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DNA-SIP鉴定甘蔗//大豆间作土壤15N-DNA富集位置的氮循环功能基因qPCR方法 预览
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作者 苟永刚 余玲玲 +1 位作者 许霞 王建武 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期140-147,共8页
为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)中超高速离心后15N-DNA富集位置的指示功能基因,利用实时荧光定量PCR技术(qPCR),检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布,通过对氮素循... 为筛选有效鉴定甘蔗//大豆间作系统的稳定性同位素核酸探针技术(DNA-SIP)中超高速离心后15N-DNA富集位置的指示功能基因,利用实时荧光定量PCR技术(qPCR),检测6个氮素循环功能基因在不同浮力密度离心液DNA中的相对丰度分布,通过对氮素循环功能基因相对丰度作图分析,nifH和amoA基因在甘蔗//大豆间作和大豆单作种植模式中15N标记组与对照组基因丰度峰发生偏移,chiA基因丰度峰仅在大豆单作种植模式下存在偏移,而nirS、nirK、nosZ等3个基因的丰度峰值在两种种植模式下均不发生偏移。结果表明nifH和amoA基因可作为指示基因,能够有效鉴定甘蔗//大豆间作系统中DNA-SIP技术15N-DNA位置。 展开更多
关键词 甘蔗//大豆间作 稳定性同位素核酸探针 荧光定量PCR 功能基因
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芝麻香型白酒高温大曲中高温放线菌及其功能基因的动态变化规律 预览
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作者 于学健 冯慧军 +5 位作者 翟磊 白秀彬 许玲 于盼盼 程池 姚粟 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2019年第13期71-77,共7页
为揭示高温放线菌及其功能基因与大曲理化性质的关系,进而为揭示微生物及高温大曲在白酒酿造中的功能作用,以及为定向调控提供技术支撑,通过宏基因组技术解析了芝麻香型白酒高温大曲中高温放线菌及其功能基因的分布及动态变化规律。结... 为揭示高温放线菌及其功能基因与大曲理化性质的关系,进而为揭示微生物及高温大曲在白酒酿造中的功能作用,以及为定向调控提供技术支撑,通过宏基因组技术解析了芝麻香型白酒高温大曲中高温放线菌及其功能基因的分布及动态变化规律。结果表明,高温放线菌丰度与大曲品温显著正相关。随大曲品温升高,高温放线菌碱性磷酸酶蛋白(Clp,K03695)、groEL分子伴侣(K04077)、磷酸转运系统ATP结合蛋白(pstB,K02036)等耐热基因富集成为优势基因,并与大曲品温呈显著正相关关系,有效提升该菌属在高温下的生存能力。入房时间与CZAy注释基因、糖化力及酯化力均显著正相关,糖基水解酶、糖基转移酶基因与大曲糖化力与酯化力显著正相关,说明大曲发酵过程中高温放线菌丰度上升,碳水化合物降解相关基因逐渐富集,促进大曲糖化力与酯化力提升。 展开更多
关键词 高温大曲 宏基因组测序 高温放线菌 功能基因
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热带植物基因组研究进展 预览
3
作者 李丹 陈晓慧 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1875-1888,共14页
基于全基因组测序结果,探讨了包括热带水果香蕉(Musa spp.)、龙眼(Dimocarpus longan)、番木瓜(Carica papaya)、菠萝(Ananas comosus)、椰子(Cocos nucifera)、榴莲(Durio zibethinus),经济作物橡胶(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot... 基于全基因组测序结果,探讨了包括热带水果香蕉(Musa spp.)、龙眼(Dimocarpus longan)、番木瓜(Carica papaya)、菠萝(Ananas comosus)、椰子(Cocos nucifera)、榴莲(Durio zibethinus),经济作物橡胶(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot esculenta)、枣椰(Phoenix dactylifera)、可可(Theobroma cacao)、油棕(Elaeis guineensis)、咖啡(Coffea canephora)以及药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)在内的13种热带植物的全基因组测序的发展历程,并对热带植物基因组研究进行了概述。 展开更多
