物共扩增出117条电泳条带,平均多态性比率68.8%。利用UP... 目的对收集的省内外的16个不同的苦参种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。方法基于ISSR-PAGE技术结合银染检测揭示不同苦参种质资源的间的亲缘关系。结果筛选获得10条多态性引物共扩增出117条电泳条带,平均多态性比率68.8%。利用UPGMA法聚类分析结果表明:16个苦参种质资源成对遗传相似系数介于0.504~0.803之间,在阈值0.67处,所有参试种源分为2大类,实验结果与苦参种源地理分布和类型显示出一定程度吻合,但在群内有一定差别。结论利用ISSR-PAGE技术揭示苦参种质资源遗传多样性与亲缘关系有一定的可行性。 展开更多
关键词 苦参 种质资源 遗传多样性 ISSR-PAGE
小肠结肠炎耶尔森菌基因组中前噬菌体基因结构特征分析
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作者 梁俊容 景怀琦 《预防医学情报杂志》 CAS 2019年第7期635-642,共8页
目的了解小肠结肠炎耶尔森菌基因组中前噬菌体和噬菌体元件的携带情况及基因组结构特征。方法利用PHAST软件,对NCBI数据中18株已完成全基因组测序完成图的小肠结肠炎耶尔森菌的前噬菌体区域进行预测,并与参考噬菌体基因组序列进行比对,... 目的了解小肠结肠炎耶尔森菌基因组中前噬菌体和噬菌体元件的携带情况及基因组结构特征。方法利用PHAST软件,对NCBI数据中18株已完成全基因组测序完成图的小肠结肠炎耶尔森菌的前噬菌体区域进行预测,并与参考噬菌体基因组序列进行比对,分析小肠结肠炎耶尔森菌前噬菌体基因的分布及其基因组特征。结果 18株小肠结肠炎耶尔森菌全基因组序列中前噬菌体携带率100%,共预测到141个前噬菌体区域,其中71个是具有完整噬菌体特征的前噬菌体,其余70个属于噬菌体元件。非致病性小肠结肠炎耶尔森菌LC20预测到的噬菌体区域最多,含有9个完整的前噬菌体和7个噬菌体元件,在一定程度上解释LC20菌株染色体基因组大于其余菌株,且含有更多重组及SNP位点的原因。截取71个完整前噬菌体区域的序列信息,与112株NCBI公布的噬菌体基因组序列进行聚类分析显示,共分为两个大簇。预测的前噬菌体与已知噬菌体之间不存在共有的核心基因组。部分前噬菌体区域含有毒力相关基因。结论小肠结肠炎耶尔森菌基因组中的前噬菌体具有基因组多样性,为噬菌体和宿主菌的协同进化研究奠定基础。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 前噬菌体 基因组多样性 宿主
青藏高原地区东方蜜蜂遗传多样性分析 预览
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作者 周丹银 刘意秋 +3 位作者 龚雪阳 冯毅楠 和绍禹 赵文正 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期565-576,共12页
利用14个微卫星分子标记对采集自青藏高原地区9个采样点的230群东方蜜蜂样本进行了遗传多样性分析。分析结果显示:9个地理种群的期望杂合度相近(0.489~0.627),总样本的期望杂合度为0.563;整体而言在沿喜马拉雅山脉和横断山脉的青藏高原... 利用14个微卫星分子标记对采集自青藏高原地区9个采样点的230群东方蜜蜂样本进行了遗传多样性分析。分析结果显示:9个地理种群的期望杂合度相近(0.489~0.627),总样本的期望杂合度为0.563;整体而言在沿喜马拉雅山脉和横断山脉的青藏高原南部以及四川与青藏高原东南缘的邻接地区探测到了相对更丰富的遗传多样性;分子方差分析和贝叶斯分析结果都表明不同地理种群间存在显著的遗传分化;Mantel检验结果显示不同地理种群间的遗传距离矩阵与地理距离矩阵间相关性系数(r=0.353)未达显著水平(P=0.063)。 展开更多
关键词 青藏高原 东方蜜蜂 遗传多样性
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泥东风螺线粒体基因组及其遗传多样性分析 预览
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作者 熊钢 周先文 +4 位作者 王晓清 巫旗生 康骊 秦溱 曾志南 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期26-33,共8页
