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豇豆轻斑驳病毒海南分离物全基因组序列测定及分子特征 预览

Genomic Sequences Measure and Molecular Characteristics of Cowpea mild mottle virus of Hainan Isolate
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摘要 从海南采集疑似感染豇豆轻斑驳病毒(Cowpea mild mottle virus,CpMMV)的豇豆病叶,采用RT-PCR 结合测序获得其全基因组序列,CpMMV海南分离物(KY420906)基因组全长8 193bp,与其他CpMMV 分离物的同源性为63.00%~83.22%。系统发育分析结果表明,CpMMV海南分离物单独聚为一个亚簇;重组分析结果表明,CpMMV 基因组有一个重组事件,断点为3212~3592 bp。 The full genomic sequence of Cowpea mild mottle virus(CpMMV)Hainan isolate was cloned from CpMMV infected cowpea.The full genomic sequence of CpMMV Hainan isolate is 8 193 bp(GenBank access No.KY420906),and shared only 63.00%-83.22% homology with the other CpMMV isolates. Phylogeny analysis showed that CpMMV Hainan isolate was located as one separate subcluster.Recombinant analysis showed that there was one recombinant event existing at breaking points 3 212-3 592 bp.
作者 杨晓 张宇 陈莎 李桑桑 龚一诺 张卓 鲁清华 胡荣 刘勇 张德咏 YANG Xiao;ZHANG Yu;CHEN Sha;LI Sang-sang;GONG Yi-nuo;ZHANG Zhuo;LU Qinghua;HU Rong;LIU Yong;ZHANG De-yong(Longping Branch of Graduate College,Hunan University,Changsha 410125,Hunan,China;Plant Protection Institute ofHunan Academy of Agricultural Sciences,Changsha 410125,Hunan,China)
出处 《中国蔬菜》 北大核心 2019年第6期35-38,共4页 China Vegetables
基金 国家自然科学基金项目(31571981) 国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-23-D-02).
关键词 豇豆轻斑驳病毒 豇豆 基因组序列 序列分析 Cowpea mild mottle virus(CpMMV) Cowpea Genomic sequence Sequence analysis
作者简介 杨晓,男,硕士研究生,主要从事蔬菜病毒致病性方面的研究,E-mail:1207654465@qq.com;通讯作者(Corresponding author):张德咏,男,研究员,主要从事蔬菜病毒致病性方面的研究,E-mail:dyzhang78@163.com.
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