关键词 热带植物 全基因组 第二代测序 遗传育种 功能基因
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禁牧对半干旱草地土壤氮循环功能基因丰度和氮储量的影响
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作者 廖李容 王杰 +2 位作者 张超 刘国彬 宋籽霖 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期3473-3481,共9页
以黄土高原云雾山不同禁牧(0、7、18、27和35年)草地为对象,研究禁牧对不同土层(0~10、10~20、20~40和40~60 cm)土壤氮循环微生物功能基因(nifH、amoA-AOA、amoA-AOB、narG、nirK、nirS和nosZ)丰度的影响,并分析了土壤氮循环微生物功能... 以黄土高原云雾山不同禁牧(0、7、18、27和35年)草地为对象,研究禁牧对不同土层(0~10、10~20、20~40和40~60 cm)土壤氮循环微生物功能基因(nifH、amoA-AOA、amoA-AOB、narG、nirK、nirS和nosZ)丰度的影响,并分析了土壤氮循环微生物功能基因与土壤氮储量之间的关系.结果表明:与放牧相比,禁牧35年提高了nifH和amoA-AOB的基因丰度,分别增加了67.8%和17.6%;禁牧降低了nirK基因丰度.表层土壤(0~10 cm)nifH、narG和nirS基因丰度显著高于深层土壤(20~40和40~60 cm),表明nifH、narG和nirS基因具有表聚效应.禁牧提高了土壤氮储量,在27年时0~60 cm土层土壤氮储量最高(20.96 mg·hm^-2),说明27年可能为最适禁牧年限.nifH、amoA-AOA和amoA-AOB基因丰度与氮储量具有显著线性关系,表明含有这些基因的微生物对于提高土壤氮储量具有重要作用.土壤全氮、容重以及速效磷含量是影响土壤氮循环基因的主要因素.本研究结果为深入理解土壤氮循环过程及退化草地的恢复提供了科学参考. 展开更多
关键词 禁牧 氮循环 功能基因 氮储量 半干旱草地
Fenton氧化对微生物群落结构和功能基因的影响 预览
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作者 高春阳 张羽 +4 位作者 张坤峰 于文赫 杜显元 郑瑾 韩占涛 《油气田环境保护》 CAS 2019年第1期37-40,47,61,62共7页
通过使用H2O2和Na2CO3·1.5H2O2所形成的两种类Fenton试剂对原油污染的土壤进行氧化修复,在比较两种试剂氧化效果的基础上,采用16srDNA技术对氧化后土壤中土著微生物的群落结构和功能基因的影响进行了比较。结果表明:Na2CO3·1.... 通过使用H2O2和Na2CO3·1.5H2O2所形成的两种类Fenton试剂对原油污染的土壤进行氧化修复,在比较两种试剂氧化效果的基础上,采用16srDNA技术对氧化后土壤中土著微生物的群落结构和功能基因的影响进行了比较。结果表明:Na2CO3·1.5H2O2所形成的类Fenton试剂对原油的降解效果较好,原油降解率达到50.48%;两种试剂氧化后土壤中的优势菌种均发生变化,由原来的放线菌门(Actinobacteria)变为变形菌门(Proteobacteria),同时氧化后土壤中的总功能基因含量下降,由原来的58093193个分别下降到36282211个和32355524个,而各种通路基因在总基因的占比变化不大。 展开更多
关键词 FENTON 原油污染 土壤 微生物群落结构 功能基因
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生物降解芳香族化合物的分子检测技术研究进展 预览
6
作者 厉舒祯 邓晔 +1 位作者 张照婧 曲媛媛 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期2577-2587,共11页
编码环羟基化加氧酶的基因常作为评价环境中微生物降解芳香族化合物能力的分子标记.近年宏基因组学技术的出现极大地加速了对环境中功能基因及功能类群的研究.本文总结了目前关于芳香族化合物环羟基化加氧酶基因的数据库,介绍了微生物... 编码环羟基化加氧酶的基因常作为评价环境中微生物降解芳香族化合物能力的分子标记.近年宏基因组学技术的出现极大地加速了对环境中功能基因及功能类群的研究.本文总结了目前关于芳香族化合物环羟基化加氧酶基因的数据库,介绍了微生物降解芳香族化合物(苯系物、萘及其它多环芳烃)过程中发挥重要作用的各类功能基因,总结了环境检测中使用的分子引物,并综述了它们在各类复杂环境样本中的检测应用,此外对使用宏基因组技术来研究微生物在环境中降解芳香族化合物的能力进行了总结与展望. 展开更多
关键词 芳香化合物 微生物群落 功能基因 环羟化加氧酶 宏基因组
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秸秆还田对稻田氮循环微生物及功能基因影响研究进展 预览 被引量:1
7
作者 王青霞 陈喜靖 +1 位作者 喻曼 沈阿林 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期333-342,共10页