为研究泥东风螺线粒体基因组遗传进化和遗传多样性,采用PCR扩增和直接测序技术,对泥东风螺线粒体基因组全序列及3个野生群体线粒体基因测序,并用生物软件进行分析。研究结果表明,泥东风螺线粒体基因组上的tRNA-Met、tRNA-Tyr、tRNA-Cys... 为研究泥东风螺线粒体基因组遗传进化和遗传多样性,采用PCR扩增和直接测序技术,对泥东风螺线粒体基因组全序列及3个野生群体线粒体基因测序,并用生物软件进行分析。研究结果表明,泥东风螺线粒体基因组上的tRNA-Met、tRNA-Tyr、tRNA-Cys、tRNA-Trp、tRNA-GLn、tRNA-Gly、tRNA-Glu和tRNA-Thr位于环形线粒体L链上;18种腹足纲动物线粒体全长基因相似性为70.1%~92.9%,种间的12S RNA和16S RNA相似性与线粒体基因组全长相似性相当;12S RNA的391~491 bp区域和16S RNA的1~106 bp和361~481 bp区域为高度变异区,而16S RNA的1191~1317 bp区域为高度保守区;以F5引物扩增测序3个野生群体,共检测到由40个多态位点组成的26个单倍型,野生群体单倍型多样性为(0.406±0.112)~(0.532±0.113),野生群体核苷酸多样性为(0.00094±0.00124)~(0.00111±0.00123);北海野生群体与连江和长乐野生群体之间的遗距离分别为0.00094和0.00099。其结果可以为泥东风螺遗传进化、人工增殖和种质资源保护评估提供参考。 展开更多
关键词 泥东风螺 线粒体基因组 环形结构 遗传多样性
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咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析 预览
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作者 闫林 黄丽芳 +4 位作者 王晓阳 孙燕 林兴军 董云萍 龙宇宙 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期491-499,共9页
【目的】对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考。【方法】从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复... 【目的】对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考。【方法】从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的引物,利用其对72份咖啡种质材料进行扩增,对电泳图谱进行统计分析,并利用NTSYSpc2.1计算遗传相似系数和遗传距离。根据非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,并进行主坐标分析。【结果】筛选出的19条引物共扩增出153条条带,其中多态性条带数为128条,占总条带数的83.7%;72份咖啡种质材料间的遗传相似系数为0.4531~0.9609,平均为0.6567;遗传距离为0.0351~1.0951,平均为0.4081。其中,大粒种种内遗传相似系数最大(0.9297~0.9531),遗传距离最小(0.0445~0.0669);中粒种种内遗传相似系数最小(0.5781~0.8750),遗传距离最大(0.1210~0.5363)。主坐标分析与聚类分析结果一致,均显示72份咖啡种质材料可分为三大类,其中3份大粒种、3份查理种及1份中粒种巴布亚新几内亚-2聚为Ⅰ类群;32份小粒种聚为聚为Ⅱ类群;除巴布亚新几内亚-2外的其他31份中粒种及1份中小粒杂交种Arabusta和1份福建咖啡共33份聚为Ⅲ类群。聚类分析结果与种质地理来源无明显相关性。【结论】咖啡种质资源各种间存在较大的遗传差异,以中粒种种内遗传多样性较丰富,以大粒种种内遗传多样性较低。利用ISSR分子标记可准确分析咖啡资源遗传多样性。 展开更多
关键词 咖啡 ISSR 遗传多样性 聚类分析 主坐标分析
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利用ISSR和SSR标记分析不同抽薹性萝卜的遗传多样性 预览
