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杏RPW8基因家族鉴定与表达量分析 预览 被引量:1
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作者 许靖 王广军 +1 位作者 额尔敦达来 乌云塔娜 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期123-131,共9页
RPW8(Resistance to powdery mildew 8)不但对拟南芥白粉菌有抗性作用,同时也对烟草白粉菌、拟南芥霜霉菌和烟草花叶病毒等多种植物寄生性病原体都表现出较高的抗性,具有广谱抗病性。以杏全基因组数据为基础,鉴定RPW8家族成员,分析基因... RPW8(Resistance to powdery mildew 8)不但对拟南芥白粉菌有抗性作用,同时也对烟草白粉菌、拟南芥霜霉菌和烟草花叶病毒等多种植物寄生性病原体都表现出较高的抗性,具有广谱抗病性。以杏全基因组数据为基础,鉴定RPW8家族成员,分析基因家族特点及不同组织中表达量分析,有利于更加深入了解RPW8基因家族功能,为杏抗白粉病基因挖掘和抗白粉病育种提供理论参考。通过SMS、GSDS2.0、Expasy-protparam、MEME、MAGA6.0、TBtool等生物信息学工具对RPW8基因家族的核酸序列的特征、基因结构、蛋白质理化性质、蛋白保守结构域、家族系统进化关系、表达量等进行分析和预测。结果表明:从杏中共鉴定出16个RPW8家族基因,分别命名为LWMRPW8-1~LWMRPW8-16,内含子数量小于6个,16个基因的全长为360~4 864 bp,碱基G+C含量为37.39%~46.89%,碱基A+T的含量为53.11%~62.61%;杏RPW8基因家族编码的氨基酸分子量为13 653.93~92 617.92 Da,理论等电点为5.42~9.47,蛋白质不稳定性指数为22.94~61.18,氨基酸组成成分以亮氨酸(Leu)赖氨酸(Lys)为主;保守结构域分析结果显示杏RPW8家族主要含有10个Motify,其中Motif8、Motif9为特征结构域;系统进化树分析显示,蔷薇科植物RPW8家族基因聚为一类,LWMRPW8-7与拟南芥、杨树基因聚为一类。对杏RPW8基因在不同组织中的表达分析结果显示,16个基因在花、花芽、叶片、果肉、果仁中的表达量呈现较大差异。 展开更多
关键词 RPW8 基因家族 表达量
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北海市村屯绿化现状及技术措施 预览 被引量:1
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作者 许靖 王广军 刘娟 《现代农业科技》 2019年第3期137-137,139共2页
自2015年“美丽广西·生态乡村”村屯绿化专项活动全面推进以来,北海市乡村新种植了大量的绿化乔木、果树、花灌木等,乡村风貌得到改善。本文对广西北海村屯绿化的现状进行了分析,并介绍了村屯绿化的技术措施,包括树种选择、种植模... 自2015年“美丽广西·生态乡村”村屯绿化专项活动全面推进以来,北海市乡村新种植了大量的绿化乔木、果树、花灌木等,乡村风貌得到改善。本文对广西北海村屯绿化的现状进行了分析,并介绍了村屯绿化的技术措施,包括树种选择、种植模式及注意事项等,以期为绿化美化乡村环境提供参考。 展开更多
关键词 村屯绿化 现状 技术措施 广西北海
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濒危植物格木天然种群的表型多样性及变异 预览
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作者 李洪果 陈达镇 +5 位作者 许靖 刘光金 庞晓东 叶金辉 莫小文 谌红辉 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第4期69-83,共15页