土壤微生物对土壤变化的反应极为敏感,秸秆还田对土壤微生物产生的影响对维持稻田系统氮素循环极其重要。秸秆还田通过对土壤微生态环境的改变影响氮素在土壤中的生物化学转化过程,进而影响水稻生产的氮素管理策略。在查阅近年来发表的... 土壤微生物对土壤变化的反应极为敏感,秸秆还田对土壤微生物产生的影响对维持稻田系统氮素循环极其重要。秸秆还田通过对土壤微生态环境的改变影响氮素在土壤中的生物化学转化过程,进而影响水稻生产的氮素管理策略。在查阅近年来发表的相关研究论文基础上,对秸秆还田下水稻土壤氮素转化过程中相关功能微生物的作用以及关键功能基因驱动机制等研究进行综述,以期厘清秸秆还田后稻田生态系统中微生物介导的氮素循环转化机制,为稻田科学施用氮肥提供理论依据。 展开更多
关键词 秸秆还田 稻田 氮循环 土壤微生物 功能基因
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Contribution of the Kodama and 4S pathways to the dibenzothiophene biodegradation in different coastal wetlands under different C/N ratios
8
作者 Lei Wang Guodong Ji Siqiao Huang 《环境科学学报:英文版》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第2期217-226,共10页
Dibenzothiophene (DBT) degradation mechanisms and the transformation of pathways during the incubation of three types of coastal sediments with C/N ratios ranging from 1 to 9 were investigated. The DBT degradation eff... Dibenzothiophene (DBT) degradation mechanisms and the transformation of pathways during the incubation of three types of coastal sediments with C/N ratios ranging from 1 to 9 were investigated. The DBT degradation efficiencies were clearly improved with increasing C/N ratio in reed wetland sediments, tidal wetlands sediments and estuary wetland sediments. The quantitative response relationships between DBT degradation rates and related functional genes demonstrate that the Kodama pathway-related gene groups were dominant factors at low C/N ratios, while the 4S-related gene groups mainly determined the degradation rate when the C/N ratio was up to 5. Network analysis also shows that the pathway shifts from the Kodama pathway to the 4S pathway occurred through changes in the connections between functional genomes and rates. Furthermore, there were competition and collaboration between the Kodama and 4S pathways. The 4S pathway-related bacteria were more active in estuary wetland sediments compared with reed wetland sediments and tidal wetland sediments. The higher degradation efficiency in estuary wetland sediments may indicate the greater participation of the 4S pathway in the DBT biodegradation reaction. And the effects of ring cleavage of Kodama pathway caused more complete metabolizing of DBT. 展开更多