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作者 杨峰 李跃建 +5 位作者 李晓梅 雍小平 冉科 陈琳 覃海燕 冉茂林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期1708-1716,共9页
[目的]本研究加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程。[方法]筛选出16对ISSR和21对SSR分子标记引物,用于64份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。[结果]ISSR-PCR共扩增出90条带,其中具有多态性的68条,多态性条带... [目的]本研究加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程。[方法]筛选出16对ISSR和21对SSR分子标记引物,用于64份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。[结果]ISSR-PCR共扩增出90条带,其中具有多态性的68条,多态性条带百分率为75.56%;SSR-PCR共扩增出86条带,其中具有多态性的62条,多态性条带百分率为72.09%。POPGENE分析结果表明,两类引物扩增结果都反映出供试材料较高的遗传多样性。UPGMA法聚类结果中,均可把供试萝卜材料分为4个类群,7个亚类。其中,ISSR标记聚类结果与供试萝卜材料的根叶类型比较接近;SSR标记聚类结果与材料的地理分布相似;整合ISSR和SSR后的聚类结果能够反映出2种标记的特征。Mantel检验显示,2种分子标记的遗传相似性系数在64份不同抽薹性萝卜材料间相关不显著(R=0.171,P>0.05),而ISSR+SSR与ISSR标记(R=0.612,P<0.05)以及SSR标记(R=0.894,P<0.05)呈显著相关。[结论]2种标记整合后的聚类分析,可检测到更大的遗传变异;而不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。 展开更多
关键词 萝卜 抽薹 ISSR SSR 遗传多样性
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基于ISSR技术对藏药"蒂达"3种基源植物的亲缘关系分析 预览
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作者 李水仙 夏从龙 陈丽元 《中国药房》 CAS 北大核心 2019年第12期1665-1669,共5页
目的:对藏药“蒂达”的3种基源植物紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行亲缘关系研究。方法:利用简单重复序列区间(ISSR)分子标记技术对紫红獐牙菜9个样品(样品ZT-1~ZT-5采自大理苍山感通寺,样品ZC-1~ZC-4采自大理宾川县)、青叶胆2个样... 目的:对藏药“蒂达”的3种基源植物紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行亲缘关系研究。方法:利用简单重复序列区间(ISSR)分子标记技术对紫红獐牙菜9个样品(样品ZT-1~ZT-5采自大理苍山感通寺,样品ZC-1~ZC-4采自大理宾川县)、青叶胆2个样品(QYD-1~QYD-2)和椭圆叶花锚2个样品(HM-1~HM-2)进行聚合酶链式反应(PCR)扩增。采用青叶胆的DNA基因组为模板DNA进行引物筛选,对筛选得到的8条引物进行PCR反应;对PCR扩增产物进行人工读带,建立原始数据矩阵,并计算多态性条带比率;同时,采用NTSYS 2.1软件计算遗传相似系数,并选择UPGMA法绘制聚类图。结果:通过8条ISSR引物共反应获得113条清晰可辨的PCR扩增产物条带,多态性位点百分率为100%。紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚3个品种共13个样品的遗传相似系数在0.301~0.500之间;紫红獐牙菜9个样品的种内遗传相似系数在0.752~0.929之间。聚类分析结果显示,当距离线为0.410时,可将13个样本分为3个类群,即青叶胆、椭圆叶花锚、紫红獐牙菜;当距离线为0.780时,可将紫红獐牙菜的9个样品分为2个亚类,一个亚类只有苍山感通寺采集的样品ZT-1,另一个亚类含有其余8个样品。结论:利用ISSR分子标记技术能从分子水平对紫红獐牙菜、青叶胆和椭圆叶花锚进行鉴别。紫红獐牙菜与青叶胆、椭圆叶花锚存在一定的亲缘关系,但亲缘关系相对较远、遗传差异较大;大理地区两个不同地点产紫红獐牙菜的遗传差异较小、亲缘关系较近,但表现出丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 ISSR分子标记技术 紫红獐牙菜 青叶胆 椭圆叶花锚 鉴定 亲缘关系 遗传多样性