【目的】通过对濒危植物格木在我国中心分布区种群的果荚和种子表型性状测量分析,研究其表型多样性及变异规律,结合地理气候信息探讨影响表型变异的关键因子,为格木天然种群的遗传多样性保护恢复和引种栽培提供科学依据。【方法】对8个... 【目的】通过对濒危植物格木在我国中心分布区种群的果荚和种子表型性状测量分析,研究其表型多样性及变异规律,结合地理气候信息探讨影响表型变异的关键因子,为格木天然种群的遗传多样性保护恢复和引种栽培提供科学依据。【方法】对8个格木天然种群114个单株的13个果荚及种子表型性状进行测量,利用巢式方差分析、多重比较、相关性分析、主成分分析、聚类分析等分析方法,探讨格木天然种群的表型多样性水平、进化和适应性潜力、表型变异规律、表型分化水平、种群聚类特征及其与地理气候因子的相关性。【结果】格木表型多样性水平中等,13个性状的Shannon-Wiener指数在1.911 1(种形指数)~2.1039(果荚周长)之间,平均 2.0278;8个种群的Shannon-Wiener指数在0.9209(P6)~1.8856(P8)之间,均值为1.474 7。格木表型性状离散程度较轻,13个性状的变异系数在7.5446%(种子长)~18.8685%(果荚面积)之间,均值为12.410 9%;8个种群的变异系数在8.8529%(P1)~13.984 8%(P5)之间,均值为12.4109%。13个表型性状的极大值为极小值的1.3952(种形指数)~2.8056(每荚种子数)倍,均值为1.7917。巢式方差分析表明,格木13个表型性状在种群间和种群内均存在极显著差异(P<0.01),说明这些性状在种群间和种群内均存在丰富的变异;种群内的变异(40.3871%)远大于种群间(11.9489%)。种群平均表型分化系数为21.8579%,各性状的分化系数变化幅度在7.4765%(种形指数)~38.6740%(果荚宽)之间。相关性分析表明,13个表型性状之间大多存在显著或极显著相关,果荚宽度、种子周长等性状和温度指标呈负相关,与纬度呈正相关,格木在气温高、降雨量大的地区往往具有小果荚、小种子的特征,随着温度指标降低和纬度增加,格木果荚及种子有变大的趋势。格木13个表型性状可提炼为4个主成分,累积贡献率为87.382%。8个天然群体基于欧氏距离� 展开更多
关键词 格木 濒危植物 天然种群 表型多样性 表型性状 种质资源
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北海市冯家江水质监测与评价 预览
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作者 王广军 许靖 +1 位作者 杨淞 徐广宽 《山东林业科技》 2019年第2期48-50,共3页
为了解冯家江水质状况,通过对溶解氧、氨氮、pH、高锰酸盐指数、五日生化需氧量、水温等指标监测,并以《地表水环境质量标准》(GB3838-2002)为依据,采用单项污染指数法和综合污染指数法对其污染程度进行评价。结果表明,从单因子污染指... 为了解冯家江水质状况,通过对溶解氧、氨氮、pH、高锰酸盐指数、五日生化需氧量、水温等指标监测,并以《地表水环境质量标准》(GB3838-2002)为依据,采用单项污染指数法和综合污染指数法对其污染程度进行评价。结果表明,从单因子污染指数评价可知冯家江水体污染严重,特别是氨氮和五日生化需氧量严重超出Ⅲ类地表水水质限值,从综合污染指数等级也可知冯家江水体污染严重,从污染程度看上游大于下游,应重视上游污染源监测与防治,以改善水质。 展开更多
关键词 水质监测与评价 单项污染指数 综合污染指数 冯家江
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印度紫檀林下种植金花茶技术探索与效益评估 预览
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作者 许靖 王广军 +2 位作者 刘娟 陈张权 孙燕 《安徽农业科学》 CAS 2018年第34期77-78,82共3页
从林地选择、种苗选择、种植管理3个方面进行印度紫檀林下种植金银花技术介绍并进行效益分析。经估算,紫檀林下套种金花茶达产后,平均年产收入达96.3万元/hm^2,同时具有较好的生态效益和社会效益。发展林下经济“双珍”模式对于乡村振... 从林地选择、种苗选择、种植管理3个方面进行印度紫檀林下种植金银花技术介绍并进行效益分析。经估算,紫檀林下套种金花茶达产后,平均年产收入达96.3万元/hm^2,同时具有较好的生态效益和社会效益。发展林下经济“双珍”模式对于乡村振兴战略的实施具有重要意义。 展开更多
关键词 林下经济 双珍模式 金花茶 印度紫檀
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台风灾害对北海市城市园林树木的影响及其对策 预览 被引量:1