关键词 Dibenzothiophene(DBT) COASTAL WETLANDS Functional genes Degradation mechanism Quantitative response relationship Network analysis
番茄基因组研究进展 预览
9
作者 唐亚萍 李宁 +9 位作者 王娟 王柏柯 杨生保 郭斌 杨涛 郭春苗 马凯 刘君 王欢 余庆辉 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期197-206,共10页
[目的]综述国内外相关高质量番茄基因组研究进展,比较与分析第一、二、三代测序技术的研究成果,为番茄重要性状功能基因的挖掘及新品种选育提供参考。[方法]收集查阅国内外相关官网、文献资料和现有研究前沿技术,整理汇总并进行对比,分... [目的]综述国内外相关高质量番茄基因组研究进展,比较与分析第一、二、三代测序技术的研究成果,为番茄重要性状功能基因的挖掘及新品种选育提供参考。[方法]收集查阅国内外相关官网、文献资料和现有研究前沿技术,整理汇总并进行对比,分析番茄基因组测序技术研究进展。[结果]栽培番茄S.lycopersi cumHeinz1706基因组利用一代和二代测序技术8年完成测序和组装。3个野生番茄基因组采用二代测序技术3年完成,三代测序技术缩短了测序时间,并且在二代测序技术的基础上提高了基因组的质量,提供了完整性高达96.46%的野生番茄品种潘那利的参考基因组。[结论]测序技术推动了番茄基因组研究,三代测序技术与一、二代技术相比,在测序速度、基因序列读长和准确性方面显著提高,也使基因组组装更加精确。 展开更多
关键词 番茄 基因组 测序技术 功能基因
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多组学技术联用在传统发酵乳品风味代谢调控中的应用研究进展 预览
10
作者 周钺 李键 +4 位作者 张玉 王洪伟 赵欣 刘士健 索化夷 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期238-243,共6页
传统发酵乳制品具有独特的风味品质、营养价值和丰富的菌种资源。由于发酵微生物的区系复杂多样,传统发酵乳制品的风味品质形成机理不清,质量安全无法保证,阻碍了传统发酵乳制品的规模化生产。基于高通量组学技术的发展,多组学技术联用... 传统发酵乳制品具有独特的风味品质、营养价值和丰富的菌种资源。由于发酵微生物的区系复杂多样,传统发酵乳制品的风味品质形成机理不清,质量安全无法保证,阻碍了传统发酵乳制品的规模化生产。基于高通量组学技术的发展,多组学技术联用为分析传统发酵乳品的风味形成条件与菌种代谢通路提供了有利手段。该文综述了国内外多组学技术联用在传统发酵乳品的风味代谢调控中的研究应用并对此展望,为传统发酵乳品的品质调控和生产研发提供新思路。 展开更多
关键词 传统发酵乳品 多组学技术联用 特征风味成分 代谢通路 功能基因
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污泥膨胀对反硝化中试反应器效能及菌群结构的影响 预览
11
作者 许子聪 李海松 胡培基 《环境工程技术学报》 CAS 2019年第2期139-144,共6页
考察了丝状菌污泥膨胀对有效体积为10 m~3,流量为300 m~3/d中试规模反硝化反应器性能的影响,并利用高通量测序法分析了菌群结构的变化。在反应器正常运行66 d时,观测到污泥膨胀现象,污泥沉降性能明显恶化,SV30由30%增至85%,反应器内生... 考察了丝状菌污泥膨胀对有效体积为10 m~3,流量为300 m~3/d中试规模反硝化反应器性能的影响,并利用高通量测序法分析了菌群结构的变化。在反应器正常运行66 d时,观测到污泥膨胀现象,污泥沉降性能明显恶化,SV30由30%增至85%,反应器内生物量也随之降低,污泥浓度由3 300 mg/L降至1 400 mg/L。镜检发现,污泥膨胀后出现大量的丝状菌,紧密的菌胶团受到破坏,说明此次污泥膨胀主要由丝状菌引起;高通量测序结果也证实了发硫菌属(Thiothrix)、纤毛属(Leptothrix)和束缚杆菌属(Haliscomenobacter)等丝状细菌在污泥膨胀后富集,由丝状菌类型和环境因素的变化推断高硫化物浓度和低溶解氧浓度是污泥膨胀的诱因。尽管发生了污泥膨胀和污泥流失,反应器反硝化性能并未降低,这可能与Methyloversatilis、氢噬胞菌属(Hydrogenophaga)和Thiothrix等具有反硝化功能的菌属丰度增大(分别为29. 74%、1. 69%和3. 45%)有关。此外,菌群结构的变化也是导致功能基因丰度改变的原因之一。 展开更多
关键词 污泥膨胀 反硝化 丝状菌 细菌 功能基因
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珍稀药用植物铁皮石斛的组学及功能基因研究进展
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作者 李以格 杨杭 +3 位作者 姜琪梦 陈研硕 王晓锋 陈勇 《生命科学》 CSCD 北大核心 2019年第9期959-967,共9页