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利用rpl32-trnL分析阿尔金山自然保护区真藓居群遗传多样性
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作者 汪琛颖 朱倩 +1 位作者 朱璐璐 买买提明·苏来曼 《基因组学与应用生物学》 CSCD 北大核心 2019年第9期4129-4134,共6页
本研究对分布在中国新疆维吾尔自治区阿尔金山自然保护区的6 个真藓(Bryum argenteum)居群的遗传结构及遗传多样性进行比较。通过对32 条叶绿体DNA的rpl32-trnL序列的核苷酸序列变异的分析,发现了14 种单倍型,存在201 个可变位点;分子... 本研究对分布在中国新疆维吾尔自治区阿尔金山自然保护区的6 个真藓(Bryum argenteum)居群的遗传结构及遗传多样性进行比较。通过对32 条叶绿体DNA的rpl32-trnL序列的核苷酸序列变异的分析,发现了14 种单倍型,存在201 个可变位点;分子变异分析显示有51.02%的遗传变异发生在居群间水平,居群内部的遗传变异为48.98%,真藓居群间的遗传分化程度较高略大于居群内的遗传分化。居群遗传变异的分化系数为0.510 2,基因流值为0.48,显示各居群间的基因流低。单倍型多态性水平为(0.780 2±0.076 0),核苷酸多态性水平为(0.058 59±0.020 09),表明真藓居群遗传多样性丰富。对所有变异位点进行的Taijma's 检验的结果是Taijma's D值为-1.567 05 (p>0.10),显示所有变异符合中性进化假说。 展开更多
关键词 真藓 叶绿体DNA rpl32-trnL序列 遗传多样性
巨菌草内生细菌多样性及其促生特性 预览
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作者 邓振山 李买平 +5 位作者 郝雷 陈凯凯 李静 刘玉珍 张宝宝 齐向英 《草地学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期1213-1221,共9页
为探究不同生境巨菌草(Pennisetum sp.)内生细菌群落组成多样性,明确促生菌株的促生特性,本试验采用菌株16S rDNA全序列分析法,对5个不同生境的巨菌草中内生细菌的遗传多样性进行系统发育分析,并以溶磷、固氮、产吲哚乙酸(Indoleacetic ... 为探究不同生境巨菌草(Pennisetum sp.)内生细菌群落组成多样性,明确促生菌株的促生特性,本试验采用菌株16S rDNA全序列分析法,对5个不同生境的巨菌草中内生细菌的遗传多样性进行系统发育分析,并以溶磷、固氮、产吲哚乙酸(Indoleacetic Acid,IAA)、产铁载体和抑菌活性等为筛选标准,对初筛菌株进行多项促生活性测定。本研究中,从巨菌草植株中共分离得到187株内生菌株,其中86株具有分泌IAA的能力,占全部菌株的46%,菌株XJ-4产IAA的能力最强,分泌的IAA浓度为30.13 mg·L^-1;47株具有溶磷能力,占全部菌株的25%,菌株FJ-23,FJ-15溶磷能力最高,分别为7.10 mg·L^-1和7.35 mg·L^-1;128株可以在Ashby无氮培养基中正常生长,表明64%的巨菌草内生细菌都具有潜在的固氮能力;34株可以在产铁载体的培养基中正常生长,表明18%的菌株产铁载体;试验中,80%以上的内生细菌对1种或者多种指示菌具有抑制作用,其中菌株SX-21,SX-30,SX-1,NY-10表现出对3种指示菌的广谱性抑菌活性,菌株SX-30对玉米大斑病菌的抑制效果最好,抑菌圈达到30 mm。供试菌株共产生了23种遗传图谱类型,通过对每种图谱类型的代表性菌株进行16S rDNA全序列分析,23株菌株分别归属于芽孢杆菌属(Bacillus)、根瘤菌属(Rhizobium)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和肠杆菌属(Enterobacter)。巨菌草中具促生特性的内生细菌表现出丰富的多样性,可为进一步构建巨菌草促生菌菌群提供良好的种质资源。 展开更多