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作者 唐筱洁 王广军 许靖 《南方农业》 2016年第3期213-214,共2页
以台风“威马逊”为例分析台风对北海市城市园林树木危害原因,进而提出应对台风危害,城市园林树木应因地制宜选择优势乡土树种为主;同时,加强管护并对受灾树木及时抢救等策略,以期为北海市城市园林树木保护提供参考。
关键词 台风灾害 园林树木 对策 广西北海市
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中国野生秋子梨果实形态变异研究 预览 被引量:9
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作者 许靖 乌云塔娜 王广军 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期64-68,共5页
对内蒙古和黑龙江的5个野生秋子梨群体的100个单株的果实性状变异程度,变异类型,果实形态的地理变异,果实和花性状指标与海拔高度的相关性进行了分析,以揭示我国野生秋子梨的遗传多样性,及其与环境的关系,为我国野生秋子梨资源的... 对内蒙古和黑龙江的5个野生秋子梨群体的100个单株的果实性状变异程度,变异类型,果实形态的地理变异,果实和花性状指标与海拔高度的相关性进行了分析,以揭示我国野生秋子梨的遗传多样性,及其与环境的关系,为我国野生秋子梨资源的保护和利用提供理论依据。研究结果表明:野生秋子梨果型小于栽培梨,在野生秋子梨果实性状指标中果柄长的变异程度最大,变异系数为23.26%;根据野生秋子梨果实的性状指标可以将野生秋梨分为‘红罐梨’、‘大苹果梨’、‘小扣罐梨’、‘红焦梨’、‘小红焦梨’、‘黄罐梨’、‘短把黄罐梨’、‘长把黄罐梨’、‘圆通梨’、‘小罐梨’;根据果实纵径/横径分为苹果型(果实的纵径/横径为0.9-1)和梨型(果实的纵径/横径小于0.9);根据果皮颜色分为‘黄皮梨’和‘红皮梨’;在野生秋子梨中内蒙野生秋子梨果型较长,果柄较短。内蒙古野生秋子梨群体中‘IM-QS’群体果型最大,果柄最长,而‘IM-RS1’群体果型最小,果柄最短;野生秋子梨的果实性状与海拔存在显著相关性。 展开更多
关键词 中国野生秋子梨 果实 形态变异
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中国野生秋子梨花形状遗传多样性研究 预览 被引量:1
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作者 许靖 乌云塔娜 王广军 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期27-30,36共5页
用SPSS20.0对我国黑龙江和内蒙古的6个野生秋子梨群体花的形态指标进行方差分析、聚类分析、及各形态指标与海拔的相关性分析,从而研究我国野生秋子花的形态变异特征,以继续探索我国野生秋子的遗传多样性特点,为野生秋子梨资源的分... 用SPSS20.0对我国黑龙江和内蒙古的6个野生秋子梨群体花的形态指标进行方差分析、聚类分析、及各形态指标与海拔的相关性分析,从而研究我国野生秋子花的形态变异特征,以继续探索我国野生秋子的遗传多样性特点,为野生秋子梨资源的分类和保护提供理论依据。方差分析表明黑龙江野生秋子梨群体遗传多样性高,其花型大,花柄长而内蒙古野生秋子梨群体遗传多样性低,其花型小且花柄短;聚类分析表明‘HLJ-FY’野生梨群体与其他野生秋子梨群体有较大差异,而单独聚为一类;相关性分析表明海拔高度与野生秋子梨花形态指标成显著负相关关系。研究揭示了我国野生秋子梨群体特别是内蒙古野生秋子梨群体的遗传多样性较低,急需加以保护。 展开更多
关键词 野生秋子梨 花形状:遗传多样性
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仁用杏花芽3个发育时期数字基因表达谱分析 被引量:3
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作者 宋猜 乌云塔娜 +2 位作者 李慧 许靖 刘汝卿 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1559-1568,共10页