铁皮石斛为兰科珍稀名贵药用植物,具有极高的医药保健和生态观赏价值。以"高通量、高精度、低成本"为特点的新一代测序技术平台,高效推动了铁皮石斛基因组和转录组等组学基础研究,有关铁皮石斛多糖和石斛碱积累、生长发育调... 铁皮石斛为兰科珍稀名贵药用植物,具有极高的医药保健和生态观赏价值。以"高通量、高精度、低成本"为特点的新一代测序技术平台,高效推动了铁皮石斛基因组和转录组等组学基础研究,有关铁皮石斛多糖和石斛碱积累、生长发育调控、环境适应性等机制逐渐获得了分子数据支持。该文综述了近年来铁皮石斛基因组、转录组、蛋白质组等组学以及功能基因等研究,内容涉及其非生物胁迫、多糖合成、种子萌发等过程,最后对当前铁皮石斛分子生物学研究进行了讨论。 展开更多
关键词 铁皮石斛 组学分析 功能基因
药用植物转录组的研究进展 预览
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作者 王媛媛 杨美青 《安徽农学通报》 2019年第8期13-15,52共4页
转录组通常是指编码蛋白质的信使RNA的总和,随着测序技术的不断进步,转录组测序成为了发展最为迅猛、应用最为普及的一种测序技术。药用植物拥有几千年的应用历史,但是大多数药用植物都缺少基因组信息,转录组测序技术可以克服这一难点,... 转录组通常是指编码蛋白质的信使RNA的总和,随着测序技术的不断进步,转录组测序成为了发展最为迅猛、应用最为普及的一种测序技术。药用植物拥有几千年的应用历史,但是大多数药用植物都缺少基因组信息,转录组测序技术可以克服这一难点,特别适合药用植物资源的研究。该文在介绍转录组测序方法和测序流程的基础上,综述了转录组测序技术在药用植物领域的应用进展,主要包括功能基因的发掘、次生代谢产物的生物合成和调控机制以及SSR分子标记的开发。 展开更多
关键词 药用植物 转录组学 功能基因 次生代谢产物 SSR分子标记
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Exaptation at the molecular genetic level
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作者 Jürgen Brosius 《中国科学:生命科学英文版》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期437-452,共16页
The realization that body parts of animals and plants can be recruited or coopted for novel functions dates back to,or even predates the observations of Darwin.S.J.Gould and E.S.Vrba recognized a mode of evolution of ... The realization that body parts of animals and plants can be recruited or coopted for novel functions dates back to,or even predates the observations of Darwin.S.J.Gould and E.S.Vrba recognized a mode of evolution of characters that differs from adaptation.The umbrella term aptation was supplemented with the concept of exaptation.Unlike adaptations,which are restricted to features built by selection for their current role,exaptations are features that currently enhance fitness,even though their present role was not a result of natural selection.Exaptations can also arise from nonaptations;these are characters which had previously been evolving neutrally.All nonaptations are potential exaptations.The concept of exaptation was expanded to the molecular genetic level which aided greatly in understanding the enormous potential of neutrally evolving repetitive DNA-including transposed elements,formerly considered junk DNA-for the evolution of genes and genomes.The distinction between adaptations and exaptations is outlined in this review and examples are given.Also elaborated on is the fact that such distinctions are sometimes more difficult to determine;this is a widespread phenomenon in biology,where continua abound and clear borders between states and definitions are rare. 展开更多