关键词 巨菌草 内生菌 遗传多样性 促生特性
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甘肃省大麦条纹病菌遗传多样性及致病力差异 预览
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作者 李葆春 司二静 +3 位作者 杨淑莲 孟亚雄 马小乐 王化俊 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期190-195,共6页
为了解甘肃省大麦条纹病病原菌 Pyrenophora graminea 的遗传多样性及致病力差异,运用RAPD分子标记技术对大麦条纹病菌不同菌株进行遗传多样性分析,并采用三明治法进行菌株致病力差异研究。结果表明:17个RAPD标记从45个菌株中扩增出126... 为了解甘肃省大麦条纹病病原菌 Pyrenophora graminea 的遗传多样性及致病力差异,运用RAPD分子标记技术对大麦条纹病菌不同菌株进行遗传多样性分析,并采用三明治法进行菌株致病力差异研究。结果表明:17个RAPD标记从45个菌株中扩增出126条带,平均每个标记7.41条带,遗传相似系数范围为0.468 3~0.984 1,平均值为0.830 8,当遗传相似系数为0.723 6时,可将供试菌株划分为4个类群,分别包含41、2、1和1个菌株;致病力测定结果显示菌株QWC较菌株QQ致病力强,两菌株除在品种‘甘啤2号’和‘GP-3’上无致病力外,在其他供试品种上致病力均存在差异。表明大麦条纹病菌不同菌株间存在遗传差异,且菌株QWC和菌株QQ存在致病力差异。 展开更多
关键词 大麦条纹病菌 随机扩增多态性DNA 遗传多样性 致病力差异
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基于SSR标记分析四川省桑树种质资源的群体结构和遗传多样性
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作者 刘玲 陈祥平 +4 位作者 范小敏 傅晓 柯皓天 吕银 陈仁芳 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期165-174,共10页
利用14对SSR引物对四川省89份桑树种质资源的基因组DNA进行PCR,分析种质资源间的群体结构和遗传多样性。共扩增出迁移率不同的条带65条,多态性条带65条,多态性条带比率达100%;Structure群体结构分析将89份桑树种质资源划分为4个群体,4... 利用14对SSR引物对四川省89份桑树种质资源的基因组DNA进行PCR,分析种质资源间的群体结构和遗传多样性。共扩增出迁移率不同的条带65条,多态性条带65条,多态性条带比率达100%;Structure群体结构分析将89份桑树种质资源划分为4个群体,4个群体的多态性信息含量在0.552 0~0.599 8之间,总体为0.657 7;基因多样度在0.554 8~0.600 3之间,总体为0.579 0;等位基因数目在66~76个之间,总体为134个;等位基因丰富度在3.327 2~3.549 1之间,总体为3.983 1;遗传多样性主要来源于品种内,属中等偏高水平;14对SSR引物位点的总基因多样度Ht在0.291~0.931之间,整体为0.699;Nei’s种群内基因多样度Hs为0.287~0.910,整体为0.662;种群间基因多样度为0.003~0.098,整体为0.037;种群间基因分化系数为0.008~0.047,整体为0.053;基因流为2.901~62.000,整体为8.934,遗传变异主要发生在群体内,群体间分化程度低,基因流大。UPGMA聚类分析与群体结构分析结果大致相同,2种分析结果都显示分群无地理迁移规律。 展开更多
关键词 桑树种质资源 SSR分子标记 群体结构 遗传多样性 四川省
南沙群岛密斑马面鲀群体遗传多样性分析 预览
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作者 高天翔 王志杨 +1 位作者 宋娜 宋林 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期159-165,共7页