以仁用杏‘优一’为试材,运用转录组、数字基因表达谱技术,研究了仁用杏花芽萌动期前后相关基因的表达规律。结果发现,仁用杏花芽在花芽萌动期前后进行着各种旺盛的生物合成和代谢活动,且4个开花调控途径(光周期途径、春化途径、自主... 以仁用杏‘优一’为试材,运用转录组、数字基因表达谱技术,研究了仁用杏花芽萌动期前后相关基因的表达规律。结果发现,仁用杏花芽在花芽萌动期前后进行着各种旺盛的生物合成和代谢活动,且4个开花调控途径(光周期途径、春化途径、自主途径、GA调控途径)均已启动,光周期途径在花芽萌动时发挥重要作用,涉及到了74条基因,其中有38条差异基因上调表达,29条下调表达;GA途径在花芽萌动期对花芽的生长发育调控表现为抑制作用,涉及到了60条基因,其中有13条差异基因上调,9条差异基因下调;其他两条途径于花芽萌动前作用,其中春化途径涉及到了23个基因,其中有4条差异基因上调,15条差异基因下调;自主途径涉及到了24条基因,其中有3条差异基因上调,11条差异基因下调。本研究通过数字基因表达谱分析,初步了解仁用杏花芽萌动前后的网络途径,为后期对仁用杏花芽相关开花基因的研究、探明仁用杏早花的分子机理及通过分子育种方法培育仁用杏晚花品种提供坚实的理论依据。 展开更多
关键词 仁用杏 花芽 转录组 数字基因表达谱 成花调控途径
杜仲MEP途径系列基因表达差异的研究 预览 被引量:9
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作者 刘慧敏 乌云塔娜 +2 位作者 王淋 许靖 叶生晶 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期26-33,61共9页
以杜仲果实和叶片转录组为基础,研究了MEP途径系列基因的表达差异,为杜仲基因的克隆、功能鉴定及重要成分的分子积累机理研究提供重要的依据。结果表明,杜仲转录组中共42条Unigene被MEP途径注释。DXS的DXS2和DXS3在幼果和叶片中表达量... 以杜仲果实和叶片转录组为基础,研究了MEP途径系列基因的表达差异,为杜仲基因的克隆、功能鉴定及重要成分的分子积累机理研究提供重要的依据。结果表明,杜仲转录组中共42条Unigene被MEP途径注释。DXS的DXS2和DXS3在幼果和叶片中表达量具有显著差异,且DXS2在幼果和叶片中的表达量最高;该酶在幼果和成熟果实中有7条Unigene被注释,其中DXS6在成熟果实中特异表达,的表达量具有显著差异。DXR在幼果和叶片中有4条Unigene被注释,其中DXR1、DXR2、DXR3的表达量具有显著差异;该酶在幼果和成熟果实中有3条Unigene被注释,其中DXR3在成熟果实中特异表达,3条Unigene的表达量均无显著差异,DXR1在幼果和成熟果实中表达量均最高。MCT在幼果和叶片中仅1条被注释,表达量差异显著;该酶在幼果和成熟果实中仅1条被注释,其表达量无显著差异。CMK在幼果和叶片中仅CMK1被注释,且表达量无显著差异;该酶在幼和成熟果实中仅CMK1被注释,且表达量无显著差异。MDS在幼果和叶片中仅MDS1被注释,其表达量差异显著;该酶在幼果和成熟果实中有2条Unigene被注释,且表达量无显著差异。HDS在幼果和叶片中仅HDS1被注释,表达量具有显著差异;该酶在幼果和成熟果实中仅HDS1被注释,表达量有显著差异。HDR在幼果和叶片中有5条Unigene被注释,其中HDR1和HDR5的表达量具有显著差异;该酶在幼果和成熟果实中有7条Unigene被注释,其中HDR3、HDR4、HDR5、HDR6的表达量有显著差异。IPI在幼果和叶片中仅IPI1被注释,其表达量无显著差异;该酶在幼果和成熟果实中有2条Unigene被注释,其中IPI1的表达量有显著差异。 展开更多
关键词 杜仲 幼果 叶片 成熟果实 基因表达量分析
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杜仲MVA途径相关基因的鉴定及荧光定量PCR引物筛选 预览 被引量:6
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作者 叶生晶 乌云塔娜 +1 位作者 田大伦 许靖 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期50-56,共7页