关键词 exaptation ADAPTATION aptation NEOFUNCTIONALIZATION subfunctionalization non-protein CODING RNA cooptation RECRUITMENT novel functional gene modules de novo GENES retrogenes
银杏类黄酮响应非生物胁迫研究进展 预览 被引量:1
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作者 赵贝贝 叶蕴灵 +1 位作者 王莉 李卫星 《扬州大学学报:农业与生命科学版》 北大核心 2018年第3期106-112,共7页
类黄酮作为银杏最重要的次生代谢物之一,不仅对人体具有多种保健与药用功能,而且在非生物胁迫中也发挥着重要作用。主要综述了银杏类黄酮响应水分、光照、温度、盐分、紫外辐射等非生物胁迫的规律,以及类黄酮生物合成途径中关键功能基... 类黄酮作为银杏最重要的次生代谢物之一,不仅对人体具有多种保健与药用功能,而且在非生物胁迫中也发挥着重要作用。主要综述了银杏类黄酮响应水分、光照、温度、盐分、紫外辐射等非生物胁迫的规律,以及类黄酮生物合成途径中关键功能基因和转录因子MYB等调控基因对非生物胁迫下类黄酮积累的响应与调节,并对今后研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 银杏 类黄酮 非生物胁迫 功能基因 调控基因
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宏基因组技术在氮循环功能微生物分子检测研究中的应用 预览 被引量:2
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作者 王朱珺 王尚 +2 位作者 刘洋荧 冯凯 邓晔 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2018年第1期1-14,共14页
氮循环是最重要的生物地球化学循环之一,而微生物是驱动自然环境中氮循环最重要的动力。应用宏基因组技术来研究自然环境中直接参与氮循环的功能微生物类群的总量和多样性是近年来环境微生物的研究热点之一。本文总结最新氮循环功能微... 氮循环是最重要的生物地球化学循环之一,而微生物是驱动自然环境中氮循环最重要的动力。应用宏基因组技术来研究自然环境中直接参与氮循环的功能微生物类群的总量和多样性是近年来环境微生物的研究热点之一。本文总结最新氮循环功能微生物类群的研究发现,聚焦各转化过程中(包括固氮、硝化、反硝化、厌氧氨氧化、氮同化/异化还原、氨化和同化作用等)分子标记基因的选择,重点介绍通过这些标记基因的分子检测方法在自然环境中检测到的微生物功能类群的分布状况,最后指出分子检测技术的革新和完善的数据分析平台的建立对未来氮循环功能微生物研究的重要意义。 展开更多
关键词 宏基因组 功能基因 氮循环 分子检测技术 功能微生物类群
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药用植物萜类化合物代谢合成途径及相关功能基因研究进展
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作者 王黎 胡静 +3 位作者 赵宏光 杨盛 张宝兴 高巧妮 《中兽医医药杂志》 2018年第5期38-41,共4页
萜类化合物是广泛存在于药用植物中的一类天然烃类化合物,具有抗癌、抗氧化、抗肿瘤、抗炎、免疫抑制等药理作用,备受研究者关注。药用植物萜类化合物有2条合成途径,即甲羟戊酸途径和5-磷酸脱氧木酮糖/2C-甲基4-磷酸-4-D-赤藓糖醇途径。... 萜类化合物是广泛存在于药用植物中的一类天然烃类化合物,具有抗癌、抗氧化、抗肿瘤、抗炎、免疫抑制等药理作用,备受研究者关注。药用植物萜类化合物有2条合成途径,即甲羟戊酸途径和5-磷酸脱氧木酮糖/2C-甲基4-磷酸-4-D-赤藓糖醇途径。2条途径中存在一系列调控萜类化合物结构和功能的基因。笔者等对药用植物萜类化合物代谢合成途径及功能基因进行综述,以期为药用萜类化合物进一步研究提供参考。 展开更多
关键词 药用植物 萜类化合物 代谢合成途径 功能基因
桃主要性状的分子标记与功能基因定位研究进展 预览
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作者 连晓东 谭彬 +4 位作者 郑先波 陈谭星 王婷 栗焕楠 冯建灿 《果树学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期334-346,共13页