密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,8... 密斑马面鲀Thamnaconustessellatus是在我国南海海域较为常见的一种马面鲀属鱼类。本研究基于线粒体DNA控制区序列对南沙群岛密斑马面鲀3个群体的遗传结构及其遗传多样性进行了分析。研究结果显示,密斑马面鲀的控制区序列变异程度较大,86尾个体序列的变异位点数为38个,共定义了28个单倍型;3个密斑马面鲀群体的单倍型多样度和核苷酸多样度均较高,且相差不大;密斑马面鲀群体间未检测到显著的群体遗传结构,分子方差分析表明,99.67%的遗传差异来自于群体内,群体间遗传差异仅为0.33%。贝叶斯树和最大似然树均显示出密斑马面鲀单倍型间松散的分布,未检测到显著的谱系结构。群体历史动态分析结果表明密斑马面鲀的群体经历了更新世的群体扩张事件。 展开更多
关键词 密斑马面鲀 南沙群岛 控制区 遗传多样性 群体遗传结构
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基于SLAF-seq技术分析甜、糯玉米种质遗传多样性
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作者 李余良 索海翠 +4 位作者 韩福光 刘建华 胡建广 高磊 李武 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期71-78,共8页
利用简化基因组测序技术SLAF-seq,对国内外引进选育的81份鲜食甜、糯玉米自交系进行遗传多样性分析。结果表明,共获得803 058个SLAF标签,其中,多态性SLAF标签373 764个。通过序列分析,获得169 128个有效单核苷酸(SNP)多态标记,利用这些... 利用简化基因组测序技术SLAF-seq,对国内外引进选育的81份鲜食甜、糯玉米自交系进行遗传多样性分析。结果表明,共获得803 058个SLAF标签,其中,多态性SLAF标签373 764个。通过序列分析,获得169 128个有效单核苷酸(SNP)多态标记,利用这些SNP标记分析和构建了81份鲜食甜、糯玉米资源的群体结构和系统发生树,并将其分为2个群。结果表明,简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低廉地开发出大量SNP标记,是作物种质资源群体遗传分析的有效工具。研究结果为甜玉米不同基因的聚合、温-热种质杂交育种、鲜食甜、糯玉米亚种间杂交育种提供依据,有利于鲜食甜、糯玉米自交系的高效利用、品种选育及杂种优势群的建立。 展开更多
关键词 甜、糯玉米 种质 SLAF-seq SNPs标记 遗传多样性
采用微卫星DNA标记分析东北黑蜂小群保种效果 预览
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作者 陈孝梅 王康 +8 位作者 张文文 高夫超 王志 范荣莉 刘一冰 徐浩 陈恒 殷玲 吉挺 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期1125-1132,共8页
本研究利用16对荧光标记微卫星引物分析国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体东北黑蜂的小群保种效果,为进一步保护和利用东北黑蜂遗传资源提供理论依据。分别选取国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体和国家级东北黑蜂保护区(原产地)群体东北黑蜂各30... 本研究利用16对荧光标记微卫星引物分析国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体东北黑蜂的小群保种效果,为进一步保护和利用东北黑蜂遗传资源提供理论依据。分别选取国家蜜蜂基因库(吉林)保种群体和国家级东北黑蜂保护区(原产地)群体东北黑蜂各30头,利用测定优势等位基因频率(Pi)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和群体内近交系数(Fis)比较基因库保种群体与原产地群体的遗传差异。两群体间东北黑蜂的Pi、He、PIC和Fis均没有显著差异(P>0.05)。国家蜜蜂基因库(吉林)对东北黑蜂群体保种效果良好,异地小群保种的方法对东北黑蜂具有潜在可行性。 展开更多
关键词 东北黑蜂 微卫星DNA标记 遗传多样性 保种效果
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