杜仲富含萜类物质,MVA途径是萜类物质合成的重要途径之一。从杜仲果实转录组数据KEGG中杜仲MVA途径共被注释30条Unigene,根据NCBI中的BLAST比较,分别鉴定了乙酰COA酰基转移酶,羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,羟甲基戊二酰辅酶a还原酶,甲羟戊... 杜仲富含萜类物质,MVA途径是萜类物质合成的重要途径之一。从杜仲果实转录组数据KEGG中杜仲MVA途径共被注释30条Unigene,根据NCBI中的BLAST比较,分别鉴定了乙酰COA酰基转移酶,羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,羟甲基戊二酰辅酶a还原酶,甲羟戊酸激酶,磷酸甲羟戊酸激酶,二磷酸甲羟戊酸脱羧酶基因,被注释7条,3条,11条,2条,2条,5条。表达差异分析表明,以上基因中分别为5条,3条,4条,1条,5条为幼果和成熟果实差异表达基因。对差异表达基因序列进行软件设计、引物特异性分析和实验验证,最终筛选出10对适合杜仲MVA途径SYBR GreenI荧光定量PCR的引物,为MVA途径基因表达差异研究及萜类物质积累的分子机理研究提供重要依据。 展开更多
关键词 杜仲 萜类合成MVA途径 荧光定量PCR 引物筛选
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枣花蕾总RNA提取方法的比较 预览 被引量:4
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作者 冯延芝 袁德义 +3 位作者 张琳 龙洪旭 许靖 刘敏 《经济林研究》 北大核心 2012年第2期88-90,共3页
为了探究枣花蕾总RNA提取的最优方法,以沾化冬枣的花蕾为材料,利用改良CTAB法、Trizol法和2种RNA提取试剂盒(PureLinkTMRNA小提试剂盒和北京奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒)分别提取花蕾的总RNA,并对RNA浓度和电泳图... 为了探究枣花蕾总RNA提取的最优方法,以沾化冬枣的花蕾为材料,利用改良CTAB法、Trizol法和2种RNA提取试剂盒(PureLinkTMRNA小提试剂盒和北京奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒)分别提取花蕾的总RNA,并对RNA浓度和电泳图谱进行比较分析,利用奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒法可提取到纯度较高,完整性好的总RNA,并可用于Northern杂交、cDNA文库构建和半定量RT-PCR等分子生物学试验。 展开更多
关键词 枣花蕾 RNA提取 改良CTAB法 TRIZOL法 RNA提取试剂盒法
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梨种质资源SSR引物的筛选与评价 预览 被引量:9
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作者 许靖 乌云塔娜 +2 位作者 叶生晶 王淋 冯延芝 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期80-85,共6页
目前在梨种质研究中仍然缺乏足够的SSR引物,因此筛选多态性丰富的SSR标记引物,为进一步研究梨种质资源的群体遗传学特征等提供参考。运用SSR标记技术,从初选后的42对SSR引物中筛选出多态性好、稳定性高的引物。筛选出的12对引物对40个... 目前在梨种质研究中仍然缺乏足够的SSR引物,因此筛选多态性丰富的SSR标记引物,为进一步研究梨种质资源的群体遗传学特征等提供参考。运用SSR标记技术,从初选后的42对SSR引物中筛选出多态性好、稳定性高的引物。筛选出的12对引物对40个梨样的DNA序列进行了SSR-PCR扩增,共检测出159个等位基因,平均每个位点检测到13.25个等位基因;平均每个等位基因有效数目为1.236 4,平均I值为0.286 6,平均Nei指数值为0.165 3;系统聚类分析表明,所有样品可以分为3个类群,即栽培梨、日本梨、野生秋子梨。筛选的12对多态性丰富的SSR引物适合用于梨种质资源群体遗传学特征分析,为梨种质资源的收集、保存、鉴定、评价以及亲缘关系研究提供方法和理论依据。 展开更多
关键词 种质资源 SSR分子标记 引物筛选
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