综述了桃果实、花、树体及抗根结线虫等主要性状的功能基因定位和分子标记开发的最新研究成果,阐述了决定果皮茸毛有无、果肉颜色(黄/白)、果肉质地与核黏离性、短枝型矮化和柱型等质量性状的功能基因定位,分析了1个与成熟期主效位点... 综述了桃果实、花、树体及抗根结线虫等主要性状的功能基因定位和分子标记开发的最新研究成果,阐述了决定果皮茸毛有无、果肉颜色(黄/白)、果肉质地与核黏离性、短枝型矮化和柱型等质量性状的功能基因定位,分析了1个与成熟期主效位点相关的重要候选基因,同时对决定果实糖、酸含量变化的QTL以及根结线虫(Meloidogyne incognita)、蚜虫(Myzus persicae Sulzer.)抗性相关位点的研究进展进行总结,为桃性状定位和整个发育期调控糖、酸含量的基因及其作用模式研究提供参考。在此基础上,对功能基因和分子标记在辅助选择育种和种质资源鉴定中的应用及发展方向进行展望。 展开更多
关键词 性状定位 功能基因 分子标记
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昆虫杆状病毒基因组学研究进展 预览 被引量:1
19
作者 梁振普 刘雅静 +3 位作者 张小霞 李鹏娟 王亮 张俊庆 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第9期1-7,共7页
杆状病毒(Baculoviruses)是一类在自然界中专一性感染节肢动物的共价闭合双链环状DNA病原微生物。由于杆状病毒的宿主特异性高,其作为无公害生物杀虫剂在生物防治方面发挥重大作用。此外,杆状病毒已被开发成为高效的真核表达载体,广泛... 杆状病毒(Baculoviruses)是一类在自然界中专一性感染节肢动物的共价闭合双链环状DNA病原微生物。由于杆状病毒的宿主特异性高,其作为无公害生物杀虫剂在生物防治方面发挥重大作用。此外,杆状病毒已被开发成为高效的真核表达载体,广泛应用于药物研发、疫苗生产等领域,并作为基因治疗载体用于疾病的基因治疗。综述了获得全基因组序列的昆虫杆状病毒类别及其序列特征,以及昆虫杆状病毒基因组中的主要功能基因,包括RNA转录相关基因、DNA复制相关基因、结构蛋白基因等,也对其应用做了较为详尽的阐述。 展开更多
关键词 昆虫杆状病毒 基因组学 功能基因 应用
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生活垃圾焚烧厂周边土壤硝化和反硝化功能基因分布特征及影响因子 预览 被引量:1
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作者 孙许超 郭彦海 +4 位作者 张士兵 钱雅洁 刘振鸿 薛罡 高品 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期373-380,共8页
以上海某垃圾焚烧厂为研究对象,采用电感耦合等离子体发射光谱(ICP-OES)和荧光定量PCR定量分析了其周边土壤中重金属(Cd、Pb、Cu、Ni、Cr、Zn和As)含量水平,及不同硝化和反硝化功能基因丰度(AOB-amoA、nxrB、narG、nirS、norB和n... 以上海某垃圾焚烧厂为研究对象,采用电感耦合等离子体发射光谱(ICP-OES)和荧光定量PCR定量分析了其周边土壤中重金属(Cd、Pb、Cu、Ni、Cr、Zn和As)含量水平,及不同硝化和反硝化功能基因丰度(AOB-amoA、nxrB、narG、nirS、norB和nosZ),并通过空间插值法分析了目标重金属与硝化和反硝化功能基因的空间分布特征,同时通过相关性分析和冗余分析探讨了土壤重金属及其理化性质对硝化和反硝化功能基因丰度变化的作用影响。结果表明,研究区域土壤中Cd、Pb、Cu、Ni、Cr、Zn和As的含量分别为0.083~1.065、15.54~43.17、18.30~65.52、24.58~41.65、65.04~201.0、58.96~153.5和0.098~5.115mg·kg-1,而土壤中AOB-amoA、nxrB、narG、nirS、norB和nosZ基因丰度分别为4.89×102~1.34×105copies·g-1、5.43×106~5.41×107copies·g-1、1.21×106~7.91×106copies·g-1、3.79×106~7.39×107copies·g-1、1.61×105~1.33×107copies·g-1和1.44×104~2.18×105copies·g-1。由空间插值分析结果可知,土壤中重金属主要来源于焚烧烟气排放沉降,硝化和反硝化功能基因的空间分布特征与土壤总氮及重金属均具有相似性。相关性分析和冗余分析结果显示,除Cd和Zn外,其余重金属含量对硝化和反硝化功能基因丰度影响不显著,表明垃圾焚烧厂周边土壤中重金属污染对氮循环过程影响较小。相比之下,土壤理化性质如总有机碳、总氮等对硝化和反硝化功能基因丰度影响更显著。该研究可为相关地区垃圾焚烧厂周边土壤重金属污染控制及微生物生态风险评价提供参考。 展开更多
关键词 垃圾焚烧厂 硝化 反硝化 功能基因 重金属
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