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虎源、小熊猫源副流感病毒5型的鉴定及F基因遗传进化分析 被引量:2
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作者 周霞 +3 位作者 邹舒展 张贺 吴梦矾 罗满林 《中国兽医学报》 CSCD 北大核心 2018年第4期700-703,共4页
为探究副流感病毒5型(PIV5)的遗传变异状况,对PIV5的预防、诊断、治疗提供依据,于20142016年,收集疑似PIV5感染病例样品14份(小熊猫4份,非洲狮4份,东北虎1份,华南虎1份,环尾狐猴4份)做相应处理,接种VerO细胞并通过PcR检测... 为探究副流感病毒5型(PIV5)的遗传变异状况,对PIV5的预防、诊断、治疗提供依据,于20142016年,收集疑似PIV5感染病例样品14份(小熊猫4份,非洲狮4份,东北虎1份,华南虎1份,环尾狐猴4份)做相应处理,接种VerO细胞并通过PcR检测,对检测到的PIV5的F基因进行扩增,连接目的片段至pMD19-T Simple Vector,测序并做序列分析。结果成功从华南虎、东北虎和小熊猫标本中分离出3株PIV5,分别命名为PIV5-SR,P1V5ST,ZJQ221。3株病毒接种到Vero细胞上,均能使Vero细胞出现空泡、拉网的现象。用相关软件分析该病毒F基因序列发现,3株病毒的F基因分别有5,6,4处突变;建立遗传进化树表明,3株病毒处同一分支,均与韩国犬源1168—1分离株亲缘关系最近。 展开更多
关键词 副流感病毒5型 小熊猫 F基因 进化树
广东地区猪伪狂犬病流行病学调查与gE、TK基因遗传进化分析 预览 被引量:2
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作者 陈华良 王和兴 +3 位作者 李小鹏 周霞 罗满林 《广东畜牧兽医科技》 2016年第2期5-9,共5页
为了解广东地区猪伪狂犬病的流行与变异情况,于2014年11月至2015年2月期间从广东省不同地区的猪场所采集的640份血清样品进行PRV野毒检测,结果显示,广东省的血清阳性率超过25%。针对PRV g E基因设计一对特异性引物,对来100份病料进行PC... 为了解广东地区猪伪狂犬病的流行与变异情况,于2014年11月至2015年2月期间从广东省不同地区的猪场所采集的640份血清样品进行PRV野毒检测,结果显示,广东省的血清阳性率超过25%。针对PRV g E基因设计一对特异性引物,对来100份病料进行PCR鉴定。对筛选为阳性的病料分别进行g E主要抗原表位序列和TK全基因扩增,分别得到约800 bp和1000 bp大小的特异性目的条带并将其测序。利用DNAstar和MEGA软件将测序结果与国内外已发表的序列进行遗传进化分析。结果表明,所得到的PRV毒株核苷酸序列有较高的同源性,且与国内流行毒株进化关系密切。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病 流行病学调查 GE基因 TK基因 遗传进化分析
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小反刍兽疫RT-PCR的鉴定及N基因序列分析 预览
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作者 李小鹏 陈华良 +5 位作者 周霞 程松 张文娟 罗满林 少伦 《亚洲兽医病例研究》 2015年第4期31-38,共8页
根据小反刍兽疫病毒(PPRV) P、N基因保守序列设计了两对引物,分别扩增部分P基因及N基因的全长阅读编码框(ORF),对疑似小反刍兽疫病毒的样品抽取RNA并以其为模板,在RT-PCR的体系中能扩增出预期大小分别为766 bp、1578 bp的目的片段,同时... 根据小反刍兽疫病毒(PPRV) P、N基因保守序列设计了两对引物,分别扩增部分P基因及N基因的全长阅读编码框(ORF),对疑似小反刍兽疫病毒的样品抽取RNA并以其为模板,在RT-PCR的体系中能扩增出预期大小分别为766 bp、1578 bp的目的片段,同时对退火温度,敏感性及特异性等RT-PCR反应条件进行了优化。在最佳反应条件下,该RT-PCR能检出最低850拷贝的PPRV基因组。对N全基因进行RT-PCR扩增并对PCR产物克隆于pMD-19T载体,转化感受态细胞DH5α后,对重组质粒测序,结果表明N基因全长大小与预期完全一致。并且这两个基因与新疆伊犁、北京所发生的小反刍兽疫病毒同源性高达100%,说明该病毒在中国南北方都有存在,其亚型为基因4型。 展开更多
关键词 小反刍兽疫病毒 P、N基因 逆转录–聚合酶联反应 同源性 序列分析
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